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用RNaseⅢ制备的小干涉RNA降解SARS冠状病毒基因的细胞内转录物 被引量:5
1
作者 朱旭东 党颖 +2 位作者 冯怡 李涛 黄培堂 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期484-489,共6页
SARS冠状病毒是引起重症急性呼吸综合症的主要原因 ,目前尚没有特效药物或疫苗对抗这种新病毒。RNA干涉是指双链RNA可以特异地降解细胞内同源基因的mRNA。在哺乳动物细胞中 ,<30bp的小双链RNA能引起RNA干涉 ,又可以避免干扰素反应。... SARS冠状病毒是引起重症急性呼吸综合症的主要原因 ,目前尚没有特效药物或疫苗对抗这种新病毒。RNA干涉是指双链RNA可以特异地降解细胞内同源基因的mRNA。在哺乳动物细胞中 ,<30bp的小双链RNA能引起RNA干涉 ,又可以避免干扰素反应。通过体外转录得到SARS病毒 3种基因RNA依赖的RNA聚合酶、刺突蛋白及核衣壳蛋白部分片段的长双链RNA ,然后用RNaseⅢ有限切割成长度 <30bp的小干涉RNA。同时把上述 3种基因片段分别连接到质粒pGL3 Control中 ,得到的 3个质粒pGL R、pGL S和pGL N可以分别在细胞内转录出荧光素酶 RNA依赖的RNA聚合酶、 刺突蛋白、 核衣壳蛋白的杂合mRNA。上述质粒分别和相应的小干涉RNA共转染HEK2 93F细胞 ,测定荧光素酶活性 ,结果小干涉RNA使相应质粒表达荧光素酶的活性显著下降 ;用逆转录定量PCR反应测量mRNA丰度 。 展开更多
关键词 SARS冠状病毒 rna干涉 rna依赖的rna聚合酶 刺突蛋白 核衣壳蛋白
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转录后基因沉默 被引量:1
2
作者 刘红梅 孟祥兵 温孚江 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期193-199,共7页
转录后基因沉默 (PTGS)普遍存在于生物界 ,如植物的共抑制、源于病原的 RNA介导的病毒抗性、真菌的基因沉默和动物的 RNA干扰等。这类现象有许多共同特点 ,如都是以向细胞内引入核酸 (转基因、双链 RNA或病毒 RNA)为诱因 ,依赖 RNA的 RN... 转录后基因沉默 (PTGS)普遍存在于生物界 ,如植物的共抑制、源于病原的 RNA介导的病毒抗性、真菌的基因沉默和动物的 RNA干扰等。这类现象有许多共同特点 ,如都是以向细胞内引入核酸 (转基因、双链 RNA或病毒 RNA)为诱因 ,依赖 RNA的 RNA聚合酶 (Rd RP)活性与基因沉默密切相关 ,在发生基因沉默的细胞中大多存在特定长度的小分子 RNA(2 1~ 2 5 nt) ,PTGS导致细胞质内 m RNA的特异性降解 ,不同生物的 PTGS相关基因及产物具有很高的相似性 ,基因沉默能够在细胞间传播并能以表型遗传的方式传递给下一代等。这说明各种生物的转录后基因沉默可能有相似的遗传起源 ,是一种抵抗外来核酸 (如病毒和转座子 ) 展开更多
关键词 共抑制 rna干扰 rna聚合酶 反义rna 双链rna 转录后基因沉默
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黄芩苷对RSV转录、复制及融合效应的影响 被引量:5
3
作者 徐建亚 徐珊 +3 位作者 陈超 李佳曦 汪受传 单进军 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期2055-2058,共4页
目的研究黄芩苷对呼吸道合胞病毒(RSV)复制、转录及融合效应的影响,探讨临床验方金欣口服液的药效物质基础。方法构建RSV感染的Hep-2细胞模型,黄芩苷干预后采用体外转录法、实时荧光定量PCR法及免疫荧光显微法分别检测黄芩苷对RSV的RNA... 目的研究黄芩苷对呼吸道合胞病毒(RSV)复制、转录及融合效应的影响,探讨临床验方金欣口服液的药效物质基础。方法构建RSV感染的Hep-2细胞模型,黄芩苷干预后采用体外转录法、实时荧光定量PCR法及免疫荧光显微法分别检测黄芩苷对RSV的RNA聚合酶活性、核酸复制及RSV介导的细胞融合作用。结果在50μmol/L的最大无毒浓度下,黄芩苷对RSV的RNA依赖的RNA聚合酶活性、核酸复制、F融合蛋白表达及其介导的细胞融合效应无显著作用。结论黄芩苷不能抑制RSV的转录、复制及融合。金欣口服液治疗RSV肺炎的主要药效成分可能非黄芩苷而为其他含量较低成分或黄芩苷代谢产物,有待进一步确定。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 黄芩苷 rna依赖的rna聚合酶 F融合蛋白
