高温胁迫对茄子花青素含量及其合成相关酶活性和基因表达的影响 被引量：10

1

作者 张圣美 刘晓慧 +3 位作者 尚静 张爱冬 朱宗文 朱月林 《上海农业学报》 2020年第6期6-12,共7页

以紫色茄子(Solanum melongena L.)为试验材料,利用人工气候室进行高温处理。以27℃为对照,测定38℃和45℃条件下处理1 h、3 h、6 h、12 h、24 h、48 h、60 h果皮花青素、类黄酮含量,以及花青素生物合成过程中苯丙氨酸解氨酶(PAL)、查... 以紫色茄子(Solanum melongena L.)为试验材料,利用人工气候室进行高温处理。以27℃为对照,测定38℃和45℃条件下处理1 h、3 h、6 h、12 h、24 h、48 h、60 h果皮花青素、类黄酮含量,以及花青素生物合成过程中苯丙氨酸解氨酶(PAL)、查尔酮合成酶(CHS)、查尔酮异构酶(CHI)、二氢黄酮醇还原酶(DFR)、花青素合成酶(ANS)、类黄酮3-葡糖基转移酶(UFGT)的活性,并测定3 h和6 h时关键酶基因的表达。结果表明:与对照相比,随着时间的延长,高温胁迫诱导花青素和类黄酮浓度显著降低,其中45℃较38℃下降幅度大;PAL的活性呈现先升高后降低的变化趋势;CHS、CHI、DFR、ANS、UFGT的活性呈现持续下降的趋势,且高温胁迫下,其活性显著低于对照;处理3 h时,SmPAL、Sm4CL的表达量随着温度的升高逐渐增加,38℃和45℃条件下处理6 h,其表达量均低于对照。SmCHI的表达量在38℃时显著升高,而在45℃时降低至与对照相当的水平。SmF3H、SmANS、SmUFGT表达量的变化趋势基本一致,处理时间相同时,温度越高,表达量越低。上述结果表明,高温胁迫降低了茄子果皮花青素合成关键酶的活性及相关基因的表达量,花青素和类黄酮含量降低。 展开更多

关键词 茄子果皮 高温胁迫 花青素 花青素合成关键酶活性 基因表达

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金针菇MYB转录因子家族成员鉴定及其在子实体形成中的表达模式分析 被引量：9

2

作者 邓冰 刘宗奇 +4 位作者 袁学文 刘靖宇 孟俊龙 常明昌 冯翠萍 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2021年第5期1-11,共11页

在全基因组中对金针菇(Flammulina filiformis)MYB转录因子进行鉴定,发现其中存在13个MYB转录因子,亚细胞定位和蛋白结构预测发现所有MYB转录因子均为包含螺旋-转角-螺旋结构的核蛋白;对金针菇菌丝、原基、幼嫩子实体和成熟子实体中MYB... 在全基因组中对金针菇(Flammulina filiformis)MYB转录因子进行鉴定,发现其中存在13个MYB转录因子,亚细胞定位和蛋白结构预测发现所有MYB转录因子均为包含螺旋-转角-螺旋结构的核蛋白;对金针菇菌丝、原基、幼嫩子实体和成熟子实体中MYB基因的表达量进行测定,与在菌丝阶段相比,Ff10734、Ff11788和Ff13454基因在原基、幼嫩子实体和成熟子实体阶段显著上调表达;顺式作用元件扫描发现金针菇基因组中存在4353个潜在的MYB靶基因,基因功能分析结果表明MYB靶基因可能涉及细胞器形成、初级代谢产物合成以及次级代谢产物积累等生物学过程。 展开更多

关键词 金针菇 MYB转录因子 生长发育 相对表达量

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不同温度培养对香菇漆酶活性及转录表达的影响 被引量：7

3

作者 陈小敏 吴海冰 +3 位作者 向泉桔 曾先富 张小平 辜运富 《四川大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期155-160,共6页

以香菇新808为材料,研究不同温度培养下漆酶活性及其基因表达调控特征.通过平板培养法测定4种温度(20℃、25℃、28℃和30℃)对香菇菌丝圈及氧化圈的影响,通过液体发酵测定漆酶活性,并采用qPCR技术检测漆酶同工酶基因的相对表达量.结果表... 以香菇新808为材料,研究不同温度培养下漆酶活性及其基因表达调控特征.通过平板培养法测定4种温度(20℃、25℃、28℃和30℃)对香菇菌丝圈及氧化圈的影响,通过液体发酵测定漆酶活性,并采用qPCR技术检测漆酶同工酶基因的相对表达量.结果表明:不同温度条件下,漆酶的活性及转录表达存在明显差异.25℃培养条件下香菇菌丝圈及氧化圈最大,漆酶活性最强(114.11 U/mL);而30℃时的菌丝圈和氧化圈最小,漆酶活性低(47.52 U/mL).不同温度培养下漆酶同工酶基因出现差异性表达,以25℃为对照组,20℃培养条件下9个漆酶基因(Llac1-3、Llac5和Llac7-11)表达量上调,28℃处理下除Llac5和Llac7基因以外,其余8个漆酶基因表达量发生上调,而30℃处理组6个漆酶基因(Llac1-2、Llac4、Llac7-8和Llac10)表达量下调.表明20℃处理下有助于漆酶基因的表达,而30℃处理下则抑制了其同工酶基因的表达. 展开更多

