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刺槐Kuntiz型胰蛋白酶抑制剂基因(RpKTI)的克隆及表达分析
1
作者
张晓静
董启迪
+2 位作者
王霞
张晓娜
周建
《山东农业科学》
北大核心
2022年第6期10-19,共10页
为了解刺槐(Robinia pseudoacacia)Kuntiz型胰蛋白酶抑制剂基因(RpKTI)的功能,本试验提取刺槐叶片中RNA,采用RACE PCR技术克隆RpKTI基因序列全长,并对其进行生物信息学分析及表达分析。结果表明,RpKTI基因的开放阅读框(ORF)长度为633 bp...
为了解刺槐(Robinia pseudoacacia)Kuntiz型胰蛋白酶抑制剂基因(RpKTI)的功能,本试验提取刺槐叶片中RNA,采用RACE PCR技术克隆RpKTI基因序列全长,并对其进行生物信息学分析及表达分析。结果表明,RpKTI基因的开放阅读框(ORF)长度为633 bp,共编码210个氨基酸,分子式为C_(1039)H_(1586)N_(258)O_(307)S_(5),是一个稳定的酸性疏水蛋白;在氨基酸序列的N端存在一个跨膜区,且在此跨膜区内含有信号肽;具有11个磷酸化位点及1个N-糖基化位点;二、三级结构均以延伸链及无规则卷曲为主。同源性及进化树分析表明,RpKTI基因属于STI超级家族,与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的KTI基因亲缘关系更近。通过实时荧光定量(qRT-PCR)分析发现RpKTI基因在铅镉混合胁迫3 d时,叶中的表达量最高,推测此基因可能在重金属铅镉胁迫下发挥重要作用。本研究为后期RpKTI基因的功能验证及应用研究奠定了理论基础。
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关键词
刺槐
rpkti
基因
基因
克隆
生物信息学分析
表达分析
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职称材料
题名
刺槐Kuntiz型胰蛋白酶抑制剂基因(RpKTI)的克隆及表达分析
1
作者
张晓静
董启迪
王霞
张晓娜
周建
机构
河南科技学院园艺园林学院
长垣市林业局
河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心
出处
《山东农业科学》
北大核心
2022年第6期10-19,共10页
基金
河南省科技攻关项目“刺槐修复铅镉污染土壤的双向调控关键技术研究及应用”(202102110053)。
文摘
为了解刺槐(Robinia pseudoacacia)Kuntiz型胰蛋白酶抑制剂基因(RpKTI)的功能,本试验提取刺槐叶片中RNA,采用RACE PCR技术克隆RpKTI基因序列全长,并对其进行生物信息学分析及表达分析。结果表明,RpKTI基因的开放阅读框(ORF)长度为633 bp,共编码210个氨基酸,分子式为C_(1039)H_(1586)N_(258)O_(307)S_(5),是一个稳定的酸性疏水蛋白;在氨基酸序列的N端存在一个跨膜区,且在此跨膜区内含有信号肽;具有11个磷酸化位点及1个N-糖基化位点;二、三级结构均以延伸链及无规则卷曲为主。同源性及进化树分析表明,RpKTI基因属于STI超级家族,与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的KTI基因亲缘关系更近。通过实时荧光定量(qRT-PCR)分析发现RpKTI基因在铅镉混合胁迫3 d时,叶中的表达量最高,推测此基因可能在重金属铅镉胁迫下发挥重要作用。本研究为后期RpKTI基因的功能验证及应用研究奠定了理论基础。
关键词
刺槐
rpkti
基因
基因
克隆
生物信息学分析
表达分析
Keywords
Robinia pseudoacacia
rpkti
gene
Gene cloning
Bioinformatics analysis
Expression analysis
分类号
S792.27 [农业科学—林木遗传育种]
Q786 [农业科学—林学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
刺槐Kuntiz型胰蛋白酶抑制剂基因(RpKTI)的克隆及表达分析
张晓静
董启迪
王霞
张晓娜
周建
《山东农业科学》
北大核心
2022
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