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CDK抑制剂夫拉平度抗冠状病毒作用机制研究
4
作者 王丽丹 郭赛赛 岑山 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1280-1285,共6页
冠状病毒属冠状病毒包含多种人类致病病毒,抗冠状病毒药物研发具有重要价值。开发靶向宿主细胞的抗病毒药物不仅有助于发展新的抗病毒策略,同时有利于解决病毒突变而带来的耐药性等问题。本课题组前期研究发现,细胞周期依赖性蛋白激酶(c... 冠状病毒属冠状病毒包含多种人类致病病毒,抗冠状病毒药物研发具有重要价值。开发靶向宿主细胞的抗病毒药物不仅有助于发展新的抗病毒策略,同时有利于解决病毒突变而带来的耐药性等问题。本课题组前期研究发现,细胞周期依赖性蛋白激酶(cell cycle-dependent protein kinases,CDKs)参与冠状病毒的复制,成为潜在的抗病毒靶点。本研究发现广谱CDK抑制剂夫拉平度显著抑制严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2) RNA依赖性RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRp)活性。进一步研究表明,夫拉平度抑制SARS-CoV-2 RdRp的RNA合成效率。此外,夫拉平度能够有效抑制人类冠状病毒OC43 (human coronavirus OC43,HCoV-OC43)的复制。本研究表明,CDK抑制剂夫拉平度可能是潜在的抗冠状病毒药物。 展开更多
关键词 夫拉平度 CDK抑制剂 冠状病毒 抗病毒 rna依赖性rna聚合酶
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丙型肝炎病毒RNA依赖的RNA聚合酶在大肠杆菌中可溶性表达条件的优化 被引量:5
5
作者 李琳 潘英 +2 位作者 王正茂 傅雅丽 李越希 《药物生物技术》 CAS CSCD 2010年第3期207-211,共5页
为了提高丙型肝炎病毒RNA依赖的RNA聚合酶蛋白(HCV-RdRp)在大肠杆菌中的可溶性表达,对影响蛋白可溶性表达水平的多种因素进行了优化。探讨了诱导时机、诱导温度及时间、诱导剂IPTG浓度等对重组蛋白可溶性表达的影响,筛选出了提高可溶表... 为了提高丙型肝炎病毒RNA依赖的RNA聚合酶蛋白(HCV-RdRp)在大肠杆菌中的可溶性表达,对影响蛋白可溶性表达水平的多种因素进行了优化。探讨了诱导时机、诱导温度及时间、诱导剂IPTG浓度等对重组蛋白可溶性表达的影响,筛选出了提高可溶表达该蛋白的最适条件。结果表明,在菌体密度OD600约为1.6时,加入终浓度为0.20 mmol/L的诱导剂IPTG,25℃下诱导表达16 h,可以获得最多的可溶性表达蛋白,获得了纯化较好并有特异性的HCV-RdRp重组蛋白,为建立其体外活性测定方法及抑制剂的筛选奠定了基础。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 rna依赖的rna聚合酶 可溶性表达 优化
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以色列急性麻痹病毒Taq Man荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用 被引量:5
6
作者 张体银 黄嫦娇 +4 位作者 田国宁 侯义宏 王武军 张志灯 林素洁 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1287-1292,共6页
