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The role of non-coding RNAs in drug resistance of oral squamous cell carcinoma and therapeutic potential 被引量:16
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作者 Xiang Meng Qiu-Yue Lou +5 位作者 Wen-Ying Yang Yue-Rong Wang Ran Chen Lu Wang Tao Xu Lei Zhang 《Cancer Communications》 SCIE 2021年第10期981-1006,共26页
Oral squamous cell carcinoma(OSCC),the eighth most prevalent cancer in the world,arises from the interaction of multiple factors including tobacco,alcohol consumption,and betel quid.Chemotherapeutic agents such as cis... Oral squamous cell carcinoma(OSCC),the eighth most prevalent cancer in the world,arises from the interaction of multiple factors including tobacco,alcohol consumption,and betel quid.Chemotherapeutic agents such as cisplatin,5-fluorouracil,and paclitaxel have now become the first-line options for OSCC patients.Nevertheless,most OSCC patients eventually acquire drug resistance,leading to poor prognosis.With the discovery and identification of non-coding RNAs(ncRNAs),the functions of dysregulated ncRNAs in OSCC development and drug resistance are gradually being widely recognized.The mechanisms of drug resistance of OSCC are intricate and involve drug efflux,epithelial-mesenchymal transition,DNA damage repair,and autophagy.At present,strategies to explore the reversal of drug resistance of OSCC need to be urgently developed.Nano-delivery and self-cellular drug delivery platforms are considered as effective strategies to overcome drug resistance due to their tumor targeting,controlled release,and consistent pharmacokinetic profiles.In particular,the combined application of new technologies(including CRISPR systems)opened up new horizons for the treatment of drug resistance of OSCC.Hence,this review explored emerging regulatory functions of ncRNAs in drug resistance of OSCC,elucidated multiple ncRNA-meditated mechanisms of drug resistance of OSCC,and discussed the potential value of drug delivery platforms using nanoparticles and self-cells as carriers in drug resistance of OSCC. 展开更多
关键词 drug delivery drug resistance long non-coding rnas MICROrnaS non-coding rna(ncrna) oral squamous cell carcinoma
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Progress in the studies on the molecular mechanisms associated with multidrug resistance in cancers 被引量:4
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作者 Lei Zhang Biwei Ye +1 位作者 Zhuo Chen Zhe-Sheng Chen 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2023年第3期982-997,共16页
