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肿瘤发生过程中miRNA与lncRNA的相互作用 被引量:10
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作者 陈声灿 肖丙秀 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1055-1061,共7页
非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是生物体内普遍存在,且对生命活动具有重要调控作用的生物分子.以微RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)为代表的ncRNA分子在肿瘤发生和发展过程中都有重要的作用.越来越... 非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是生物体内普遍存在,且对生命活动具有重要调控作用的生物分子.以微RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)为代表的ncRNA分子在肿瘤发生和发展过程中都有重要的作用.越来越多研究发现,miRNA和lncRNA之间的关系是非常密切的,某些lncRNA(如H19和BIC)可以作为miRNA的前体,通过加工成miRNA而发挥作用.有些miRNA通过作用于lncRNA影响肿瘤的发生(如:miR-129与MEG3,let-7与H19);同样地,有些lncRNA通过作用于miRNA影响肿瘤的发生(如:HULC与miR-372,PTCSC3与miR-574-5p,ciRS-7与miR-7,Sry与miR-138).miRNA与lncRNA之间既可以直接相互作用,也可以通过其它分子(特别是蛋白质或蛋白质复合物)间接地影响着肿瘤的发生和发展.揭示miRNA和lncRNA相互作用在肿瘤发生中的作用可以为肿瘤的诊断和治疗提供新思路. 展开更多
关键词 rna 长链非编码rna rna-rna相互作用 肿瘤发生
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环状RNA的生物学功能及其在胃肠肿瘤发生中的作用 被引量:4
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作者 赵乾富 陈仕俊 +1 位作者 肖丙秀 郭俊明 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2018年第6期601-612,共12页
环状RNA(circular RNA,circ RNA)是广泛存在于真核生物转录组的内源性非编码RNA.与线性RNA不同,circ RNA不易被酶解,具有更加稳定的结构.circ RNA具有微小RNA(micro RNA,mi RNA)海绵、RNA结合蛋白海绵、调节转录以及翻译蛋白质等多种生... 环状RNA(circular RNA,circ RNA)是广泛存在于真核生物转录组的内源性非编码RNA.与线性RNA不同,circ RNA不易被酶解,具有更加稳定的结构.circ RNA具有微小RNA(micro RNA,mi RNA)海绵、RNA结合蛋白海绵、调节转录以及翻译蛋白质等多种生物学功能,能够在转录水平或转录后水平调节基因的表达.近期的研究发现,circ RNA在调控肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭过程中扮演着重要的角色.胃肠肿瘤是我国常见且死亡率高的恶性肿瘤,研究者在胃肠肿瘤中发现大量异常表达的circ RNA(如:hsa_circ_0014717、hsa_circ_0001017、hsa_circ_0061276、hsa_circ_0125965和hsa_circ_KLDHC10等).本文首先阐述circ RNA的形成机制和生物学功能;然后结合国内外胃肠肿瘤相关circ RNA的最新研究进展和本课题组相关研究成果,对circ RNA影响胃肠肿瘤发生的机制作一综述,并希望能以此为胃肠肿瘤的诊断和治疗提供新的理论依据. 展开更多
关键词 环状rna 微小rna rna-rna相互作用 胃肠肿瘤 肿瘤诊断
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体内与体外RNA-RNA相互作用的比较初探
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作者 陆启轩 查磊 +3 位作者 李宗城 陈临溪 李伍举 应晓敏 《军事医学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期517-520,共4页
目的通过比较in vitro与in vivo的RNA-RNA相互作用(RNA-RNA interaction,RRI),探究通过in vitroRRI推测in vivo RRI的可靠性。方法采用perl语言编写脚本分析酵母转录组水平in vitro RNA的二级结构信息,得到可能的in vitro RRI,再与酵母... 目的通过比较in vitro与in vivo的RNA-RNA相互作用(RNA-RNA interaction,RRI),探究通过in vitroRRI推测in vivo RRI的可靠性。方法采用perl语言编写脚本分析酵母转录组水平in vitro RNA的二级结构信息,得到可能的in vitro RRI,再与酵母的in vivo小核仁RNA(snoRNA)-rRNA相互作用进行比较。结果发现in vitrosnoRNA-rRNA相互作用与in vivo snoRNA-rRNA相互作用的重叠率仅为23.42%(26/111);而in vitro测定的snoRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的snoRNA片段重叠率为38.78%(19/49);in vitro测定的rRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的rRNA片段重叠率为80.70%(46/57)。结论 in vitro和in vivo条件下snoRNA-rRNA的相互作用差异很大,提示in vitro条件下测定的snoRNA-rRNA的相互作用不能真实反映它们在in vivo的相互作用。 展开更多
关键词 rnarna相互作用 生物信息学 rna 小核仁 核糖体rna
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