为建立以色列急性麻痹病毒(IAPV)荧光定量RT-PCR检测方法,本研究根据GenBank中IAPV RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)基因保守区域序列设计了一对特异性引物和一条特异性探针,以体外转录制备的重组质粒标准品为模板,经过反应条件优化,建立了IAP... 为建立以色列急性麻痹病毒(IAPV)荧光定量RT-PCR检测方法,本研究根据GenBank中IAPV RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)基因保守区域序列设计了一对特异性引物和一条特异性探针,以体外转录制备的重组质粒标准品为模板,经过反应条件优化,建立了IAPV荧光定量RT-PCR检测方法,并对其进行了特异性、敏感性、重复性试验;利用所建立的方法对70份福建地区临床疑似IAPV感染的蜜蜂样品进行检测,并对阳性样品进行测序验证。结果显示,荧光定量RT-PCR方法的最佳引物和探针浓度分别为0.25μmol/L和0.20μmol/L,最佳退火温度为61℃。该方法仅对IAPV出现阳性扩增信号,对蜜蜂克什米尔病毒、蜜蜂慢性麻痹病毒、蜜蜂残翅病毒、蜜蜂急性麻痹病毒、蜜蜂黑蜂王台病毒、蜜蜂囊状幼虫病毒等6种病毒均未出现扩增,特异性较强;该方法对重组质粒标准品的最低检测限为9.7拷贝/μL,比普通RT-PCR敏感性高约100倍;该方法批内及批间变异系数均小于1.5%,重复性好。利用该方法和普通RT-PCR方法分别对70份临床样品进行检测,结果显示,两种方法的阳性检出率分别为31.4%(22/70)和27.1(19/70),二者的符合率为95.9%。本研究首次建立的IAPV Taq Man荧光定量RTPCR检测方法快速、敏感,检测结果准确可靠,为IAPV的流行病学调查及其分子生物学的快速检测奠定了基础。 展开更多
关键词 以色列急性麻痹病毒 荧光定量RT-PCR rna依赖的rna聚合酶
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靶向抗流感病毒药物的抗病毒作用研究进展
7
作者 郑曦 张晨阳 +1 位作者 王俊琳 苏福祥 《抗感染药学》 2023年第9期893-898,共6页
流行性感冒(简称流感)是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病,甲型和乙型流感病毒每年呈季节性流行,其中甲型流感病毒可引起全球大流行。当前,临床常采用抗流感病毒药物治疗流感,其主要通过阻止流感病毒的进入、复制和释放而发挥药效... 流行性感冒(简称流感)是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病,甲型和乙型流感病毒每年呈季节性流行,其中甲型流感病毒可引起全球大流行。当前,临床常采用抗流感病毒药物治疗流感,其主要通过阻止流感病毒的进入、复制和释放而发挥药效。然而,流感病毒亦会通过变异与伪装而逃脱免疫系统的识别和清除,这反过来加速了科研人员对靶向抗流感病毒药物的研发。本文主要对靶向流感病毒的血凝素、M2离子通道蛋白、RNA依赖性RNA聚合酶、Cap依赖性内切酶、神经氨酸酶、非结构蛋白1等为位点的抗流感病毒药物的抗病毒作用进行了综合和分析,以期为临床防治流感和新药的研发提供理论支撑。 展开更多
关键词 抗病毒药物 流行性感冒 流感病毒 血凝素 M2离子通道蛋白 rna依赖性rna聚合酶 Cap依赖性内切酶 神经氨酸酶 非结构蛋白1
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正链RNA病毒复制蛋白的分子生物学研究进展 被引量:1
8
作者 赵国芬 张鹤龄 +2 位作者 宋立华 杨丽华 刘扬 《内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版)》 CAS 2003年第1期49-54,共6页
综述了复制蛋白的几个关键的结构域(解螺旋酶的功能区,依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)的核心区域,类似糜蛋白酶的蛋白酶区域,转甲基酶结构域)的结构特点、功能和基因表达方式,以及复制酶基因在抗病毒工程中的应用.
