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实时荧光定量PCR技术在致病菌检测中的应用 被引量:10
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作者 周丽民 雷永良 +2 位作者 王小光 叶碧峰 陈秀英 《标记免疫分析与临床》 CAS 2012年第5期296-299,共4页
目的本文将实时荧光定量PCR(Real-time Q-PCR)法检查致病菌与细菌培养法作比较,探讨对指导临床诊断治疗的意义。方法采用Real-time Q-PCR法和细菌培养法对100份标本进行6个微生物项目的检测,并比较两种方法的灵敏度、特异性和准确性。结... 目的本文将实时荧光定量PCR(Real-time Q-PCR)法检查致病菌与细菌培养法作比较,探讨对指导临床诊断治疗的意义。方法采用Real-time Q-PCR法和细菌培养法对100份标本进行6个微生物项目的检测,并比较两种方法的灵敏度、特异性和准确性。结果 Real-time Q-PCR法检测结果与细菌培养法,除完全符合的19例标本之外,另有8例用细菌培养法为阴性的标本,用Real-time Q-PCR法检测为阳性。结论 Real-time Q-PCR法较细菌培养法具有准确性好、灵敏度高、特异性强和检测快速等优点,是快速筛查致病菌的理想检测方法之一。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 细菌培养法 致病菌 快速筛查 应用
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Cu^(2+)、Cd^(2+)胁迫对小麦幼根SOD活性及其基因表达的影响 被引量:8
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作者 李春喜 张志娟 +3 位作者 张黛静 邵云 姜丽娜 李婷婷 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2011年第4期92-98,共7页
采用水培试验探索不同浓度(0 mg/L、5 mg/L、30 mg/L和60 mg/L)Cu2+或Cd2+胁迫(24 h、48 h、72 h和96 h)后对小麦幼根超氧化物歧化酶(SOD)活性的影响,并通过实时荧光定量聚合酶链式反应(real-timefluorescence quantitative PCR,Real-ti... 采用水培试验探索不同浓度(0 mg/L、5 mg/L、30 mg/L和60 mg/L)Cu2+或Cd2+胁迫(24 h、48 h、72 h和96 h)后对小麦幼根超氧化物歧化酶(SOD)活性的影响,并通过实时荧光定量聚合酶链式反应(real-timefluorescence quantitative PCR,Real-time Q-PCR)检测Cu/ZnSOD基因表达。结果表明,Cu2+胁迫处理72 h后,各处理SOD活性均较对照极显著提高(P<0.01),且30 mg/L浓度下SOD酶活性最高,是对照的3.67倍;而Cd2+胁迫处理后,幼根SOD活性整体呈现"升-降-升"的趋势,胁迫前期酶活性的降低程度与Cd2+浓度成正比,至72 h酶活性最低。Cd2+胁迫条件下Cu/ZnSOD的表达量明显高于Cu2+胁迫。不同时间Cu2+胁迫下,Cu/ZnSOD基因表达均呈现5 mg/L浓度处理高于60 mg/L和30 mg/L,表明低浓度促进而高浓度抑制该基因表达;而对于Cd2+胁迫,Cu/ZnSOD基因随浓度的升高和时间的延长呈现明显下降趋势,至96 h最低。本实验结果表明,Cu2+、Cd2+胁迫处理后浓度对基因表达的影响较大。该结果为深入探讨重金属胁迫下小麦幼根中SOD特性的研究提供理论参考和技术支持。 展开更多
关键词 小麦 Cu2+和Cd2+胁迫 超氧化物歧化酶 real-timeq-pcr 基因表达
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PPARγ2基因P12A单核苷酸多态性与2型糖尿病肾病的相关性 被引量:2
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作者 郝利霞 苏秀兰 毕力夫 《内蒙古医科大学学报》 2013年第4期290-294,298,共6页
目的:探讨PPARγ2基因P12A单核苷酸多态性与2型糖尿病肾病的关系。方法:所选对象根据WHO对糖尿病的标准,对照组55例,2型糖尿病组97例。2型糖尿病组根据每分钟尿蛋白排泄率早期肾病组59例和临床肾病组31例。TaqMan探针检测PPARγ2基... 目的:探讨PPARγ2基因P12A单核苷酸多态性与2型糖尿病肾病的关系。方法:所选对象根据WHO对糖尿病的标准,对照组55例,2型糖尿病组97例。2型糖尿病组根据每分钟尿蛋白排泄率早期肾病组59例和临床肾病组31例。TaqMan探针检测PPARγ2基因Pr012Ala基因型和等位基因。结果:PPARγ2基因的A等位基因频率在正常组、早期肾病组和临床肾病组中分别为7.7%、6.8%和8.1%,P12A基因型及等位基因的分布频率在正常组、早期肾病组和临床肾病组之间无显著性差异(P〉0.05)。调整病程后,应用logistic回归分析PPAR72基因Prol2Ala单核苷酸多态性与2型糖尿病肾病相关性,结果显示OR值在肾病组的两组间比较OR=0.966,95%IC为0.279~3.344。在早期肾病组和临床肾病组比较,A等住基因携带者在空腹胰岛素、胰岛素抵抗指数、胰岛素敏感指数和尿蛋白排泄率与P等位基因携带者比较有统计学意义(P〉0.05)。结论:PPARγ2基因Prol2Ala单核苷酸多态性与2型糖尿病肾病无明显的相关性。PPARγ2基因A等位基因是2型糖尿病肾病发生发展的保护基因。 展开更多
