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龙眼24个品种的SCoT遗传多样性分析 被引量：73
1
作者 陈虎 何新华 +2 位作者 罗聪 朱建华 李峰 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1651-1654,共4页
利用SCoT标记对24份龙眼品种资源进行了检测。从80条引物中筛选出24条重复性好,条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增出211条带,其中181条具有多态性,多态性带比率为85.8%。24个龙眼品种间遗传相似系数在0.65～0.86之间,说明SCoT标记能够... 利用SCoT标记对24份龙眼品种资源进行了检测。从80条引物中筛选出24条重复性好,条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增出211条带,其中181条具有多态性,多态性带比率为85.8%。24个龙眼品种间遗传相似系数在0.65～0.86之间,说明SCoT标记能够揭示材料间较高的遗传多样性。UPGMA聚类分析显示,SCoT标记能将24份龙眼品种完全区分开,并分成两类。 展开更多
关键词 龙眼 scot 遗传多样性
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SCoT分子标记在植物研究中的应用进展 被引量：55
2
作者 龙治坚 范理璋 +2 位作者 徐刚 胡尚连 韩国辉 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期336-343,共8页
SCo T是一种新型的目的基因分子标记,该标记不仅能获得与性状联系紧密的目的基因,而且能对性状进行跟踪,已被广泛应用于多种植物的研究。本文概述了SCo T标记的原理、引物设计方法及特点,并从PCR反应体系建立与优化、种质资源遗传多样... SCo T是一种新型的目的基因分子标记,该标记不仅能获得与性状联系紧密的目的基因,而且能对性状进行跟踪,已被广泛应用于多种植物的研究。本文概述了SCo T标记的原理、引物设计方法及特点,并从PCR反应体系建立与优化、种质资源遗传多样性与亲缘关系分析、种质鉴定与指纹图谱构建、基因差异表达与分子遗传连锁图谱构建等方面总结了SCo T标记的应用进展。同时,对其存在的问题进行了讨论,并展望了该标记的发展应用前景。 展开更多
关键词 scot 种质鉴定 遗传多样性 图谱构建 基因差异表达
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龙眼SCoT-PCR反应体系的优化 被引量：48
3
作者 陈虎 何新华 +2 位作者 罗聪 高美萍 朱建华 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期970-974,共5页
目标起始密码子多态（start condon tardeted polymorphism,SCoT）分子标记结合了ISSR标记和RAPD标记的优点,具有操作简单﹑成本低廉﹑多态性丰富﹑重复性好﹑引物设计简单且通用性良好等诸多优点。本实验以石硖龙眼的新鲜叶片为试材,... 目标起始密码子多态（start condon tardeted polymorphism,SCoT）分子标记结合了ISSR标记和RAPD标记的优点,具有操作简单﹑成本低廉﹑多态性丰富﹑重复性好﹑引物设计简单且通用性良好等诸多优点。本实验以石硖龙眼的新鲜叶片为试材,采用单因素试验的方法分别研究模版、引物、rTaqDNA聚合酶、dNTPs、缓冲液（Mg2＋）及退火温度共6因素各8个水平对龙眼SCoT-PCR扩增结果的影响。结果表明：龙眼SCoT标记的20μL优化反应体系为：10×BufferⅡ（含Mg2＋）2.0μL、DNA模板30ng、引物浓度为30μmol/L、rTaqD-NA聚合酶用量为0.45U、dNTP浓度为4.0mmol/L。适宜的扩增程序为：94℃预变性4min;95℃变性50s,49.5℃退火40s,72℃复性2min,36个循环;最后72℃延伸10min。利用24个龙眼品种验证该反应体系,1.5%琼脂糖电泳检测结果显示,扩增产物在400-2200bp之间,不同品种间DNA谱带具有多态性,反应体系具有良好的稳定性和可重复性。 展开更多
关键词 龙眼 scot PCR体系优化
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葡萄目标起始密码子多态性反应体系的优化 被引量：44