关键词 正链rna病毒 复制蛋白 分子生物学 研究进展 螺旋酶 转甲基酶 RDRP rna聚合酶 基因表达
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汉坦病毒A9株全长L片段cDNA克隆和核苷酸序列测定
9
作者 王晓芳 李德新 +5 位作者 刘尊 李川 梁米芳 张全福 霍子威 宋干 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期256-261,共6页
目的 克隆我国分离的汉坦病毒A9株L片段全长cDNA ,并测定其核苷酸序列。方法 用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)技术分段扩增汉坦病毒A9株全部L片段 ,用T A克隆方法进行PCR产物克隆 ,测定PCR产物的核苷酸序列。通过亚克隆将分段的L片... 目的 克隆我国分离的汉坦病毒A9株L片段全长cDNA ,并测定其核苷酸序列。方法 用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)技术分段扩增汉坦病毒A9株全部L片段 ,用T A克隆方法进行PCR产物克隆 ,测定PCR产物的核苷酸序列。通过亚克隆将分段的L片段连接成全长cDNA克隆。结果 A9株的基因组L片段长度为 6 5 33个核苷酸 ,腺嘌呤核苷酸和尿嘧啶核苷酸丰富 (%A +U =62 47)。包含有一个单一的开放读码框架 (ORF) ,编码一个标准的质量为 2 46× 10 5 的蛋白 ,含有 215 1个氨基酸。A9株与 76 118、C1 1和C1 2株的同源性最高 ,达到 83 8%。与TULA病毒的关系较远 ,其核酸序列的同源性为 65 8%。将推导的A9株编码的氨基酸序列与其他 2 1种负链RNA病毒的依赖RNA的RNA聚合酶的氨基酸序列以及汉坦病毒几个代表株的L片段氨基酸序列进行比较 ,显示A9编码的RNA聚合酶也有 6个比较保守的区域以及几个极端保守的氨基酸残基。结论 汉坦病毒A9株L片段具有和其他汉坦病毒RNA聚合酶相似的核苷酸一级结构 ,通过对推导的氨基酸分析 。 展开更多
关键词 汉坦病毒 序列测定 依赖rnarna聚合酶
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基于SARS-CoV-2 RdRp潜在变构位点小分子拟肽类抑制剂的筛选
10
作者 毛辉 储春霞 +5 位作者 朱秋莎 孟诗 周雪 顾明星 费翔 袁月 《中国药业》 CAS 2021年第14期33-37,共5页
目的建立筛选新型冠状病毒(SARS-CoV-2)RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)蛋白抑制剂的分子对接技术。方法以SARS-CoV-2 RdRp蛋白为靶点,检测RdRp潜在的变构位点;以FTmap在线平台和Maestro软件预测结合位点;以Maestro软件实现高通量分子对接,获... 目的建立筛选新型冠状病毒(SARS-CoV-2)RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)蛋白抑制剂的分子对接技术。方法以SARS-CoV-2 RdRp蛋白为靶点,检测RdRp潜在的变构位点;以FTmap在线平台和Maestro软件预测结合位点;以Maestro软件实现高通量分子对接,获得具有潜在抗SARS-CoV-2活性的拟肽化合物。结果与结论通过分子对接筛选得到活性最强的拟肽分子为AR00455,为后期抗SARS-CoV-2药物的设计及研发提供了新路径。 展开更多
关键词 冠状病毒 虚拟筛选 拟肽类化合物 变构位点 rna依赖性rna聚合酶
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以RdRp酶为例通过蛋白结构比对研究RNA病毒进化历史的方法学探讨
11
作者 钟鸿圣 凌诚 +4 位作者 柏佳宁 张忠 于爱莲 张尚宏 史卫峰 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2013年第9期773-777,共5页
目的以RdRp酶为例探讨病毒蛋白的保守性以及通过蛋白结构比对研究RNA病毒进化历史的可能性。方法从GenBank下载6个病毒科RdRp酶的序列,通过多维尺度分析筛选代表性的序列,使用在线预测工具SwissModel预测三维结构,分别用Dali和Matt软件... 目的以RdRp酶为例探讨病毒蛋白的保守性以及通过蛋白结构比对研究RNA病毒进化历史的可能性。方法从GenBank下载6个病毒科RdRp酶的序列,通过多维尺度分析筛选代表性的序列,使用在线预测工具SwissModel预测三维结构,分别用Dali和Matt软件进行结构两两比对,对比对结果进行聚类分析。筛选的序列同时进行系统发育分析。结果同一病毒科内RdRp酶结构比对的分值一般小于1.0,不同病毒科之间结构比对的分值一般大于3.0。对于同一病毒种,分离自不同年份的病毒蛋白结构相似,病毒蛋白结构的差异性与年份无明显相关性。聚类分析表明同一科病毒均聚在一起,但Dali和Matt得到的不同病毒科之间的进化关系并不完全相同,与系统发育树所揭示的进化关系也不完全相同。结论用现有的结构比对方法研究RNA病毒进化所得到的结果并不一致,与系统发育树的结论也不尽相同。因此,通过蛋白结构比对来研究病毒的进化历史,需要开发新的、更复杂的结构比对算法。 展开更多
