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孟德尔随机化研究应用于因果推断的影响因素及其结果解读面临的挑战 被引量:34
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作者 王玉琢 沈洪兵 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1231-1236,共6页
孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究使用遗传变异作为工具变量,推断暴露因素与结局之间的因果关系,能够有效克服混杂和反向因果问题所导致的偏倚。然而,MR研究中的工具变量须满足关联性、独立性和排他性3个核心假设。即使核... 孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究使用遗传变异作为工具变量,推断暴露因素与结局之间的因果关系,能够有效克服混杂和反向因果问题所导致的偏倚。然而,MR研究中的工具变量须满足关联性、独立性和排他性3个核心假设。即使核心假设成立,MR研究在因果推断中的应用还受到其他局限性的影响。此外,MR研究结果的解读需要基于综合证据。本文将围绕MR研究应用于因果推断的影响因素和研究结果的解读进行综述,以期为MR研究结果应用提供指导。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 核心假设 因果推断 结果解读 局限性
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孟德尔随机化研究精神分裂症与自杀或故意自残的因果关系 被引量:8
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作者 丁佳豪 章梦琦 +5 位作者 郝明霞 龙丽婷 陈晓 田荣燊 张爽 苑杰 《中华精神科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期32-39,共8页
目的采用孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)方法研究精神分裂症与自杀或故意自残的双向因果关系。方法利用大规模全基因组关联研究(genome-wide association studies, GWAS)汇总数据, 选择相互独立且与欧洲血统人群精神分裂症... 目的采用孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)方法研究精神分裂症与自杀或故意自残的双向因果关系。方法利用大规模全基因组关联研究(genome-wide association studies, GWAS)汇总数据, 选择相互独立且与欧洲血统人群精神分裂症及自杀或故意自残相关的遗传位点作为工具变量。精神分裂症GWAS数据包括76 755例精神分裂症患者和243 649名对照者。自杀或故意自残的GWAS数据包括1 058例自杀或故意自残患者和307 942名对照者。应用逆方差加权法(inverse variance weighted, IVW)及加权中位数法进行MR分析, 以比值比作为评价指标对精神分裂症及自杀或故意自残的双向因果关系进行探讨。CochranQ检验评估各个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)之间的异质性。使用孟德尔随机多态性残差和离群值(Mendelian randomization, pleiotropy residual sum and outlier, MR-PRESSO)检测SNP异常值。MR-Egger截距测试检验SNP的水平多效性。"留一法"敏感性分析检验MR研究是否受单个SNP的影响。结果 IVW显示, 精神分裂症可增加自杀或故意自残的风险(OR=1.297, 95%CI=1.154~1.457, P<0.001), 且在加权中位数法中被证实(OR=1.232, 95%CI=1.038~1.461, P=0.017)。反之, 自杀或故意自残与精神分裂症无关(OR=0.969, 95%CI=0.927~1.012, P=0.157), 同样被加权中位数法证实。CochranQ检验、MR-PRESSO检测和MR-Egger截距测试显示工具变量之间不存在异质性或水平多效性;"留一法"敏感性分析证实, 没有单个SNP对整体的结果有较大的影响。结论精神分裂症与自杀或故意自残的风险增加有显著的因果关系。 展开更多
关键词 精神分裂症 自杀 自残 孟德尔随机化 因果推断
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孟德尔随机化研究及其在中医药领域的应用展望 被引量:6
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作者 谢朝荣 陶庆锋 +3 位作者 胡缤予 周梦荻 郑晖 赵凌 《中医杂志》 CSCD 北大核心 2023年第5期438-442,447,共6页
孟德尔随机化研究以遗传变异作为工具变量建立模型,用于测试风险因素与各种表型间的因果关系,目前已被广泛用于流行病学中疾病复杂病因的探索。孟德尔随机化研究能有效克服混杂和反向因果导致的偏倚,且易于实施,使其在中医药领域进行因... 孟德尔随机化研究以遗传变异作为工具变量建立模型,用于测试风险因素与各种表型间的因果关系,目前已被广泛用于流行病学中疾病复杂病因的探索。孟德尔随机化研究能有效克服混杂和反向因果导致的偏倚,且易于实施,使其在中医药领域进行因果关系的推断变得可行。通过对孟德尔随机化研究的概念、核心假设、常见类型、在医学领域的研究现状及当前面临的弱工具变量、多效性、连锁不平衡等问题的阐述和分析认为,(1)孟德尔随机化研究在中医药领域具有较大的应用发展空间,其有助于中医证型的简化,理清不同病证间的关系,实现“异病同治”的目的;(2)该方法可有效补充观察性研究和干预性研究的不足,为中医药研究提供新方法;(3)同时存在可用数据相对局限的问题。 展开更多
