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罗氏HIV-1定量检测引物SK145和SKCC1B的评估及优化
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作者 樊路娟 张春霞 +1 位作者 徐庆刚 张驰宇 《江苏大学学报（医学版）》 CAS 2014年第1期26-30,共5页
目的:评估罗氏HIV-1检测系统中引物SK145和SKCC1B对不同亚型HIV-1病毒定量检测的广谱性及准确性,并在此基础上对该引物进行优化。方法:下载并分析5个主要HIV-1流行亚型(B、C、A、01_AE、D)在引物SK145和SKCC1B扩增区段的对应序列,从各... 目的:评估罗氏HIV-1检测系统中引物SK145和SKCC1B对不同亚型HIV-1病毒定量检测的广谱性及准确性,并在此基础上对该引物进行优化。方法:下载并分析5个主要HIV-1流行亚型(B、C、A、01_AE、D)在引物SK145和SKCC1B扩增区段的对应序列,从各亚型筛选出所占比例最高的5条序列构建定量标准品。用梯度稀释的HIV-1各亚型标准品来评估引物SK145和SKCC1B的扩增效率。为改善引物SK145和SKCC1B对HIV-1不同亚型扩增的准确性和广谱性,我们重新设计了一对简并引物并分析其对不同亚型病毒的扩增效果。结果:引物SK145、SKCC1B对于B亚型病毒的扩增效果最好,而对非B亚型病毒的扩增效果并不理想,简并引物能显著改善对各亚型HIV-1病毒扩增的效果。结论:罗氏引物SK145和SKCC1B不适用于非B亚型HIV-1病毒载量的定量检测,而优化设计的简并引物能改善对各亚型HIV-1病毒的扩增效率,因而可用于中国等HIV-1多亚型共流行国家的HIV-1病毒载量检测。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒1型 实时荧光定量PCR SK145 skcc1b
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