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乙型肝炎病毒基因型S基因PCR-RFLP分型方法的建立 被引量:77
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作者 阎丽 侯金林 +3 位作者 郭亚兵 王战会 林裕龙 骆抗先 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期224-228,共5页
目的 建立乙型肝炎病毒 (HBV)S基因聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)的基因型分型方法并验证其准确性。方法 比较GenBank中HBV 2 2 3株各基因型全序列的S基因氨基酸及核苷酸序列 ,设计限制性内切酶BsrI、StyI、DpnI和Hp... 目的 建立乙型肝炎病毒 (HBV)S基因聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)的基因型分型方法并验证其准确性。方法 比较GenBank中HBV 2 2 3株各基因型全序列的S基因氨基酸及核苷酸序列 ,设计限制性内切酶BsrI、StyI、DpnI和HpaII鉴别HBVA F基因型的方法。选择经前SPCR PFLP的方法已鉴定出的HBVB、C和D基因型标本各 3 0例 ,用此方法鉴定验证 ,并随机对HBVB、C和D基因型各 3株标本进行S基因测序证实。结果 两种PCR RFLP及S基因测序鉴定HBV基因型结果一致。结论 S基因PCR RFLP的方法能够准确鉴定HBV基因型。此方法灵敏性高 ,特异性强 ,且酶切图谱简明单一 ,易于识别 ,适宜于HBV基因型的流行病学调查。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 HBV S基因 基因型 聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 PCR-RFLP 基因分型
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水稻耐盐性数量性状位点的初步检测 被引量:59
2
作者 顾兴友 梅曼彤 +2 位作者 严小龙 郑少玲 卢永根 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期65-70,共6页
用RFLP分析技术和分蘖株系法对由耐盐性品种Pokkali和盐敏感品种Peta配制的BC1 (Peta/Pokkali∥Peta)群体分别检测水稻苗期和成熟期耐盐性数量性状位点 (QTLs)。表型鉴定在含 (处理 )或不含 (对照 ) 6 0mol/m3NaCl的营养液中进行 ,苗期... 用RFLP分析技术和分蘖株系法对由耐盐性品种Pokkali和盐敏感品种Peta配制的BC1 (Peta/Pokkali∥Peta)群体分别检测水稻苗期和成熟期耐盐性数量性状位点 (QTLs)。表型鉴定在含 (处理 )或不含 (对照 ) 6 0mol/m3NaCl的营养液中进行 ,苗期观测盐害级别、苗Na+ 含量和鲜重 /干重比值 3项指标 ,成熟期测定 1 0种农艺性状处理与对照的相对值。从水稻 1 2条染色体上筛选出 43个多态性标记 ,对上述指标分别作点分析 ,共检出 1 5个连锁标记。连锁标记的分布特点显示 ,在研究所涉及的基因组范围内存在 4个影响苗期耐盐性的QTL ,其增效等位基因均来自耐盐品种Pokkali;影响成熟期耐盐性的QTL分布于 7条染色体的 1或 2个连锁区间上 ,其有利基因来自双亲 ;RG6 78和RZ40 0B~RZ792附近的 展开更多
关键词 水稻 数量性状位点 耐盐性 RFLP标记
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云南地方稻种的遗传变异和籼粳分化 被引量:35
3
作者 刘克德 张启发 +1 位作者 张端品 谢岳峰 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1995年第9期718-724,共7页
用7 个单拷贝探针对87 份云南稻地方品种进行了RFLP分析.结果表明∶云南稻(Oryzasativa L.)地方品种中,籼稻(indica)和粳稻(japonica)都表现出较高水平的变异,粳稻的等位基因数目和遗传多... 用7 个单拷贝探针对87 份云南稻地方品种进行了RFLP分析.结果表明∶云南稻(Oryzasativa L.)地方品种中,籼稻(indica)和粳稻(japonica)都表现出较高水平的变异,粳稻的等位基因数目和遗传多样性水平都高于籼稻,表明粳稻的遗传变异比籼稻丰富. 云南稻地方品种中的籼稻和粳稻间表现出明显的遗传分化,且不同染色体区段分化程度不同. 展开更多