关键词 孟德尔随机化研究 遗传变异 因果推断 中医药研究方法
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网络型自然垄断产业纵向分离改革绩效评估--基于随机推断的小样本双重差分模型 被引量:3
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作者 裴丹 陈林 韩胜飞 《数量经济技术经济研究》 CSCD 北大核心 2023年第1期192-212,共21页
中国铁塔股份有限公司的成立,是中国移动通信业的一次纵向分离式改革,也是国家对信息网络产业的“统一大市场”式改革。近期党的二十大报告提出加快建设数字中国、加快建设网络强国,而移动通信业正是“数字中国”和“网络强国”的基础... 中国铁塔股份有限公司的成立,是中国移动通信业的一次纵向分离式改革,也是国家对信息网络产业的“统一大市场”式改革。近期党的二十大报告提出加快建设数字中国、加快建设网络强国,而移动通信业正是“数字中国”和“网络强国”的基础设施领域之一,为考察其改革成效,并在“十四五”时期更好地指导数字信息基础设施建设,本文使用鲍莫尔(Baumol)的成本次可加方法实证测算铁塔设施的自然垄断属性,并剖析成本属性影响行业产出绩效的具体机理,然后在国内首次构建基于随机推断的小样本双重差分模型(Randomization Inference Differences-in-Differences,RI-DID)评估此次纵向分离改革的政策绩效。实证结果表明,信息基础网络上游环节的通讯铁塔设施有一定的非自然垄断属性,垄断式的经营因推高成本而导致下游运营商产出显著下降。从政策含义看,在网络型自然垄断产业或非自然垄断的网络环节,纵向分离改革需审慎推进。从方法论看,本文一是改良了成本次可加模型的数据选取方式,避免因不区分上下游业务环节及垄断利润过高造成自然垄断属性误判;二是引入随机推断法,在一定程度上控制了双重差分法的小样本学术难题,有助于双重差分模型在政策绩效评估中的进一步科学应用。 展开更多
关键词 数字基础设施 纵向分离 自然垄断 随机推断 小样本双重差分模型
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基于孟德尔随机化的DHA水平与ADHD的关系研究 被引量:1
5
作者 张郑 谭景蓝 罗庆华 《重庆医学》 CAS 2024年第8期1151-1156,共6页
目的基于孟德尔随机化(MR)探讨二十二碳六烯酸(DHA)水平与注意缺陷与多动障碍(ADHD)发病的关系。方法从已发表的全基因组关联研究数据(GWAS)中提取了DHA和ADHD的工具变量,为了确保研究结果的稳定性,ADHD数据集选自两个不同的研究。DHA... 目的基于孟德尔随机化(MR)探讨二十二碳六烯酸(DHA)水平与注意缺陷与多动障碍(ADHD)发病的关系。方法从已发表的全基因组关联研究数据(GWAS)中提取了DHA和ADHD的工具变量,为了确保研究结果的稳定性,ADHD数据集选自两个不同的研究。DHA水平的数据集包括115006例个体,ADHD1数据集共55374例个体涵盖20183例病例和35191例对照,ADHD2共225534例个体涵盖38691例病例和186843例对照,进行全面MR分析和敏感性分析。应用逆方差加权法(IVW)、MR-Egger回归分析及加权中位数法(WM)进行MR分析,以优势比(OR)和回归系数(β)作为评价指标,对DHA与ADHD的双向因果关系进行探讨。结果DHA与ADHD发病存在因果关系(ADHD1的IVW:OR=0.833,95%CI:0.719~0.964,P=0.014;ADHD2的IVW:OR=0.895,95%CI:0.808~0.992,P=0.034)。此外,发现ADHD与DHA存在反向因果关系(IVW:β=-0.073,95%CI:-0.103~-0.043,P<0.001)。结论DHA水平与ADHD存在潜在的双向因果关系。 展开更多
关键词 二十二碳六烯酸 注意缺陷与多动障碍 孟德尔随机化 因果推断 儿童心理
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基于孟德尔随机化方法探讨炎症性肠病与骨质疏松性骨折的因果关系 被引量:1
6
作者 陈尚桐 陈跃平 +1 位作者 宋世雷 黄川洪 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2024年第1期67-73,共7页
