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连作对马铃薯根际土壤细菌群落结构的影响 被引量：10
1
作者 李国庆 郭华春 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期914-928,共15页
本研究利用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析技术,对长期施肥与不施肥的连作马铃薯根际土壤细菌群落结构与功能进行研究。结果表明连作马铃薯在长期施肥与不施肥下,根际土壤细菌群落种类和数量发生显著变化,与对照土壤(CK)相比,有... 本研究利用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析技术,对长期施肥与不施肥的连作马铃薯根际土壤细菌群落结构与功能进行研究。结果表明连作马铃薯在长期施肥与不施肥下,根际土壤细菌群落种类和数量发生显著变化,与对照土壤(CK)相比,有益细菌种类和数量均增加,但长期不施肥土壤中有害细菌数量高于长期施肥土壤。与长期不施肥相比,长期施肥对土壤养分利用率较高,与土壤细菌群落种类和数量PS>PNS>CK的变化趋势相一致。因此,连作马铃薯在长期施肥条件下,在一定程度上可以改善土壤养分状况,促进土壤有益微生物的活动,减少根际产生致病菌,但不能从根本上消除马铃薯连作障碍,可能还与其根系分泌物密切相关。今后可对根际土壤微生物、土壤养分和根系分泌物等土壤生态因子之间进行综合研究,从根本上解决马铃薯连作障碍。 展开更多
关键词 马铃薯 连作 根际土壤细菌 末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP) 群落结构 施肥
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香葱伴生番茄对青枯病及根际微生态特征的影响 被引量：1
2
作者 佘小漫 姚挺 +1 位作者 黄真珍 何自福 《广东农业科学》 CAS 2024年第1期10-20,共11页
【目的】为明确香葱伴生对番茄青枯病及根际微生态特征的影响,揭示香葱伴生番茄降低青枯病发病率的机理。【方法】通过田间试验设置番茄单作和香葱伴生番茄2个处理,分别采集单作发病番茄(QK)、单作健康番茄(NBS)和香葱伴生番茄(BS)的根... 【目的】为明确香葱伴生对番茄青枯病及根际微生态特征的影响,揭示香葱伴生番茄降低青枯病发病率的机理。【方法】通过田间试验设置番茄单作和香葱伴生番茄2个处理,分别采集单作发病番茄(QK)、单作健康番茄(NBS)和香葱伴生番茄(BS)的根际土壤,应用16S rDNA高通量测序和液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术,探究香葱伴生对番茄根际微生态特征的影响。【结果】田间试验结果表明,番茄单作处理和香葱伴生番茄处理的青枯病平均病株率分别为50.48、31.43%,香葱伴生番茄处理对番茄青枯病的防治效果为37.74%。16S rDNA高通量测序结果表明,BS、NBS根际土壤细菌群落相对丰度和多样性均显著高于QK;与QK相比,BS和NBS根际土壤细菌茄科雷尔氏菌属相对丰度显著降低,而芽孢杆菌属相对丰度升高;与NBS相比,BS根际土壤细菌茄科雷尔氏菌属相对丰度降低,芽孢杆菌属相对丰度显著提高。利用LC-MS技术共鉴定出番茄根际土壤代谢物586种,其中正离子模式代谢物320种,负离子模式代谢物266种,并将代谢物的功能注释至新陈代谢、遗传信息加工和环境信息加工等代谢通路;与NBS相比,BS根际土壤代谢物中的缬氨酸、L-天冬酰胺和柠檬酸的含量均显著降低,L-赖氨酸、谷氨酸、D-谷氨酰胺和异亮氨酸的含量也低于NBS,但差异未达到显著水平。【结论】香葱伴生番茄显著降低番茄青枯病田间发病率,改变了番茄根际土壤中细菌群落结构和番茄根际土壤代谢物含量。 展开更多
关键词 香葱伴生 番茄青枯病 根际土壤细菌 根际土壤代谢物 防效
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普洱地区茶叶内生细菌与根际土壤细菌群落结构分析 被引量：6
3
作者 王桥美 严亮 +5 位作者 杨瑞娟 彭文书 季爱兵 刘丽 张文杰 胡先奇 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期703-714,共12页