关键词 亚洲栽培稻 遗传变异 籼粳分化
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云南稻种冲腿的孕穗期耐冷性QTL分析(英文) 被引量:34
4
作者 叶昌荣 加藤明 +3 位作者 齐藤浩二 伊势一男 戴陆园 杨勤忠 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期13-16,共4页
利用 35 2个探针分析了日本品种农林 2 0和云南品种冲腿之间的限制性片段长度多态性 ( RFL P) ,从中筛选出15 7个在农林 2 0和冲腿间显示多态性的探针 ,其中 5 5个被用于其杂交后代 (农林 2 0 /冲腿 )的 70个 F3 系统的孕穗期耐冷性数... 利用 35 2个探针分析了日本品种农林 2 0和云南品种冲腿之间的限制性片段长度多态性 ( RFL P) ,从中筛选出15 7个在农林 2 0和冲腿间显示多态性的探针 ,其中 5 5个被用于其杂交后代 (农林 2 0 /冲腿 )的 70个 F3 系统的孕穗期耐冷性数量性状位点 ( QTL)分析。结果初步显示出一些与水稻孕穗期耐冷性有关的 QTL,它们主要分布在第 1、3、4、5、6、7、8、10和第 12染色体上。可能在第 3和第 7染色体上具有对孕穗期耐冷性作用较大的 QTL。 展开更多
关键词 限制性片段长度多态性 数量性状位点 耐冷性 孕穗期 水稻
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我国几种植物植原体的快速分子鉴别与鉴定的研究 被引量:33
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作者 李永 田国忠 +1 位作者 朴春根 朱水芳 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期293-299,共7页
选用桑萎缩病(M u lberry dw arf,MD)、枣疯病(Ju jube w itches-broom,JW B)、酸枣丛枝病(W ild ju jube w itches-broom,W JW B)、泡桐丛枝病(Pau lownia w itches-broom,PaW B)和苦楝丛枝病(Chinaberry tree w itches-broom,CW B)5... 选用桑萎缩病(M u lberry dw arf,MD)、枣疯病(Ju jube w itches-broom,JW B)、酸枣丛枝病(W ild ju jube w itches-broom,W JW B)、泡桐丛枝病(Pau lownia w itches-broom,PaW B)和苦楝丛枝病(Chinaberry tree w itches-broom,CW B)5种不同植物植原体和来源于3个不同地区PaW B和JW B材料进行16S rDNA和23S rDNA PCR扩增、异源双链迁移率分析(HMA)、PCR产物的RFLP分析和16S rDNA的克隆和测序等比较研究,建立了一种快速确定未知植原体种类和分类地位的分子鉴别与鉴定优化程序;并可对田间采集的各种植物植原体样品进行快速鉴定和鉴别。16S rDNA PCR产物HMA分析结果显示,JW B与CW B、MD和PaW B皆可形成明显的异源杂交双链;而CW B、MD和PaW B植原体之间未能形成异源双链。JW B和PaW B不同地区样品之间、JW B和W JW B之间也未发现异源杂交双链的形成。而23S rDNA PCR产物HMA分析则可以将MD与PaW B区分开。进一步对未知分类地位的CW B序列测定及与其它植原体16S rDNA的RFLP和同源性比较结果显示,CW B与PaW B同源性为99.5%,其中与MD的同源性高达99.7%,因而应将CW B归为翠菊黄花组16S r I-B,16S r I-B(rp-B)。 展开更多
关键词 植原体 分子鉴别与鉴定 异源双链迁移率分析 限制性片段长度多态性 序列测定
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慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒准种特点的初步研究(英文) 被引量:33