目的:采用两样本孟德尔随机化方法(Mendelian randomization,MR)探讨炎症性肠病与骨质疏松性骨折的因果关系。方法:对全基因关联研究(GWAS)的汇总数据进行分析。炎症性肠病选择克罗恩病与溃疡性结肠炎的样本进行分析,其中克罗恩病、溃... 目的:采用两样本孟德尔随机化方法(Mendelian randomization,MR)探讨炎症性肠病与骨质疏松性骨折的因果关系。方法:对全基因关联研究(GWAS)的汇总数据进行分析。炎症性肠病选择克罗恩病与溃疡性结肠炎的样本进行分析,其中克罗恩病、溃疡性结肠炎的GWAS汇总数据来源于欧洲IEU数据库,样本量分别为20883和47745,骨质疏松性骨折的GWAS汇总数据来源于芬兰数据库,样本量为173619。利用与克罗恩病、溃疡性结肠炎密切关联的单核苷酸多态性(SNPs)作为工具变量,分别用逆方差加权(IVW)法、MR-Egger回归法、加权中位数(Weighted Median,WME)法、简单模式(Simple Mode)法和加权模式(Weighted Mode)法行两样本孟德尔随机化分析,以比值比(OR值)评价炎症性肠病对骨质疏松性骨折风险的因果关系。分别采用IVW和MR-Egger法进行Cochran Q异质性检验,用MR_pleiotropy_test函数、MR PRESSO进行多效性检验,MR_leaveoneout_plot函数进行敏感性分析,并计算F值以评估是否存在弱工具变量偏倚。结果:共获得了52个与克罗恩病密切相关的SNPs作为工具变量,IVW结果[OR(95%CI):1.12(1.03-1.22),P=0.006]、WME结果[OR(95%CI):1.15(1.01-1.32),P=0.02]、MR-Egger结果[OR(95%CI):1.16(0.94-1.44),P=0.15]、Simple Mode结果[OR(95%CI):1.15(0.88-1.50),P=0.28]和Weighted Mode结果[OR(95%CI):1.16(0.97-1.39),P=0.10],提示克罗恩病与骨质疏松性骨折存在正向因果关系。共获得了88个与溃疡性结肠炎密切相关的SNPs作为工具变量,IVW结果[OR(95%CI):1.15(1.03-1.28),P=0.009]、MR-Egger结果[OR(95%CI):1.35(1.03-1.75),P=0.02]、WME结果[OR(95%CI):1.18(1.01-1.37),P=0.02]、Simple Mode结果[OR(95%CI):1.15(0.86-1.55),P=0.32]和Weighted Mode结果[OR(95%CI):1.19(0.96-1.47),P=0.10],提示溃疡性结肠炎与骨质疏松性骨折存在正向因果关系。克罗恩病与骨质疏松性骨折的异质性检验结果分别为P=0.55和P=0.52,即不存在异质性;多效性检验结果MR_pleiotropy_test函� 展开更多
关键词 孟德尔随机化 骨质疏松症 炎症性肠病 因果推断
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油性坚果摄入量与原发性肺癌的两样本孟德尔随机化研究
7
作者 郭学云 李娜 +1 位作者 陶国仲 黄正 《昆明医科大学学报》 CAS 2024年第6期44-50,共7页
目的以两样本孟德尔随机化方法探讨油性坚果摄取量与原发性肺癌的因果关系。方法从全基因组关联研究openGWAS公开数据库中筛选出与油性坚果摄入量相关的(P<5×10^(-7))单核苷酸多态性位点作为工具变量,以逆方差加权法为该研究评... 目的以两样本孟德尔随机化方法探讨油性坚果摄取量与原发性肺癌的因果关系。方法从全基因组关联研究openGWAS公开数据库中筛选出与油性坚果摄入量相关的(P<5×10^(-7))单核苷酸多态性位点作为工具变量,以逆方差加权法为该研究评估因果效应的主要分析方法,并采用MR-Egger回归和加权中位数法用于补充说明,以OR值及95%CI评价油性坚果摄入量与原发性肺癌之间是否存在因果关系。采用mr_pleiotropy_test法及MR-PRESSO法检验水平多效性,leave-one-out留一法进行敏感性检验。结果从ukbb-16576数据集共提取100个SNP作为工具变量,MR-Egger回归、加权中位数和逆方差加权法计算得OR值和95%可信区间分别[0.63,95%CI(0.11~3.65),P=0.611],[0.34,95%CI(0.19~0.61),P=0.001],[0.32,95%CI(0.21~0.48),P=0.001],所有b值结果方向均小于0。mr_pleiotropy_test检验显示MR-Egger截距为-7.66E-03,接近于0,P=0.441,同样MR-PRESSO包GlobalTest检验P=0.162,所选的工具变量不存在水平多效性,经过leave-one-out敏感性分析,未发现任何SNP位点对结果产生显著影响,表明结果具有较高的稳定性和可靠性。结论两样本孟德尔随机化分析表明油性坚果摄入量与原发性肺癌的发病风险呈负向因果关系,但需要更大样本量和不同种族背景的人的数据来进一步验证。 展开更多
关键词 油性坚果 原发性肺癌 孟德尔随机化 因果推断
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孟德尔随机化探索维生素B 12缺乏性贫血和1型糖尿病风险的因果关系
8
作者 赵晨玥 高景波 +4 位作者 郭荣 曹桂芝 郭敏 岳昊 薛慧琴 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第5期644-649,共6页