关键词 过氧化物酶增殖激活受体γ2 单核苷酸多态性 realtime q-pcr 2型糖尿病肾病
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新铁炮百合朱丽叶器官差异基因表达分析 被引量:2
4
作者 杜方 王婷 +1 位作者 樊俊苗 张浩宇 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期25-30,共6页
为了探明17个候选基因在新铁炮百合朱丽叶花、叶、鳞片3个器官中的表达情况,利用实时荧光定量PCR技术,对其相对表达量进行了研究。结果表明,根据表达情况,17个候选基因可以分为5类,CL10636.Contig1_All、CL6300.Contig2_All、CL7951.Con... 为了探明17个候选基因在新铁炮百合朱丽叶花、叶、鳞片3个器官中的表达情况,利用实时荧光定量PCR技术,对其相对表达量进行了研究。结果表明,根据表达情况,17个候选基因可以分为5类,CL10636.Contig1_All、CL6300.Contig2_All、CL7951.Contig5_All、Unigene8314_All、Unigene19279_All和CL1306.Contig1_All 6个在花中显著高表达,分别与糖转运蛋白-类SWEET4基因、赤霉素调控蛋白基因、线粒体伴侣基因、光依赖性短下胚轴基因、1-脱氧葡萄糖-5-磷酸合成酶基因、牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因高度同源;CL9292.Contig2_All、CL212.Contig5_All、Unigene1800_All、CL3468.Contig1_All、CL4520.Contig5_All、Unigene4212_All、CL4079.Contig1_All和Unigene10210_All8个在叶中显著高表达,分别与GDSL酯酶/脂酶基因、类黄酮O-甲基转移酶、脂氢过氧化物裂解酶基因、4-羟基-3-甲基-2-丁烯基二磷酸合成酶基因、多酚氧化酶基因、类葡苷露聚糖4-β-甘露糖转移酶基因、左旋海松烷合成酶基因和反式罗勒烯合成酶基因高度同源;CL2405.Contig1_All在鳞片中显著高表达,功能未知;CL1114.Contig2_All在花和叶中同时显著高表达,与3-酮酯酰Co A-硫解酶高度同源;CL1772.Contig2_All为非器官差异表达基因,与Δ24-甾醇还原酶基因高度同源。此结果可为今后研究这些候选基因的功能奠定基础,对百合分子育种具有重要意义。 展开更多
关键词 百合 差异基因 实时荧光定量pcr 器官
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Expression of structural genes related to anthocyanin biosynthesis of Vitis amurensis 被引量:1
5
作者 Quan Zhao Fei He +3 位作者 Malcolm J.Reeves Qiu-Hong Pan Chang-Qing Duan Jun Wang 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2016年第3期647-657,共11页
This research was designed to assess the changes in anthocyanin content in grape skins of Vitis amurensis and to explore m RNA transcriptions of 11 structural genes(PAL,CHS3, CHI1, F3H2, F30 H, F3050 H, DFR, LDOX, UF... This research was designed to assess the changes in anthocyanin content in grape skins of Vitis amurensis and to explore m RNA transcriptions of 11 structural genes(PAL,CHS3, CHI1, F3H2, F30 H, F3050 H, DFR, LDOX, UFGT,OMT and GST) related to anthocyanin biosynthesis during