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核仁小分子RNA的结构、功能与合成 被引量:5
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作者 陆勇军 屈良鹄 《生命的化学》 CAS CSCD 1999年第4期167-170,共4页
九十年代以来,许多新的核仁小分子RNA(snoRNA)陆续被发现。它们的大小一般在几十到几百个核苷酸,能与特定的蛋白质如核纤蛋白(fibrilarin)或Th/To自身免疫抗原等相结合生成snoRNP,在细胞中稳定地... 九十年代以来,许多新的核仁小分子RNA(snoRNA)陆续被发现。它们的大小一般在几十到几百个核苷酸,能与特定的蛋白质如核纤蛋白(fibrilarin)或Th/To自身免疫抗原等相结合生成snoRNP,在细胞中稳定地存在,并且富集于核仁区。snoRN... 展开更多
关键词 SNOrna Rrna 前体加工 rna伴侣 功能结构
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金黄色葡萄球菌Hfq蛋白体外聚体生成和生物学功能的研究 被引量:1
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作者 刘玉 吴娜 +3 位作者 高亚萍 董洁 杨光 邵宁生 《军事医学科学院院刊》 CSCD 北大核心 2009年第1期24-28,共5页
目的:研究金黄色葡萄球菌中Hfq蛋白的聚体形式以及聚体和单体的不同生物学功能。方法:利用pET28-(a)载体克隆表达金葡菌来源的Hfq蛋白,通过天然凝胶电泳和SDS-PAGE检测不同条件下Hfq蛋白的存在形式。通过点突变的方法获得56和63位突变的... 目的:研究金黄色葡萄球菌中Hfq蛋白的聚体形式以及聚体和单体的不同生物学功能。方法:利用pET28-(a)载体克隆表达金葡菌来源的Hfq蛋白,通过天然凝胶电泳和SDS-PAGE检测不同条件下Hfq蛋白的存在形式。通过点突变的方法获得56和63位突变的Hfq蛋白,利用凝胶阻滞试验检测单体和聚体的RNA结合活性。结果:Hfq蛋白以单体、二聚体、四聚体以及六聚体的形式存在,各种聚体比例不同,长时间的高温、强酸和强碱会影响聚体的稳定性。在常规SDS-PAGE条件下,重组蛋白仅以四聚体形式存在。突变体蛋白不能够形成聚体且只有形成聚体的Hfq蛋白才能特异结合RNA。结论:Hfq蛋白形成聚体的过程是二聚体四聚体六聚体,且不同聚体形成的机制不同。56位和63位酪氨酸是Hfq蛋白聚体形成的关键氨基酸。聚体结构对Hfq蛋白发挥RNA伴侣分子生物学功能至关重要。 展开更多
关键词 葡萄球菌 金黄色 Ufq蛋白 聚体形式 rna伴侣
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RNA伴侣分子的研究进展 被引量:1
3
作者 孙卫国 曹国军 +1 位作者 杨光 邵宁生 《医学分子生物学杂志》 CAS CSCD 2004年第6期347-350,共4页
RNA只有折叠成天然构像才能具有正常的功能。RNA不是孤立存在的 ,它总是与蛋白质结合成复合物发挥作用。在动力学和热力学上 ,RNA易于形成错误折叠。RNA伴侣分子可以帮助RNA正确折叠或抑制RNA错误折叠 ,可以使错误折叠的RNA构像解链并... RNA只有折叠成天然构像才能具有正常的功能。RNA不是孤立存在的 ,它总是与蛋白质结合成复合物发挥作用。在动力学和热力学上 ,RNA易于形成错误折叠。RNA伴侣分子可以帮助RNA正确折叠或抑制RNA错误折叠 ,可以使错误折叠的RNA构像解链并形成正确的空间折叠。文章对RNA伴侣分子的分子特性和作用机制进行了探讨 ,介绍了几种常见RNA伴侣分子活性鉴定的策略 ,列举了几种重要的RNA伴侣分子并论述了RNA伴侣分子的意义及当前研究中存在的问题。 展开更多
关键词 rna伴侣分子 rna折叠 天然结构
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伴侣蛋白Hfq对禽致病性大肠杆菌致病力的影响
4