4
作者 张君玉 郭大龙 +3 位作者 龚莹 刘崇怀 李猛 张国海 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期209-214,共6页
SCoT标记是一种新型目的基因分子标记方法,采用L16(45)正交试验和单因素试验2种方法优化了葡萄SCoT-PCR反应体系,结果表明正交试验中关键影响因子为dNTPs浓度,单因素试验中为dNTPs和Mg2+浓度。综合2种方法,优化的葡萄SCoT-PCR反应体系为... SCoT标记是一种新型目的基因分子标记方法,采用L16(45)正交试验和单因素试验2种方法优化了葡萄SCoT-PCR反应体系,结果表明正交试验中关键影响因子为dNTPs浓度,单因素试验中为dNTPs和Mg2+浓度。综合2种方法,优化的葡萄SCoT-PCR反应体系为:Mg2+2.0 mmol.L-1、dNTPs 0.3 mmol.L-1、Taq酶1.0 U、引物0.3μmol.L-1、DNA模板30 ng,总体积20μL。扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性1 min,54℃退火1 min,72℃复性2 min,34个循环;最后72℃延伸8 min。该反应体系在20个葡萄品种的验证中表现出良好的稳定性和可重复性,该反应体系的建立为葡萄种质遗传多样性评价、基因组分析、指纹图谱构建、分子标记辅助选择育种等研究提供了新的技术手段。 展开更多
关键词 葡萄 scot 正交设计 单因素试验 体系优化
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铁皮石斛SCoT-PCR反应体系构建及优化 被引量：39
5
作者 赵瑞强 高燕会 +1 位作者 章晓玲 斯金平 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期648-655,共8页
采用正交设计和单因素试验相结合的方法,对铁皮石斛的SCoT-PCR反应中5个因素(DNA模板、Mg2+、dNTPs、Taq酶和引物)进行优化试验。建立了适合铁皮石斛既稳定且多态性高的SCoT-PCR的最佳反应体:20μl PCR反应体系中含有1×Buffer、30n... 采用正交设计和单因素试验相结合的方法,对铁皮石斛的SCoT-PCR反应中5个因素(DNA模板、Mg2+、dNTPs、Taq酶和引物)进行优化试验。建立了适合铁皮石斛既稳定且多态性高的SCoT-PCR的最佳反应体:20μl PCR反应体系中含有1×Buffer、30ng DNA模板、2.5mmol.L-1Mg2+、0.15mmol.L-1dNTPs、1.5U Taq DNA聚合酶和0.4μmol.L-1引物。对铁皮石斛的SCoT-PCR最佳反应体系的退火温度进行梯度试验,发现本试验引物S6的退火温度为54.5℃,且最适退火温度因引物而异。这一优化的SCoT-PCR反应体系在32份铁皮石斛材料的验证中表现出良好的稳定性和重复性。该优化的SCoT-PCR反应体系为进一步进行铁皮石斛种质鉴定、遗传图谱构建、基因定位和遗传多样性的分析奠定了技术基础。 展开更多
关键词 铁皮石斛 scot 正交设计 单因素试验 体系优化
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草莓属植物SCoT分析体系的建立及优化 被引量：36
6
作者 秦国新 何桥 +2 位作者 梁国鲁 雷家军 郭启高 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期393-397,共5页
为利用SCoT技术开展草莓属(Fragaria)植物种质资源遗传多样性及分子系统学研究,以草莓属植物11个野生种和1个栽培品种为试材,采用L25(56)正交试验设计,建立了草莓属植物的最优SCoT-PCR反应体系,即20μL反应体系中,含Mg2+2.0 mmol·... 为利用SCoT技术开展草莓属(Fragaria)植物种质资源遗传多样性及分子系统学研究,以草莓属植物11个野生种和1个栽培品种为试材,采用L25(56)正交试验设计,建立了草莓属植物的最优SCoT-PCR反应体系,即20μL反应体系中,含Mg2+2.0 mmol·L-1、dNTPs 0.3 mmol·L-1、Taq酶0.75 U、引物0.75μmol·L-1、模板DNA 40 ng,并对退火温度进行了优化,对电泳检测方法及草莓属植物DNA提取方法进行了改进。共筛选出22个适于进行草莓属植物SCoT分析的引物。经验证,该反应体系稳定性好、可重复性强、多态性高、扩增效果好,适于草莓属植物的SCoT分析。 展开更多
