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中蜂囊状幼虫病毒RdRp基因dsRNA干扰的研究 被引量:10
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作者 史红霞 党晓群 +5 位作者 朱祥龙 马振刚 刘永梅 黄钰彬 周泽扬 许金山 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期103-111,共9页
中蜂囊状幼虫病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)可以引起中蜂幼虫死亡,给中蜂的养殖造成严重的威胁。其RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)是病毒复制中必不可少的中心酶,控制着病毒的复制和翻译过程。本研究以CSB... 中蜂囊状幼虫病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)可以引起中蜂幼虫死亡,给中蜂的养殖造成严重的威胁。其RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)是病毒复制中必不可少的中心酶,控制着病毒的复制和翻译过程。本研究以CSBV RdRp基因为靶标,选取两个干扰区域RdRp-1和RdRp-2,并构建相应的dsRNA表达载体,获取dsRNA后进行RNAi实验,通过qRT-PCR检测CSBV RdRp基因的表达情况。实验结果显示:干扰片段RdRp-1不能显著下调RdRp基因的转录,而干扰片段RdRp-2可显著性下调RdRp表达并具有剂量依赖性,当添食2μg dsRdRp-2时,在72 h RdRp基因表达下调了85%,CSBV的衣壳蛋白VP1基因下调表达78%,幼虫死亡率降低60%,表明RdRp基因可以作为RNA干扰的靶标用于CSBV防治,本研究为后期在养蜂场进行蜜蜂病毒病的防治奠定了基础。 展开更多
关键词 中华蜜蜂 中蜂囊状幼虫病毒(CSBV) rna依赖rna聚合酶(rdrp) dsrna体外表达 rnaI
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中国国内首次发现Nam Dinh病毒 被引量:9
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作者 刘渠 林琳 +5 位作者 周健明 陈应坚 张起文 王德全 李静媚 金玉娟 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期1-6,共6页
2009~2011年,课题组在深圳市龙岗区的致倦库蚊标本中检测到我国首株Nam Dinh病毒(Nam DinhVirus,NDiV)。本研究通过细胞培养、SYBR Green I实时定量荧光RT-PCR和RT-PCR方法对深圳NDiV的细胞易感性和分子进化特征进行分析。结果发现4批... 2009~2011年,课题组在深圳市龙岗区的致倦库蚊标本中检测到我国首株Nam Dinh病毒(Nam DinhVirus,NDiV)。本研究通过细胞培养、SYBR Green I实时定量荧光RT-PCR和RT-PCR方法对深圳NDiV的细胞易感性和分子进化特征进行分析。结果发现4批致倦库蚊标本可以引起C6/36细胞病变。4株深圳分离株的SYBR Green I实时定量荧光RT-PCR检测结果均出现"S"型扩增曲线与特异性的熔解曲线。对分离株的RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)基因与部分ZmHel1(Zn module+Superfamily 1 Helicase)基因进行扩增均可以在2%琼脂糖电泳显示到目的条带。4株深圳分离毒株的RdRp基因核苷酸和氨基酸序列与越南代表株NDiV(02VN178)的同源性均达99%以上。系统进化树分析表明,4株深圳NDiV株与越南NDiV代表株的亲缘性最近,属于同一个进化分支上。据文献检索表明,本文发现的NDiV为国内首次报道。 展开更多
关键词 NAM Dinh病毒 rna依赖rna聚合酶(rdrp) 系统进化树
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RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP)与非编码RNA(ncRNA)调控的研究进展 被引量:6
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作者 丁超 张兰 +1 位作者 曹洁 于文强 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期256-261,共6页
RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干... RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干扰(RNA interference,RNAi)现象。越来越多研究证明RdRP的功能与非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)密不可分,本文对病毒RdRP、细胞RdRP与ncRNA调控之间的关系作了较详细的阐述,同时对丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)诱发的肝癌机制提出新的观点。 展开更多
关键词 rna依赖rna聚合酶(rdrp) 非编码rna(ncrna) rna干扰(rnaI) 丙型肝炎病毒(HCV)
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猪繁殖与呼吸综合征病毒RNA依赖的RNA聚合酶功能研究进展
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作者 段宏勇 唐超智 +5 位作者 王树茂 王安冉 姜一峰 周艳君 高飞 李丽薇 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期674-679,共6页
猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory synd,rPoRmReS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRS virus,PRRSV)引起的一种重要猪病毒性传染病,其主要临床特征是母猪繁殖障碍和生长肥育猪呼吸系统疾病,给全球养猪业造成巨大... 猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory synd,rPoRmReS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRS virus,PRRSV)引起的一种重要猪病毒性传染病,其主要临床特征是母猪繁殖障碍和生长肥育猪呼吸系统疾病,给全球养猪业造成巨大损失。Nsp9是PRRSV的一种非结构蛋白,由于其RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)功能,在PRRSV的复制和毒力中发挥着重要作用。Nsp9序列高度保守,并包含T细胞表位,对未来疫苗的开发具有重要意义。Nsp9在PRRSV感染过程中,特别是基因组RNA复制和转录中,成为病毒与宿主蛋白相互作用的中心。本文就Nsp9在病毒遗传变异、病毒毒力、与其他病毒蛋白及宿主蛋白相互作用影响病毒复制、宿主免疫调节、抗病毒药物及疫苗研发等方面的研究进展进行综述。本综述可为PRRSV的防控提供新的思路和策略。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) rna依赖rna聚合酶(rdrp) 病毒复制 病毒毒力 疫苗研发
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中老缅边境蚊虫标本中Nam Dinh病毒的分离和鉴定 被引量:5
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作者 雷雯雯 郭晓芳 +4 位作者 付士红 冯云 宋敬东 周红宁 梁国栋 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期782-789,共8页
2012年在云南省南部中老缅边境地区采集的库蚊中分离到3株病毒(YN12039、YN12040、YN12060),该病毒只引起C6/36细胞发生病变。负染电镜观察病毒颗粒呈球形,直径60-80nm,有囊膜,表面有刺突。采用RTPCR方法对分离株的RNA依赖的RNA聚合酶... 2012年在云南省南部中老缅边境地区采集的库蚊中分离到3株病毒(YN12039、YN12040、YN12060),该病毒只引起C6/36细胞发生病变。负染电镜观察病毒颗粒呈球形,直径60-80nm,有囊膜,表面有刺突。采用RTPCR方法对分离株的RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRp)、HEL1(superfamily 1helicase)、S蛋白(spike protein)基因进行扩增,同源性分析显示3株云南新分离株与Nam Dinh病毒(NDiV)RdRp、HEL1、S蛋白氨基酸序列相似度最高,均为98%以上。系统进化分析结果表明,3株云南新分离株与NDiV的亲缘关系最近,处于同一进化分支。该研究结果丰富了NDiV病毒的信息,对NDiV病毒分子特征、分布区域和物种嗜性等特征提供了数据参考。 展开更多
关键词 NAM Dinh病毒 rna依赖rna聚合酶(rdrp) HEL1基因 S基因
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RNA依赖的RNA聚合酶的结构特征及其靶向抑制剂的开发
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作者 刘欣阳 谭政 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期413-421,共9页
新型冠状病毒肺炎是由新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染导致的急性呼吸道传染性疾病。自2019年爆发以来,SARS-CoV-2在世界范围内引起大流行,严重威胁人类的生命安全。目前,已有的疫苗尚... 新型冠状病毒肺炎是由新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染导致的急性呼吸道传染性疾病。自2019年爆发以来,SARS-CoV-2在世界范围内引起大流行,严重威胁人类的生命安全。目前,已有的疫苗尚不能提供完全的机体免疫保护。因此,开发广谱有效的抗病毒抑制剂是当下热门的研究方向。SARS-CoV-2属于RNA病毒,其RNA依赖性的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRp)在不同RNA病毒中具有高度保守性,是抗病毒抑制剂研发的重要靶标。RdRp是RNA病毒复制的核心组成部分,具有典型的右手杯状结构特征。本文重点介绍近年爆发并持续流行的新型冠状病毒RdRp的结构特征,以及靶向抑制剂的研发进展。同时,选取了其它几种有代表性的致病RNA病毒:流感病毒、轮状病毒、人类鼻病毒、丙型肝炎病毒和寨卡病毒,介绍了它们RdRp的结构特征及其靶向抑制剂的开发。本研究比较了抑制剂靶点结构的异同及抑制效果差异,并分析了可能导致该差异的原因。最后,本文总结讨论了目前针对RdRp抑制剂相关研究的瓶颈问题,为未来针对突发性的RNA病毒传染病的抗病毒抑制剂开发提供新思路。 展开更多
关键词 rna依赖rna聚合酶(rdrp) 抗病毒抑制剂 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)
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四川省Nam Dinh病毒的首次分离鉴定 被引量:1
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作者 李伟 张佳珂 +2 位作者 林世华 周兴余 冯玉亮 《中国病毒病杂志》 CAS 2022年第2期108-113,共6页