6
作者 董菁 成军 +6 位作者 王勤环 王刚 施双双 刘友昭 夏小兵 邵清 斯崇文 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期199-203,共5页
目的 探讨乙型肝炎病毒 (HBV )准种在慢性乙型肝炎患者中的存在状态。方法 以已知中国株HBV基因序列为依据 ,设计特异性聚合酶链反应 (PCR)引物 ,自 3例慢性乙型肝炎患者体内扩增HBV全S基因片段 ,克隆入 pGEMTeasy质粒 ,用限制性片段... 目的 探讨乙型肝炎病毒 (HBV )准种在慢性乙型肝炎患者中的存在状态。方法 以已知中国株HBV基因序列为依据 ,设计特异性聚合酶链反应 (PCR)引物 ,自 3例慢性乙型肝炎患者体内扩增HBV全S基因片段 ,克隆入 pGEMTeasy质粒 ,用限制性片段长度多态性(RFLP)法确定HBV的变异现象 ,DNA测序确定病毒的变异程度。结果 分别自 3例患者血清中克隆出 2 9、2 8和 8个阳性克隆 ,以EcoRI酶切患者 1和 2的RFLP结果提示各有 5种不同的长度带型 ,PCR产物XhoI酶切RFLP结果表现为高度保守 ,测序结果发现HBV体内毒株DNA序列高度一致 ,同一患者两株全S区序列测序结果表明DNA序列的同源性大于 97%。结论 慢性乙型肝炎患者体内有HBV准种共存 ,且呈现出一定的优势克隆现象 ,可能与患者预后有关。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 变异 限制性片段长度多态性 HBV
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木耳属真菌rDNA特异性扩增片段的RFLP研究 被引量:21
7
作者 阎培生 罗信昌 周启 《菌物系统》 CSCD 北大核心 1999年第2期206-213,共8页
对木耳属8个种25个菌株的ITS和28SrDNA5’端两个区域分别进行了PCR扩增和限制酶切片段长度多态性(RFLP)研究。ITS-RFMP研究结果表明,HaeⅢ可将黑木耳与其它种区分开,MspⅠ可将盾形木耳、角质木耳、琥珀木耳和黑木耳4个种区分开,... 对木耳属8个种25个菌株的ITS和28SrDNA5’端两个区域分别进行了PCR扩增和限制酶切片段长度多态性(RFLP)研究。ITS-RFMP研究结果表明,HaeⅢ可将黑木耳与其它种区分开,MspⅠ可将盾形木耳、角质木耳、琥珀木耳和黑木耳4个种区分开,而供试的HaeⅢ、TaqⅠ、HinfⅠ和MaPⅠ这四种限制酶均不能将皱木耳、大木耳、网脉木耳及毛木耳4个种区分开,表明它们之间的亲缘关系较近;结果还表明,ITS—rDNA拷贝在毛木耳和琥珀木耳种内是异质性的,而在黑木耳种内是同质性的。285rDNA-RFLP研究结果表明,供试的4种限制酶中,仅MspⅠ可将盾形木耳和角质木耳区分开,而不能将其它种区分开,这显示了28SrDNA序列在木耳属不同种间的保守性。 展开更多
关键词 木耳属 RDNA PCR 系统发育 RFLP
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水环境细菌16S rDNA限制性片段长度多型性及群落结构分析 被引量:17
8
作者 李志岗 杨官品 朱艳红 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期111-115,共5页
用细菌16S核糖体RNA基因(rDNA)限制性片段长度多型性描述了水环境细菌群落结构。从环境水样中直接分离 DNA,以细菌特异的引物扩增 165 rDNA,构建质粒文库,随机分离重组质粒,用限制性内切酶消化获得 16S ... 用细菌16S核糖体RNA基因(rDNA)限制性片段长度多型性描述了水环境细菌群落结构。从环境水样中直接分离 DNA,以细菌特异的引物扩增 165 rDNA,构建质粒文库,随机分离重组质粒,用限制性内切酶消化获得 16S rDNA基因型,用基因型的种类及频率描述特定水体生境的细菌群落结构。该方法在分析水体隐含遗传多样性、揭示污染的生物学效应和评价水环境质量等方面具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 16S核糖体RNA基因 限制性片段长度多态性 细菌群落 水环境 环境污染 评价
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贵州三个民族亚甲基四氢叶酸还原酶基因的遗传多态性 被引量:24