grape berry development, by the use of HPLC-MS/MS and real-time Q-PCR analysis. Accumulation of anthocyanins began at veraison, continued throughout the later berry development and reached a peak at maturity. Veraison is the time when the berries turn from green to purple. Expression of PAL, CHI1, and LDOX were up-regulated from 2 to4 weeks after flowering(WAF), down-regulated from6 WAF to veraison, whereas DFR was up-regulated at8 WAF, and then up-regulated from veraison to maturity.CHS3, F3050 H, UFGT, GST, and OMT were down-regulated from 2 WAF to veraison, and then up-regulated from veraison to maturity. The transcriptional expressions of the11 structural genes also showed positive correlations with the anthocyanin content from veraison to maturity. Positive correlations were also observed between OMT transcriptional level and the content of methoxyl-anthocyanins, and between F3050 H transcriptional level and the content of delphinidin anthocyanins. F3H2 and F30 H expression was up-regulated at 2 WAF. F3H2 expression was down-regulated from 4 WAF to veraison and then up-regulated again from veraison to maturity. F30 H expression was down-regulated at 4 WAF and then up-regulated again from 6 WAF to maturity. F30 H transcriptional level was correlated positively with the cyanidin anthocyanin concentration from veraison to maturity. These results indicate that the onset of anthocyanin synthesis during berry development coincides with a coordinated increase in the expression of a number of genes in the anthocyanin biosynthetic pathway. 展开更多
关键词 Anthocyanins Gene expression HPLC-MS/MS real-time q-pcr Vitis amurensis
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实时荧光定量PCR技术综述 被引量:44
6
作者 邓文星 张映 《生物技术通报》 CAS CSCD 2007年第5期93-95,103,共4页
实时荧光定量PCR技术是在PCR技术基础上发展起来的一种高度灵敏的核酸定量技术。与传统PCR相比,实时定量PCR能够更加快速、灵敏,并有效地对核酸进行定量检测。
关键词 实时荧光定量pcr 标准曲线
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藏药红景天对大鼠肺纤维化保护作用及机制探讨 被引量:12
7
作者 胡晓波 程德云 +3 位作者 穆茂 聂莉 方洵 杨礼腾 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期2772-2774,共3页