关键词 草莓属 scot 体系优化
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SRAP结合SCoT标记分析番木瓜种质的遗传多样性 被引量：33
7
作者 蔡元保 杨祥燕 +3 位作者 陈豪军 曾黎明 庞新华 孙光明 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期292-298,共7页
利用SRAP和SCoT两种分子标记相结合对中国22个番木瓜主要栽培品种（系）进行遗传多样性研究。SCoT标记检测获得的遗传多样性参数值和遗传相似系数范围均高于SRAP标记检测的结果，表明SCoT标记检测多态性的能力高于SRAP标记。基于两种标... 利用SRAP和SCoT两种分子标记相结合对中国22个番木瓜主要栽培品种（系）进行遗传多样性研究。SCoT标记检测获得的遗传多样性参数值和遗传相似系数范围均高于SRAP标记检测的结果，表明SCoT标记检测多态性的能力高于SRAP标记。基于两种标记数据合并后的UPGMA聚类结果显示，番木瓜种质间的遗传相似系数为0.65～0.90，种质间遗传多样性水平较低；在相似性系数为0.82时，将所有参试材料划分为3个类群。应用Mantel检测对SRAP和SCoT及两种标记合并进行相关性分析，表明三者之间具有显著的相关性，且相关性很高。聚类结果从分子水平反映出中国番木瓜主要栽培品种（系）的遗传基础狭窄。 展开更多
关键词 番木瓜 遗传多样性 SRAP scot
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36份菠萝种质的遗传多样性SCoT分析 被引量：28
8
作者 陈香玲 苏伟强 +2 位作者 刘业强 任惠 陆玉英 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期625-629,共5页
利用SCoT标记研究了36份菠萝种质资源的遗传多样性。从86条引物中筛选出18条重复性好,条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增出209条带,其中135条具有多态性,多态性带比率为64.99%。经NTSYS软件分析,36份菠萝种质间遗传相似系数在0.63～0.9... 利用SCoT标记研究了36份菠萝种质资源的遗传多样性。从86条引物中筛选出18条重复性好,条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增出209条带,其中135条具有多态性,多态性带比率为64.99%。经NTSYS软件分析,36份菠萝种质间遗传相似系数在0.63～0.93之间,说明SCoT标记能够揭示菠萝种质间较高的遗传多样性。UPGMA聚类分析显示,SCoT标记能将36份菠萝种质完全区分开,并分成五类。 展开更多
关键词 菠萝 scot 遗传多样性
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澳洲坚果SCoT反应体系的建立及应用 被引量：27
9
作者 蔡元保 杨祥燕 +4 位作者 陈显国 曾黎明 郭凌飞 林玉虹 崔明勇 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期253-258,共6页
为建立澳洲坚果(Macadamia spp.)的SCoT最适反应体系,用单因素设计方法对影响SCoT-PCR反应体系的主要影响因素进行了优化筛选,并构建了澳洲坚果种质的指纹图谱。结果表明,澳洲坚果的SCoT最适反应体系为:反应体系总体积为20μL,包含2.5 m... 为建立澳洲坚果(Macadamia spp.)的SCoT最适反应体系,用单因素设计方法对影响SCoT-PCR反应体系的主要影响因素进行了优化筛选,并构建了澳洲坚果种质的指纹图谱。结果表明,澳洲坚果的SCoT最适反应体系为:反应体系总体积为20μL,包含2.5 mmol L–1Mg2+,0.3 mmol L–1dNTPs,0.8μmol L–1引物,40 mg L–1模板DNA和1.0 U Taq DNA聚合酶。最适退火温度为50℃。该反应体系对澳洲坚果种质具有良好的稳定性、可靠性和较高的分辨率。选用多态性良好的单引物SC5和引物组合SC34+SC39,可以将12份澳洲坚果种质完全区分开,每份种质都各有独特的指纹图谱,置信概率达到99.988%。构建的SCoT反应体系可为澳洲坚果种质鉴定和遗传多样性分析等提供技术支持。 展开更多