关键词 香菇 漆酶基因家族 相对表达量 温度

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高温胁迫对大白菜类胡萝卜素的影响

4

作者 尹莲 孙玉东 +7 位作者 罗德旭 刘璐 张雪莲 白甜 顾妍 王林闯 许文钊 赵建锋 《江西农业学报》 CAS 2024年第1期42-48,共7页

为探讨高温胁迫下大白菜叶片对逆境的响应机制,以叶片颜色和抗逆性存在差异的大白菜品种245、改良青杂3号和紫裔为试验材料,对其幼苗进行了昼/夜温度为40℃/30℃、相对湿度为60%左右的高温胁迫处理,分析了高温胁迫对大白菜幼苗生长及其... 为探讨高温胁迫下大白菜叶片对逆境的响应机制,以叶片颜色和抗逆性存在差异的大白菜品种245、改良青杂3号和紫裔为试验材料,对其幼苗进行了昼/夜温度为40℃/30℃、相对湿度为60%左右的高温胁迫处理,分析了高温胁迫对大白菜幼苗生长及其生理特性的影响。结果表明:胁迫条件下,3个品种大白菜叶片的类胡萝卜素在高温处理下均呈现先下降后上升的变化趋势;随着胁迫时间的增加,品种245在高温处理后第6天类胡萝卜素含量最低(123.51μg/g),在处理后第10天达到顶峰(148.64μg/g)。改良青杂3号和紫裔呈现出不同程度的波动,其中改良青杂3号对热处理更加敏感,在第4天后达到最低值(97.54μg/g);紫裔品种在初始时类胡萝卜素含量差别变化不明显,在热处理后第8天达到最低值(124.50μg/g)。实时荧光定量PCR结果显示,大白菜高温相关基因BraA01g019700.3C和BraA04g000960.3C对热胁迫响应明显,大白菜类胡萝卜素相关基因BraA01g019700.3C、BraA07g002160.3C和BraA04g000960.3C的转录水平均呈先上升后下降的变化趋势;相关性分析结果显示,BraA05g001160.3C(P<0.01;r=0.000)和BraA01g019200.3C(P<0.05;r=0.040)的转录丰度与类胡萝卜素含量显著相关。 展开更多

关键词 高温 大白菜 类胡萝卜素 相对表达水平

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科尔沁牛不同组织脂肪酸含量与SCD和SREBP-1基因表达相关分析

5

作者 斯琴图雅 才文明 +2 位作者 梅花 庞悦 吴白乙拉 《中国饲料》 北大核心 2024年第14期20-24,共5页

文章旨在研究科尔沁牛不同组织脂肪酸含量及SCD、SREBP-1基因表达量和参与脂肪酸代谢的调控机制。试验采用气相色谱-质谱联用法和实时荧光定量PCR方法分别检测科尔沁牛的肾周脂肪、肠周脂肪、肩肌和背最长肌等4个不同组织的脂肪酸含量及... 文章旨在研究科尔沁牛不同组织脂肪酸含量及SCD、SREBP-1基因表达量和参与脂肪酸代谢的调控机制。试验采用气相色谱-质谱联用法和实时荧光定量PCR方法分别检测科尔沁牛的肾周脂肪、肠周脂肪、肩肌和背最长肌等4个不同组织的脂肪酸含量及SCD和SREBP-1基因的表达量。结果表明:(1)SFA中,肾周脂肪C14:0、C16:0、C18:0含量显著高于背最长肌(P<0.05)。MUFA中,背最长肌C16:1和总MUFA含量高于肾周脂肪,但无显著差异(P>0.05)。背最长肌的各PUFA、总PUFA和UFA含量均显著高于肾周脂肪(P<0.05)。(2)SCD基因在科尔沁牛背最长肌中的表达量高于肾周脂肪组织,与SREBP-1基因的表达趋势相似,但无显著差异(P>0.05)。SREBP-1基因在科尔沁牛背最长肌中的表达量显著高于肾周脂肪组织(P<0.05)。以上结果表明,科尔沁牛背最长肌的营养价值与肉质较肾周脂肪更高、更有利于健康。同时,SREBP-1基因在参与SCD基因的脂肪沉积调控过程中,协同调节肌内脂肪代谢,进而影响牛肉脂肪酸组成及风味。 展开更多

关键词 科尔沁牛 SCD基因和SREBP-1基因 脂肪酸 相对表达量

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PD-1、PD-L1、miRNA let-7a1及let-7c在非小细胞肺癌组织中表达意义分析