目的观察红景天对肺纤维化大鼠肺组织I型胶原、转化生长因子β1(TGF-β1)及其信号通路分子Smad4表达的影响,探讨红景天对大鼠肺纤维化的防治作用与机制。方法健康SD大鼠40只随机分为4组:模型组(A组),正常对照组(B组),红景天14d治疗组(C... 目的观察红景天对肺纤维化大鼠肺组织I型胶原、转化生长因子β1(TGF-β1)及其信号通路分子Smad4表达的影响,探讨红景天对大鼠肺纤维化的防治作用与机制。方法健康SD大鼠40只随机分为4组:模型组(A组),正常对照组(B组),红景天14d治疗组(C组),红景天28d治疗组(D组)各10只。博莱霉素(BLM)气管内滴入建立大鼠肺纤维化模型,正常对照组气管内滴入生理盐水。在造模的第2日治疗组予红景天0.21g/kg灌胃干预,于第14,28日取肺组织,运用组织芯片结合图象分析技术,通过苏木素-伊红(HE)染色观察肺组织病理学改变,用免疫组化检测I型胶原蛋白和TGF-β1的表达,实时荧光定量RT-PCR检测I型胶原和TGF-β1的mRNA表达,原位杂交技术对Smad4 mRNA进行定位定量分析。结果红景天在两时相皆抑制I型胶原,TGF-β1的表达。C组I型胶原蛋白的IOD值为(0.362±0.241),D组I型胶原蛋白IOD值为(0.334±0.122),与A组(0.513±0.384)相比有统计学意义(P均<0.05)。C组TGF-β1蛋白的IOD值为(0.062±0.013),D组TGF-β1蛋白IOD值为(0.058±0.011),与A组(0.100±0.005)相比有统计学意义(P均<0.05)。C组I型胶原mRNA相对表达量为(0.041±0.017),D组I型胶原mRNA相对表达量为0.040±0.021,与A组0.071±0.054相比有统计学意义(P均<0.05)。C组TGF-β1 mRNA相对表达量为(0.0025±0.0013),D组TGF-β1 mRNA相对表达量为(0.0030±0.0005),与A组(0.0170±0.0157)相比有统计学意义(P均<0.05)。肺组织Smad4 mRNA表达呈局灶性,在炎症和胶原沉积部位表达较明显,而治疗组和模型组比较无统计学意义(P均>0.05);治疗组Smad4 mRNA表达量与正常对照组(0.165±0.099)比较亦无统计学意义(P>0.05)。结论红景天对大鼠肺纤维化具有一定治疗作用,其机制可能是通过抑制I型胶原及TGF-β1表达,从而干扰TGF-β-Smads信号通路对基因表达、蛋白合成的调节而实现的。 展开更多
关键词 红景天 肺纤维化 Ⅰ型胶原 转化生长因子Β1 组织芯片 实时荧光定量pcr
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实时定量PCR技术研究DNA疫苗在小鼠体内的生物分布
8
作者 付洁 李丁 +6 位作者 夏绍友 宋海峰 董增祥 陈方 孙效 欧伦 汤仲明 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期728-732,766,共6页
目的:建立并确证实时定量PCR(RT-PCR)定量检测生物基质中质粒DNA的方法,并应用于治疗性核酸疫苗HIV-PV的体内生物分布研究。方法:建立SYBR Green荧光定量PCR绝对定量方法(Q-PCR),考察方法的特异性、灵敏度、精密度、准确度以及生... 目的:建立并确证实时定量PCR(RT-PCR)定量检测生物基质中质粒DNA的方法,并应用于治疗性核酸疫苗HIV-PV的体内生物分布研究。方法:建立SYBR Green荧光定量PCR绝对定量方法(Q-PCR),考察方法的特异性、灵敏度、精密度、准确度以及生物基质对PCR的抑制效应。小鼠尾静脉注射裸质粒DNA、小鼠尾静脉注射和灌胃2种途径免疫HIV-PV DNA疫苗,考察建立的Q-PCR方法对于不同形式的质粒DNA疫苗以及不同免疫方式的适用性。结果:Q-PCR方法可特异检测目标DNA,定量检测范围为10-10^7拷贝/100 ng基因组DNA(gDNA),定量下限(LLOQ)为10拷贝/100 ng gDNA。批内和批间精密度分别〈11%和8%;由高至低4种浓度(10^7,10^4,100,10拷贝/100 ng gDNA)QC样品准确度分别为(1.57±0.02)%,(1.60±0.01)%,(2.20±0.02)%和(2.28±0.02)%。用Q-PCR方法成功得到不同形式DNA疫苗和不同免疫途径(尾静脉注射和灌胃HIV-PV疫苗)下该质粒DNA的生物分布模式。结论:利用RT-PCR技术,建立了符合DNA疫苗生物分布研究要求的定量检测生物基质中质粒DNA的方法学,并成功应用于不同质粒DNA疫苗形式和不同免疫途径下的DNA疫苗的生物分布研究。 展开更多
关键词 DNA疫苗 实时定量pcr 生物基质 绝对定量 生物分布
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实时荧光定量PCR技术研究进展及其应用 被引量:7
9
作者 丁晓东 马国文 《内蒙古民族大学学报(自然科学版)》 2006年第6期665-668,共4页
实时荧光定量PCR(Real Time Quantitative PCR)是把酶动力学、核酸扩增与杂交、光谱分析和实时检测技术巧妙结合的一项技术;并且广泛应用于病毒学、遗传性疾病、肿瘤和癌症的诊断等方面.因此成为分子生物学研究中的重要工具,本文就此技... 实时荧光定量PCR(Real Time Quantitative PCR)是把酶动力学、核酸扩增与杂交、光谱分析和实时检测技术巧妙结合的一项技术;并且广泛应用于病毒学、遗传性疾病、肿瘤和癌症的诊断等方面.因此成为分子生物学研究中的重要工具,本文就此技术研究进展及其应用做一综述. 展开更多