【目的】茶叶内生细菌、根际土壤细菌在普洱茶的发酵中起着重要的作用,还可以促进茶树生长,诱导茶树抗病性。研究其群落结构组成及相互关系可为微生物资源开发利用提供理论依据。【方法】本研究以普洱地区茶树叶片和根际土壤为材料,采... 【目的】茶叶内生细菌、根际土壤细菌在普洱茶的发酵中起着重要的作用,还可以促进茶树生长,诱导茶树抗病性。研究其群落结构组成及相互关系可为微生物资源开发利用提供理论依据。【方法】本研究以普洱地区茶树叶片和根际土壤为材料,采用高通量测序技术,对茶叶及根际土壤细菌的16S核糖体RNA基因(16S rRNA)进行测序,比较分析茶叶与根际土壤细菌的群落结构组成。【结果】结果表明,茶叶内生细菌主要由76个属组成,归属于9个门。相对丰度较高的门是厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)。相对丰度较高的属为乳杆菌属(Lactobacillus)、布劳特氏菌属(Blautia)、粪杆菌属(Faecalibacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)、红球菌属(Rhodococcus)、拟杆菌属(Bacteroide)和普雷沃氏菌属(Prevotella)。根际土壤细菌主要由198个属组成,归属于10个门,相对丰度较高的门是变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)和放线菌门(Actinobacteria)。相对丰度较高的属与茶叶中的高丰度属相似,但在两者中的相对丰度有所差异。茶叶内生细菌物种丰度和多样性显著低于根际土壤细菌,但超过50%的茶叶内生细菌同时存在根际土壤中。【结论】通过对普洱地区茶叶内生细菌及根际土壤细菌的群落结构组成分析,明确了茶叶内生细菌与根际土壤细菌的共性与差异,为普洱茶品质改良和生物菌肥开发研究奠定了基础。 展开更多
关键词 茶树 茶叶内生细菌 根际土壤细菌 16S rRNA测序
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环境因子对西藏野生手掌参根际土壤细菌群落结构的影响
4
作者 尹秀 张二豪 +4 位作者 李谊 普姆 刘亚可 禄亚洲 兰小中 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期835-843,共9页
[目的]探究环境因子对西藏野生手掌参根际土壤细菌群落结构的影响。[方法]选取废弃木材厂(FM)、林芝观景台(LZ)、林海观景台(LH)和雷达站(LD)4个采样点采集土壤样品,采用高通量测序技术分析不同海拔手掌参根际土壤细菌群落多样性和群落... [目的]探究环境因子对西藏野生手掌参根际土壤细菌群落结构的影响。[方法]选取废弃木材厂(FM)、林芝观景台(LZ)、林海观景台(LH)和雷达站(LD)4个采样点采集土壤样品,采用高通量测序技术分析不同海拔手掌参根际土壤细菌群落多样性和群落结构特征及不同环境因子对其多样性和结构的影响。[结果]所有样品共检测32门、90纲、224目、378科和693属细菌,变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)为优势门,慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和金黄杆菌属(Chryseobacterium)为优势属。随着海拔的升高,手掌参根际土壤细菌群落多样性和丰富度增加,且不同采样点土壤细菌群落多样性的组间差异大于组内差异。[结论]海拔、总钾(TK)、pH和电导率(EC)显著影响根际土壤细菌群落在门水平的组成,总钾(TK)、总磷(TP)和海拔3种环境因子对土壤细菌群落组成在属水平上的影响更明显。 展开更多
关键词 手掌参 环境因子 根际土壤细菌 群落多样性 群落结构
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茶树根和叶内生细菌的多样性及来源分析
5
作者 林海燕 刘昌伟 +4 位作者 杨勇 张志旭 曾超珍 伍岗 刘仲华 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2023年第6期675-683,共9页
以碧香早和茗丰作为研究对象,采用高效液相色谱等方法测定茶叶中的化学成分,并运用高通量测序技术对比分析不同茶树品种的鲜叶和根部的微生物群落。结果显示:碧香早和茗丰茶鲜叶的优势细菌门为Proteobacteria、Bacteroidetes等,优势细... 以碧香早和茗丰作为研究对象,采用高效液相色谱等方法测定茶叶中的化学成分,并运用高通量测序技术对比分析不同茶树品种的鲜叶和根部的微生物群落。