目的使用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究方法确定维生素B 12(VitB_(12))缺乏性贫血是否与1型糖尿病(type 1 diabetes,T1D)有因果关系。方法双样本MR研究选择从T1D和VitB_(12)缺乏性贫血的全基因组关联研究获得的单核苷... 目的使用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究方法确定维生素B 12(VitB_(12))缺乏性贫血是否与1型糖尿病(type 1 diabetes,T1D)有因果关系。方法双样本MR研究选择从T1D和VitB_(12)缺乏性贫血的全基因组关联研究获得的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)作为工具变量,采用逆方差加权(inverse-variance weighted,IVW)作为MR的主要分析方法,并额外采用加权中位数法(weighted median,WME)、MR-Egger和weighted mode方法来进行验证。对工具变量进行敏感性分析,保证分析的稳健性。结果共获得10个与VitB_(12)缺乏性贫血密切相关的SNP作为工具变量,IVW结果(OR=2.706,95%CI 1.357~5.396,P<0.05)、WME结果(OR=5.179,95%CI 2.678~10.015,P<0.05)、MR-Egger结果(OR=13.088,95%CI 2.230~76.802,P<0.05)和Weighted mode结果(OR=5.699,95%CI 2.807~11.570,P<0.05)均表明基因预测VitB_(12)缺乏性贫血与T1D的发病风险显著相关。同时反向MR研究发现T1D并不是VitB_(12)缺乏性贫血原因。多种敏感性分析表明研究分析结果具有稳健性。结论本研究表明VitB_(12)缺乏性贫血是T1D发生的危险因素,两者之间存在正向因果关联。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 维生素B 12缺乏性贫血 1型糖尿病 单核苷酸多态性 因果推断
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炎症因子与糖尿病肾病的因果关系:双向孟德尔随机化研究
9
作者 董朋涛 王峥 +2 位作者 李晓羽 张青 冯雪 《中国循证医学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第5期543-549,共7页
目的 采用孟德尔随机化方法探索炎症因子与糖尿病肾病之间潜在的因果关系。方法 使用炎症因子和糖尿病肾病的全基因组关联研究的摘要级数据,逆方差加权分析法用作主要分析方法,采用加权中位数、MR-Egger回归法、简单模型和中位模型方法... 目的 采用孟德尔随机化方法探索炎症因子与糖尿病肾病之间潜在的因果关系。方法 使用炎症因子和糖尿病肾病的全基因组关联研究的摘要级数据,逆方差加权分析法用作主要分析方法,采用加权中位数、MR-Egger回归法、简单模型和中位模型方法进行结果补充。进行敏感性分析检验孟德尔随机化分析结果是否可靠。结果 在逆方差加权分析方法中,干细胞因子[OR=1.28,95%CI(1.04,1.58),P=0.020]和干扰素-γ[OR=1.36,95%CI(1.10,1.70),P=0.005]与糖尿病肾病风险呈正相关,糖尿病肾病与干扰素诱导蛋白10[OR=0.90,95%CI(0.83,0.98),P=0.012]之间存在负相关。敏感性分析结果显示孟德尔随机化分析结果可靠。结论 干细胞因子和干扰素-γ与发生糖尿病肾病风险增加有关,糖尿病肾病会减少体内干扰素诱导蛋白10的表达。炎症因子与糖尿病肾病发生之间存在潜在的因果关系。这一发现对糖尿病肾病的前期诊断及治疗具有一定的临床指导意义。 展开更多
关键词 炎症因子 糖尿病肾病 孟德尔随机化 因果推断
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血清维生素D与乳腺癌的因果关系分析
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作者 王旭 马兆龙 +2 位作者 肖宝荣 万龙 孟丽 《医学理论与实践》 2024年第17期2902-2905,共4页
目的:通过两样本孟德尔随机化方法探索维生素D与乳腺癌的因果关系。方法:以公开发表汇总水平的全基因组关联分析(GWAS)数据为基础,利用与维生素D强相关的单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量,采用逆方差加权、加权中位数等五种分析方法评... 目的:通过两样本孟德尔随机化方法探索维生素D与乳腺癌的因果关系。方法:以公开发表汇总水平的全基因组关联分析(GWAS)数据为基础,利用与维生素D强相关的单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量,采用逆方差加权、加权中位数等五种分析方法评估因果关联。使用Cochran’s Q检验进行异质性分析,并使用MR-Egger回归进行多效性评估,最后使用“留一法”进行敏感性分析。结果:逆方差加权法显示血清维生素D水平与乳腺癌之间不存在因果关系(P>0.05),其余四种方法也显示均无因果关系,异质性检验显示SNP之间存在一定的异质性(P<0.05)。MR-Egger回归分析结果表明纳入的SNP不存在水平多效性(P>0.05)。“留一法”分析显示没有单个SNP明显影响总体的效应估计。结论:本研究显示血清维生素D水平与乳腺癌之间不存在因果关系,补充维生素D对于降低乳腺癌的发病率可能没有帮助。 展开更多
关键词 维生素D 乳腺癌 孟德尔随机化 因果推断
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甲状腺功能障碍与白癜风之间的关联:一项两样本孟德尔随机化研究
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作者 陈悦 高爱莉 《中国皮肤性病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期26-31,58,共7页