关键词 澳洲坚果 scot 单因素试验 体系优化 DNA指纹图谱
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中国鸭茅主栽品种DNA指纹图谱构建 被引量：28
10
作者 蒋林峰 张新全 +4 位作者 黄琳凯 马啸 罗登 张宗瑜 蒙芬 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期604-614,共11页
利用SSR标记和SCoT标记构建了我国主栽的21个鸭茅品种的DNA指纹图谱。从180对SSR引物和80个SCoT引物中,筛选出多态性高、谱带清晰的SSR引物和SCoT引物各24个。24对SSR引物在供试材料中共检测到186个条带,其中多态性条带为175个,品种特... 利用SSR标记和SCoT标记构建了我国主栽的21个鸭茅品种的DNA指纹图谱。从180对SSR引物和80个SCoT引物中,筛选出多态性高、谱带清晰的SSR引物和SCoT引物各24个。24对SSR引物在供试材料中共检测到186个条带,其中多态性条带为175个,品种特异条带6个,平均多态性比率94.03%,多态性信息量均值0.845,Shannon指数变幅0.4479～0.6549,基因多样性指数变幅0.2946～0.4633,可鉴别的品种数2～21个；利用24个SCoT引物在供试材料中共检测到321个条带,其中多态性条带为249个,品种特异条带6个,平均多态性比率76.33%,多态性信息量均值0.907,Shannon指数变幅0.2588～0.6329,基因多样性指数变幅0.1695～0.4451,可鉴别的品种数1～21个；5对SSR引物和5个SCoT引物在10个品种上具有唯一特征谱带,最终综合各项指标筛选出5个引物（A01E14、A01K14、B03E14、D02K13和SCoT23）上的37个条带用于鸭茅品种DNA指纹图谱构建,数据库中每个品种均具有唯一DNA指纹编码,构建的DNA指纹数据可用于鸭茅品种真伪鉴定,为品种权保护提供了科学依据。 展开更多
关键词 鸭茅 主栽品种 SSR scot DNA指纹图谱 遗传多样性
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番木瓜主栽品种SCoT指纹图谱构建及遗传变异分析 被引量：25
11
作者 杨祥燕 蔡元保 +3 位作者 黄秋伟 陈涛 覃剑峰 彭靖茹 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期1756-1761,共6页
利用SCoT标记对中国22个番木瓜主要栽培品种进行遗传多样性分析和指纹图谱构建,为番木瓜品种资源的鉴定和杂交亲本的选配提供技术参考。结果显示：（1）SCoT标记有效等位基因数（Ne）平均为1.47,Nei’s基因多样性指数（H）平均为0.26,Sh... 利用SCoT标记对中国22个番木瓜主要栽培品种进行遗传多样性分析和指纹图谱构建,为番木瓜品种资源的鉴定和杂交亲本的选配提供技术参考。结果显示：（1）SCoT标记有效等位基因数（Ne）平均为1.47,Nei’s基因多样性指数（H）平均为0.26,Shannon’s信息指数（I）平均为0.39,表明SCoT标记具有较高的多态性检测效率。（2）聚类分析和主坐标分析结果表明,大部分番木瓜品种间的遗传相似系数为0.79~0.90,品种间遗传多样性水平较低;在相似性系数为0.75时可将所有品种分为3个组群。（3）6个SCoT引物可以将22个番木瓜品种完全区分开,每个品种都各有独特的指纹图谱,置信概率达到99.976%。 展开更多
关键词 番木瓜 主栽品种 scot 指纹图谱 遗传多样性
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应用SCoT标记分析玄参种质资源的遗传多样性 被引量：23
12
作者 陈大霞 张雪 +1 位作者 王钰 李隆云 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第16期2368-2372,共5页