结果显示:碧香早和茗丰茶鲜叶的优势细菌门为Proteobacteria、Bacteroidetes等,优势细菌属为Chryseobacterium、Sphingomonas、Rhizobium、Methylobacterium和Aureimonas等;茶树根系中的优势细菌门主要是Proteobacteria、Actinobacteria和Firmicutes等,优势细菌属为Planococcaceae、Rhizobium和Sphingomona;碧香早叶片中内生菌群的丰富度高于茗丰的,茗丰根系中的内生菌丰富度高于碧香早的;茶树根系内生细菌的多样性高于茶鲜叶的;茶树根和叶的内生菌OTU数少于土壤微生物的;同源性分析表明,茶树叶片内生菌主要来源于叶表,而根部内生细菌主要来自土壤;茗丰鲜叶中的茶氨酸、氨基酸、可可碱、咖啡碱、儿茶素、没食子儿茶素没食子酸酯、表没食子儿茶素没食子酸酯、麦芽糖含量均显著高于碧香早的,碧香早鲜叶中的表没食子儿茶素、蔗糖含量和酚氨比显著高于茗丰的;相关性分析结果显示,部分关键细菌属的相对丰度与茶叶中的部分化学成分的含量呈显著正相关或负相关,推测不同的内生菌群可能参与了茶树品质成分的合成,从而影响茶叶的品质。 展开更多
关键词 茶树 内生细菌 根际土壤细菌 化学成分 茶叶品质
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西藏林芝市油菜根际细菌群落特征分析 被引量：3
6
作者 杜娟 聂丽妍 +2 位作者 魏丽萍 王瑞琪 巩文峰 《高原农业》 2022年第1期16-28,共13页
为了探究西藏林芝市油菜根际细菌群落组成、多样性及与土壤因子的相关性,揭示林芝市油菜根际细菌群落特征,本研究对林芝市18个采样点油菜根际土壤样品进行收集,并采用16S rRNA基因的V3-V4区高通量测序技术对其细菌群落的组成和多样性进... 为了探究西藏林芝市油菜根际细菌群落组成、多样性及与土壤因子的相关性,揭示林芝市油菜根际细菌群落特征,本研究对林芝市18个采样点油菜根际土壤样品进行收集,并采用16S rRNA基因的V3-V4区高通量测序技术对其细菌群落的组成和多样性进行测定分析。结果表明,林芝油菜根际土壤细菌群落中优势菌门为放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Acidobacteria),其中放线菌门在各样点间显著差异;通过线性判别分析(LEfSe),巴宜区和工布江达县具有最多的生物标志物和最高的分类群水平,同为17个,米林县最少;PCoA分析和CPCoA分析显示林芝3个地点油菜根际细菌多样性存在差异。冗余分析(RDA)结果表明铵态氮(NH_(4)^(+))、可溶性P(AP)、总氮(TN)、C_N、蔗糖酶(Sucrase)和有机质(O_M)是影响根际土壤群落最重要的因素,而海拔(Altitude)和NO_(3)^(-)对根际土壤群落影响次之,pH对根际土壤群落影响最小。本研究为掌握林芝市油菜根际土壤微生物群落结构提供了数据支持,为进一步利用高原油菜根际微生物提供了参考。 展开更多
关键词 油菜 根际土壤细菌 群落特征 多样性 冗余分析
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遮阴胁迫对麦冬和多年生黑麦草根际土壤细菌群落结构和多样性的影响 被引量：4
7
作者 罗艺岚 赵东豪 +3 位作者 孙鹏越 高金柱 呼天明 付娟娟 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1204-1212,共9页
为探究麦冬(Ophiopogon japonicus(Linn.f.)Ker-Gawl.,缩写为OJ)和多年生黑麦草(Lolium perenne L.,缩写为LP)根际土壤微生物群落对遮阴胁迫的响应机制,本试验利用Illumina HiSeq2500测序平台,以16S rRNA基因为标靶进行相关研究。结果表... 为探究麦冬(Ophiopogon japonicus(Linn.f.)Ker-Gawl.,缩写为OJ)和多年生黑麦草(Lolium perenne L.,缩写为LP)根际土壤微生物群落对遮阴胁迫的响应机制,本试验利用Illumina HiSeq2500测序平台,以16S rRNA基因为标靶进行相关研究。结果表明:遮阴改变OJ和LP土壤中硝态氮、铵态氮、全磷、全钾、速效钾和速效磷含量;遮阴显著改变OJ和LP根际土壤细菌群落组成,但是对其多样性影响不显著;OJ和LP根际土壤中变形菌门(Proteobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)为主要优势菌群,相对丰度分别为26.34%~35.23%,19.79%~24.24%和19.03%~24.49%,19.20%~32.96%。遮阴导致OJ根际土壤中变形菌门、绿弯菌门(Chloroflexi)和疣微菌门(Verrucomicrobia)的丰度降低,而LP根际土壤中其相对丰度显著高于OJ。相关性分析表明:土壤速效钾、全氮是影响OJ根际土壤细菌群落结构的主要原因,而铵态氮、硝态氮、全氮是影响LP根际土壤细菌群落结构的主要原因。因此可得出,遮阴改变了OJ和LP土壤的理化性质,改变了其根际土壤中优势细菌类群组成,而植物本身对土壤细菌群落组成的影响强于遮阴胁迫。 展开更多