关键词 RdRp酶 rna依赖rna聚合酶 病毒 结构比对 进化
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棉铃虫5型质型多角体病毒RNA聚合酶的确定与功能机制研究
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作者 杨洁 张松柳 +4 位作者 熊威 钱齐 王赵玮 胡远扬 周溪 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2015年第2期183-189,共7页
棉铃虫5型质型多角体病毒属于呼肠孤病毒科质型多角体病毒属,以重要农业害虫棉铃虫为其天然宿主,对棉铃虫的生物控制具有重要意义.本文对棉铃虫5型质型多角体病毒第3片段编码的蛋白的功能进行了初步研究.首先通过同源性对比,推测其所编... 棉铃虫5型质型多角体病毒属于呼肠孤病毒科质型多角体病毒属,以重要农业害虫棉铃虫为其天然宿主,对棉铃虫的生物控制具有重要意义.本文对棉铃虫5型质型多角体病毒第3片段编码的蛋白的功能进行了初步研究.首先通过同源性对比,推测其所编码的蛋白可能行使RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP)的功能.通过体外活性研究确定了该蛋白的RdRP活性,并确定了其保守活性位点GDD.随后以病毒基因组RNA和3′-OH封闭的病毒基因组RNA为模板,利用Northern blot方法研究该蛋白起始病毒基因组RNA合成的分子机制.结果表明,该病毒的RdRP主要通过引物非依赖的方式起始病毒基因组RNA的合成,并且该RdRP蛋白并不具有末端转移酶活性.最后,对RdRP行使功能的生化条件进行探索,发现RdRP功能的发挥需要二价金属离子Mg2+的存在. 展开更多
关键词 棉铃虫 质型多角体病毒 rna聚合酶 末端转移酶
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蜜蜂囊状幼虫病病毒的基因型分析 被引量:15
13
作者 曹兰 沈克飞 +6 位作者 张邑帆 罗文华 王瑞生 任勤 郭军 王志冬 戴荣国 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2012年第1期41-44,共4页
为了解蜜蜂囊状幼虫病病毒的遗传进化规律,依据SB14f/SB15r引物所扩增的RNA依赖的RNA聚合酶基因片段序列对该病毒进行基因型分析。结果表明,该病毒主要分为欧洲型、远东型和南非型3个基因型。欧洲基因型分为中欧和英国亚型,远东基因型... 为了解蜜蜂囊状幼虫病病毒的遗传进化规律,依据SB14f/SB15r引物所扩增的RNA依赖的RNA聚合酶基因片段序列对该病毒进行基因型分析。结果表明,该病毒主要分为欧洲型、远东型和南非型3个基因型。欧洲基因型分为中欧和英国亚型,远东基因型分为东方蜜蜂和西蜂亚型。提示蜜蜂囊状幼虫病病毒总体上按地域分型。 展开更多
关键词 囊状幼虫病病毒 rna依赖的rna聚合酶基因 基因型 蜜蜂
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草鱼呼肠孤病毒RNA聚合酶基因功能区在原核细胞中的表达 被引量:6
14
作者 方勤 朱作言 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期86-88,共3页
An about 1.5kb functional domain sequence of GCRV-RdRp gene was obtained by using RT-PCR amplification.The amplified fragment was cloned into T7 promoted prokaryotic expression system pRSET-C vector and then was trans... An about 1.5kb functional domain sequence of GCRV-RdRp gene was obtained by using RT-PCR amplification.The amplified fragment was cloned into T7 promoted prokaryotic expression system pRSET-C vector and then was transformed into CaCl 2 treated TOP10F’and BL21(DE3)pLysS competent cells respectively.The recombinants were detected with restriction enzyme digestion and further confirmed the interest insert by sequencing pRSET-C/GCRV-RdRp plasmid,which was in frame with