Chemotherapy is one of the important methods to treat cancer,and the emergence of multidrug resistance(MDR)is one major cause for the failure of cancer chemotherapy.Almost all anti-tumor drugs develop drug resistance ... Chemotherapy is one of the important methods to treat cancer,and the emergence of multidrug resistance(MDR)is one major cause for the failure of cancer chemotherapy.Almost all anti-tumor drugs develop drug resistance over a period of time of application in cancer patients,reducing their effects on killing cancer cells.Chemoresistance can lead to a rapid recurrence of cancers and ultimately patient death.MDR may be induced by multiple mechanisms,which are associated with a complex process of multiple genes,factors,pathways,and multiple steps,and today the MDR-associated mechanisms are largely unknown.In this paper,from the aspects of protein–protein interactions,alternative splicing(AS)in pre-mRNA,non-coding RNA(ncRNA)mediation,genome mutations,variance in cell functions,and influence from the tumor microenvironment,we summarize the molecular mechanisms associated with MDR in cancers.In the end,prospects for the exploration of antitumor drugs that can reverse MDR are briefly discussed from the angle of drug systems with improved targeting properties,biocompatibility,availability,and other advantages. 展开更多
关键词 Multidrug resistance(MDR) ABC transporter family Signaling pathway Alternative splicing(AS) Gene mutation None-coding rna(ncrna) Tumor microenvironment
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Promising roles of non-exosomal and exosomal non-coding RNAs in the regulatory mechanism and as diagnostic biomarkers in myocardial infarction
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作者 Jingru LI Haocheng MA +5 位作者 Xinyu WU Guihu SUN Ping YANG Yunzhu PENG Qixian WANG Luqiao WANG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2023年第4期281-300,共20页
Non-exosomal non-coding RNAs(non-exo-ncRNAs)and exosomal ncRNAs(exo-ncRNAs)have been associated with the pathological development of myocardial infarction(MI).Accordingly,this analytical review provides an overview of... Non-exosomal non-coding RNAs(non-exo-ncRNAs)and exosomal ncRNAs(exo-ncRNAs)have been associated with the pathological development of myocardial infarction(MI).Accordingly,this analytical review provides an overview of current MI studies on the role of plasma non-exo/exo-ncRNAs.We summarize the features and crucial roles of ncRNAs and reveal their novel biological correlations via bioinformatics analysis.The following