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作者 肖雁 单可人 +9 位作者 李毅 赵艳 齐晓岚 谢渊 吴昌学 马骄 刘烜 徐鹰 官志忠 任锡麟 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期219-221,共3页
目的 研究贵州汉族、布依族、苗族亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolatereductase,MTHFR)基因多态性,为贵州少数民族基因多态性数据库的建立提供相关数据。方法 应用聚合酶链反应及限制性片段长度多态性检测贵州荔波汉族... 目的 研究贵州汉族、布依族、苗族亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolatereductase,MTHFR)基因多态性,为贵州少数民族基因多态性数据库的建立提供相关数据。方法 应用聚合酶链反应及限制性片段长度多态性检测贵州荔波汉族、布依族、雷山苗族MTH FR基因两个单核苷酸(6 77及12 98位)多态位点的基因频率及基因型频率。结果 汉族、布依族、苗族MTH FR 6 77位T等位基因的分布频率分别是2 2 .8% ,16 .1% ,10 .6 % ,MTH FR 12 98位C等位基因的分布频率分别是2 8.9% ,39.1% ,4 8.7% ,6 77CT/ 12 98AC双杂合子的分布频率分别是16 .6 6 % ,2 2 .7% ,11.1%。在苗族还发现1例6 77TT/ 12 98CC双纯合子。结论 MTH FR C6 77T和A12 98C多态性存在群体差异;贵州雷山苗族、荔波布依族MTH FR12 98位有较高的C等位基因频率,贵州雷山苗族MTH FR12 98位C等位基因频率是目前文献报道最高的民族。 展开更多
关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶基因 遗传多态性 贵州 限制性片段长度多态性 等位基因频率 MTHFR基因 基因多态性 聚合酶链反应 分布频率 A1298C 基因型频率 C677T 布依族 相关数据 少数民族 方法应用 多态位点 单核苷酸 群体差异
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广州地区汉族人群细胞色素P4501A1和细胞色素P4502E1基因多态性 被引量:18
10
作者 王建 刘焯霖 +1 位作者 卢锡林 陈彪 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期259-261,共3页
目的 探讨广州地区汉族人群细胞色素 P45 0 1A1(CYP1A1)和细胞色素 P45 0 2 E1(CYP2 E1)基因的多态性分布规律。方法 用 PCR- RFL P和等位基因特异性扩增技术 ,对 15 0名广州地区汉族正常人的 CYP1A1和 CYP2 E1基因多态性进行了检测 ... 目的 探讨广州地区汉族人群细胞色素 P45 0 1A1(CYP1A1)和细胞色素 P45 0 2 E1(CYP2 E1)基因的多态性分布规律。方法 用 PCR- RFL P和等位基因特异性扩增技术 ,对 15 0名广州地区汉族正常人的 CYP1A1和 CYP2 E1基因多态性进行了检测 ,并与其他人群进行了比较。结果 CYP1A1基因3′端非翻译区的 Msp 多态位点 m1(Msp - )、m2 (Msp + )等位基因频率分别为 6 2 .33%和 37.6 7% ;m1m1、m1m2和 m2 m2基因型频率分别为 40 %、44 .6 7%和 15 .33%。CYP1A1基因 7号外显子 A4889G多态位点 A、G等位基因频率分别为 79%和 2 1% ;AA、AG和 GG基因型频率分别为 6 2 .6 7%、32 .6 7%和4.6 6 %。发现在广州地区汉族人群 Msp 多态与 7号外显子 A4889G多态存在连锁不平衡关系 (χ2 =6 2 .2 35 8,P<0 .0 0 5 )。CYP2 E1基因 5′侧翼区 Rsa 和 Pst 多态位点等位基因 C1(Rsa + ,Pst - )、C2(Rsa - ,Pst + )的频率分别为 85 .3% ,14.7% ;C1C1、C1C2、C2 C2基因频率分别为 6 7.3%、2 9.3%和3.4%。结论 广州地区汉族人群 CYP1A1和 CYP2 E1基因多态分布与日本人相近 ,与欧美人显著不同。 展开更多