目的对2015年从四川省西部的甘孜藏族自治州蚊虫中分离到的病毒株SC1502、SC1510进行鉴定并分析其基因特征。方法通过细胞培养的方法对蚊虫标本进行病毒分离,利用Nam Dinh病毒(Nam Dinh virus,NDiV)特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(re... 目的对2015年从四川省西部的甘孜藏族自治州蚊虫中分离到的病毒株SC1502、SC1510进行鉴定并分析其基因特征。方法通过细胞培养的方法对蚊虫标本进行病毒分离,利用Nam Dinh病毒(Nam Dinh virus,NDiV)特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)鉴定,同时扩增分离株的开放阅读框、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRp)、解旋酶超家族1(superfamily 1 helicase,HEL1)、刺突蛋白(spike protein,S蛋白)基因序列并测序,然后利用Mega Align软件对核苷酸序列和推测的氨基酸序列进行比对分析,利用Mega 7软件绘制系统进化树。结果SC1502、SC1510病毒株能够引起C6/36细胞发生病变,但不能引起BHK-21细胞的病变。同源性分析结果显示,2株四川新分离株与NDiV的RdRp、HEL1、S蛋白的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别超过99.4%和97.5%。系统进化分析结果表明,2株四川新分离株与NDiV亲缘关系最近,处于同一进化分支。结论SC1502与SC1510为NDiV,该研究结果丰富了四川省的虫媒病毒病原谱数据库,对相关地区的不明原因疫情分析和调查提供了参考依据。 展开更多
关键词 Nam Dinh病毒 rna依赖rna聚合酶(rdrp) HEL1基因 S基因 系统进化树
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HCV治疗的新方法:RNA依赖的RNA聚合酶抑制剂 被引量:2
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作者 张秀杰 韩晓峰 欧阳红生 《生命的化学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期251-253,共3页
丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染呈世界流行趋势,50%感染者转变为慢性肝炎,部分发展为肝硬化、肝细胞癌,给人类健康带来了极大危害。目前,没有疫苗研制成功,现有的HCV治疗药物普遍存在局限性,或者有一些药物没有发挥应有的作... 丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染呈世界流行趋势,50%感染者转变为慢性肝炎,部分发展为肝硬化、肝细胞癌,给人类健康带来了极大危害。目前,没有疫苗研制成功,现有的HCV治疗药物普遍存在局限性,或者有一些药物没有发挥应有的作用。因此,开发新型、安全有效的抗HCV药物成为迫在眉睫的问题。NS5B蛋白是HCV复制的核心物质,具有RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)功能。研发有效的NS5B抑制剂,从而阻断病毒的复制,成为许多科研机构及制药公司的研究热点,有一些NS5B抑制剂已进入临床实验阶段。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒(HCV) rna依赖rna聚合酶(rdrp) 抑制剂
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细胞与病毒中的RNA依赖的RNA聚合酶
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作者 夏霄鹤 《河南教育学院学报(自然科学版)》 2008年第4期31-32,共2页
就细胞与病毒的RdRP的结构及其功能,以丙型肝炎病毒的NS5B蛋白和RNA干扰系统为例,介绍了RdRP的研究进展.
关键词 rna依赖rna聚合酶(rdrp) NS5B蛋白 rna干扰系统
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龙眼RDRP基因家族的全基因组鉴定与功能预测
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作者 林艺灵 徐小萍 +3 位作者 张春渝 陈晓慧 张梓浩 赖钟雄 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1364-1371,共8页
为了解龙眼RNA依赖的RNA聚合酶基因(RDRP)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法对龙眼RDRP家族基因成员进行鉴定,并且对其染色体定位、分子进化树、启动子顺式作用元件、蛋白质结构域、蛋白质二级和三级结构、蛋白质互作、可变剪接... 为了解龙眼RNA依赖的RNA聚合酶基因(RDRP)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法对龙眼RDRP家族基因成员进行鉴定,并且对其染色体定位、分子进化树、启动子顺式作用元件、蛋白质结构域、蛋白质二级和三级结构、蛋白质互作、可变剪接类型以及在体胚发生过程中差异表达的FPKM值进行分析.结果显示:龙眼RDRP家族基因包括10位成员,分别定位在1、8、9、11、15号共5条染色体上.通过龙眼与拟南芥、水稻构建的进化树分析,将其分为4类,分别为DlRDR1、DlRDR2、DlRDR4、DlRDR6.龙眼RDRP成员启动子包含多种植物激素以及低温、干旱等非生物胁迫的元件.龙眼RDRP家族均含有RDRP保守结构域,其蛋白质家族成员二级、三级结构较为相似,并且与特异性核酸内切酶(DCL)蛋白互作关系密切,同时也与基因沉默蛋白抑制剂3(SGS3)、依赖DNA的RNA聚合酶(NRPD1A)发生互作.不同体细胞胚发生阶段与不同组织部位的可变剪接事件以内含子剪接为主.龙眼体细胞胚不同阶段的表达模式分析中,龙眼RDRP在非胚性阶段显著上调.本研究表明龙眼RDRP家族成员能够响应植物激素的应答并且参与龙眼体胚和不同组织部位生长发育调控. 展开更多
关键词 龙眼 rna依赖rna聚合酶基因(rdrp) 基因家族 全基因组鉴定 功能分析
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