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西尼罗病毒的RT-PCR检测与鉴定 被引量:7
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作者 邓永强 姜涛 +3 位作者 范宝昌 于曼 祝庆余 秦鄂德 《微生物学免疫学进展》 2004年第4期31-35,共5页
建立西尼罗病毒敏感、特异、快速的RTPCR检测方法用于实验室诊断和流行病学监测。采用一步RTPCR和套式PCR法对西尼罗病毒感染的乳鼠脑和细胞培养上清进行扩增,并对扩增产物进行序列测定。两种方法均可分别从两种组织中扩增出与预期大小... 建立西尼罗病毒敏感、特异、快速的RTPCR检测方法用于实验室诊断和流行病学监测。采用一步RTPCR和套式PCR法对西尼罗病毒感染的乳鼠脑和细胞培养上清进行扩增,并对扩增产物进行序列测定。两种方法均可分别从两种组织中扩增出与预期大小相一致的片段,套式PCR法比一步RTPCR法更为敏感,该扩增片段与西尼罗病毒埃及Eg101株相应序列的同源性为99%。 展开更多
关键词 西尼罗病毒 rt-pcr一步法 套式pcr
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禽I型副粘病毒f基因克隆及序列分析 被引量:7
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作者 宋建领 赵文华 +5 位作者 杨斌 张永仙 王金萍 信爱国 朱建波 丛佩清 《中国病毒学》 CSCD 2003年第2期141-145,共5页
用RT-PCR一步法对云南省不同禽类(鸡、鸽子)3株禽I型副粘病毒F基因进行扩增和克隆,并对其f基因片段核苷酸序列进行分析,结果表明,云南省禽I型副粘病毒各毒株同源性为88.1%~94.9%,与疫苗株LaSota和强毒株F48E9的同源性为85.6%。所分离... 用RT-PCR一步法对云南省不同禽类(鸡、鸽子)3株禽I型副粘病毒F基因进行扩增和克隆,并对其f基因片段核苷酸序列进行分析,结果表明,云南省禽I型副粘病毒各毒株同源性为88.1%~94.9%,与疫苗株LaSota和强毒株F48E9的同源性为85.6%。所分离两株新城疫病毒在F蛋白裂解位点区(112~117aa)的氨基酸序列与强毒株在这一区域的序列完全相同,表明为强毒株。鸽I型副粘病毒F蛋白裂解位点区的氨基酸序列与PPMV ZQ98-1株在这一区域的序列完全相同,揭示为中强毒株。以1 662bp核苷酸绘制系统发育树,表明云南地方新城疫病毒属于基因Ⅶ型,鸽I型副粘病毒属于基因Ⅵ型。 展开更多
关键词 禽Ⅰ型副粘病毒 F基因 基因克隆 序列分析 rt-pcr一步法 同源性 系统发育
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实时荧光RT-PCR一步法检测番茄环斑病毒 被引量:26
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作者 朱建裕 朱水芳 +1 位作者 廖晓兰 高必达 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期338-341,共4页
根据番茄环斑病毒 (ToRSV)各株系RNA1聚合酶基因的保守序列 ,设计并合成 1对引物和 1条TaqMan荧光探针 ,建立了对ToRSV的实时荧光RT PCR检测方法。该方法利用TaqMan荧光探针实时监测目的基因的扩增 ,实现RT PCR扩增与探针检测同时进行 ... 根据番茄环斑病毒 (ToRSV)各株系RNA1聚合酶基因的保守序列 ,设计并合成 1对引物和 1条TaqMan荧光探针 ,建立了对ToRSV的实时荧光RT PCR检测方法。该方法利用TaqMan荧光探针实时监测目的基因的扩增 ,实现RT PCR扩增与探针检测同时进行 ,不需PCR后处理 ,消除了PCR产物的污染 ,不需电泳和EB染色 ,减少了检测步骤 ,节省了时间。这个方法具有“灵敏、准确、简便、快速”的特点适合于种传病害的快速诊断和口岸检验检疫运用。 展开更多
关键词 实时荧光rt-pcr一步法 检测技术 番茄 环斑病毒 聚合酶基因 保守序列 pcr产物 诊断 检验检疫
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