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题名转录组分析松茸多糖诱导T细胞增殖的分子机制
被引量：1
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作者
朱淼
侯怡铃
唐贤
宋志强
丁祥
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机构
西华师范大学生命科学学院
西华师范大学环境科学与工程学院
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出处
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期1738-1747,共10页
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基金
四川省科技厅应用基础重点项目(2018JY0087)
四川省科技厅重点研发项目(2018NZ0055)
+1 种基金
四川省教育厅重大培育项目(16CZ0018)
南充市科技局项目(16YFZJ0043)。
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文摘
目的转录组分析松茸多糖(TMP-A)诱导T细胞增殖的分子机制。方法分别用TMP-A(10μg/mL)、LPS(10μg/mL)处理T细胞24 h,采用RNA-seq测序技术对T细胞进行测序并进行生物信息学分析。结果空白对照组、TMP-A组和LPS阳性对照组分别得到46574489、50259600、57439600条Clean reads,对应的总大小分别为6.99、7.54、8.62 G。线粒体色素C氧化酶基因家族、钙网蛋白基因等是TMP-A组的超高表达基因,在T细胞增殖过程中细胞运动、蛋白质合成及线粒体代谢增强,且氧化磷酸化所产生的能量是T细胞增殖过程的主要能量来源。TMP-A组相比于空白对照组有485个基因差异表达,其中上调的基因482个,下调的基因3个,主要与离子转运和系统过程,外周和质膜以及分子功能中转运活性有关;且通路涉及神经活性配体-受体相互作用、Ras信号途径、MAPK信号途径等。结论T细胞在TMP-A作用下的生物代谢发生差异,离子转运、质膜、转运活性相关基因是TMP-A诱导T细胞增殖的关键基因,且Ras-Raf-Erk-MAPK信号通路是TMP-A诱导T细胞增殖的关键信号通路。
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关键词
松茸多糖
RNA-Seq测序
差异基因
ras-raf-erk-mapk信号通路
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Keywords
Tricholoma matsutake polysaccharide(TMP⁃A)
RNA⁃Seq sequencing
differentially expressed genes(DEGs)
ras⁃raf⁃erk⁃mapk signaling pathway
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分类号
R285.5
[医药卫生—中药学]
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