contributions are made:(1)we comprehensively describe the expression profile,competing endogenous RNA(ceRNA)network,and“pre-necrotic”biomarkers of non-exo/exo-ncRNAs for MI;(2)functional enrichment analysis indicates that the target genes of ncRNAs are enriched in the regulation of apoptotic signaling pathway and cellular response to chemical stress,etc.;(3)we propose an updated and comprehensive view on the mechanisms,pathophysiology,and biomarker roles of non-exo/exo-ncRNAs in MI,thereby providing a theoretical basis for the clinical management of MI. 展开更多
关键词 EXOSOME Non-exosomal non-coding rna(ncrna) Exosomal ncrna Long non-coding rna(lncrna) Microrna(mirna) Circular rna(circrna) Myocardial Infarction(MI)
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Micropeptides: origins, identification, and potential role in metabolism-related diseases
4
作者 Yirui LU Yutong RAN +5 位作者 Hong LI Jiao WEN Xiaodong CUI Xiaoyun ZHANG Xiumei GUAN Min CHENG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2023年第12期1106-1122,共17页
With the development of modern sequencing techniques and bioinformatics, genomes that were once thought to be noncoding have been found to encode abundant functional micropeptides(miPs), a kind of small polypeptides. ... With the development of modern sequencing techniques and bioinformatics, genomes that were once thought to be noncoding have been found to encode abundant functional micropeptides(miPs), a kind of small polypeptides. Although miPs are difficult to analyze and identify, a number of studies have begun to focus on them. More and more miPs have been revealed as essential for energy metabolism homeostasis, immune regulation, and tumor growth and development. Many reports have shown that miPs are especially essential for regulating glucose and lipid metabolism and regulating mitochondrial function.MiPs are also involved in the progression of related diseases. This paper reviews the sources and identification of miPs, as well as the functional significance of miPs for metabolism-related diseases, with the aim of revealing their potential clinical applications. 展开更多
关键词 Energy metabolism Micropeptides MITOCHONDRIA Noncoding rna(ncrna) Small open reading frame(sORF)
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非编码RNA作为ceRNA在人癌症中的功能及机制 被引量:19
5
作者 麦尔哈巴·阿不都热依木 潘燕 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期895-902,共8页