目的:研究玄参种质资源的遗传多样性及亲缘关系。方法:应用目标起始密码子多态性(SCoT)技术对来源于全国各地的48份玄参种质进行遗传多态性分析。遗传距离采用TREECONW软件计算,UPGMA方法构建亲缘关系树状图。结果:28条引物共检测到279... 目的:研究玄参种质资源的遗传多样性及亲缘关系。方法:应用目标起始密码子多态性(SCoT)技术对来源于全国各地的48份玄参种质进行遗传多态性分析。遗传距离采用TREECONW软件计算,UPGMA方法构建亲缘关系树状图。结果:28条引物共检测到279个位点,其中214个为多态位点,占76.7%。遗传距离变化范围在0.150 7～0.493 3。聚类结果显示栽培玄参亲缘关系较为复杂:有的种质具明显的地理相关性;有的种质聚类混杂,与地理分布无明显相关性;也有来源于同一地区的种质仅部分聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律。结论:栽培玄参的遗传多样性水平较高,为优良品种的培育提供了丰富的遗传基础。 展开更多
关键词 玄参 scot 种质资源 遗传多样性
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冷胁迫下铁皮石斛抗寒相关基因的SCoT差异表达分析 被引量：22
13
作者 李东宾 高燕会 斯金平 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期511-515,共5页
为了探讨铁皮石斛在冷胁迫下相关基因表达差异的分子机制,选用抗寒性较强的铁皮石斛种质,分别构建了冷胁迫处理总RNA混合池,利用反转录cDNA进行SCoT PCR进行差异表达分析。通过64条引物筛选了约500个cDNA片段,获得差异片段11个,并进行... 为了探讨铁皮石斛在冷胁迫下相关基因表达差异的分子机制,选用抗寒性较强的铁皮石斛种质,分别构建了冷胁迫处理总RNA混合池,利用反转录cDNA进行SCoT PCR进行差异表达分析。通过64条引物筛选了约500个cDNA片段,获得差异片段11个,并进行割胶回收、克隆、测序和序列分析。结果表明,利用SCoT方法可以筛选出冷胁迫下铁皮石斛的抗寒相关基因,获得的基因片段分别与膜相关蛋白、渗透调节蛋白、CBF转录因子、抗逆性蛋白有很高的同源性,还有1个基因片段功能未知,可能与铁皮石斛的抗寒有关。 展开更多
关键词 铁皮石斛 冷胁迫 scot 抗寒基因 差异表达
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广西西北部高原地区柿种质资源调查及遗传多样性分析 被引量：22
14
作者 邓立宝 何新华 +1 位作者 李天文 胡颖 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期215-224,共10页
调查和研究了广西西北部云贵高原地区柿种质资源状况,并对收集到的柿种质进行表型系统聚类和SCoT遗传多样性分析。结果表明,广西西北部云贵高原地区柿种质资源较丰富,至少拥有柿、油柿和野柿3个种31个不同品种和类型,部分地方仍保存有... 调查和研究了广西西北部云贵高原地区柿种质资源状况,并对收集到的柿种质进行表型系统聚类和SCoT遗传多样性分析。结果表明,广西西北部云贵高原地区柿种质资源较丰富,至少拥有柿、油柿和野柿3个种31个不同品种和类型,部分地方仍保存有原始的野生种。不同柿种质在形态和DNA水平上都表现出很大的变异,具有丰富的多样性。35个相对独立的表型性状被用于柿种质的Q型系统聚类分析,在欧氏距离D=9.8处,31份种质被分为5组,与果形及种质类型在一定程度上相吻合。13条SCoT多态性引物可从31份柿种质中扩增出161个DNA位点,多态性带比例为95.65%;UPGMA聚类分析显示,SCoT标记能将31份柿种质完全区分开,在相似系数0.686的水平将其分为5大类,与表型分析结果基本一致。 展开更多
关键词 柿 广西 种质资源 scot 遗传多样性
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传播研究与STS如何相遇:以“技术的社会建构”路径为核心的讨论 被引量：22
15
作者 戴宇辰 《新闻大学》 CSSCI 北大核心 2021年第4期15-27,119,共14页
近年来,传播学能否与STS相关联的议题陆续出现在学者们的研究之中。STS对于技术的考察有助于传播研究重新思考媒介技术与社会变迁之间的关联。有鉴于此,本文尝试选取STS传统中的"技术的社会建构"(SCOT)路径来阐释STS对技术的... 近年来,传播学能否与STS相关联的议题陆续出现在学者们的研究之中。STS对于技术的考察有助于传播研究重新思考媒介技术与社会变迁之间的关联。有鉴于此,本文尝试选取STS传统中的"技术的社会建构"(SCOT)路径来阐释STS对技术的独特理解。SCOT对于技术与社会相互嵌入关系的把握,可以为传播研究提供包括"从技术转向使用者""从媒介生产转向媒介消费"以及"从受众效果转向社会影响"三个议题的转变。最后,本文还将探讨对于传播研究而言SCOT的独特性何在。本文认为,将媒介技术的社会性纳入传播研究的版图意味着采取一种包含"文本—物质"维度的"非媒介中心"研究视角。 展开更多