关键词 细胞色素P450 聚合酶链反应 基因多态性
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宁夏地区乙型肝炎病毒基因型分布及D基因型的测序鉴定 被引量:18
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作者 阎丽 侯金林 +3 位作者 王战会 牛贞玉 郭亚兵 骆抗先 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期4-7,共4页
为确定乙型肝炎病毒 (HBV) D基因型在我国的存在 ,建立我国 HBV D基因型的参照序列 ,作者用聚合酶链式反应 (PCR)结合限制性片段长度多态性分析 (RFL P)技术 ,调查了可能存在 D基因型的我国宁夏地区 HBV基因型分布。对 90例 HBe Ag阳性 ... 为确定乙型肝炎病毒 (HBV) D基因型在我国的存在 ,建立我国 HBV D基因型的参照序列 ,作者用聚合酶链式反应 (PCR)结合限制性片段长度多态性分析 (RFL P)技术 ,调查了可能存在 D基因型的我国宁夏地区 HBV基因型分布。对 90例 HBe Ag阳性 HBV感染者的血清进行前 S区 RFL P基因型分型。结果发现 :C基因型 86 .7% (78/ 90 ) ;D基因型 1 0 % (9/ 90 ) ;无 A、B、E和 F型 ;不能明确分型者 3.3% (3/ 90 )。 2例 RFL P分型为 D基因型的病例经测序证实。结果表明 ,宁夏地区 HBV优势基因型为 C型 ,并首次在该地区发现 D基因型的存在。本研究为我国 HBV基因型分布积累了新的资料 ,为进一步建立我国 HBV 展开更多
关键词 直炎病毒 基因型 聚合酶链反应 RFLP
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82例 HCV RNA 阳性血清聚合酶链反应产物的酶切分析 被引量:24
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作者 邱望龙 孙菊芬 +1 位作者 杜绍财 陶其敏 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1994年第1期1-3,共3页
为了探讨广州地区HCV感染的基因型,作者对广州地区不同人群中105例抗-HCV阳性血清用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)进行了HCVRNA的检测,对其中82例HCVRNA阳性患者血清做了PCR产物的限制性内切片段长... 为了探讨广州地区HCV感染的基因型,作者对广州地区不同人群中105例抗-HCV阳性血清用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)进行了HCVRNA的检测,对其中82例HCVRNA阳性患者血清做了PCR产物的限制性内切片段长度多态性(RFLP)分析,结果显示:HCVⅡ型感染78例(92.1%),HCVⅢ型1例,HCVⅡ/Ⅲ型混合感染3例,4例HCVⅢ型感染均是肝病患者,初步表明广州地区HCV感染大多数属Ⅱ型。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 基因型 聚合酶链反应
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细胞色素P4502D6酶基因多态性与右美沙芬氧化代谢的相关研究 被引量:19
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作者 蔡卫民 陈冰 +2 位作者 陶欣 凌树森 张银娣 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期181-184,共4页