非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA),即无编码蛋白质潜力的RNA,包括短非编码RNA,例如微RNA(microRNA, miRNA),长非编码RNA(long coding RNA, lncRNA)和环状RNA(circular RNA, circRNA)等,已被证明可以在RNA水平上调节细胞中多种生理及病... 非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA),即无编码蛋白质潜力的RNA,包括短非编码RNA,例如微RNA(microRNA, miRNA),长非编码RNA(long coding RNA, lncRNA)和环状RNA(circular RNA, circRNA)等,已被证明可以在RNA水平上调节细胞中多种生理及病理过程。miRNA是约18~22个核苷酸大小的内源性非编码RNA分子,可以通过MRE与靶基因的3′非翻译区(untranslated region,UTR)中的互补序列结合,抑制蛋白质编码基因的表达,并导致mRNA转录物的更新、转换或降解。2011年,Salmena等提出,非编码RNA与具有编码蛋白质能力的RNA(mRNA)之间存在一种被称为竞争性内源RNA(competing endogenous RNA, ceRNA)的相互作用机制假说,即含有miRNA反应元件(MRE)的ncRNA通过与miRNA结合,解除miRNA对靶基因的抑制作用。这一假说对基因表达调控的传统认知进行了补充,在RNA水平上将多种ncRNA的作用补充到经典的miRNA调控mRNA翻译的过程,将其延伸为ceRNA-miRNA-mRNA的网络调控模式。近年来研究发现,ceRNA机制广泛存在于胃癌、结肠癌和膀胱癌等各类癌症中,并且在肿瘤的基因调控及肿瘤细胞的增殖、侵袭、转移、凋亡、细胞周期等生物过程中发挥作用。本文将介绍ceRNA及其网络的机制与分子基础,并且结合两类非编码RNA——lncRNA及circRNA作为ceRNA分别在人类不同癌症类型中的近期研究进展作一综述,讨论该机制在肿瘤中的角色及作用,以期拓宽对肿瘤发生发展机制的视野,为癌症治疗提供新思路。 展开更多
关键词 非编码rna 竞争性内源rna rna 长非编码rna 环状rna
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新型长链非编码RNA(lncRNA)的生物信息学研究进展 被引量:15
6
作者 原佳沛 张浩文 鲁志 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第7期634-640,共7页
非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)是指不被翻译成蛋白质的一类RNA,近几年来关于它们的功能研究越来越引起人们的重视.现在已经发现了一些中小型ncRNA,比如microRNA、snoRNA、tRNA等,但是关于长ncRNA(lncRNA)的研究还不够完善.本篇综述回... 非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)是指不被翻译成蛋白质的一类RNA,近几年来关于它们的功能研究越来越引起人们的重视.现在已经发现了一些中小型ncRNA,比如microRNA、snoRNA、tRNA等,但是关于长ncRNA(lncRNA)的研究还不够完善.本篇综述回顾了ncRNA特别是lncRNA的生物信息学研究进展,包括它们的研究历程、基本特点、与疾病的关系,以及对已有的预测非编码RNA的计算机方法进行了分析和比较,并且介绍了利用机器学习模型整合新一代高通量测序数据的方法. 展开更多
关键词 非编码rna 长链非编码rna 非编码rna预测 机器学习
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非编码RNA与糖尿病血管病变的关系 被引量:9
7
作者 万淑君 孔祥 吕坤 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期665-670,共6页
非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)为一类不编码蛋白的RNA分子,是机体重要的生物调控因子,在转录及转录后水平调控基因表达,影响糖尿病血管病变的发展过程。ncRNA按其片段大小主要分为微RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non cod... 非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)为一类不编码蛋白的RNA分子,是机体重要的生物调控因子,在转录及转录后水平调控基因表达,影响糖尿病血管病变的发展过程。ncRNA按其片段大小主要分为微RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non coding RNA,lncRNA)及环状RNA(circular RNA,circRNA)。miRNA可在转录后水平调控靶基因表达,并有成为临床诊断标志物的潜能。lncRNA影响多种分子信号通路,其在糖尿病血管病变中的作用逐渐受到关注。circRNA具有显著的基因调节功能,可与miRNA竞争结合位点,参与调控糖尿病血管病变。该文回顾目前有关ncRNA与糖尿病血管病变的研究,探讨ncRNA与糖尿病微血管及大血管病变间的关系,为糖尿病血管病变的诊断和治疗提供新思路。 展开更多
关键词 非编码rna rna 长链非编码rna 糖尿病 糖尿病血管病变
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piRNA的生物学功能 被引量:8
8
作者 黄文强 邢万金 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期783-788,共6页