关键词 遮阴胁迫 根际土壤微生物 麦冬 多年生黑麦草
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元阳梯田水稻品种‘月亮谷’根系内生及根际细菌的群落结构 被引量：2
8
作者 赵丹 赵娟 +5 位作者 刘涛 黄惠川 廖静静 靳百慧 朱有勇 何霞红 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2017年第1期17-26,共10页
为了解元阳梯田传统水稻品种‘月亮谷’的根系内生及根际土壤的细菌群落结构,本研究以现代品种‘楚粳27’为对照,分别在云南省元阳县和建水县开展种植试验。结果显示:通过菌落分离,共得到202个菌株,结合形态特征、生理生化特性及16s rDN... 为了解元阳梯田传统水稻品种‘月亮谷’的根系内生及根际土壤的细菌群落结构,本研究以现代品种‘楚粳27’为对照,分别在云南省元阳县和建水县开展种植试验。结果显示:通过菌落分离,共得到202个菌株,结合形态特征、生理生化特性及16s rDNA对其进行初步鉴定研究,可分离到11个种和8个属;聚类分析结果表明:元阳县种植的水稻根系内生细菌的相似水平比建水县的低0.202,但其丰富度更高,差异更大;从0.890的相似水平划分,建水县种植的水稻根际土壤细菌聚为一类,较单一,表明元阳县水稻生长的微生物多样性较丰富。比较两个水稻品种在两个地点的根系内生细菌和根际土壤细菌的相对分离频率发现:假单胞菌属(Pseudomonas sp.)为优势属和共有属,恶臭假单胞菌(P.putida)是两个品种在两个地点种植的共有种,两个地点种植的‘月亮谷’,其根系和根际土壤中均能分离到荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)。研究初步表明‘月亮谷’在两个不同生态环境种植其根系内生细菌和根际土壤细菌的差异,从土壤微生态的角度阐述了‘月亮谷’能够在哈尼梯田持续种植的原因。 展开更多
关键词 内生细菌 根际土壤细菌 水稻传统品种 '月亮谷’
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接种大豆根瘤菌对大豆根际土壤细菌区系的影响
9
作者 牛彦波 吴皓琼 +1 位作者 安琦 王笑庸 《黑龙江科学》 2019年第6期20-21,25,共3页
本研究采用illumina Miseq高通量测序技术,对接种大豆根瘤菌与不接种大豆根瘤菌的大豆根际土壤进行总细菌DNA的提取,对细菌16srRNA高可变区V4～V5进行序列分析,对土壤中的细菌群落进行比较性分析。以不施肥的大豆根际土壤为参照,在施入... 本研究采用illumina Miseq高通量测序技术,对接种大豆根瘤菌与不接种大豆根瘤菌的大豆根际土壤进行总细菌DNA的提取,对细菌16srRNA高可变区V4～V5进行序列分析,对土壤中的细菌群落进行比较性分析。以不施肥的大豆根际土壤为参照,在施入不同根瘤菌处理后,分析大豆根际土壤的细菌区系在门、纲、目、科、属、种的分类群方面是否有差异改变,从分子生物学的角度来揭示黑龙江黑土土壤环境中外源根瘤菌对土壤微生物环境的影响。结果显示:与不接种根瘤菌的秋季土壤为参照,接种适宜的根瘤菌制剂能够丰富大豆根际土壤细菌群落,而不适宜的根瘤菌制剂不能对根际土壤环境有大的影响。由此说明,外源接种大豆根瘤菌引起根际土壤细菌的改变可能需要外源根瘤菌与大豆根系形成共生固氮关系,否则其对土壤群落的影响有限。 展开更多
关键词 接种 大豆根瘤菌 根际土壤细菌 区系影响
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不同蔬菜根际细菌群落多样性及轮作效应 被引量：3
10
作者 刘守伟 于慧颖 吴凤芝 《北方园艺》 CAS 北大核心 2012年第12期103-106,共4页
以设施内常用的黄瓜、菜豆、番茄和芹菜为试材,采用PCR-DGGE技术,研究了7种轮作栽培模式对其土壤细菌群落结构多样性的影响。结果表明:第1茬3种蔬菜中番茄和黄瓜的根际土壤细菌群落结构多样性差异不显著,都极显著高于菜豆(P<0.01);第... 以设施内常用的黄瓜、菜豆、番茄和芹菜为试材,采用PCR-DGGE技术,研究了7种轮作栽培模式对其土壤细菌群落结构多样性的影响。结果表明:第1茬3种蔬菜中番茄和黄瓜的根际土壤细菌群落结构多样性差异不显著,都极显著高于菜豆(P<0.01);第2茬轮作处理后,番茄、菜豆、黄瓜3种蔬菜与芹菜轮作均可较大程度地提高根际土壤细菌群做结构多样性指数和均匀度指数。 展开更多
关键词 蔬菜轮作 土壤细菌群落多样性 DGGE
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