6

作者 钱宇清 于俊才 《罕少疾病杂志》 2024年第9期40-41,49,共3页

目的 分析程序性死亡-1(PD-1)、程序性死亡受体配体1(PD-L1)与微小RNA(mi RNA)let-7a1、let-7c在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达。方法 选取2022年9月至2023年9月本院收治的200例NSCLC患者,采集其癌组织、癌旁正常组织,检测比较不同组织内... 目的 分析程序性死亡-1(PD-1)、程序性死亡受体配体1(PD-L1)与微小RNA(mi RNA)let-7a1、let-7c在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达。方法 选取2022年9月至2023年9月本院收治的200例NSCLC患者,采集其癌组织、癌旁正常组织,检测比较不同组织内PD-1、PD-L1、 let-7a1、let-7c表达差异;另分析四项指标与患者各项临床病理特征间的关系。结果 癌组织内的PD-1、PD-L1阳性率高于癌旁正常组织,let-7a1、let-7c相对表达量低于癌旁正常组织(P<0.05);PD-1、PD-L1、let-7a1、let-7c表达与NSCLC患者的临床分期、淋巴结转移、分化程度有关(P<0.05)。结论 PD-1、PD-L1、let-7a1、let-7c参与NSCLC的发生、发展。 展开更多

关键词 非小细胞肺癌 淋巴结转移 相对表达量

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用蛋白质印迹评价GAPDH与β-actin作为Skp2内参蛋白的研究

7

作者 孙浚源 罗微微 +1 位作者 杨金凤 贾静 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期844-848,共5页

目的确定用蛋白质印迹(WB)技术研究细胞S期激酶相关蛋白2(Skp2)时适宜的内参蛋白。方法选取多种人源肿瘤细胞系,通过瞬时转染shRNA质粒下调细胞内Skp2蛋白水平,用甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)与β-肌动蛋白(β-actin)作为内参蛋白进行WB... 目的确定用蛋白质印迹(WB)技术研究细胞S期激酶相关蛋白2(Skp2)时适宜的内参蛋白。方法选取多种人源肿瘤细胞系,通过瞬时转染shRNA质粒下调细胞内Skp2蛋白水平,用甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)与β-肌动蛋白(β-actin)作为内参蛋白进行WB检测,分析GAPDH、β-actin、Skp2的相对表达水平及相互关系。结果细胞内Skp2相对表达水平发生改变时,对于人非小细胞肺癌细胞H1299(1.32×10^(6)±7.86×10^(4))、人宫颈癌细胞HeLa(6.59×10^(6)±1.79×10^(6))和人肝癌细胞HepG2(3.13×10^(6)±2.87×10^(5))的GAPDH相对表达水平均发生明显变化(均P<0.05)。相关性结果显示:对于人非小细胞肺癌细胞A549(R=0.8258)和H1299(R=0.9062),Skp2与GAPDH相对表达水平均存在一定的相关性(均P<0.05)。结论β-actin更适合作为研究Skp2蛋白WB实验的内参蛋白。 展开更多

关键词 内参蛋白 Β-肌动蛋白 甘油醛-3-磷酸脱氢酶 细胞S期激酶相关蛋白2 相对表达水平 蛋白质印迹

原文传递

妊娠合并系统性红斑狼疮患者血清miR-21的相对表达水平及临床意义

8

作者 何小琴 刘玢含 王英 《检验医学与临床》 2024年第5期586-591,共6页

目的 探讨妊娠合并系统性红斑狼疮(pSLE)患者血清miR-21的相对表达水平及其临床意义。方法 选取2021年6月至2023年6月于四川大学华西医院诊断为pSLE的48例患者作为pSLE组,另外选取同时期于该院体检的30例健康妊娠期女性作为健康对照组,... 目的 探讨妊娠合并系统性红斑狼疮(pSLE)患者血清miR-21的相对表达水平及其临床意义。方法 选取2021年6月至2023年6月于四川大学华西医院诊断为pSLE的48例患者作为pSLE组,另外选取同时期于该院体检的30例健康妊娠期女性作为健康对照组,采用SLE疾病活动指数(SLEDAI),将pSLE组患者分为低活动组(SLEDAI评分为1~9分)和高活动组(SLEDAI评分>9分)。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测miR-21相对表达水平,采用红细胞沉降率(ESR)仪检测ESR,采用酶联免疫吸附试验检测血清C反应蛋白(CRP)、抗心磷脂抗体(ACA)和补体C3、C4,以及循环免疫复合物(CIC)水平。统计并比较合并与未合并器官损害pSLE患者的miR-21相对表达水平。采用Pearson相关分析pSLE患者miR-21相对表达水平与ESR、CRP及血清免疫学指标的相关性;绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析miR-21对pSLE的诊断效能。结果 pSLE组miR-21相对表达水平高于健康对照组,高活动组pSLE患者miR-21相对表达水平高于低活动组,差异均有统计学意义(P<0.05)。健康对照组、高活动组和低活动组ESR、CRP、补体C3、C4、ACA、CIC水平比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。高活动组和低活动组患者ESR、CRP水平显著高于健康对照组,且高活动组显著高于低活动组,差异均有统计学意义(P<0.05);高活动组和低活动组患者补体C3、C4水平低于健康对照组,且高活动组低于低活动组,差异均有统计学意义(P<0.05);高活动组患者血清ACA和CIC水平显著高于低活动组,差异均有统计学意义(P<0.05)。有肾脏和关节损害的pSLE患者的miR-21相对表达水平高于无损害患者,差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关分析结果显示,pSLE患者miR-21相对表达水平与补体C3、C4水平呈负相关(r=-0.346、-0.330,P<0.05),与血清ACA、CIC、ESR、CRP水平呈正相关(r=0.499、0.326、0.286、0.389,P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,miR-21诊断pSLE的曲线 展开更多