目的 探讨中国人右美沙芬氧化代谢多态性的遗传机理。方法 采用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性技术 ,对 119名健康汉族人的肝细胞色素 P45 0 2 D6 (CYP2 D6 )基因型进行分析。结果CYP2 D6 * 10 B的基因频率为 5 8.4% ,其中 13名 ... 目的 探讨中国人右美沙芬氧化代谢多态性的遗传机理。方法 采用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性技术 ,对 119名健康汉族人的肝细胞色素 P45 0 2 D6 (CYP2 D6 )基因型进行分析。结果CYP2 D6 * 10 B的基因频率为 5 8.4% ,其中 13名 (10 .9% )为野生型 (w/ w) ,33名 (2 7.7% )为突变型 (m/ m) ,其余 73名 (6 1.3% )为杂合子 (m/ w)。右美沙芬中速代谢者 (intermediate metabolizer,IM)表型中有约 70 %是由 CYP2 D6 * 10 B m/ m造成的 ,而 1名弱代谢者 (poor metabolizer,PM)亦为 m/ m型。另外 ,10名受试者不存在与白种人 PM相关的 6种缺陷 CYP2 D6等位基因。结论 中国人 CYP2 D6 * 10 展开更多
关键词 右美沙芬 遗传多态性 细胞色素P450 PCR
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浙江地方猪种线粒体DNA多态及遗传多样性研究 被引量:11
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作者 章胜乔 徐继初 +2 位作者 张亚平 傅衍 陈永久 《Zoological Research》 CAS CSCD 1998年第2期125-130,共6页
本实验用ApaⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、BclⅠ、BglⅠ、BglⅡ、ClaⅠ、DraⅠ、EcoRI、EcoRV、HaeⅡ、HincⅡ、HindⅢ、HpaⅠ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅠ、PvuⅡ、SacⅠ、SalⅠ... 本实验用ApaⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、BclⅠ、BglⅠ、BglⅡ、ClaⅠ、DraⅠ、EcoRI、EcoRV、HaeⅡ、HincⅡ、HindⅢ、HpaⅠ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅠ、PvuⅡ、SacⅠ、SalⅠ、ScaⅠ、SmaⅠ、StuⅠ、XbaⅠ和XhoⅠ等25种识别6个碱基对的限制性内切酶分析了浙江地方品种猪、浙江野猪等30个个体的线粒体DNA,共检出30种限制性态型(morph),可归结成3种单倍型,其中BamHⅠ-B、BclⅠ-B、DraⅠ-B和XbaⅠ-C为首次发现;各单倍型间平均遗传距离(p)为0.005,群体的平均多态度(π)为0.0008,均处于遗传多样性贫乏范围,提示浙江地区猪可能起源于一个共同的祖先。结合前人资料,对金华Ⅲ系猪进行分析,分析结果提示金华Ⅲ系猪可能有两个母系起源。 展开更多
关键词 线粒体 DNA 限制性片段 多态性
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慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒准种特点的初步研究 被引量:17
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作者 董菁 成军 +6 位作者 王勤环 刘友昭 王刚 施双双 夏小兵 邵清 斯崇文 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2002年第1期17-19,共3页
探讨乙型肝炎病毒(HBV)在慢性患者中存在状态. 以 HBV基因序列为依据,设计特异性多聚酶链反应(PCR)引物.自2例慢性患者体内扩增HBV全S基因片段,克隆入T载体.限制片段长度多态性(RFLP)法确定HBV的变异... 探讨乙型肝炎病毒(HBV)在慢性患者中存在状态. 以 HBV基因序列为依据,设计特异性多聚酶链反应(PCR)引物.自2例慢性患者体内扩增HBV全S基因片段,克隆入T载体.限制片段长度多态性(RFLP)法确定HBV的变异现象,DNA测序确定病毒的变异程度。质粒EcoRI酶切RFLP结果提示自2例患者血清中克隆出的29和28个阳性克隆中各有5种不同的长度带型,PCR产物XhoI酶切RFLP结果则表现为高度保守,测序结果发现HBV体内毒株碱基序高度一致,同一患者两株全S区序列测序结果表明DNA序列的同源性大于97%。本结果提示HBV慢性患者体内有HBV准种共存,且呈现出一定的优势克隆现象。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 限制片段长度多态性 慢性乙型肝炎 病毒变异 克隆
