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SARS冠状病毒主蛋白酶抑制剂的筛选及抑制动力学研究 被引量:3
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作者 朱云鹏 王鹏 +2 位作者 夏博然 唐延婷 王权 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期35-42,共8页
对SARS冠状病毒主蛋白酶(SARS-Co V M^(pro))进行异源重组表达与提纯,并以其为靶点,利用基于荧光共振能量转移(FRET)技术的体外药物筛选模型, 对蛋白酶抑制剂聚焦库96种化合物进行了体外抑制活性的评价,并从动力学的角度探讨筛选出的阳... 对SARS冠状病毒主蛋白酶(SARS-Co V M^(pro))进行异源重组表达与提纯,并以其为靶点,利用基于荧光共振能量转移(FRET)技术的体外药物筛选模型, 对蛋白酶抑制剂聚焦库96种化合物进行了体外抑制活性的评价,并从动力学的角度探讨筛选出的阳性化合物对SARS-CoV M^(pro)的抑制能力与机制。结果表明:通过筛选获得抑制率>80%、淬灭率<20%的化合物5种,为P-1-08、P-1-19、P-2-24、P-2-28、P-2-54,其半数有效抑制浓度(IC_(50))分别为:0.69±0.05μmol/L、1.19±0.41μmol/L、0.14±0.01μmol/L、1.36±0.07μmol/L、0.36±0.03μmol/L。其中化合物P-1-08、P-1-19、P-2-24、P-2-54对SARS冠状病毒主蛋白酶的抑制作用为不可逆抑制,化合物P-2-28的抑制作用为可逆抑制。根据Lineweaver-Burk图和Dixon图的研究,发现化合物P-2-28对SARS冠状病毒主蛋白酶呈竞争性抑制,抑制常数Ki为0.81μmol/L。通过对底物浓度,IC_(50)值及Ki值关系的研究,进一步验证了P-2-28的抑制作用为竞争性抑制。该抑制剂的发现为SARS冠状病毒主蛋白酶抑制剂的研究打下基础,为抗SARS病毒药物开发提供了先导化合物。 展开更多
关键词 sars冠状病毒蛋白酶 高通量药物筛选 抑制剂 动力学
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SARS冠状病毒主蛋白酶可切割多肽的搜索与生物信息学的应用
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作者 孙浩 杜奇石 +2 位作者 王树青 谢军民 李大鹏 《湘潭大学自然科学学报》 CAS CSCD 2004年第4期80-84,共5页
用新近发展的冠状病毒的基因解析软件系统ZCURVE -CoV 1 .0和ZCURVE -CoV 2 .0(http ://tubic .tju .edu .cn/sars/)分析了基因库 (NCBIRefSeqproject)中的 2 7个不同来源的SARS冠状病毒的RNA基因序列 ,找出了主蛋白酶 (CoVMpro)在聚蛋... 用新近发展的冠状病毒的基因解析软件系统ZCURVE -CoV 1 .0和ZCURVE -CoV 2 .0(http ://tubic .tju .edu .cn/sars/)分析了基因库 (NCBIRefSeqproject)中的 2 7个不同来源的SARS冠状病毒的RNA基因序列 ,找出了主蛋白酶 (CoVMpro)在聚蛋白pp1a和pp1ab中的 2 97个酶切位点 .在此基础上确定的 1 1个SARS冠状病毒主蛋白酶的可切割八肽 .这些八肽都含有SARSCoVMpro 的真实切割点 ,因而是发展SARSCoVMpro的多肽类抑制剂的适宜出发点 .计算了可切割八肽在特异性位点R2、R1、和R1上的氨基酸的分布概率 ,发现位点R4和R3也有一定的特异性 .分析了这些位点上的氨基酸的结构特征 ,找出了最有希望成为SARSCoVMpro的多肽类抑制剂的两个八肽NH2 -ATLQ↓AIAS-COOH和NH2 -ATLQ↓AENV -COOH ,并探讨了对可切割八肽作化学修饰的思路 ,为SARSCoVMpro的多肽类抑制剂和非肽类抑制剂的设计提供了基础 .同时把生物信息学用于药物开发 。 展开更多
关键词 sars sars冠状病毒蛋白酶 多肽的剪切性 抑制剂 变形钥匙
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SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂的理论研究 被引量:5
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作者 王嵩 黄旭日 +2 位作者 高雪峰 赵熹 孙家锺 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第3期535-537,共3页
应用AutoDock程序将SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂配体和受体进行了对接,并用InsightⅡ中的Discover3模块进行了分子动力学模拟,分析了蛋白酶活性口袋的形状,讨论了其亚基的氢键、静电、疏水等相互作用,为进一步设计药物提供了重要... 应用AutoDock程序将SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂配体和受体进行了对接,并用InsightⅡ中的Discover3模块进行了分子动力学模拟,分析了蛋白酶活性口袋的形状,讨论了其亚基的氢键、静电、疏水等相互作用,为进一步设计药物提供了重要的参考信息. 展开更多
关键词 sars冠状病毒3CL蛋白酶 抑制剂 对接 分子动力学模拟
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非肽类SARS冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂的设计与活性表征 被引量:3
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作者 刘莹 郑腾飞 +4 位作者 金凤 周璐 刘振明 魏平 来鲁华 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第16期1707-1712,共6页
SARS冠状病毒3CL蛋白酶是SARS病毒复制过程中的主要蛋白酶,针对其开展药物设计有望得到有效的抗SARS病毒药物.本文基于SARS冠状病毒3CL蛋白酶的三维结构,对现有化学试剂及临床用药数据库进行虚拟筛选,选出可能对SARS冠状病毒3CL蛋白酶... SARS冠状病毒3CL蛋白酶是SARS病毒复制过程中的主要蛋白酶,针对其开展药物设计有望得到有效的抗SARS病毒药物.本文基于SARS冠状病毒3CL蛋白酶的三维结构,对现有化学试剂及临床用药数据库进行虚拟筛选,选出可能对SARS冠状病毒3CL蛋白酶有抑制的非肽化合物进行初步活性测试,并研究了已知的人鼻病毒3C蛋白酶抑制剂对SARS冠状病毒3CL蛋白酶的活性,合成了两种母环的衍生物,得到靛红和哌嗪两类SARS冠状病毒3CL蛋白酶的抑制剂,其中一个靛红类化合物的IC50为0.76μmol·L-1;而抗组胺药哌嗪类化合物对SARS冠状病毒3CL蛋白酶及细胞培育的SARS病毒的抑制作用,提示了老药可以开发出新的用途. 展开更多
关键词 sars冠状病毒3CL蛋白酶 虚拟筛选 非肽抑制剂 活性测试
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