目的 探究甲状腺功能障碍与白癜风之间的因果关系,为甲状腺功能障碍与白癜风发病风险关联提供遗传学证据支持。方法 两样本孟德尔随机化(MR)研究数据来源于公共数据库。本研究选择甲状腺功能亢进(甲亢)、甲状腺功能减退(甲减)、游离甲... 目的 探究甲状腺功能障碍与白癜风之间的因果关系,为甲状腺功能障碍与白癜风发病风险关联提供遗传学证据支持。方法 两样本孟德尔随机化(MR)研究数据来源于公共数据库。本研究选择甲状腺功能亢进(甲亢)、甲状腺功能减退(甲减)、游离甲状腺素(FT4)和促甲状腺素(TSH)作为暴露因素,白癜风作为结局变量。甲亢和甲减的单核苷酸多态性(SNPs)来自IEU数据库的全基因组关联研究(GWAS),包括462 933个样本。FT4和TSH的数据来自甲状腺组学联盟,包括72 167个样本。与来自不同的IEU数据库的白癜风GWAS研究(包括337 159个样本)进行两样本MR分析。研究采用随机效应逆方差加权法(inverse-variance weighted, IVW)、MR-Egger回归、加权中位数法(weight median estimator, WME)等3种回归模型对甲状腺功能障碍与白癜风的因果关系进行孟德尔随机化分析。结果 IVW模型显示甲减(OR=1.00, 95%CI:1.00~1.01)为白癜风的危险因素,MR-Egger回归截距项P>0.05,即筛选出的SNPs不存在基因多效性,因此孟德尔随机化在本研究中为因果推断的有效方法。异质性检验结果P<0.05,故应重点关注随机效应IVW模型。结论 利用两样本孟德尔随机化方法排除混杂因素和反向因果关联后,得到无偏估计的结果,据此可以确定甲减与白癜风之间存在因果关系。 展开更多
关键词 白癜风 甲状腺功能障碍 甲减 孟德尔随机化 因果推断
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基于两样本孟德尔随机化分析系统性红斑狼疮与膝关节骨性关节炎的因果关系 被引量:2
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作者 张广阳 宋启春 +4 位作者 赵研 李东 刘瑞宇 时志斌 党晓谦 《中国骨与关节损伤杂志》 2023年第2期140-143,共4页
目的采用两样本孟德尔随机化分析方法来研究系统性红斑狼疮与膝关节骨性关节炎发病风险的因果关系。方法获取系统性红斑狼疮和膝关节骨性关节炎的全基因组关联研究(Genome-wide association study,GWAS)数据,将单核苷酸多态性(Single nu... 目的采用两样本孟德尔随机化分析方法来研究系统性红斑狼疮与膝关节骨性关节炎发病风险的因果关系。方法获取系统性红斑狼疮和膝关节骨性关节炎的全基因组关联研究(Genome-wide association study,GWAS)数据,将单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)作为工具变量并选择敏感的SNPs进行分析。通过逆方差加权法(Inverse variance weighted,IVW)、加权中位数法(Weighted median,WM)、MR-Egger回归法进行两样本孟德尔随机化分析,以OR值评估系统性红斑狼疮与膝关节骨性关节炎之间的因果关系,并对结果进行异质性和多效性检验。结果纳入4个SNP位点作为工具变量,随机效应模型IVW法和WM法估计的OR值分别为1.062(95%CI为1.009~1.118,P=0.021)和1.054(95%CI为1.018~1.091,P=0.003),表明系统性红斑狼疮与膝关节骨性关节炎之间存在因果关系。MREgger回归方程截距项为-0.0268(P=0.798),表明因果估计结果不受基因多效性的影响。结论系统性红斑狼疮与膝关节骨性关节炎存在正向因果关系,系统性红斑狼疮的存在使得膝关节骨性关节炎的发病风险升高。 展开更多
关键词 膝关节骨性关节炎 系统性红斑狼疮 孟德尔随机化 因果推断
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酒精、咖啡、绿茶和乳制品的摄入量与前列腺癌的关联:两样本孟德尔随机化研究
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作者 柴红强 邵晋凯 +2 位作者 吴明 赵克洁 庞磊 《现代泌尿外科杂志》 CAS 2024年第3期253-260,共8页
目的采用两样本孟德尔随机化方法探究酒精、咖啡、绿茶和乳制品的摄入量与前列腺癌(PCa)发病之间是否存在因果关系,以期帮助明确PCa的发病风险因素,从而帮助寻求PCa的预防途径。方法采用全基因组关联研究(GWAS)收集酒精、咖啡、绿茶、... 目的采用两样本孟德尔随机化方法探究酒精、咖啡、绿茶和乳制品的摄入量与前列腺癌(PCa)发病之间是否存在因果关系,以期帮助明确PCa的发病风险因素,从而帮助寻求PCa的预防途径。方法采用全基因组关联研究(GWAS)收集酒精、咖啡、绿茶、乳制品和PCa的数据,采用两样本孟德尔随机化(2SMR)方法探讨上述饮品摄入量与PCa发病风险的因果关联。逆方差加权法(IVW)是本次孟德尔随机化(MR)分析的主要方法。敏感性分析采用加权中位数、MR-Egger回归、MR多效性残差和离群值(MR-PRESSO)检验。结果咖啡摄入量(OR:0.994,95%CI:0.990~0.999,P=0.014)、绿茶摄入量(OR:0.999,95%CI:0.998~0.999,P=0.036)与PCa发病呈负向因果效应。酒精摄入量(OR:0.997,95%CI:0.990~1.004,P=0.392)和乳制品摄入量(OR:1.025,95%CI:0.983~1.069,P=0.256)与PCa发病风险无因果关联。在加权中位数、MR-Egger回归和留一法分析中,结果均稳健,无异质性和多效性。结论咖啡摄入量和绿茶摄入量与PCa发病存在因果关联,而酒精摄入量与乳制品摄入量和PCa发病则没有因果关联。 展开更多