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慢性HBV感染前C区变异与病毒复制水平关系 被引量:16
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作者 戴炜 郭亚兵 +4 位作者 杨大国 唐蔚 袁静 王召钦 舒丹 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2001年第3期152-153,共2页
探讨HBV前C基因变异与病毒复制水平的关系在慢性HBV感染者中的意义。应用错配聚合酶链反应 (PCR) -限制性片段长度多态性 (RFLP)分析与荧光定量聚合酶链反应检测HBVDNA相结合 ,对 30例HB sAg(+ )、抗 -HBe(+ )及抗 -HBc(+ )慢性HBV感染... 探讨HBV前C基因变异与病毒复制水平的关系在慢性HBV感染者中的意义。应用错配聚合酶链反应 (PCR) -限制性片段长度多态性 (RFLP)分析与荧光定量聚合酶链反应检测HBVDNA相结合 ,对 30例HB sAg(+ )、抗 -HBe(+ )及抗 -HBc(+ )慢性HBV感染者 ,其中无症状携带者 (AsC) 9例、慢性乙型肝炎 (CHB) 12例及慢性重症肝炎 (CHF) 9例进行前C区基因变异与HBVDNA水平关系进行分析。AsC组 3例 (33 33 % ) ,CHB组9例 (75 % )及CHF组 8例 (88 89% )有A83(nt 1896 )变异。荧光定量PCR结果表明HBVDNA含量在CHF组中最高。HBV前C变异在HBV不同感染状态中都可见 。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 基因变异 限制性片段长度多态性 聚合酶链反应 RFLP HBVDNA CHF
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油菜内生细菌16S核糖体DNA的RFLP分析 被引量:13
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作者 杨瑞先 孙广宇 +1 位作者 张荣 陈立军 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期606-609,共4页
植物内生细菌定殖在植物组织内部但不引起明显的病害症状。从健康油菜植株的不同器官中分离到大量内生细菌,这些细菌菌落形态存在明显的差异,表明油菜组织中存在大量内生细菌,且类群丰富。分离到的122株内生细菌根据菌落形态可以划分为3... 植物内生细菌定殖在植物组织内部但不引起明显的病害症状。从健康油菜植株的不同器官中分离到大量内生细菌,这些细菌菌落形态存在明显的差异,表明油菜组织中存在大量内生细菌,且类群丰富。分离到的122株内生细菌根据菌落形态可以划分为35类;利用细菌通用引物对16S核糖体DNA进行扩增,获得约1.5kb片段,分别用内切酶HaeⅢ和MspⅠ对扩增产物进行限制性酶切,产生不同的酶切图谱,根据酶切图谱聚类分析结果,所有供试菌株被归为39类,这一结果从遗传上显示油菜内生细菌类群的多样性。两种方法归类结果比较发现菌落特征所反映的信息量有限,只能作为初步的参考指标,核糖体DNA的限制性片段长度多态性分析快速、准确,可以作为油菜内生细菌多样性分析的一种有效方法。 展开更多
关键词 多样性 16S核糖体DNA 限制性片段长度多态性
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西安地区丙型肝炎病毒基因分型研究 被引量:15
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作者 王平忠 周永兴 《世界华人消化杂志》 CAS 1999年第9期757-759,共3页