the N-terminal tag and in the proper orientation.SDS-PAGE revealed that the highly expressed fusion protein is produced by inducing with l nm IPTG,and its molecular weight is around 55kD,which is the right size corresponding to the predicted value.It indicated the fused protein was produced in the form of inclusion body with its yield remained steadly more than 60% of total bacterial protein. It also showed that the expressed protein was able to bind immunologically to rabbit anti-GCRV-VP2 serum. 展开更多
关键词 草鱼 呼肠孤病毒 rna聚合酶 基因表达 原核细胞
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马铃薯卷叶病毒复制酶基因5'端克隆及序列分析 被引量:5
15
作者 梁成罡 张彤 +1 位作者 哈斯阿古拉 张鹤龄 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第4期377-382,共6页
马铃薯卷叶病毒(Potatoleafrolvirus,PLRV)是正链RNA病毒,属黄化病毒组(Luteovirus)〔1〕,严格虫传,分布广泛,难以控制,侵染马铃薯能引起大面积减产,给马铃薯生产造成巨大损失。PL... 马铃薯卷叶病毒(Potatoleafrolvirus,PLRV)是正链RNA病毒,属黄化病毒组(Luteovirus)〔1〕,严格虫传,分布广泛,难以控制,侵染马铃薯能引起大面积减产,给马铃薯生产造成巨大损失。PLRV基因组全长6.0kb,有6个读... 展开更多
关键词 马铃薯卷叶病毒 RDRP 基因克隆 序列测定
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RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP)与非编码RNA(ncRNA)调控的研究进展 被引量:6
16
作者 丁超 张兰 +1 位作者 曹洁 于文强 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期256-261,共6页
RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干... RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干扰(RNA interference,RNAi)现象。越来越多研究证明RdRP的功能与非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)密不可分,本文对病毒RdRP、细胞RdRP与ncRNA调控之间的关系作了较详细的阐述,同时对丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)诱发的肝癌机制提出新的观点。 展开更多
关键词 rna依赖的rna聚合酶(RdRP) 非编码rna(ncrna) rna干扰(rnaI) 丙型肝炎病毒(HCV)
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蜜蜂慢性麻痹病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立
17
作者 张体银 王武军 +3 位作者 林素洁 张志灯 李宋钰 于师宇 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第3期72-78,共7页
为建立慢性蜜蜂麻痹病毒(CBPV)快速诊断方法,本研究根据CBPV RNA依赖RNA聚合酶(RdRp)基因保守区设计特异性引物和TaqMan探针,建立了荧光定量RT-PCR检测方法。结果显示,以构建的重组质粒为标准品建立的TaqMan荧光定量PCR方法,标准曲线具... 为建立慢性蜜蜂麻痹病毒(CBPV)快速诊断方法,本研究根据CBPV RNA依赖RNA聚合酶(RdRp)基因保守区设计特异性引物和TaqMan探针,建立了荧光定量RT-PCR检测方法。结果显示,以构建的重组质粒为标准品建立的TaqMan荧光定量PCR方法,标准曲线具有良好的线性关系,线性相关系数达0.998;该方法最低检出限为10拷贝/μL,与蜜蜂急性麻痹病毒等常见蜜蜂病毒无交叉反应,具有良好的灵敏性和特异性;组内和组间变异系数分别低于0.5%和2%,具有较好的稳定性。本研究建立的CBPV荧光定量RT-PCR检测方法,可用于实验室检测、流行病学调查和疫情监测。 展开更多
关键词 蜜蜂慢性麻痹病毒 荧光定量RT-PCR rna依赖rna聚合酶