关键词 孟德尔随机化法 前列腺癌 因果推断 全基因组关联研究 酒精 咖啡 绿茶 乳制品
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基于两样本孟德尔随机化研究血脂水平和子宫内膜异位症之间的关系
14
作者 李永红 何家楠 +3 位作者 许俊晖 张圆青 郑群 何跃东 《成都医学院学报》 CAS 2024年第3期424-427,共4页
目的 采用两样本孟德尔随机化研究,探索血脂水平和子宫内膜异位症之间的因果关系。方法 利用大样本全基因组关联研究(GWAS)汇总数据,选择与各类血脂水平密切相关的遗传位点为工具变量,采用逆方差加权法进行两样本孟德尔随机化分析,以OR... 目的 采用两样本孟德尔随机化研究,探索血脂水平和子宫内膜异位症之间的因果关系。方法 利用大样本全基因组关联研究(GWAS)汇总数据,选择与各类血脂水平密切相关的遗传位点为工具变量,采用逆方差加权法进行两样本孟德尔随机化分析,以OR值评价各类血脂水平与子宫内膜异位症间的因果关系。结果 除了极小极低密度脂蛋白(VLDL)胆固醇外,其余与VLDL有关的血脂水平升高会增加子宫内膜异位症的发病风险(OR>1)。高密度脂蛋白(HDL)中与胆固醇有关的血脂类型、小低密度脂蛋白(LDL)中总胆固醇水平升高可减少子宫内膜异位症的发病风险(OR<1)。所有与甘油三酯相关的血脂类型、小LDL中胆固醇酯与总脂质比率的升高均可增加子宫内膜异位症的发病风险(OR>1)。结论 多种类型的血脂水平会影响子宫内膜异位症的发生,HDL中与胆固醇或甘油三酯相关的血脂水平可作筛查子宫内膜异位症的生物指标。 展开更多
关键词 孟德尔随机化研究 子宫内膜异位症 血脂水平 因果关系
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孟德尔随机化研究首次性行为年龄与双相障碍的关系
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作者 张郑 罗庆华 《中华精神科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期199-206,共8页
目的通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探索首次性行为年龄(age at first sexual intercourse,AFS)与双相障碍发病风险之间的潜在因果关系。方法利用来自欧洲血统人群的大规模全基因组关联研究(Genome-Wide Association... 目的通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探索首次性行为年龄(age at first sexual intercourse,AFS)与双相障碍发病风险之间的潜在因果关系。方法利用来自欧洲血统人群的大规模全基因组关联研究(Genome-Wide Association Studies,GWAS)汇总数据,选择与AFS和双相障碍相关、相互独立的遗传位点作为暴露和结局的工具变量。AFS的数据来源包括医学研究委员会整合流行病学单位(Medical Research Council Integrative Epidemiology Unit,MRC-IEU)的406457名个体(AFS1数据)和英国生物库(UK Biobank,UKB)的397338名个体(AFS2数据)。双相障碍的GWAS数据来源于精神病基因组学联盟(Psychiatric Genomics Consortium,PGC)2019年和2021年的研究,分别包括20352例患者与31358名对照者(BD1数据)和41917例患者与371549名对照者(BD2数据)。通过逆方差加权法(inverse variance weighting,IVW)评估AFS与BD的因果效应,此外采用MR-Egger回归、加权中位数法(weighted median,WM)、基于众数的简单估计和基于众数的加权估计法检验结果稳定性,以优势比(odds ratio,OR)和效应系数(beta coefficient,β)作为效应大小的评价指标。结果正向MR分析显示,AFS与双相障碍发病风险存在因果关系(IVW:OR=0.69,95%CI=0.57~0.82,P<0.001)。反向MR分析显示,双相障碍与AFS未见因果关系(IVW:β=0.01,95%CI=-0.01~0.03,P=0.159)。结论AFS与双相障碍发病风险之间有因果关系,而双相障碍对AFS的影响不显著。 展开更多
关键词 双相情感障碍 性行为 孟德尔随机化 因果推断
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肥胖和IgA肾病的因果关系:孟德尔随机化研究
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作者 董朋涛 王峥 +1 位作者 李晓羽 张青 《临床肾脏病杂志》 2024年第5期370-377,共8页