关键词 系统性红斑狼疮 妊娠 微小RNA-21 相对表达水平 临床意义

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甘蓝型油菜CBF基因家族的鉴定和表达分析 被引量：5

9

作者 解盼 刘蔚 +4 位作者 康郁 华玮 钱论文 官春云 何昕 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期2394-2406,共13页

低温是影响植物生长发育的重要环境胁迫因子,ICE1(inducer of CBF expression1)-CBF(C-repeat(CRT)-binding factors)-COR(cold responsive)在植物响应低温胁迫的信号途径中具有重要作用。为探究CBF(C-repeat-binding factors)基因在甘... 低温是影响植物生长发育的重要环境胁迫因子,ICE1(inducer of CBF expression1)-CBF(C-repeat(CRT)-binding factors)-COR(cold responsive)在植物响应低温胁迫的信号途径中具有重要作用。为探究CBF(C-repeat-binding factors)基因在甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中的进化以及在低温胁迫应答反应中的功能,本研究以4个拟南芥CBF基因为基础序列,鉴定出11个甘蓝型油菜、6个白菜和5个甘蓝CBF基因,并对它们的分子特性、蛋白保守结构域和系统进化树、基因结构及基因染色体分布、甘蓝型油菜CBF基因组织表达模式以及不同逆境和激素处理下的表达模式进行系统的比较分析。结果表明,在11个甘蓝型油菜CBF基因中,可分为亚组Ⅰ(CBF1/2/3)和亚组Ⅱ (CBF4) 2个亚组。转录组测序结果表明,所有甘蓝型油菜CBF基因受低温诱导表达,其中亚组Ib的4个基因对冷胁迫响应迅速且持续时间长,亚组Ⅱ中2个基因对冷胁迫响应表达较弱,但它们在根中表达量明显高于叶片,并且参与盐胁迫和渗透胁迫响应;甘蓝型油菜中CBF基因家族对冻害响应更强烈,其中亚组Ⅰ中的BnaA08g30930D、BnaCnng49280D、BnaAnng34260D、BnaC07g39680D和亚组Ⅱ中BnaA10g07630D、BnaC09g28190D对冻害响应尤为显著。本研究将为进一步了解甘蓝型油菜CBF家族基因的生物学功能及其对低温尤其是冻害响应奠定基础,同时为CBF家族基因在其他物种中的生物信息学研究提供参考。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 CBF 低温 冻害 基因表达分析

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小麦G2-like转录因子家族基因鉴定与表达模式分析 被引量：1

10

作者 贾玉库 高宏欢 +5 位作者 冯健超 郝紫瑞 王晨阳 谢迎新 郭天财 马冬云 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1410-1425,共16页

Golden2-Like(G2-like)转录因子,是属于MYB类转录因子中GARP超家族的成员,在调节叶绿体发育中起重要作用。本研究利用生物信息学方法对小麦G2-like基因进行了全基因组鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、启动子顺式作用元件及对非生物胁... Golden2-Like(G2-like)转录因子,是属于MYB类转录因子中GARP超家族的成员,在调节叶绿体发育中起重要作用。本研究利用生物信息学方法对小麦G2-like基因进行了全基因组鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、启动子顺式作用元件及对非生物胁迫和激素的响应模式进行了分析。从小麦中共鉴定出87个G2-like基因,不均匀的分布在小麦21条染色体上,系统发育分析将这些基因分为14个亚族。蛋白质二级结构预测表明,小麦G2-like基因的氨基酸序列均以α螺旋和随机卷曲为主要结构。启动子顺式作用元件分析表明其上游2 kb区域含有7种(P-box、SpI、LTR、ABRE、MBS、TGA-element和AE-box)与逆境胁迫诱导相关顺式作用元件。其中Ta3AG2-like19含有顺式调控元件结合位点最多,一共有18个结合位点。qRT-PCR验证发现,Ta3AG2-like19、Ta3AG2-like20、Ta4AG2-like29和Ta6AG2-like52在PEG和盐胁迫下以及GA、IAA和ABA激素诱导下表达量显著上调,这些基因可能介导了小麦对多种非生物逆境的响应。 展开更多