关键词 荧光定量pcr TAqMAN探针 标准曲线
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黄药子及黄药子配伍当归对大鼠肝组织grp78和bad基因表达的影响 被引量:17
10
作者 汤青 刘树民 +2 位作者 王加志 周琦 刘天宇 《药物不良反应杂志》 2010年第2期91-95,共5页
目的:研究单用黄药子及黄药子配伍当归对大鼠肝组织grp78和bad基因表达的影响,探讨黄药子引起肝损伤以及配伍当归后其损伤减轻的机制。方法:30只清洁级SD雄性大鼠随机分为黄药子组、黄药子配伍当归组和对照组,每组10只。上述3组大鼠分... 目的:研究单用黄药子及黄药子配伍当归对大鼠肝组织grp78和bad基因表达的影响,探讨黄药子引起肝损伤以及配伍当归后其损伤减轻的机制。方法:30只清洁级SD雄性大鼠随机分为黄药子组、黄药子配伍当归组和对照组,每组10只。上述3组大鼠分别给予黄药子提取物混悬液(1mL相当于黄药子0.067g)、黄药子和当归提取物混悬液(1mL相当于黄药子0.067g,当归0.133g)及0.5%羧甲基纤维素钠(CMC)溶液各2mL,灌胃,2次/d,持续14d。末次给药24h后采用实时定量聚合酶链式反应(实时定量PCR)的方法测定各组大鼠肝脏grp78和bad基因的表达。结果:3组大鼠肝脏grp78和bad基因表达通过看家基因gapdh校正后的结果如下:黄药子组grp78和bad基因的2-△△Ct分别为339.9和256.2,黄药子配伍当归组分别为17.0和9.9,对照组均为1.0。与对照组比较,黄药子组grp78和bad基因表达明显上调,差异有统计学意义(P<0.01);而与黄药子组比较黄药子配伍当归组基因表达有显著的下调趋势,差异有统计学意义(P<0.01)。结论:黄药子可上调大鼠肝脏grp78和bad基因的表达,这可能是黄药子引起肝损伤的机制;当归对黄药子致大鼠肝脏grp78和bad基因表达上调的拮抗作用可能是其减轻黄药子所致肝损害的机制之一。 展开更多
关键词 黄药子 黄药子配伍当归 实时定量pcr grp78和bad基因
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实时荧光定量PCR法研究葛根素对成骨细胞TGF-β1及Smad2/3mRNA表达的影响 被引量:13
11
作者 钱康琦 孙玉明 詹秀琴 《辽宁中医药大学学报》 CAS 2013年第9期46-49,共4页
目的:检测葛根素对成骨细胞TGF-β1及Smad 2/3mRNA表达的影响,从分子生物学层面探讨葛根素治疗骨质疏松症的机理。方法:取小鼠胎鼠成骨细胞进行体外培养,以三种浓度1、0.1、0.01μg/mL的葛根素液进行干预,同时设置空白对照组,分别采用... 目的:检测葛根素对成骨细胞TGF-β1及Smad 2/3mRNA表达的影响,从分子生物学层面探讨葛根素治疗骨质疏松症的机理。方法:取小鼠胎鼠成骨细胞进行体外培养,以三种浓度1、0.1、0.01μg/mL的葛根素液进行干预,同时设置空白对照组,分别采用碱性磷酸酶(ALP)法检测成骨细胞活性,实时荧光定量PCR法检测葛根素干预液对成骨细胞TGF-β1及Smad 2/3mRNA表达变化的影响。结果:不同浓度葛根素干预液均能够增加成骨细胞内碱性磷酸酶的活性,并且呈浓度依赖性,实时荧光定量PCR结果显示成骨细胞内TGF-β1及Smad 2/3mRNA的表达明显高于阴性对照组(具有统计学差异P<0.05)。结论:表明葛根素可刺激成骨细胞信号转导蛋白Smad2/3mRNA的表达和刺激TGF-β1的分泌和合成,从而促进骨形成,抑制骨吸收。可能是其有效防治骨质疏松症的疗效机理。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 葛根素 TGF-Β1 SMAD2 3 成骨细胞
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冬虫夏草菌在寄主钩蝠蛾幼虫中的潜伏侵染过程研究 被引量:11
12
作者 雷桅 彭青云 +1 位作者 张古忍 刘昕 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2015年第2期387-392,共6页
冬虫夏草是青藏高原的特色名贵药材,是冬虫夏草菌Ophiocordyceps sinensis寄生于钩蝠蛾幼虫后形成的虫生子囊真菌,其发生机理和侵染途径至今未知。本文利用real-time q PCR实时定量技术检测了寄主蒲氏钩蝠蛾Thitarodes pui幼虫表皮、脂... 冬虫夏草是青藏高原的特色名贵药材,是冬虫夏草菌Ophiocordyceps sinensis寄生于钩蝠蛾幼虫后形成的虫生子囊真菌,其发生机理和侵染途径至今未知。本文利用real-time q PCR实时定量技术检测了寄主蒲氏钩蝠蛾Thitarodes pui幼虫表皮、脂肪体、血淋巴和肠壁等组织中冬虫夏草菌定殖量,分别建立了起始于表皮的侵染路径(R20.678)和起始于肠道的侵染路径(R20.271)两种Holt数学模型,经比较分析后,推论冬虫夏草菌随口腔摄食侵染寄主幼虫的方式具有一定合理性和可行性,揭示冬虫夏草菌可以通过进食途径实现其对钩蝠蛾幼虫的带菌生长、侵染和寄生,从而为深入阐释冬虫夏草菌与寄主钩蝠蛾幼虫相互作用关系提供重要参考。 展开更多