目的 本研究应用孟德尔随机化方法探索肥胖和IgA肾病之间潜在的因果关系。方法 使用肥胖相关形状(体重指数、体脂百分比、腰围和腰臀比)和IgA肾病的全基因组关联研究的摘要级数据,逆方差加权分析法用作主要分析方法,加权中位数、MR-Egge... 目的 本研究应用孟德尔随机化方法探索肥胖和IgA肾病之间潜在的因果关系。方法 使用肥胖相关形状(体重指数、体脂百分比、腰围和腰臀比)和IgA肾病的全基因组关联研究的摘要级数据,逆方差加权分析法用作主要分析方法,加权中位数、MR-Egger回归法对结果进行补充。敏感性分析用于检验孟德尔随机化分析结果是否可靠。结果 (1)两样本孟德尔随机化结果显示在正向分析逆方差加权分析方法中,体重指数(OR=1.193,95%CI:1.104~1.289,P<0.001)、体脂百分比(OR=1.189,95%CI:1.054~1.341,P=0.005)和腰围(OR=1.307,95%CI:1.178~1.450,P<0.001)与IgA肾病可能存在正向因果关系。(2)多变量孟德尔随机化显示体脂百分比(P=0.10)和腰围(P=0.18)与IgA肾病的因果关系差异无统计学意义。(3)反向孟德尔随机化结果显示IgA肾病与腰臀比(OR=1.112,95%CI:1.046~1.183,P=0.0007)存在正向因果关系,敏感性分析均提示分析结果可靠。结论 孟德尔随机化结果支持肥胖会增加IgA肾病的发病概率。高体重指数的人们平时要更注意体重及生活管理,并定期进行肾功能检查。 展开更多
关键词 肥胖 IGA肾病 孟德尔随机化 因果推断
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基于双样本孟德尔随机化研究二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险的因果关系
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作者 曹铁凤 何雨诗 沈慧敏 《中国医药导报》 CAS 2024年第14期9-12,共4页
目的 探讨孟德尔随机化(MR)分析二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险的因果关系。方法 本研究基于两样本MR分析,将二甲双胍作为暴露因素,卵巢癌为结局变量。二甲双胍数据来源于IEU OpenGWAS project网站的全基因组关联研究(GWAS)及已发表的药... 目的 探讨孟德尔随机化(MR)分析二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险的因果关系。方法 本研究基于两样本MR分析,将二甲双胍作为暴露因素,卵巢癌为结局变量。二甲双胍数据来源于IEU OpenGWAS project网站的全基因组关联研究(GWAS)及已发表的药物靶点研究,卵巢癌的GWAS数据来自卵巢癌协会联盟。使用随机效应逆方差加权(IVW)法、加权模式法、MR-Egger回归法、加权中位数法、简单模式法进行MR分析;科克伦Q检验用于异质性检验,MR-Egger截距法和MR-PRESSO法进行水平多效性检验;留一法确定单个工具变量是否对结果产生影响。结果 对于第一种暴露因素,最终获取了45个单核苷酸多态性位点作为工具变量;对于第二种暴露因素,获取32个工具变量。二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险不存在因果关系;对于第一种暴露因素,工具变量不存在异质性及水平多效性;对于第二种暴露因素,工具变量存在异质性,但本研究使用随机效应IVW法,不影响最终结果;留一法均提示无异常工具变量。二甲双胍治疗与不同类型卵巢癌发病风险不存在因果关系。对于两种暴露因素,工具变量均存在部分异质性,但本研究使用随机效应IVW法,不影响最终结果;留一法均提示无异常工具变量。结论 二甲双胍治疗与卵巢癌发病风险之间无明显因果关系。 展开更多
关键词 二甲双胍 孟德尔随机化 全基因组关联研究 因果推断 卵巢癌
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基于两样本孟德尔随机化的肠道微生物多尔氏菌属与急性呼吸窘迫综合征的因果关系研究
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作者 崔旭东 王文豪 杨敬平 《国际呼吸杂志》 2024年第8期914-919,共6页
目的:采用孟德尔随机化(MR)分析方法,探讨肠道微生物多尔氏菌属与急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的因果关系。方法:对全基因关联研究(GWAS)的汇总数据进行分析。多尔氏菌属的GWAS汇总数据来源于IEU数据库;ARDS的GWAS汇总数据来源于FinnGen数... 目的:采用孟德尔随机化(MR)分析方法,探讨肠道微生物多尔氏菌属与急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的因果关系。方法:对全基因关联研究(GWAS)的汇总数据进行分析。多尔氏菌属的GWAS汇总数据来源于IEU数据库;ARDS的GWAS汇总数据来源于FinnGen数据库。多尔氏菌属数据包含14306例样本,ARDS包含328例样本。筛选10个与多尔氏菌属密切关联的遗传位点作为工具变量。分别使用逆方差加权法、加权中位数法和MR-Egger回归分析等方法进行两样本孟德尔随机化分析,以OR值和95%CI为评估指标,评估多尔氏菌属与ARDS之间的因果关系,同时进行基因多效性检验、异质性检验和敏感性分析来评估结果的稳定性和可靠性。结果:逆方差加权法结果显示多尔氏菌属丰度升高可以明显降低ARDS的患病风险(P=0.034,OR=0.212,95%CI:0.050~0.891),加权中位数法的结果显示了相同的因果关系(P=0.017,OR=0.150,95%CI:0.031~0.714),MR-Egger回归结果无统计学意义(P=0.971)。MR-Egger截距法结果显示不存在基因的水平多效性(P=0.473)。异质性检验表明单核苷酸多态性存在异质性(P=0.024),使用随机效应逆方差加权法进一步分析显示多尔氏菌属与ARDS之间仍存在因果关联(β=-1.552,SE=0.733,P=0.034)。敏感性分析显示研究结果没有产生偏倚。结论:利用两样本孟德尔随机化方法排除混杂因素和因果关联后,得到无偏倚估计结果,多尔氏菌属与ARDS之间存在因果关系。 展开更多