非编码小RNA(non-codingRNA,ncRNA)主要有siRNA(smallinterferingRNA)、miRNA(microRNA)和piRNA(piwi-interactingRNA)三类,其中piRNA是近年来新发现的一类小RNA分子,特异性地同Argonuat蛋白家族中的Piwi亚家族蛋白结合,主要在生殖细胞... 非编码小RNA(non-codingRNA,ncRNA)主要有siRNA(smallinterferingRNA)、miRNA(microRNA)和piRNA(piwi-interactingRNA)三类,其中piRNA是近年来新发现的一类小RNA分子,特异性地同Argonuat蛋白家族中的Piwi亚家族蛋白结合,主要在生殖细胞系中表达,对维持生殖系DNA完整、抑制转座子转录、抑制翻译、参与异染色质的形成、执行表观遗传调控和生殖细胞发生等均有重要作用.piRNA基因几乎遍布于整个基因组,但呈高度不连续性分布,大部分定位于20~90kb的染色体基因簇上.与来自于双链RNA的siRNA和发卡结构miRNA不同之处是piRNA来自长单链RNA前体,或者是两股非重叠的反向转录前体,其生成与Dicer无关.作为调节RNA(riboregulator),piRNA和miRNA可能在动物起源早期就已经出现了,帮助生命进入了一个多细胞动物的时代,产生了今天的生物体复杂性和多样性.piRNA成为ncRNA的研究热点,进展飞快,有很多综述及时介绍piRNA的研究进展,本文结合siRNA、miRNA的特点介绍了关于piRNA的形成机制和作用的最新研究成果. 展开更多
关键词 非编码小rna(ncrna) SIrna MIrna piwi-interacting rna(pirna)
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阿尔茨海默病中β淀粉样蛋白的生成及清除的调节 被引量:10
9
作者 崔雨婷 王亚琦 王培昌 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期176-181,共6页
阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)是一种慢性退行性神经系统疾病,临床主要表现为进行性认知能力下降、记忆力衰退、人格改变等。AD的标志性病理特征包括脑细胞外β淀粉样蛋白(β-amyloid protein, Aβ)沉积形成老年斑、细胞内神... 阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)是一种慢性退行性神经系统疾病,临床主要表现为进行性认知能力下降、记忆力衰退、人格改变等。AD的标志性病理特征包括脑细胞外β淀粉样蛋白(β-amyloid protein, Aβ)沉积形成老年斑、细胞内神经纤维缠结(neurofibrillary tangles, NFT)、神经炎症增加以及神经元凋亡。β淀粉样蛋白主要在神经元产生,是淀粉样前体蛋白经过一系列酶解反应生成的由39~42个氨基酸组成的多肽,调节Aβ的生成和清除能够有效延缓甚至逆转阿尔茨海默病的进程,因而具有重大的研究价值。β-分泌酶(β-site APP cleaving enzyme 1,BACE1)为Aβ产生过程中的关键酶,其含量及活性的改变均能影响Aβ产生,在阿尔茨海默病的发生发展中发挥至关重要的作用;老年斑周围炎性细胞的聚集提示,AD与神经炎症高度相关,神经炎症相关细胞能够参与Aβ的清除,多种炎性因子也能调节Aβ的生成;非编码RNA虽很少直接参与Aβ的产生、沉积和清除,但其可以通过多种途径调节Aβ的产生。本文从β淀粉样蛋白生成及清除的机制着手,重点阐述了BACE1、神经炎症、非编码RNA对Aβ调控的重要作用,以期为AD发病机制的进一步研究提供思路,并对阿尔茨海默病早期干预及治疗提供理论参考。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 Β淀粉样蛋白 神经炎症 非编码rna Β-分泌酶
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RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP)与非编码RNA(ncRNA)调控的研究进展 被引量:6
10
作者 丁超 张兰 +1 位作者 曹洁 于文强 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期256-261,共6页
RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干... RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRP)是一类以单链RNA为模板合成互补RNA链的聚合酶。根据其来源可分为病毒RdRP和细胞RdRP,病毒RdRP对病毒基因组复制及病毒引起的宿主免疫反应有重要作用,宿主细胞RdRP主要参与RNA干扰(RNA interference,RNAi)现象。越来越多研究证明RdRP的功能与非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)密不可分,本文对病毒RdRP、细胞RdRP与ncRNA调控之间的关系作了较详细的阐述,同时对丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)诱发的肝癌机制提出新的观点。 展开更多
关键词 rna依赖的rna聚合酶(RdRP) 非编码rna(ncrna) rna干扰(rnaI) 丙型肝炎病毒(HCV)
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长非编码RNA以及与疾病发生的研究进展 被引量:8
11
作者 唐珍 王含彦 +2 位作者 易芳 郭冬梅 罗蓉 《西南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2015年第1期51-55,共5页