关键词 冬虫夏草菌 蒲氏钩蝠蛾 real-time q pcr 侵染 青藏高原
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丹皮酚对蛋白聚糖诱导的小鼠关节炎模型骶髂关节滑膜细胞BMP-2、Cbfα1及Smad1mRNA表达的影响 被引量:4
13
作者 吴倩 任婕 +2 位作者 吴琪 周晓红 杨德才 《湖北中医药大学学报》 2018年第2期18-22,共5页
目的观察丹皮酚对蛋白聚糖诱导的小鼠关节炎模型骶髂关节滑膜细胞BMP-2、Cbfα1及Smad1mRNA表达的影响,初步从分子水平探讨丹皮酚治疗强直性脊柱炎的机理。方法将40只BALB/c小鼠随机分为正常组、模型组、柳氮磺吡啶组和丹皮酚组,每组10... 目的观察丹皮酚对蛋白聚糖诱导的小鼠关节炎模型骶髂关节滑膜细胞BMP-2、Cbfα1及Smad1mRNA表达的影响,初步从分子水平探讨丹皮酚治疗强直性脊柱炎的机理。方法将40只BALB/c小鼠随机分为正常组、模型组、柳氮磺吡啶组和丹皮酚组,每组10只。除正常组外,其余三组采用完全弗氏佐剂+蛋白聚糖腹腔注射建立蛋白聚糖诱导的BALB/c小鼠关节炎模型。实时荧光定量PCR法检测丹皮酚对滑膜细胞BMP-2、Cbfα1及Smad1mRNA表达变化的影响。结果与正常组比较,模型组的BMP-2、Cbfα1和Smad1基因表达明显升高(P<0.01);与模型组比较,柳氮磺吡啶组的BMP-2、Cbfα1和Smad1基因表达差异无统计学意义(P>0.05),而丹皮酚组的基因mRNA表达具有显著差异(P<0.05)。结论丹皮酚能显著抑制强直性脊柱炎病理性骨化,且这种抑制作用与下调滑膜细胞BMP-2、Cbfα1和Smad1基因表达,从而阻断BMP/Smad成骨信号通路有关。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 丹皮酚 BMP-2 Cbfα1 Smad1强直性脊柱炎
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基于定量PCR方法初步分析西藏开菲尔粒中细菌与酵母菌数量变化 被引量:3
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作者 王兴兴 丁梦帆 +1 位作者 潘迎捷 王永杰 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期625-631,共7页
运用实时荧光定量PCR方法分析西藏开菲尔粒中细菌与酵母菌的数量变化规律,需要有效提取其微生物总基因组DNA。本文通过同时添加溶菌酶与溶壁酶优化实验方案,成功获得西藏开菲尔粒中微生物的总基因组DNA。荧光定量PCR分析提取自培养1、4... 运用实时荧光定量PCR方法分析西藏开菲尔粒中细菌与酵母菌的数量变化规律,需要有效提取其微生物总基因组DNA。本文通过同时添加溶菌酶与溶壁酶优化实验方案,成功获得西藏开菲尔粒中微生物的总基因组DNA。荧光定量PCR分析提取自培养1、4、8和12周的西藏开菲尔粒的微生物总基因组DNA,结果显示:4个时间点细菌16S rRNA与酵母菌26S rRNA基因拷贝数均分别约为每微升107拷贝与105拷贝,表明细菌与酵母菌的数量相对稳定。该结果为进一步研究西藏开菲尔粒中细菌与酵母菌间的共生关系奠定了一定的基础。 展开更多
关键词 西藏开菲尔粒 基因组提取 实时荧光定量pcr 数量变化
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毛尖紫萼藓类泛素蛋白基因的克隆与表达分析 被引量:1
15
作者 张梅娟 沙伟 +2 位作者 刘博 安洪雪 宋璐 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第6期58-62,共5页
为研究类泛素蛋白基因在苔藓植物中的生物学功能,从毛尖紫萼藓干旱c DNA文库中获得了类泛素蛋白基因c DNA全长序列,命名为Gp-UBL5。该基因c DNA全长471 bp,包含1个222 bp的完整开放阅读框,编码73个氨基酸组成的蛋白。生物信息学分析表明... 为研究类泛素蛋白基因在苔藓植物中的生物学功能,从毛尖紫萼藓干旱c DNA文库中获得了类泛素蛋白基因c DNA全长序列,命名为Gp-UBL5。该基因c DNA全长471 bp,包含1个222 bp的完整开放阅读框,编码73个氨基酸组成的蛋白。生物信息学分析表明,Gp-UBL5基因编码蛋白分子质量为8.525 k Da,等电点为7.84,为稳定型蛋白。进化分析显示,该编码蛋白与二穗短柄草、大麦等类泛素蛋白具有较高一致性,达96%-99%。实时荧光定量PCR结果表明,Gp-UBL5基因在复水和快速干旱的各个时期均有表达,推测该基因可能在毛尖紫萼藓的抗旱机制中发挥作用。 展开更多
关键词 毛尖紫萼藓 类泛素蛋白基因(Gp-UBL5) 基因克隆 实时荧光定量pcr