关键词 小麦 G2-like转录因子 生物信息学 逆境胁迫 表达分析

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大蒜热激转录因子基因AsHSFB1的克隆、亚细胞定位及其表达分析 被引量：1

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作者 杨青青 杨峰 +5 位作者 赵永强 陆信娟 刘灿玉 葛洁 张碧薇 樊继德 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期169-177,共9页

热激转录因子(HSF)基因是植物热胁迫响应的重要转录调节基因,在植物胁迫应答和其他抗逆反应过程中起着关键作用。为研究大蒜热激反应的分子机制,本研究基于大蒜转录组数据,以徐蒜6号为试验材料,采用同源克隆方法获得编码HSF的AsHSFB1基... 热激转录因子(HSF)基因是植物热胁迫响应的重要转录调节基因,在植物胁迫应答和其他抗逆反应过程中起着关键作用。为研究大蒜热激反应的分子机制,本研究基于大蒜转录组数据,以徐蒜6号为试验材料,采用同源克隆方法获得编码HSF的AsHSFB1基因。序列分析结果显示,AsHSFB1含有882 bp的开放阅读框,编码293个氨基酸,其蛋白质含有热激转录因子的特征结构域。在进化关系上,AsHSFB1与拟南芥AT4G11660(AtHSFB2B)同源性最高。亚细胞定位结果表明,AsHSFB1蛋白主要定位在细胞核和细胞质上。本研究采用同源重组技术成功构建pCAMBIA1305-AsHSFB1过表达载体,为进一步研究该转录因子基因的功能,培育耐热大蒜品种奠定基础。RT-PCR分析结果表明,不同大蒜品种中,AsHSFB1基因在叶片中相对表达水平均最高,具有组织表达特异性;38℃高温胁迫处理下,徐蒜6号中的AsHSFB1基因相对表达水平在24 h时明显上调;4℃低温胁迫下,徐蒜815和徐蒜6号中AsHSFB1基因相对表达水平的变化趋势相似,均先上升后下降,在处理4 h时相对表达水平达到峰值。 展开更多

关键词 大蒜 AsHSFB1基因 同源重组技术 亚细胞定位 相对表达水平

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大肠杆菌编码序列碱基片段的统计分析 被引量：4

12

作者 李宏 罗辽复 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2000年第2期153-160,共8页

对大肠杆菌基因 1 2 3 1个编码开始区域和 1 3 0 7个编码终止区域内的 6碱基片段、4碱基片段和 3碱基片段进行了统计 ,发现 6碱基片段模式数的对数与其相对频率成线性下降关系 ,绝大多数 4碱基和 3碱基片段出现在相对频率小于 2的范围之... 对大肠杆菌基因 1 2 3 1个编码开始区域和 1 3 0 7个编码终止区域内的 6碱基片段、4碱基片段和 3碱基片段进行了统计 ,发现 6碱基片段模式数的对数与其相对频率成线性下降关系 ,绝大多数 4碱基和 3碱基片段出现在相对频率小于 2的范围之内 ;编码区出现最多的碱基片段是多聚A ;编码开始区域和编码终止区域的碱基构成模式有明显区别 ;编码开始区域里GGA类的稀有片段恰恰是SD区域最偏好的碱基片段 ;密码子之间 ,以TAG或CTA构造的关联模式为编码区禁用模式 .另外 ,还发现编码开始区域或编码终止区域碱基片段的相对频率与基因表达水平有明显关系 ,多数高频出现的碱基片段其相对频率随基因表达水平的提高而增加 . 展开更多

关键词 碱基片段 大肠杆菌 基因编码区 统计分析

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小麦幼苗活性LTR反转录转座子筛选及其对非生物胁迫的响应 被引量：1

13

作者 周宾寒 杨竹 +4 位作者 王书平 方正武 胡赞民 徐兆师 张迎新 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期966-977,共12页

LTR(长末端重复,long terminal repeat)反转录转座子占小麦基因组的60%以上,筛选小麦基因组中具有转座活性的LTR反转录转座子,并分析其在非生物胁迫下的响应,对研究反转录转座子在小麦抗逆境胁迫中的作用具有重要意义。本研究通过生物... LTR(长末端重复,long terminal repeat)反转录转座子占小麦基因组的60%以上,筛选小麦基因组中具有转座活性的LTR反转录转座子,并分析其在非生物胁迫下的响应,对研究反转录转座子在小麦抗逆境胁迫中的作用具有重要意义。本研究通过生物信息学分析,从转座子数据库(TREP database)中筛选出4个具有完整结构的LTR反转录转座子Fatima、Wis、Angela和Babara;同时利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)、甲基化特异PCR(methylmion specific PCR,MSP)和转座子展示(transposon display,TD)技术分别分析了它们在盐、ABA、H2O2和干旱等处理的小麦幼苗期(二叶一心)叶和根中的表达水平、甲基化水平和转座活性变化。结果表明,这4个反转录转座子在正常条件下均存在基础水平的转录,并且能够响应上述4种胁迫而发生转录水平的变化,且在相同胁迫条件下表达水平变化趋势一致。Fatima、Angela和Babara在非生物胁迫处理下表达水平的提高与其甲基化水平的降低有关,Wis则相反。反转录转座子LTR序列含有胁迫响应顺式作用元件,但在非生物胁迫条件下顺式作用元件对这4个反转录转座子的调控作用不显著。与叶相比,这4个反转录转座子在根中对胁迫的响应程度更高,且在盐和ABA处理下转座活性更强。本研究将有助于进一步揭示LTR反转录转座子对非生物胁迫的响应规律,为进一步研究利用反转录转座子进行小麦抗逆育种的遗传改良积累资料。 展开更多