调节性非编码RNA是指不被翻译为蛋白且具调节作用的功能性RNA分子,常见的具调控作用的非编码RNA(ncRNA)包括si RNA、miRNA、piRNA以及长链非编码RNA(lncRNA).lncRNA是目前调节性非编码RNA研究的热点.lncRNA与物种进化、胚胎发育、物质... 调节性非编码RNA是指不被翻译为蛋白且具调节作用的功能性RNA分子,常见的具调控作用的非编码RNA(ncRNA)包括si RNA、miRNA、piRNA以及长链非编码RNA(lncRNA).lncRNA是目前调节性非编码RNA研究的热点.lncRNA与物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等有密切的联系,对其功能深入了解可促进细胞内基因表达调控网络的研究,也为临床疾病尤其是肿瘤的诊断和治疗以及新药的研发提供科学依据.本文主要对lncRNA的功能研究以及与疾病的发生研究现状进行探讨. 展开更多
关键词 非编码rna(ncrna) 长链非编码rna(lncrna) 调控机制 肿瘤
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非编码RNA在胚胎发育过程中的作用 被引量:7
12
作者 吴昊 张运海 凌英会 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期1-7,共7页
胚胎发育是一个复杂的过程,其发生受到了很多转录调控因子的调控。随着高通量深度测序技术的发展,研究发现非编码RNA(ncRNA)对动物胚胎发育、X染色体失活、性别调控、脑部发育都具有十分重要的调控作用。其中,miRNA主要通过与其靶向mRNA... 胚胎发育是一个复杂的过程,其发生受到了很多转录调控因子的调控。随着高通量深度测序技术的发展,研究发现非编码RNA(ncRNA)对动物胚胎发育、X染色体失活、性别调控、脑部发育都具有十分重要的调控作用。其中,miRNA主要通过与其靶向mRNA的3′UTR结合参与调控胚胎发育的相关基因;lncRNA通过转录干扰或是修饰染色质来调控相关基因从而介导哺乳动物X染色体失活和昆虫W染色体的剂量补偿;piRNA通过沉默转座子来维持生殖细胞DNA完整性,并参与生殖细胞形成及家蚕性别调控;circRNA可以作为miRNA的海绵调控动物脑部的发育。本文拟从miRNA、lncRNA、piRNA、circRNA等ncRNA角度阐述其在胚胎发育过程中的研究进展,为进一步研究ncRNA参与调控动物胚胎发育过程的作用机制提供参考。 展开更多
关键词 非编码rna(ncrna) 胚胎发育 X染色体失活 性别调控 脑部发育
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非编码RNA通过调控Notch通路影响非小细胞肺癌的生物学行为
13
作者 孙佳珺 董美辰 +1 位作者 张树冰 文斗斗 《生命科学》 CSCD 2024年第5期649-657,共9页
Notch信号通路是决定细胞命运的重要通路之一,已被证实在非小细胞肺癌(NSCLC)的增殖、分化和凋亡中起重要作用。在对Notch信号通路与NSCLC的研究中,非编码RNA (ncRNA)对Notch通路的调控是近五年的一个研究热点。其中,微小RNA (miRNA)、... Notch信号通路是决定细胞命运的重要通路之一,已被证实在非小细胞肺癌(NSCLC)的增殖、分化和凋亡中起重要作用。在对Notch信号通路与NSCLC的研究中,非编码RNA (ncRNA)对Notch通路的调控是近五年的一个研究热点。其中,微小RNA (miRNA)、长链非编码RNA (lncRNA)和环状RNA (circRNA)通过多种方式调控Notch通路从而影响NSCLC的发生发展。此外,ncRNA对Notch通路的调控还与NSCLC耐药相关。尽管目前ncRNA在NSCLC治疗中的研究较少,但是基于ncRNA的靶向药物将为NSCLC治疗提供新的方案。 展开更多
关键词 非编码rna(ncrna) NOTCH信号通路 非小细胞肺癌(NSCLC) 耐药
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猪肌内脂肪沉积的影响因素及非编码RNA对其调控的研究进展
14
作者 李莉娜 吴仙 +5 位作者 陈朝军 张洁 向清华 王清峰 谭露霖 冯宇隆 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第14期18-22,共5页
肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)俗称“大理石纹”,是猪肉脂肪组织的重要组成部分,可以改善肉的嫩度、多汁性,提升肉的风味,是评价猪肉品质的重要指标。IMF主要分布在肌纤维或肌纤维束间,由三酰甘油、磷脂和胆固醇组成,受遗传、营养、... 肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)俗称“大理石纹”,是猪肉脂肪组织的重要组成部分,可以改善肉的嫩度、多汁性,提升肉的风味,是评价猪肉品质的重要指标。IMF主要分布在肌纤维或肌纤维束间,由三酰甘油、磷脂和胆固醇组成,受遗传、营养、环境等因素的影响。文章对影响猪IMF沉积的主要因素及非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)]在猪IMF沉积中的作用进行综述,旨在为深入研究猪脂肪沉积的分子机制提供理论基础。 展开更多
关键词 肉品质 肌内脂肪(IMF) 影响因素 非编码rna(ncrna)
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调控肉牛肌内脂肪沉积的分子机制研究进展
15