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法夫酵母中产类胡萝卜素特性与其合成相关基因表达关系的研究
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作者 郑晨华 杜希萍 +3 位作者 李利君 李天丽 曹樱 倪辉 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期123-130,共8页
为研究法夫酵母中类胡萝卜素合成代谢调控机理,通过高效液相色谱法和实时定量PCR技术分别对JMU-VDL668和JMU-N3法夫酵母菌株中类胡萝卜素和类胡萝卜素合成相关基因的表达差异进行分析,并研究了在JMU-VDL668菌株培养过程中添加β-胡萝卜... 为研究法夫酵母中类胡萝卜素合成代谢调控机理,通过高效液相色谱法和实时定量PCR技术分别对JMU-VDL668和JMU-N3法夫酵母菌株中类胡萝卜素和类胡萝卜素合成相关基因的表达差异进行分析,并研究了在JMU-VDL668菌株培养过程中添加β-胡萝卜素对其产虾青素的影响。结果显示,法夫酵母类胡萝卜素代谢途径的关键酶crt E,crt YB,crt I和crt S基因在JMUVDL668菌株中的表达水平整体低于JMU-N3菌株,而JMU-N3菌株中没有检测到crt R基因的表达。在JMU-VDL668菌株培养过程中添加β-胡萝卜素发现,在72 h和96 h添加时能促进虾青素的合成,其中96 h添加时所得虾青素比对照组提高了83%。结果表明,这两株菌的产类胡萝卜素特性与类胡萝卜素合成相关基因的表达量存在一定的正相关关系,且JMU-VDL668菌株中总类胡萝卜素细胞产率在一定范围内,可能存在反馈调节机制。 展开更多
关键词 法夫酵母 虾青素 实时定量pcr 代谢调控
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水中抑制物对定量PCR与膜过滤法检测E.coli的影响
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作者 徐丽梅 王晓昌 +2 位作者 周进宏 吉铮 张崇淼 《环境工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期609-614,共6页
针对水中病原微生物的污染,选择大肠埃希氏菌E.coli作为病原示踪剂,以E.coli染色体上β-葡萄糖醛酸酶uid A目的基因建立了SYBR Green实时荧光定量PCR的检测方法。该定量PCR方法灵敏度高,检测限可达104CFU/L,线性关系良好,相关系数为R2=0... 针对水中病原微生物的污染,选择大肠埃希氏菌E.coli作为病原示踪剂,以E.coli染色体上β-葡萄糖醛酸酶uid A目的基因建立了SYBR Green实时荧光定量PCR的检测方法。该定量PCR方法灵敏度高,检测限可达104CFU/L,线性关系良好,相关系数为R2=0.999。研究表明,定量PCR与菌液浓度呈显著正相关R2=0.935。通过人工投加腐殖酸、COD,研究了水中抑制物对定量PCR和膜过滤MF培养法的影响。结果显示,腐殖酸可使E.coli在培养皿上的菌落变小聚集,且显色不明显,当腐殖酸量为20 mg/L时,浓度为50 CFU/100 m L的E.coli完全受到抑制,没有菌落出现。腐殖酸对PCR扩增的抑制作用明显,当腐殖酸浓度增加到10 mg/L,定量PCR检测结果基因拷贝数减少约1 log,增加到20 mg/L定性PCR检测结果为阴性。 展开更多
关键词 E.COLI 实时荧光定量pcr 膜过滤 腐殖酸 抑制作用
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RhoA/Rho激酶信号通路参与慢性应激大鼠抑郁模型结肠动力的改变
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作者 贾海珍 胡柳丹 余保平 《武汉大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2012年第2期182-185,190,共5页
目的:检测Rho A、Rock1、Rock2在抑郁大鼠结肠组织中mRNA及蛋白的表达,探讨Rho A/Rho激酶信号通路在抑郁大鼠结肠动力障碍中的可能机制。方法:通过慢性应激建立大鼠抑郁模型,正常组作对照,应用Real Time Q-PCR和Western blot检测Rho A、... 目的:检测Rho A、Rock1、Rock2在抑郁大鼠结肠组织中mRNA及蛋白的表达,探讨Rho A/Rho激酶信号通路在抑郁大鼠结肠动力障碍中的可能机制。方法:通过慢性应激建立大鼠抑郁模型,正常组作对照,应用Real Time Q-PCR和Western blot检测Rho A、Rock1、Rock2在结肠组织中mRNA及蛋白的表达。结果:抑郁组结肠组织中的Rho A、Rock1、Rock2的mRNA及蛋白表达明显降低,与正常组比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论:RhoA/Rho激酶信号通路在抑郁大鼠结肠动力障碍起着重要作用,但其作用机制仍需进一步的实验研究。 展开更多