作者 陈睿 王忠星 +2 位作者 姜敏 诸葛祥凯 戴建君 《畜牧与兽医》 北大核心 2022年第5期105-112,共8页
为了探究小RNA(sRNA)伴侣蛋白Hfq在禽致病性大肠杆菌(APEC)感染致病过程中的作用,本研究采用Red同源重组法构建了禽致病性大肠杆菌FY26的hfq缺失株FY26Δhfq,通过测定缺失株生长曲线、生物被膜形成、体内定殖、胞内存活等能力来判定sRN... 为了探究小RNA(sRNA)伴侣蛋白Hfq在禽致病性大肠杆菌(APEC)感染致病过程中的作用,本研究采用Red同源重组法构建了禽致病性大肠杆菌FY26的hfq缺失株FY26Δhfq,通过测定缺失株生长曲线、生物被膜形成、体内定殖、胞内存活等能力来判定sRNA伴侣蛋白Hfq对APEC致病力的影响。在体外,生物被膜形成能力直接决定着细菌对外界环境的抵抗能力,而在细菌进入体内后,其生长速率、黏附、定殖、吞噬细胞内的存活等能力均会直接影响其致病力。在进行了缺失株FY26Δhfq与野生株FY26的生长曲线测定试验、生物被膜形成能力测定试验、感染雏鸡试验、雏鸡体内定殖与侵袭试验、DF-1细胞黏附及HD11吞噬细胞内存活试验后,结果表明:hfq缺失株相较野生株其生长速率下降,生物背膜形成能力降低了18.6%,感染雏鸡时毒力降低,感染7 d后存活率为80%,在雏鸡体内定殖侵袭减弱,体内竞争能力下降至33.2%,对DF-1细胞的黏附能力降低,HD11吞噬细胞内的存活能力下降,单个细胞内存活的细菌数大多少于6个。研究表明,sRNA伴侣蛋白Hfq对APEC的致病力起着关键的正向调控作用。 展开更多
关键词 大肠杆菌rna伴侣蛋白 Srna HFQ APEC 毒力
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目的基因全长cDNA合成及克隆技术进展 被引量:6
5
作者 张光祥 马正强 《生物技术通报》 CAS CSCD 2003年第5期1-5,共5页
在基因克隆、基因功能和表达调控研究中 ,获得目的基因尤其是表达丰度低的基因全长cDNA仍然是一个技术难题。本文对近年来有关反转录过程中影响全长cDNA合成的因素与对策的研究进行了总结 ,特别对消除mRNA二级结构阻碍的方法及其效果、... 在基因克隆、基因功能和表达调控研究中 ,获得目的基因尤其是表达丰度低的基因全长cDNA仍然是一个技术难题。本文对近年来有关反转录过程中影响全长cDNA合成的因素与对策的研究进行了总结 ,特别对消除mRNA二级结构阻碍的方法及其效果、较高反应温度和金属离子对模板mRNA完整性的影响、RNA分子伴侣在反应温度不变的情况下改善cDNA第一链质量的效果等作了较为详细的介绍。此外 ,还介绍了确保具有完整5′端的cDNA进入后续研究的几种新方法。 展开更多
关键词 反转录 rna分子伴侣 目的基因 全长CDNA 克隆
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细菌RNA稳定性调控相关元件的研究进展 被引量:1
6
作者 黄义 张维 燕永亮 《生物技术进展》 2018年第5期376-382,461,共8页
RNA降解体(细菌RNA降解的主要执行者)是一种多亚基的蛋白质复合物,主要由RNA解螺旋酶、聚核苷酸磷酸化酶(polynucleotide phosphorylase,PNPase)、内切核酸酶(ribonuclease E,RNase E)以及糖酵解途径中的烯醇化酶、磷酸果糖激酶等组成,... RNA降解体(细菌RNA降解的主要执行者)是一种多亚基的蛋白质复合物,主要由RNA解螺旋酶、聚核苷酸磷酸化酶(polynucleotide phosphorylase,PNPase)、内切核酸酶(ribonuclease E,RNase E)以及糖酵解途径中的烯醇化酶、磷酸果糖激酶等组成,参与核糖体RNA(ribosome RNA,rRNA)的加工以及信使RNA(messenger RNA,mRNA)的降解。此外,RNA分子伴侣Hfq和调控小RNA(small RNA,sRNA)在RNA稳定性调控中也发挥着重要作用。综述了细菌RNA稳定性调控相关功能元件,特别是降解体蛋白及RNA分子伴侣Hfq的最新进展,以期为研究细菌RNA稳定性及其参与的代谢调控提供理论参考。 展开更多