关键词 小麦 非生物胁迫 LTR反转录转座子 相对表达水平 转座

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亚麻生氰糖苷合成关键酶CYP79基因家族的鉴定及表达分析 被引量：1

14

作者 齐燕妮 李闻娟 +6 位作者 赵丽蓉 李雯 王利民 谢亚萍 赵玮 党照 张建平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期687-702,共16页

CYP79蛋白是生氰糖苷合成关键酶,但关于亚麻CYP79基因的研究鲜有报道。本研究对包括亚麻在内的9种作物的CYP79基因家族进行了鉴定,并分析了亚麻CYP79基因的序列特征、复制事件、共线性关系、系统进化、顺式作用元件及表达模式。结果表明... CYP79蛋白是生氰糖苷合成关键酶,但关于亚麻CYP79基因的研究鲜有报道。本研究对包括亚麻在内的9种作物的CYP79基因家族进行了鉴定,并分析了亚麻CYP79基因的序列特征、复制事件、共线性关系、系统进化、顺式作用元件及表达模式。结果表明,在亚麻、白亚麻、毛果杨、木薯、芝麻、高粱、大豆、葡萄及水稻中分别鉴定到9、9、3、2、5、7、6、16和4个CYP79家族成员;系统进化分析显示,CYP79基因的进化具有物种特异性;LuCYP79不均匀分布在4条染色体上,具有1~3个外显子,其启动子区含大量激素与逆境响应相关元件;共克隆到8个亚麻CYP79基因的全长DNA序列及5个成员的全长cDNA序列;LuCYP79蛋白序列长度为282~565aa,等电点为5.84~9.14,分子量为31.56~62.86kD,均为亲水性蛋白,定位于内质网;共有5对基因发生复制事件,占全部基因的77.8%,全部经历了强烈的纯化选择,其中LuCYP79-1和LuCYP79-9在拟南芥和木薯中均具有同源基因。表达分析表明,LuCYP79家族成员具有组织特异性,且各成员在不同遗传背景下表达模式不同,其中LuCYP79-1、LuCYP79-7、LuCYP79-8和LuCYP79-9在4个品种中的表达差异显著。相关分析表明,50d时的LuCYP79-1/LuCYP79-7与成熟亚麻籽中生氰糖苷含量呈极显著正相关,20d时的LuCYP79-7/LuCYP79-8及(LuCYP79-7+LuCYP79-9)/LuCYP79-8分别与成熟亚麻籽中生氰糖苷含量呈极显著正相关,初步推测其可能是亚麻籽生氰糖苷合成的关键基因。研究结果对进一步阐明亚麻CYP79蛋白的功能具有积极意义,并为培育低生氰糖苷亚麻品种提供了理论参考。 展开更多

关键词 亚麻 CYP79基因家族 生氰糖苷 生物信息学 表达分析

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甘薯PHB基因家族的全基因组鉴定和表达分析 被引量：1

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作者 梅玉琴 刘意 +3 位作者 王崇 雷剑 朱国鹏 杨新笋 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1715-1725,共11页

蛋白质抑制素(prohibitin,PHB)是在原核生物到真核生物中发现的含有SPFH结构域的蛋白质。植物PHB基因家族参与多种不同生物过程的重要功能,包括生长发育以及对生物和非生物胁迫的响应。目前PHB蛋白在拟南芥、水稻、玉米、大豆、番茄和... 蛋白质抑制素(prohibitin,PHB)是在原核生物到真核生物中发现的含有SPFH结构域的蛋白质。植物PHB基因家族参与多种不同生物过程的重要功能,包括生长发育以及对生物和非生物胁迫的响应。目前PHB蛋白在拟南芥、水稻、玉米、大豆、番茄和陆地棉等多种植物中被鉴定。但对甘薯中PHB家族的系统分析仍未确定。本研究鉴定出甘薯11个PHB基因,且对这些保守的蛋白质基序和基因结构的分析显示它们在系统发育亚群中具有高度的保守性。此外,启动子区域预测出与多种激素调节及胁迫相关的顺式作用元件,同时研究发现IbPHB基因在植物不同部位及受到不同的非生物胁迫时的表达模式存在差异。本研究系统分析了甘薯中IbPHB基因的一般特性,为甘薯及其他植物中PHB基因的功能特性研究提供了理论基础。 展开更多

