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差异表达基因分析揭示重度斑秃的新型生物标志物和生物学变化
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作者 王怡丹 鲁严 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期707-714,共8页
目的:探讨与重度斑秃(AA)相关的生物标志物和生物学变化。方法:下载两份AA患者数据集,其中数据集GSE68801分为3个亚组:正常组(62例)、斑片型斑秃组(AAP)(28例)和全秃/普秃组(AT/AU)(32例)。通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)、基因本... 目的:探讨与重度斑秃(AA)相关的生物标志物和生物学变化。方法:下载两份AA患者数据集,其中数据集GSE68801分为3个亚组:正常组(62例)、斑片型斑秃组(AAP)(28例)和全秃/普秃组(AT/AU)(32例)。通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)、基因本体论(GO)和单样本基因集富集分析(ssGSEA)的方法对识别出的差异表达基因(DEGs)进行分析,并通过3种不同的机器学习算法在模块中筛选出受试者工作特征曲线下面积(AUC)均>0.7的3个基因,验证其诊断价值。最后,利用STRING和Cytoscape构建这些基因和相关转录因子的网络。结果:与正常组比较,在AT/AU中发现了703个DEGs。在DEGs的关键模块中,通过机器学习发现了3个枢纽基因,即BNC1、PPP1R1C和RMND5A。3个枢纽基因的AUC都表明枢纽基因在AAP和AT/AU以及GSE148346的AA组中具有较高的诊断价值(AUC>0.7)。结论:3个枢纽基因在GSE68801和GSE148346中均表现出令人满意的诊断能力,有助于诊断重度AA。这些发现还提出了针对与毛发周期和再生相关的基因和通路的AA新疗法。 展开更多
关键词 非瘢痕性脱发 免疫紊乱 毛发周期 BNC1 PPP1R1C rmnd5A
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人类新基因RMND5A的克隆及功能研究 被引量:4
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作者 唐文岘 黎冠 +5 位作者 邓云 袁婺州 李永青 王跃群 朱传柄 吴秀山 《湖南师范大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2008年第1期85-89,共5页
克隆了一个新的人类Lish/CTLH结构域基因,经国际基因命名委员会批准命名为RMND5A.该基因位于染色体2p11.2,长3 239 bp,编码391个氨基酸,其结构域从N端起依次为LisH、CTLH与CRA.RT-PCR分析表明该基因在人类早期胚胎的多个组织中有表达,... 克隆了一个新的人类Lish/CTLH结构域基因,经国际基因命名委员会批准命名为RMND5A.该基因位于染色体2p11.2,长3 239 bp,编码391个氨基酸,其结构域从N端起依次为LisH、CTLH与CRA.RT-PCR分析表明该基因在人类早期胚胎的多个组织中有表达,在心脏、肝和肾中的表达水平较强.对该基因的蛋白进行了表达并制备了多克隆抗体.荧光素酶活性测定分析表明,在COS7细胞中过表达蛋白可以使MAPK信号途径的两个下游转录因子ELK-1和AP-1的转录活性显著下降,表明RMND5A通过MAPK信号途径参与了对细胞生命活动的调控过程. 展开更多
关键词 rmnd5A 克隆 表达 MAPK
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小鼠RMND5A的原核表达、纯化及多克隆抗体制备
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作者 朱泽安 范雄伟 +7 位作者 邓云 莫小阳 万永奇 李永青 袁婺洲 江志钢 吴秀山 王跃群 《激光生物学报》 CAS CSCD 2010年第2期273-277,共5页
RMND5A通过MAPK信号途径参与了对细胞生命活动的调控过程。通过PCR扩增RMND5A基因,并将其克隆至表达载体pGEX-4T-1上,转化至大肠杆菌BL21(DE3)中,再通过IPTG进行诱导表达GST-RMND5A融合蛋白。通过尿素洗涤包涵体并切胶回收纯化融合蛋白... RMND5A通过MAPK信号途径参与了对细胞生命活动的调控过程。通过PCR扩增RMND5A基因,并将其克隆至表达载体pGEX-4T-1上,转化至大肠杆菌BL21(DE3)中,再通过IPTG进行诱导表达GST-RMND5A融合蛋白。通过尿素洗涤包涵体并切胶回收纯化融合蛋白,免疫新兰大白兔制备多克隆抗体,Western blot检测抗体活性。结果说明,获得了RMND5A原核表达重组融合蛋白及高效价的特异性兔抗RMND5A多克隆抗体,为RMND5A进一步的功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 rmnd5A 原核表达 多克隆抗体
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RMND5B基因的克隆及其腺病毒载体的构建
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作者 张仕超 陈宇 +8 位作者 尹丽阳 刘文邦 崔俊毅 蔡英桂 朱旋 陈辉 吴秀山 范雄伟 王跃群 《激光生物学报》 CAS 2016年第4期350-355,共6页
已有研究表明RMND5B可能与心肌肥大相关,但具体机制不明,RMND5B的重组腺病毒载体的构建和鉴定为研究RMND5B功能提供了基础工具。首先,设计小鼠RMND5B基因的特异性引物,以c DNA为模板,PCR扩增RMND5B ORF区,并在两端各加入HindⅢ及SalⅠ... 已有研究表明RMND5B可能与心肌肥大相关,但具体机制不明,RMND5B的重组腺病毒载体的构建和鉴定为研究RMND5B功能提供了基础工具。首先,设计小鼠RMND5B基因的特异性引物,以c DNA为模板,PCR扩增RMND5B ORF区,并在两端各加入HindⅢ及SalⅠ的酶切位点。将此片段插入到p MD18-T载体,再亚克隆至线性化的穿梭质粒p Ad Track-CMV中。PmeⅠ酶切线性化之后,电转化到含p Ad Easy-1的BJ5183感受态细菌中。在BJ5183细菌中发生同源重组获得了重组质粒p Ad-RMND5B质粒。PacⅠ酶切线性化之后转染293A细胞,经过包装获得腺病毒AdRMND5B。将此腺病毒感染新生大鼠原代心肌细胞,并在一段时间后观察绿色荧光并通过RT-PCR检测RMND5B的表达情况。结果表明,成功构建了RMND5B的重组腺病毒载体并实现了AdRMND5B在新生大鼠原代心肌细胞中表达,为进一步研究RMND5B基因在心肌肥大中的作用奠定了良好的实验基础。 展开更多
关键词 腺病毒 rmnd5B 心肌细胞
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