关键词 rna降解体 rna分子伴侣Hfq 非编码rna rna稳定性 内切核酸酶
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大肠杆菌RNA分子伴侣Hfq与DsrA和rpoS作用机制的研究进展 被引量:1
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作者 王丽君 王维维 +2 位作者 龚庆国 吴季辉 施蕴渝 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第7期627-633,共7页
RNA分子伴侣Hfq是细菌重要的转录后调节因子,它能够帮助非编码small RNA(sRNA)与目标mRNA配对.mRNArpoS编码的稳态sigma因子σS是大肠杆菌中应激响应的核心调控因子.在低温下,Hfq蛋白对于sRNA DsrA介导的mRNArpoS的翻译激活是必需的.然... RNA分子伴侣Hfq是细菌重要的转录后调节因子,它能够帮助非编码small RNA(sRNA)与目标mRNA配对.mRNArpoS编码的稳态sigma因子σS是大肠杆菌中应激响应的核心调控因子.在低温下,Hfq蛋白对于sRNA DsrA介导的mRNArpoS的翻译激活是必需的.然而,Hfq使用何种机制来促进sRNA和mRNA配对一直有两种并不互斥的模型存在:Hfq远侧和近侧两个表面同时结合sRNA和mRNA,使得两条RNA相互靠近,便于形成碱基配对;Hfq可能结合一条或者两条RNA,改变它们的二级结构或者三级结构,从而促进sRNA-mRNA配对的实现.最近的研究报道,成功在体外捕捉到了sRNA-Hfq-mRNA三元复合物,测定了AU6A-Hfq-A7三元复合物的晶体结构,并且在大肠杆菌体内证实了三元复合物的形成对于Hfq帮助sRNA DsrA激活mRNA rpoS的翻译是重要的.本文以sRNA DsrA和mRNA rpoS为例综述了蛋白质Hfq与RNA的结合特性,同时也讨论了sRNA-Hfq-mRNA三元复合物的存在对于研究sRNA介导的调控机制的一些启示. 展开更多
关键词 HFQ rna分子伴侣 Srna DSRA Mrna RPOS Hfq-rna复合物晶体结构 翻译激活
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异源表达古菌TRAM基因增强水稻的耐旱性 被引量:1
8
作者 陈巍 李华丽 邱金龙 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1676-1685,共10页
干旱会直接影响水稻的生长发育,导致其产量和品质下降。在水稻中异源表达细菌RNA分子伴侣Csp能够显著提高水稻的耐旱能力,并且不影响水稻的正常生长。古菌中也发现具有类似细菌分子伴侣Csp功能的TRAM (TRM2 and MiaB)蛋白,且古菌的DNA... 干旱会直接影响水稻的生长发育,导致其产量和品质下降。在水稻中异源表达细菌RNA分子伴侣Csp能够显著提高水稻的耐旱能力,并且不影响水稻的正常生长。古菌中也发现具有类似细菌分子伴侣Csp功能的TRAM (TRM2 and MiaB)蛋白,且古菌的DNA复制、转录和翻译等过程与真核生物有着更为相似的调控方式,然而,古菌中RNA分子伴侣蛋白能否调控植物耐旱能力还未见报道。我们选取了嗜冷甲烷古菌Methanolobus psychrophilus R15中两个TRAM蛋白在水稻中进行研究,发现在水稻中过量表达Mpsy3066和Mpsy0643两个TRAM蛋白均能显著提高水稻苗期和成株期时对干旱胁迫的耐受能力。同时,我们在水稻原生质体中验证了TRAM蛋白可以发挥其分子伴侣的功能消除RNA的错误折叠对翻译的影响,这可能是TRAM转基因植物发挥其耐旱能力的作用机制。该工作初步展示了异源表达古菌TRAMs可以作为提高水稻耐旱能力的一种有效手段。 展开更多
关键词 水稻 干旱胁迫 rna分子伴侣 古菌 TRAM
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