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中国小型猪SLA-DMA基因的SSCP分析
被引量:
2
1
作者
于辉
李波
+4 位作者
李华
李彬
李学伟
刘为民
赵海全
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1300-1305,共6页
通过对甘孜藏猪、合作猪、巴马猪以及五指山猪4个群体的SLA-DMA基因第2和第3外显子的PCR-SS-CP和序列多态分析表明:SLA-DMA基因的第2外显子没有多态,但第3外显子有2个等位基因的变异。通过优化低离子强度单链构象多态分型条件(LIS-PCR-S...
通过对甘孜藏猪、合作猪、巴马猪以及五指山猪4个群体的SLA-DMA基因第2和第3外显子的PCR-SS-CP和序列多态分析表明:SLA-DMA基因的第2外显子没有多态,但第3外显子有2个等位基因的变异。通过优化低离子强度单链构象多态分型条件(LIS-PCR-SSCP)、克隆测序、菌落PCR、菌落不对称PCR及单链DNA二级结构计算机预测等技术,对第3外显子PCR-SSCP复杂带型进行了准确的判定,J等位基因的带型与单链DNA二级结构计算机预测结果之间存在很高的一致性。4群体中SLA-DMA基因的第3外显子共有JJ/JK/KK 3种基因型,均达到了Hardy-Weinberg平衡。其中K等位基因频率高于J等位基因频率。杂合度和多态信息含量的高低依次为:巴马猪、五指山猪、合作猪、甘孜藏猪。除甘孜藏猪多态信息含量为低度多态外,其余群体均为中度多态。
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关键词
小型猪
sla
-
dma
SSCP
方法学
多样性
下载PDF
职称材料
题名
中国小型猪SLA-DMA基因的SSCP分析
被引量:
2
1
作者
于辉
李波
李华
李彬
李学伟
刘为民
赵海全
机构
佛山科学技术学院生命科学学院
四川农业大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1300-1305,共6页
基金
国家自然科学基金(3030024630671500)资助项目
文摘
通过对甘孜藏猪、合作猪、巴马猪以及五指山猪4个群体的SLA-DMA基因第2和第3外显子的PCR-SS-CP和序列多态分析表明:SLA-DMA基因的第2外显子没有多态,但第3外显子有2个等位基因的变异。通过优化低离子强度单链构象多态分型条件(LIS-PCR-SSCP)、克隆测序、菌落PCR、菌落不对称PCR及单链DNA二级结构计算机预测等技术,对第3外显子PCR-SSCP复杂带型进行了准确的判定,J等位基因的带型与单链DNA二级结构计算机预测结果之间存在很高的一致性。4群体中SLA-DMA基因的第3外显子共有JJ/JK/KK 3种基因型,均达到了Hardy-Weinberg平衡。其中K等位基因频率高于J等位基因频率。杂合度和多态信息含量的高低依次为:巴马猪、五指山猪、合作猪、甘孜藏猪。除甘孜藏猪多态信息含量为低度多态外,其余群体均为中度多态。
关键词
小型猪
sla
-
dma
SSCP
方法学
多样性
Keywords
miniature pigs
sla
-
dma
SSCP
methodology
polymorphism
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国小型猪SLA-DMA基因的SSCP分析
于辉
李波
李华
李彬
李学伟
刘为民
赵海全
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
2
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职称材料
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参考文献
引证文献
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