作者 王思伟 彭朋 +3 位作者 刘婷婷 肖延仁 王昆 周荣艳 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第14期23-31,124,共10页
肉牛肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)是指存在于肌纤维内的脂肪组织,含量与牛肉的多汁性、嫩度和适口性呈正相关关系,是决定牛肉质量等级的重要因素之一。明确肉牛IMF沉积的产生和调控机制是提高牛肉IMF含量的有效途径。文章对肉牛IMF... 肉牛肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)是指存在于肌纤维内的脂肪组织,含量与牛肉的多汁性、嫩度和适口性呈正相关关系,是决定牛肉质量等级的重要因素之一。明确肉牛IMF沉积的产生和调控机制是提高牛肉IMF含量的有效途径。文章对肉牛IMF沉积过程及调控IMF沉积的候选基因、转录因子和非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)进行综述,旨在为进一步解析肉牛IMF沉积的分子机制和推动肉牛肉质性状选育进程提供参考。 展开更多
关键词 肉牛 肌内脂肪(IMF) 候选基因 转录因子 非编码rna(ncrna) 调控机制
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东方蜜蜂微孢子虫孢子中长链非编码RNA的竞争性内源RNA调控网络及潜在功能 被引量:4
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作者 周丁丁 史小玉 +10 位作者 王杰 范元婵 祝智威 蒋海宾 范小雪 熊翠玲 郑燕珍 付中民 徐国钧 陈大福 郭睿 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期2122-2136,共15页
[背景]长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度>200 nt且不具有编码能力的转录本,能够在真核生物的转录水平和转录后水平通过顺式(cis)、反式(trans)或竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)机制调控基因的表... [背景]长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度>200 nt且不具有编码能力的转录本,能够在真核生物的转录水平和转录后水平通过顺式(cis)、反式(trans)或竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)机制调控基因的表达,已被证明在生物体的生长和发育等生物学过程中发挥重要的调控作用.[目的]结合测序得到的东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)纯化孢子的small RNA(sRNA)组学数据和前期获得的lncRNA组学数据对lncRNA的调控方式进行深入细致的分析和探讨,揭示lncRNA在东方蜜蜂微孢子虫孢子中的潜在功能.[方法]利用small RNA-seq(sRNA-seq)技术对东方蜜蜂微孢子虫纯化孢子进行测序,通过相关的生物信息学软件对测序数据进行质控.根据lncRNA与mRNA的位置关系预测lncRNA的上下游基因;使用Blast软件比对GO和KEGG数据库,对上下游基因进行功能和代谢通路注释;利用Target Finder软件预测lncRNA-miRNA及lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,进而通过Cytoscape v3.7.2软件对调控网络进行可视化;利用RT-PCR对调控网络中的部分lncRNA、miRNA和mRNA的表达进行验证.[结果]东方蜜蜂微孢子虫纯化孢子样品的sRNA-seq分别得到16597883、15451791和12248316条raw reads,经质控分别得到15608370、14249255和11440684条clean reads,各样品的Q30≥98.58%.共预测出lncRNA的上下游基因310个,它们可注释到代谢进程、细胞进程、催化活性、结合和细胞等相关的35个功能条目;此外还可注释到56条代谢通路,涉及嘌呤代谢、碳代谢和丙酮酸代谢等物质代谢通路,以及甲烷代谢、氧化磷酸化和糖酵解/糖异生等能量代谢通路.上述结果表明相应的lncRNA可能通过cis作用调节上下游基因的表达,从而参与调控东方蜜蜂微孢子虫孢子中的物质和能量代谢以及细胞生命活动.进一步构建lncRNA-miRNA调控网络,分析结果显示MSTRG.3636.1、MSTRG.4498.1和MSTRG.4883.1可靶向结合4个miRNA(nce-mi 展开更多
关键词 东方蜜蜂微孢子虫 非编码rna 长链非编码rna 上下游基因 竞争性内源rna 调控网络
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非编码RNA在卵泡发育和卵巢疾病中的研究进展 被引量:3
17
作者 王静 包日强 +1 位作者 董麒铭 张春平 《生殖与避孕》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期135-141,共7页