关键词 STS scot 传播研究 非媒介中心视角
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SCoT结合克隆测序鉴别湖南甜橙变异类型 被引量：20
16
作者 蒋巧巧 龙桂友 +1 位作者 李武文 邓子牛 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第6期148-154,共7页
本试验对SCoT反应体系进行优化,并筛选合适的引物,然后对24份试材进行SCoT标记,获得的目的片段克隆测序,通过测序结果探讨其遗传变异;结果表明,甜橙SCoT标记的20μL优化反应体系为:DNA模板80ng,Mg2+浓度1.6mmol/L,dNTPs浓度0.3mmol/L,... 本试验对SCoT反应体系进行优化,并筛选合适的引物,然后对24份试材进行SCoT标记,获得的目的片段克隆测序,通过测序结果探讨其遗传变异;结果表明,甜橙SCoT标记的20μL优化反应体系为:DNA模板80ng,Mg2+浓度1.6mmol/L,dNTPs浓度0.3mmol/L,引物浓度0.2μmol/L,Taq DNA聚合酶用量1.6U,扩增产物在100～2000bp之间,扩增条带明亮清晰,反应体系具有良好的稳定性和可重复性。24份试材的测序片段的大小为1090～1091bp,一致性达到99.84%,存在单碱基的缺失与替换,BLAST结果显示,该序列的编码蛋白质与核糖体蛋白S3的N端同源性高;利用单碱基变异可以区分其中的12个甜橙变异株系和'安江香柚',其他变异株系还需要结合其他的分子标记技术来进行鉴别,有待进一步研究。 展开更多
关键词 甜橙 scot 均匀设计 序列比对
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广西地方葛根种质资源遗传多样性的SCoT分析 被引量：21
17
作者 尚小红 严华兵 +3 位作者 曹升 肖亮 王艳 欧昆鹏 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1311-1317,共7页
为了解广西地方葛根种质资源之间的亲缘关系,本研究以SCoT分子标记对44份广西葛根种质资源的基因组DNA进行PCR扩增,并进行遗传多样性分析。结果表明,25条SCoT引物共扩增出223个条带,其中具有多态性的条带有194条,平均每条引物获得7.76... 为了解广西地方葛根种质资源之间的亲缘关系,本研究以SCoT分子标记对44份广西葛根种质资源的基因组DNA进行PCR扩增,并进行遗传多样性分析。结果表明,25条SCoT引物共扩增出223个条带,其中具有多态性的条带有194条,平均每条引物获得7.76个多态性条带,多态性比例为86.99%。聚类分析表明,44份葛根种质资源的遗传相似系数在0.587～0.982之间。在系数0.65处,44份葛根分为两大类,37号材料单独成为一类;在系数为0.74处,可聚为六类。综上所述,SCoT分子标记适用于葛根种质资源遗传多样性分析,本研究结果为广西葛根种质资源鉴定评价和新品种选育奠定了一定的理论基础。 展开更多
关键词 葛根 广西地方品种 scot 遗传多样性分析
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人工栽培铁皮石斛种质资源遗传多样性的SCoT分析 被引量：18
18
作者 徐旭栋 蒋瑞彬 +4 位作者 蓝小明 颜美秋 丁志山 金波 吕圭源 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期2123-2125,共3页
目的:将目标起始密码子多态性分子标记(SCoT)技术应用于铁皮石斛的遗传多样性研究。方法:采用SCoT分子标记技术和非加权平均距离法(UPGMA)对20份不同来源的人工栽培铁皮石斛样品进行遗传多样性分析。结果:从备选的56个引物中筛选出20个S... 目的:将目标起始密码子多态性分子标记(SCoT)技术应用于铁皮石斛的遗传多样性研究。方法:采用SCoT分子标记技术和非加权平均距离法(UPGMA)对20份不同来源的人工栽培铁皮石斛样品进行遗传多样性分析。结果:从备选的56个引物中筛选出20个SCoT引物,对共扩增共获得226个条带,平均每个引物产生11.3个条带,其中多态性条带204条,多态性比率达到90.3%。结论:本实验发现不同来源的铁皮石斛人工栽培种存在较大的遗传差异,目前药材市场中的人工栽培铁皮石斛遗传多样性丰富,SCoT技术可有效应用于铁皮石斛的遗传多样性研究。 展开更多
