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急性损伤所致膝关节软骨下骨髓病变与被覆软骨T2弛豫时间变化的磁共振研究 被引量：5
1
作者 陈凯 徐凯 +4 位作者 王佳丽 韩曙光 鹿彩銮 张秀莉 孟闫凯 《中国医学计算机成像杂志》 CSCD 北大核心 2015年第4期367-371,共5页
目的:利用T2弛豫时间图(T2 mapping)技术测量膝关节急性损伤后软骨下骨髓病变(subchondral bone marrow lesion,SBML)被覆软骨的T2弛豫时间(T2 relaxation time,T2 RT),并初步探讨膝关节急性损伤后SBML与被覆软骨T2 RT之间的关系及临床... 目的:利用T2弛豫时间图(T2 mapping)技术测量膝关节急性损伤后软骨下骨髓病变(subchondral bone marrow lesion,SBML)被覆软骨的T2弛豫时间(T2 relaxation time,T2 RT),并初步探讨膝关节急性损伤后SBML与被覆软骨T2 RT之间的关系及临床意义。方法:收集因急性损伤及临床诊断骨性关节炎(osteoathritis,OA)所致膝关节疼痛前来就诊58例患者,将其分为急性损伤组28例,OA组30例。另外选择20例健康志愿者膝关节作为正常对照组。将膝关节软骨分为三个分区:髌骨软骨、股骨髁软骨及胫骨平台软骨。正常对照组中分别测量三个分区内软骨的平均T2 RT。在急性损伤组和OA组中,测量SBML被覆软骨的T2 RT以及急性损伤组中邻近非SBML区域被覆软骨的T2 RT,并进行比较。测量急性损伤组中SBML的体积,且与其被覆软骨T2 RT进行相关性分析。结果:在正常对照组中,三个膝关节软骨分区内髌骨软骨的T2RT较股骨髁软骨、胫骨平台软骨偏低(P<0.05)。急性损伤组SBML被覆软骨的T2 RT较正常对照组膝关节软骨以及急性损伤组中非SBML被覆软骨的T2 RT升高(P<0.05),而与OA组SBML被覆软骨之间的T2 RT比较无统计学意义(P>0.05);急性损伤组SBML体积与其被覆软骨的T2 RT之间无相关性。结论:利用T2mapping技术测量软骨T2 RT可以发现急性损伤后膝关节SBML被覆软骨在形态变化之前的内部改变;并且提示其可能存在更高发生OA的风险。 展开更多
关键词 膝关节 软骨 T2弛豫时间 软骨下骨髓病变 急性损伤 骨性关节炎
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基于TGG的SBML与其他生物建模语言间的自动转换研究 被引量：1
2
作者 朱世佳 王亚东 +1 位作者 季春光 陶海军 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2011年第5期885-896,共12页
基于XSLT技术的SBML与其他生物建模语言之间的转换方法存在无法保证转换结果的确定性、语法正确性及不能满足模型转换的工业化需求等缺陷.针对以上问题,提出了利用图文法定义SBML Schema及其他生物建模语言,并且利用Triple Graph Gramma... 基于XSLT技术的SBML与其他生物建模语言之间的转换方法存在无法保证转换结果的确定性、语法正确性及不能满足模型转换的工业化需求等缺陷.针对以上问题,提出了利用图文法定义SBML Schema及其他生物建模语言,并且利用Triple Graph Grammar构造SBML与其他建模语言之间的转换方法.在此基础上,提出了一种基于单路径尝试条件的转换算法,该算法具有多项式时间复杂性,能够保证转换目标对象的确定性与语法正确性,给出了相关证明,并且讨论了该条件在生物模型转换中的适用性.与传统方法相比,该方法利用可视化方法实现转换,简化了定义过程;无需动态检查转换过程,只要转化规则正确即可保证转换结果正确;同时支持扩增传播以及模型间双向转换.最后,通过Petri网与SBML之间的转换例子证实了该算法的正确性与有效性. 展开更多
关键词 sbml 模型转换 TGG 图文法 XML
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基于Web的代谢网络仿真环境
3
作者 张升蓉 罗若愚 +2 位作者 刘谦 李亦学 骆清铭 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2006年第36期97-99,共3页
针对实时服务的需求和大规模代谢网络的大计算量,构建了一个基于集群系统的多层体系结构的代谢网络仿真环境,主要采用Applet技术、系统生物学描述语言(SBML)、Servlet与Applet之间的通信技术、线程池技术和负载平衡机制来实现。基于这... 针对实时服务的需求和大规模代谢网络的大计算量,构建了一个基于集群系统的多层体系结构的代谢网络仿真环境,主要采用Applet技术、系统生物学描述语言(SBML)、Servlet与Applet之间的通信技术、线程池技术和负载平衡机制来实现。基于这个仿真环境,结合已有的代谢网络仿真技术,提供了一个远程在线的代谢网络的仿真服务。该仿真环境不仅便于升级和维护,而且具有平台无关性、强大的计算性能和对重负荷的支持能力。 展开更多
关键词 多层体系结构 APPLET SERVLET sbml 线程池 负载平衡机制
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系统生物模型转换研究——从SBML到Stochastic Pi Calculus 被引量：1
4
作者 董驻鹏 董笑菊 倪佳华 《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第8期1280-1283,共4页
分析了系统生物标记语言(SBML)模型和用随机Pi演算对生物建模(BioSPI)的不同特点,给出了两种模型之间转换的一系列处理规则;在规则的指导下将具体的SBML模型转换为BioSPI表示的程序语言,并借助分析工具来模拟该SBML模型运动变化过程.提... 分析了系统生物标记语言(SBML)模型和用随机Pi演算对生物建模(BioSPI)的不同特点,给出了两种模型之间转换的一系列处理规则;在规则的指导下将具体的SBML模型转换为BioSPI表示的程序语言,并借助分析工具来模拟该SBML模型运动变化过程.提出了自动实现转换的方法以及将转换扩展到其他进程演算形式的构想. 展开更多
关键词 系统生物 系统生物标记语言 随机Pi演算对生物建模 形式化方法 DNA计算机
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