关键词 甘薯 PHB基因家族 系统进化 生物信息学 表达分析

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青稞新基因HvMEL1 AGO的克隆和条纹病胁迫下的表达 被引量：4

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作者 姚晓华 王越 +3 位作者 姚有华 安立昆 王燕 吴昆仑 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1181-1190,共10页

为筛选与青稞条纹病相关的AGO类基因,本研究以青稞抗病品种昆仑14号和感病品种1141为材料,从感病和正常叶片的转录组测序结果中获得一个差异表达的AGO家族新基因,克隆验证了该基因为青稞HvMEL1 AGO。HvMEL1 AGO基因全长3462 bp,其中蛋... 为筛选与青稞条纹病相关的AGO类基因,本研究以青稞抗病品种昆仑14号和感病品种1141为材料,从感病和正常叶片的转录组测序结果中获得一个差异表达的AGO家族新基因,克隆验证了该基因为青稞HvMEL1 AGO。HvMEL1 AGO基因全长3462 bp,其中蛋白质编码区(CDS,coding domain sequence)在昆仑14号和1141品种中的一致性为100%,无内含子,全长3161 bp,包含一个3129 bp开放阅读框,编码1043个氨基酸,理论等电点为9.33,预测蛋白分子量为115,865.58 Da。蛋白质序列分析表明,HvMEL1 AGO为亲水性的不稳定酸性蛋白,具有高度保守的DUF1785、PAZ和PIWI结构域,属于AGO基因家族成员。进化树分析表明,HvMEL1 AGO与大麦AGO家族中HvAGO12、HvAGO18、HvAGO1D、HvAGO1B在拟南芥AGO家族系统发育树上属于AGO1一类;与HvAGO12的亲缘关系最近。蛋白质互作预测结果表明,在水稻中与MEL1作用密切的已知蛋白为DCL类,分别为DCL1、DCL2A、DCL3A、DCL3B和DCL4。半定量和定量PCR结果表明,条纹病胁迫下,抗病品种昆仑14号与感病品种1141的HvMEL1 AGO基因表达量显著下降;且1141显著高于昆仑14号(P<0.01)。推测青稞HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中发挥重要作用。本研究为探索HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中的作用及调控机制奠定基础。 展开更多

关键词 青稞 条纹病 HvMEL1 AGO基因 基因表达

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MMP15、PICK1基因在山羊睾丸中的表达研究

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作者 汪艳妃 张艳 +1 位作者 惠茂茂 陈祥 《山地农业生物学报》 2023年第4期18-25,共8页

MMP15、PICK1基因均是哺乳动物性腺组织中影响性腺生理功能正常发挥的重要影响因子,但它们在黔北麻羊睾丸组织中的表达规律尚不明晰。为研究黔北麻羊不同月龄的睾丸中MMP15、PICK1基因的表达情况,本试验以黔北麻羊为研究对象,通过qRT-PC... MMP15、PICK1基因均是哺乳动物性腺组织中影响性腺生理功能正常发挥的重要影响因子,但它们在黔北麻羊睾丸组织中的表达规律尚不明晰。为研究黔北麻羊不同月龄的睾丸中MMP15、PICK1基因的表达情况,本试验以黔北麻羊为研究对象,通过qRT-PCR技术分别检测MMP15与PICK1基因在1、3、6、9、12月龄的黔北麻羊睾丸中的表达水平并建立基因表达的标准曲线。结果显示:MMP15、PICK1基因在黔北麻羊不同月龄睾丸组织中均有表达;MMP15基因在黔北麻羊不同月龄睾丸中的表达量从高到低排列为:12月龄>1月龄>9月龄>3月龄>6月龄;12月龄与1月龄的表达差异不显著(P>0.05),二者表达量均极显著高于3月龄、6月龄、9月龄(P<0.01);9月龄表达显著高于3月龄(P<0.05),极显著高于6月龄(P<0.01);3月龄表达极显著高于6月龄(P<0.01)。PICK1基因在黔北麻羊不同月龄睾丸中的表达量从高到低排列分别是:3月龄>6月龄>12月龄>9月龄>1月龄;3、6月龄其表达量极显著高于9、12月龄(P<0.01);1月龄与其他几个月龄相比,其表达量均极显著低于其他月龄(P<0.01)。结合黔北麻羊的生理机能发育情况,黔北麻羊在6月龄时已经基本达到性成熟,所以此时睾丸内细胞活动增强,睾丸机能活跃。本次试验结果表明,黔北麻羊睾丸生精功能的正常发挥或与MMP15及PICK1基因的表达量有关。 展开更多

关键词 黔北麻羊 MMP15 PICK1 相对表达量 睾丸

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马铃薯GAUT基因家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量：4

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作者 牛娜 刘震 +6 位作者 黄鹏翔 朱金勇 李志涛 马文婧 张俊莲 白江平 刘玉汇 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期2348-2361,共14页