关键词 RHO激酶 抑郁 结肠动力 实时定量pcr
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高压氧对兔颈内动脉和基底动脉内皮细胞凋亡影响的实验研究
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作者 范祯祯 刘志艳 +5 位作者 蔡宏斌 张翠杰 张旭东 张兰芳 梁成 葛朝明 《重庆医学》 CAS 北大核心 2015年第24期3328-3330,共3页
目的探讨高压氧(HBO)对兔颈内动脉和基底动脉内皮细胞Caspase-3和Bcl-2mRNA表达的影响。方法健康成年新西兰白兔24只,随机分为HBO组和对照组各12只。HBO组每日持续暴露于2.2ATA HBO下60min,连续3d;对照组正常饲养,不予任何处理。实时荧... 目的探讨高压氧(HBO)对兔颈内动脉和基底动脉内皮细胞Caspase-3和Bcl-2mRNA表达的影响。方法健康成年新西兰白兔24只,随机分为HBO组和对照组各12只。HBO组每日持续暴露于2.2ATA HBO下60min,连续3d;对照组正常饲养,不予任何处理。实时荧光定量PCR法检测Caspase-3、Bcl-2mRNA在2组颈内动脉和基底动脉内皮细胞的表达水平。结果 HBO可使颈内动脉内皮细胞Caspase-3mRNA表达明显下降[(0.038±0.006)vs.(1.000±0.225)],Bcl-2mRNA表达明显增高[(1.877±0.169)vs.(1.000±0.364)];使基底动脉内皮细胞Caspase-3 mRNA表达明显降低[(0.419±0.091)vs.(1.000±0.175)],Bcl-2mRNA的表达明显升高[(1.269±0.270)vs.(1.000±0.117)],差异均有统计学意义(P<0.01)。结论HBO对兔脑血管内皮细胞凋亡的发生有抑制作用,其机制可能与HBO对促凋亡基因Caspase-3的抑制和抗凋亡基因Bcl-2的促进作用有关。 展开更多
关键词 高压氧 颈内动脉 基底动脉 细胞凋亡 CASPASE-3 Bcl-2 实时荧光定量pcr
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不同水分含量下黑土硝化反硝化微生物群落结构的变化
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作者 丛兢兢 马君玲 +5 位作者 李顺和 高威 鲍雪莲 朱雪峰 解宏图 王连峰 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期1400-1410,共11页
【目的】阐明土壤水分含量的变化对土壤硝化与反硝化微生物数量的影响,揭示土壤微生物群落结构对土壤水分含量的响应规律,为黑土区农田合理水分管理提供参考。【方法】依托长期定位试验平台,采集典型黑土区表层土壤样品进行室内微宇宙试... 【目的】阐明土壤水分含量的变化对土壤硝化与反硝化微生物数量的影响,揭示土壤微生物群落结构对土壤水分含量的响应规律,为黑土区农田合理水分管理提供参考。【方法】依托长期定位试验平台,采集典型黑土区表层土壤样品进行室内微宇宙试验,设置4个土壤水分含量梯度(40%WHC、60%WHC、80%WHC和100%WHC)模拟土壤湿度环境,土壤样品在(25±1)℃下连续培养7天后,采用实时荧光定量q-PCR和高通量测序技术,分析黑土硝化与反硝化微生物数量,揭示不同土壤水分含量下黑土微生物群落结构的变化规律。【结果】土壤水分对农田黑土硝化与反硝化微生物数量影响显著。硝化微生物AOA基因拷贝数在60%WHC下最低,随着土壤水分含量的升高而显著增加(P<0.05)。AOB基因拷贝数变化随土壤水分状况的变化由多到少依次为100%WHC、60%WHC、80%WHC和40%WHC。反硝化微生物nirS和nosZ基因拷贝数均随土壤含水量的升高而增加,在土壤含水量为100%WHC条件下均达到最高值,分别是40%WHC条件下的38和2.7倍。高通量测序及分析结果表明,不同土壤水分状况下土壤微生物群落结构发生明显分异,微生物物种组间差异分析发现,不同土壤水分状况微生物群落组成差异显著,80%WHC处理条件下土壤微生物群落的物种丰富度和多样性较高,而100%WHC处理条件下土壤微生物群落的多样性较低。低土壤水分(40%WHC和60%WHC)状况下土壤中的优势微生物属为难培养的RB41和硝化螺菌(Nitrospira),高土壤水分(80%WHC和100%WHC)状况下为根瘤杆菌(Rhizobacter)、假单胞菌(Pseudomonas)和黄色土源菌(Flavisolibacter)。土壤水分含量与优势微生物类群的相关分析结果表明,变形菌门(Proteobacteria)与土壤水分含量呈现极强的正相关关系,根瘤杆菌属和假单胞菌属与土壤水分含量呈显著正相关关系。【结论】较低的土壤水分含量增加硝化微生物丰度,� 展开更多
关键词 黑土 水分含量 实时荧光定量q-pcr 高通量测序 硝化微生物 反硝化微生物
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