目的 了解西安地区不同人群HCV 基因型分布.方法 先用逆转录- 套式多聚酶链反应检测抗- HCV 阳性血清的RNA, 阳性者再用限制性片段长度多态性分析法进行HCV 基因分型.结果 113 份HCVRNA 阳性血清的基因... 目的 了解西安地区不同人群HCV 基因型分布.方法 先用逆转录- 套式多聚酶链反应检测抗- HCV 阳性血清的RNA, 阳性者再用限制性片段长度多态性分析法进行HCV 基因分型.结果 113 份HCVRNA 阳性血清的基因型如下:输血后丙肝组,Ⅱ型、Ⅲ型及Ⅱ/ Ⅲ混合型分别为80 % ,16-7 % 和3-3 % .散发性丙肝组,Ⅱ型、Ⅲ型分别为78-9 % 和21-1 % ,未检出Ⅱ/Ⅲ混合型. 肝硬变组, Ⅱ型、Ⅲ型及Ⅱ/ Ⅲ混合型分别为87-9 % ,9-1 % 和3 % . 原发性肝癌组,Ⅱ型、Ⅲ型分别为87-1 %和12-9 % ,未检出Ⅱ/ Ⅲ混合型. 分型总结果为:HCVⅡ型、Ⅲ型及Ⅱ/ Ⅲ混合型分别为84-1 % ,14-2 % 和1-7 % .结论 HCVⅡ型是西安地区优势株. 不同人群中HCV 基因型总体分布差异无显著性. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 基因分型 RFLP PCR
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应用PCR-RFLP方法鉴定梅花鹿茸与马鹿茸 被引量:16
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作者 徐岩 邵博宇 +8 位作者 徐宁 翟英南 高锋 艾金霞 张亚丽 李明成 李丹 高丽君 夏薇 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第24期2021-2028,共8页
目的建立一种应用限制性片段长度多态性技术鉴别梅花鹿茸与马鹿茸的方法。方法提取各种鹿茸样品的基因组DNA,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对正品鹿茸的特异性片段进行扩增,鉴别鹿茸的真伪,然后对正品鹿茸利用动... 目的建立一种应用限制性片段长度多态性技术鉴别梅花鹿茸与马鹿茸的方法。方法提取各种鹿茸样品的基因组DNA,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对正品鹿茸的特异性片段进行扩增,鉴别鹿茸的真伪,然后对正品鹿茸利用动物通用引物进行PCR扩增,并通过限制性片段长度多态性分析进一步对正品鹿茸的种属来源进行确证。结果通过对特异性片段的PCR扩增,可将梅花鹿茸及马鹿茸与驯鹿、麋鹿、新西兰鹿等伪品鹿茸加以区分,通过对限制性内切酶Msp I进行酶切后的片段长度进行分析,可进一步区分梅花鹿茸与马鹿茸。结论本实验建立了一种基于限制性片段长度多态性技术快速、准确的鉴别鹿茸真伪及种属鉴定的方法,为解决中药易混品种难以鉴定的问题提供了又一个新方法。 展开更多
关键词 鹿茸 限制性片段长度多态性 聚合酶链式反应 种属鉴别
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2型糖尿病患者脂蛋白脂酶基因PvuⅡ酶切多态性的观察 被引量:11
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作者 沈洪兵 俞顺章 +3 位作者 徐耀初 喻荣彬 姜维平 陈文宇 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期24-27,共4页
目的 探讨脂蛋白脂酶基因变化与2型糖尿病及其脂质代谢的关系。方法 采用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性方法,对127例2型糖尿病患者和125名正常对照者脂蛋白脂酶基因第6号内含子Pvu酶切位点进行多态性分析。结果 脂蛋白脂酶Pvu... 目的 探讨脂蛋白脂酶基因变化与2型糖尿病及其脂质代谢的关系。方法 采用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性方法,对127例2型糖尿病患者和125名正常对照者脂蛋白脂酶基因第6号内含子Pvu酶切位点进行多态性分析。结果 脂蛋白脂酶Pvu酶切位点的“P+”等位基因和不含酶切位点的“P-”等位基因在糖尿病病例组和对照组的分布频率分别为“P+”693%、636%,“P-”307%、364%;3类基因型的分布各为P+P+480%、448%,P+P-425%、376%和P-P-945%、176%。两组人群在基因型和等位基因频率上均无显著的统计学差异。我国人群脂蛋白脂酶Pvu酶切位点多态性的分布频率与日本人群相近,与欧美人群差异较大。结论 我国汉族人群脂蛋白脂酶Pvu酶切多态性与2型糖尿病无明显关联;该酶切位点多态性具有明显的种族差异。 展开更多
关键词 糖尿病 脂蛋白脂酶基因 NIDDM RFLP
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