关键词 铁皮石斛 遗传多样性 scot
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新疆枸杞种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 被引量：19
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作者 查美琴 赵玉玲 +3 位作者 李疆 朱瑜 罗淑萍 胡月 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期1065-1071,共7页
利用SCoT分子标记对新疆枸杞种质资源进行遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建,为杂交育种和种质鉴定提供理论依据。结果显示：9条SCoT引物扩增出条带256条,其中219条为多态性条带,多态性比率达85.62%,多态性信息含量（PIC）值变化范围在0.... 利用SCoT分子标记对新疆枸杞种质资源进行遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建,为杂交育种和种质鉴定提供理论依据。结果显示：9条SCoT引物扩增出条带256条,其中219条为多态性条带,多态性比率达85.62%,多态性信息含量（PIC）值变化范围在0.77-0.91之间,平均值为0.85,观测等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei＇s基因多样性指数（H）和Shannon信息指数（I）的平均值分别为1.8562、1.4350、0.2611、0.3989,聚类分析表明,遗传相似系数变化范围在0.5938-0.8398之间,在遗传相似系数为0.66和0.71处,可将30份材料分别分为2大类和4个亚类,主坐标分析结果和聚类结果基本一致,同时利用5条多态性SCoT引物构建了30份材料的DNA指纹图谱。新疆枸杞种质资源遗传多样性水平较高,且SCoT分子标记适于新疆枸杞种质资源遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建,该研究结果为新疆枸杞种质资源评价、鉴定和新品种选育奠定了基础。 展开更多
关键词 枸杞 scot 种质资源 遗传多样性 DNA指纹图谱
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利用SCoT标记分析不同秋眠型苜蓿的遗传多样性 被引量：18
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作者 何庆元 王吴斌 +3 位作者 杨红燕 向仕华 周丽英 王松华 《草业学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期133-140,共8页
用L16(45)正交实验设计研究模板DNA、dNTPs、Mg2+、Taq酶和引物5个因素的浓度对SCoT扩增迁移率重现率的影响。结果表明,在20μL反应体系中,2.5ng/μL DNA、1.00mmol/L Mg2+、1.20U Taq酶、0.40mmol/L dNTPs和0.30μmol/L浓度的引物最为... 用L16(45)正交实验设计研究模板DNA、dNTPs、Mg2+、Taq酶和引物5个因素的浓度对SCoT扩增迁移率重现率的影响。结果表明,在20μL反应体系中,2.5ng/μL DNA、1.00mmol/L Mg2+、1.20U Taq酶、0.40mmol/L dNTPs和0.30μmol/L浓度的引物最为稳定,重现率达到100%。利用最优反应体系从50条引物中筛选出13条扩增效果好的引物,将它们分别扩增34个苜蓿品种,共检测到103个SCoT标记,其中92个位点具有多态性。聚类分析表明,从安徽和江苏两地收集的野生南苜蓿和栽培苜蓿的遗传距离最远,单独聚为一类;其余32个品种苜蓿在相似系数0.757附近分为3个亚群,秋眠型苜蓿品种主要分布在第Ⅱ亚群中,半秋眠型在3个亚群中都有分布,而非秋眠型苜蓿分布在第一和第二亚群中,表明SCoT标记的聚类结果在一定程度上能够反映苜蓿的秋眠型,但并不完全一致。 展开更多
关键词 苜蓿 scot 条件优化 秋眠型 遗传多样性
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