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马铃薯卷叶病毒中国株(PLRV-Ch)复制酶基因结构研究 被引量:2
18
作者 张鹤龄 梁成罡 +2 位作者 张彤 哈斯阿古拉 赵国芬 《中国病毒学》 CAS CSCD 2000年第3期255-263,共9页
用设计合成的两对特异性引物 ,以马铃薯卷叶病毒中国分离株PLRV ChRNA为模板 ,经反转录PCR扩增 ,将复制酶基因 3′端 0 .6kb和 5′端 1.2kb ,克隆于 pUC19中 ,分别构建了重组质粒pLR3和 pLR5,并分五段进行了序列分析。将获得的核苷酸序... 用设计合成的两对特异性引物 ,以马铃薯卷叶病毒中国分离株PLRV ChRNA为模板 ,经反转录PCR扩增 ,将复制酶基因 3′端 0 .6kb和 5′端 1.2kb ,克隆于 pUC19中 ,分别构建了重组质粒pLR3和 pLR5,并分五段进行了序列分析。将获得的核苷酸序列及氨基酸序列与国外报导的四个PLRV分离株的相应区段的序列同源性进行了比较。结果表明具有高度同源性。文中对核苷酸序列中存在的可能移码序列和其下游的茎环结构或假节结构、以及特征性三次重复区及氨基酸序列中复制酶蛋白N端的碱性氨基酸序列以及C端区域中包括GDD在内的 8个特征序列进行了讨论。作者发现移码序列上游的三次重复的核苷酸序列可以形成连续折叠的互补双链区和发夹结构 ,这一结构可能和转译移码有关。此外PLRV复制酶蛋白N端部分氨基酸序列易变 ,而C端氨基酸序列十分保守 ,可能和复制酶功能有更重要关系。 展开更多
关键词 马铃薯卷叶病毒 基因克隆 序列分析 复制酶
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非编码RNA和RNA沉默 被引量:1
19
作者 毛新国 董玉琛 《生物技术通报》 CAS CSCD 2004年第1期6-12,22,共8页
生物体内存在大量的非编码RNA ,它们形态各异 ,功能也千差万别 ,在生物的生长、发育、分化进程中扮演着不同的角色 ,尤其是siRNA ,它是RNA沉默的诱因。RNA沉默是真核生物特有的现象 ,它需要一系列因子的参与 ,其中RNA依赖性的RNA聚合酶... 生物体内存在大量的非编码RNA ,它们形态各异 ,功能也千差万别 ,在生物的生长、发育、分化进程中扮演着不同的角色 ,尤其是siRNA ,它是RNA沉默的诱因。RNA沉默是真核生物特有的现象 ,它需要一系列因子的参与 ,其中RNA依赖性的RNA聚合酶是沉默起始的关键 ,Dicer酶是形成siRNA的基础 ,而RNA沉默诱导复合体 (RSIC)等是发生RNA沉默“链式反应” 展开更多
关键词 非编码rna rna沉默 小干扰rna rna依赖性rna聚合酶 rna沉默诱导复合体
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异源5′非翻译区在猪繁殖与呼吸综合征病毒感染性拯救过程中的功能解析 被引量:1
20
作者 高飞 陆嘉琦 +3 位作者 姚火春 杨倩 袁世山 童光志 《中国动物传染病学报》 CAS 2011年第6期7-14,共8页
猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reporoductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)基因组5′非翻译区(untranslated region,UTR)对病毒复制转录等过程至关重要,但其发挥作用的机制尚不清楚。本实验室将欧洲型PRRSV 5′UTR替换入... 猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reporoductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)基因组5′非翻译区(untranslated region,UTR)对病毒复制转录等过程至关重要,但其发挥作用的机制尚不清楚。本实验室将欧洲型PRRSV 5′UTR替换入北美型PRRSV弱毒株感染性克隆pAPRRS的骨架中,构建pAPLV5。经过DNA转染入MARC-145细胞系中,两次传代后,拯救出嵌合病毒vAPLV5。通过对嵌合病毒的全长测序发现,嵌合病毒基因组较亲本病毒发生了碱基突变,突变主要集中于Nsp2和Nsp9位置。将Nsp9位置(病毒的RNA依赖的RNA聚合酶,RNA-dependent KNA povymerase,RdRp)的4处突变位点引入嵌合病毒的感染性克隆pAPLV5,所构建的4个突变嵌合克隆转染MARC-145细胞后无需传代即产生细胞病变(cytopathic effect,CPE),且P0代病毒滴度较原嵌合病毒vAPLV5高。通过半定量负链和亚基因组检测发现,突变嵌合病毒的RNA合成水平也较亲本嵌合病毒高。由此推测PRRSV 5′UTR功能可能与RdRp相关,异源的5′UTR通过突变RdRp来发挥其调控作用,完成病毒拯救过程。 展开更多
关键词 非翻译区 rna依赖的rna聚合酶 嵌合病毒 转染
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