半乳糖醛酸转移酶(GAUT)是一种参与催化糖基化反应的酶类,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。本研究鉴定了马铃薯GAUT家族成员,并对其理化性质、染色体定位、基因结构、保守蛋白结构域、基因重复事件和表达模式进行了分析。结果表明... 半乳糖醛酸转移酶(GAUT)是一种参与催化糖基化反应的酶类,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。本研究鉴定了马铃薯GAUT家族成员,并对其理化性质、染色体定位、基因结构、保守蛋白结构域、基因重复事件和表达模式进行了分析。结果表明,鉴定到的41个GAUT家族成员(StGAUT),不均匀的分布在10条染色体上。根据基因的结构和系统发育蛋白特征,将41个StGAUT分为4个亚组。共线性分析表明,StGAUT基因家族存在12对片段重复基因,均在纯化选择下进化。通过对马铃薯双单倍体(DM)的不同组织部位和非生物胁迫下的RNA-seq数据进行分析,筛选出了组织特异性表达及响应非生物胁迫的StGAUT基因。此外,进一步对不同四倍体栽培种彩色马铃薯的薯皮和薯肉进行RNA-seq测序和分析,获得了可能参与花色素苷生物合成的StGAUT基因。本研究结果为进一步阐明StGAUT基因在马铃薯中的功能提供了有价值的信息。 展开更多

关键词 马铃薯 半乳糖醛酸转移酶 表达分析 花色素苷生物合成

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基因偏好模及其与基因表达水平关系的研究 被引量：2

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作者 晋宏营 李宏 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期176-182,共7页

利用重新定义的碱基片段的相对模式含量,研究了大肠杆菌和酵母基因序列的三碱基偏好模。发现在前导区,起始密码子模式的相对模式含量明显低于其它区,大肠杆菌基因拖尾区和编码终止区中,“SSS”型模式的相对模式含量平均较高。并研究了... 利用重新定义的碱基片段的相对模式含量,研究了大肠杆菌和酵母基因序列的三碱基偏好模。发现在前导区,起始密码子模式的相对模式含量明显低于其它区,大肠杆菌基因拖尾区和编码终止区中,“SSS”型模式的相对模式含量平均较高。并研究了基因前导区和拖尾区偏好模或禁用模出现频数与基因表达水平的关系,发现基因前导区偏好模使用频数的多少与基因表达水平成正相关关系,而禁用模使用频数的多少与基因表达水平则成反相关关系;在基因拖尾区,偏好模或禁用模使用频数的多少与基因表达水平的关系对于两种生物是不同的。 展开更多

关键词 基因 偏好模 基因表达水平 起始密码子模式 基因拖尾区

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SbGA20ox1·SbGA20ox3和SbGA2ox3基因对高粱品种赤霉素表达水平的影响 被引量：2

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作者 商靖 陆劲羽 +3 位作者 逄洪波 李雪梅 王艳秋 李玥莹 《安徽农业科学》 CAS 2022年第2期105-108,共4页

[目的]研究SbGA20ox1、SbGA20ox3和SbGA2ox3基因对高粱品种赤霉素表达水平的影响。[方法]以不同高粱品种为试材(9544.7057为父本与不同母本进行杂交得到子代:辽夏梁1号、辽2297、辽2697、辽5397、01-26B;以及01-26A为母本与不同父本进... [目的]研究SbGA20ox1、SbGA20ox3和SbGA2ox3基因对高粱品种赤霉素表达水平的影响。[方法]以不同高粱品种为试材(9544.7057为父本与不同母本进行杂交得到子代:辽夏梁1号、辽2297、辽2697、辽5397、01-26B;以及01-26A为母本与不同父本进行杂交得到子代:辽杂35、0-01、9544.7057、3550、辽2697),利用实时荧光定量PCR技术比较不同时期(拔节期、抽穗期、成熟期),不同品种的高粱之间SbGA20ox1基因、SbGA20ox3基因、SbGA2ox3基因表达含量规律。[结果]SbGA20ox1基因在同一父本不同母本高粱组的基因表达规律基本符合抽穗期>成熟期>拔节期;SbGA2ox3基因在同一父本不同母本高粱组的基因表达规律基本符合抽穗期>成熟期>拔节期,SbGA2ox3基因在同一母本不同父本高粱组的基因表达规律基本符合拔节期>成熟期>抽穗期。而SbGA20ox1基因在同一母本不同父本高粱组的基因表达以及SbGA20ox3基因在各品种高粱的基因表达并未发现明显规律,各时期基因的相对表达量大部分品种间无明显差异。[结论]该研究一定程度上揭示了SbGA20ox1、SbGA20ox3和SbGA2ox3基因在多个高粱品种各时期的基因表达规律,为进一步研究调控赤霉素水平的小基因家族的作用机制提供启示。 展开更多

关键词 高粱 相对表达量 实时荧光定量 赤霉素 小基因家族

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