非编码RNA(non-coding RNA,nc RNA)是目前生物医学领域的研究热点,如长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)和小非编码RNA:微小RNA(mirco RNA,mi RNA)、内源性小干扰RNA(endogenous small interfering RNA,endo-si RNA)、PIWI相... 非编码RNA(non-coding RNA,nc RNA)是目前生物医学领域的研究热点,如长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)和小非编码RNA:微小RNA(mirco RNA,mi RNA)、内源性小干扰RNA(endogenous small interfering RNA,endo-si RNA)、PIWI相互作用RNA(PIWI interacting RNA,pi RNA)等,它们作为细胞内基因调控网络的重要成员影响细胞的各种生命活动。近年来研究表明这些非编码RNA在卵巢也发挥重要作用,参与了颗粒细胞增殖、分化、凋亡以及激素合成的调控,在卵母细胞存活和发育中发挥重要作用,非编码RNA的表达异常与多囊卵巢等疾病密切相关,本文就非编码RNA与卵巢卵泡发育以及卵巢相关疾病的研究作一简述。 展开更多
关键词 长链非编码rna(lncrna) 微小rna(mirna) PIWI相互作用rna(pirna) 内源性小干扰rna(endo-sirna) 卵泡发育
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非编码RNA在多囊卵巢综合征发生发展中的作用及潜在的临床意义 被引量:2
18
作者 刘珺 陈娇 +1 位作者 尹太郎 杨菁 《武汉大学学报(医学版)》 CAS 2021年第3期502-506,共5页
多囊卵巢综合征(PCOS)是育龄期女性最常见的内分泌性疾病,也是导致女性不孕的重要原因之一,目前确切的发病机理仍不清楚。非编码RNA(ncRNA)是指不翻译蛋白质的RNA,其中长链非编码RNA(lncRNA)、微小非编码RNA(miRNA)及环状非编码RNA(circ... 多囊卵巢综合征(PCOS)是育龄期女性最常见的内分泌性疾病,也是导致女性不孕的重要原因之一,目前确切的发病机理仍不清楚。非编码RNA(ncRNA)是指不翻译蛋白质的RNA,其中长链非编码RNA(lncRNA)、微小非编码RNA(miRNA)及环状非编码RNA(circRNA)是近年来的研究热点,在PCOS患者的子宫、卵丘细胞、卵巢颗粒细胞、卵泡液中均有异常表达,且与PCOS导致的卵泡发育障碍和内分泌紊乱有着密不可分的联系,或可成为未来PCOS诊断及治疗的靶点。本文综述了近年来上述三种ncRNA在PCOS发生发展中的作用及潜在的临床意义。 展开更多
关键词 多囊卵巢综合征(PCOS) 非编码rna(ncrna) 长链非编码rna(lncrna) 微小非编码rna(mirna) 环状非编码rna(circrna)
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非编码RNA对胰腺癌发生进展及耐药的影响
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作者 吴念平 周策凡 唐景峰 《生命科学研究》 CAS 2023年第6期488-497,共10页
非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)作为近几年研究的热点,它们大量存在于生物体内。大多数非编码RNA不具备编码蛋白质的能力,但是能够调控基因表达及蛋白质功能,在各种疾病中参与复杂的信号网络并发挥着重要的功能。胰腺癌由于早期症状... 非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)作为近几年研究的热点,它们大量存在于生物体内。大多数非编码RNA不具备编码蛋白质的能力,但是能够调控基因表达及蛋白质功能,在各种疾病中参与复杂的信号网络并发挥着重要的功能。胰腺癌由于早期症状不明显,一旦被发现就是晚期,并且治疗和预后效果极差,因此被称为癌症之王,目前科研上也难以攻克。本文阐述了非编码RNA在胰腺癌发生、进展及耐药过程中的作用机理,以期为科研人员寻找检测和治疗胰腺癌的靶点提供一定的思路。 展开更多
关键词 非编码rna(ncrna) 胰腺癌 耐药
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非编码RNA及其在畜禽中的应用研究进展 被引量:3
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作者 尚方正 韩文静 +4 位作者 吴志红 海尔汗 马荣 张燕军 李金泉 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第1期235-247,共13页
在真核生物基因组转录过程中,除了一些蛋白质编码RNA以外,还有一些不同类型的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)也参与了复杂生命活动过程的调节。近年来,全转录组测序技术的出现和生物信息学的快速发展极大地促进了人们对ncRNA的研究,nc... 在真核生物基因组转录过程中,除了一些蛋白质编码RNA以外,还有一些不同类型的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)也参与了复杂生命活动过程的调节。近年来,全转录组测序技术的出现和生物信息学的快速发展极大地促进了人们对ncRNA的研究,ncRNA在生物领域的多个方面具有重要作用,如在人类肿瘤、非肿瘤等方面的疾病治疗,在动物胚胎发育、肌肉生长、脂肪沉积、免疫应答及皮肤毛囊调控等领域都有了很大的进展。作者主要综述了全转录组测序技术、ncRNA分类、主要作用机制和ncRNA在畜禽中的应用,为探究ncRNA在动物中的调控机制提供理论依据。 展开更多
关键词 非编码rna(ncrna) 全转录组测序 畜禽 应用
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