关键词 呼吸窘迫综合征 孟德尔随机化 肠道微生物 因果推断
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男性和女性睾酮与非酒精性脂肪肝的孟德尔随机化研究
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作者 沈涛 黄鑫 +2 位作者 袁中尚 管庆波 王淑康 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期121-131,共11页
目的采用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探究男性和女性睾酮与非酒精性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的因果关联。方法利用全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)汇总数据,使... 目的采用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探究男性和女性睾酮与非酒精性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的因果关联。方法利用全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)汇总数据,使用女性、男性睾酮(总睾酮、生物有效性睾酮)以及性激素结合球蛋白(sex hormone-binding globulin,SHBG)的遗传变异作为工具变量,采用逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)为主分析方法,同时结合基于其他模型假设下的6种单变量MR方法评估女性、男性睾酮(总睾酮、生物有效性睾酮)以及SHBG与NAFLD的因果关系。此外,应用芬兰生物银行(FinnGen)的NAFLD数据对探索性分析的结果进行验证。进一步采用Cochran′s Q检验,MR-Egger回归和留一法等方法进行敏感性分析,评估工具变量的异质性水平、基因多效性和稳定性。结果探索性分析IVW模型结果表明,女性生物有效性睾酮和SHBG与NAFLD具有因果关联,女性生物有效性睾酮水平每增加一个单位,NAFLD发病风险增高24%(OR=1.24,95%CI 1.07~1.43,P=0.004);女性SHBG每降低一个单位,NAFLD发病风险增高31%(OR=0.69,95%CI 0.57~0.83,P<0.001)。然而,男性睾酮(总睾酮,生物有效性睾酮)以及SHBG和女性总睾酮与NAFLD并未显示出因果关系。其他6种MR方法的结果与IVW法基本一致。外部验证数据的结果进一步证明了女性生物有效性睾酮和SHBG与NAFLD的因果关系。结论较高的女性生物有效性睾酮水平与较低的SHBG水平可能会增加NAFLD的发病风险。 展开更多
关键词 总睾酮 生物有效性睾酮 性激素结合球蛋白 孟德尔随机化 因果推论 非酒精性脂肪肝病
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克罗恩病与衰弱的双向孟德尔随机化研究 被引量:2
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作者 高亚南 徐涯鑫 +3 位作者 朱宇倩 徐军 姚亭 陈亚梅 《预防医学》 2023年第11期943-947,共5页
目的采用孟德尔随机化(MR)研究方法分析克罗恩病(CD)与衰弱的因果关系,为制定相应的防治策略提供依据。方法CD的遗传关联数据来自国际炎症性肠病遗传学联盟,包括20883人,收集单核苷酸多态性位点(SNP)12276506个;衰弱的遗传关联数据来自... 目的采用孟德尔随机化(MR)研究方法分析克罗恩病(CD)与衰弱的因果关系,为制定相应的防治策略提供依据。方法CD的遗传关联数据来自国际炎症性肠病遗传学联盟,包括20883人,收集单核苷酸多态性位点(SNP)12276506个;衰弱的遗传关联数据来自一项包括175226人的Meta分析,收集SNP 7589717个。采用逆方差加权法(IVW),以CD相关的37个SNP为工具变量,衰弱为研究结局进行正向MR分析;以衰弱相关的13个SNP为工具变量,CD为研究结局进行反向MR分析;采用Cochran Q检验评估异质性,采用MR-PRESSO检验和MR-Egger回归法检验水平多效性,采用留一法检验结果的稳健性。结果正向MR分析结果显示,与未患CD者相比,遗传学预测的CD患者的衰弱风险升高(β=0.018,95%CI:0.011~0.026,P<0.05);Cochran Q检验显示不存在异质性(P>0.05),MRPRESSO检验和MR-Egger回归法均未发现工具变量的水平多效性(均P>0.05)。逐个剔除SNP后,MR分析结果稳健。反向MR分析未观察到衰弱与患CD之间的关联(O_(R)=0.740,95%CI:0.206~2.661,P>0.05)。结论遗传学预测的CD与衰弱有关,提示应加强CD患者衰弱相关的筛查和预防。 展开更多
关键词 克罗恩病 衰弱 孟德尔随机化 因果推断
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