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基于网络药理学和分子对接探讨清热化湿抗毒方治疗COVID-19的物质基础和作用机制
被引量:
2
1
作者
李林
田鑫
+4 位作者
王兴
韦祖猛
黄卫清
刘良徛
徐丽丽
《中药材》
CAS
北大核心
2021年第3期756-766,共11页
目的:探寻国医大师伍炳彩所拟清热化湿抗毒方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在效应物质基础及可能的分子机制,为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的中医药治疗及科研提供参考。方法:借助TCMSP、Batman等数据库检索清热化湿抗毒方的中药...
目的:探寻国医大师伍炳彩所拟清热化湿抗毒方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在效应物质基础及可能的分子机制,为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的中医药治疗及科研提供参考。方法:借助TCMSP、Batman等数据库检索清热化湿抗毒方的中药化学成分和作用靶点。通过GeneCards、OMIM和GEO数据库筛选出COVID-19的疾病靶点。使用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络和潜在靶点的相互作用关系,通过Metascape富集分析预测核心模块和作用机制,并用主要成分与ACE2进行分子对接。结果:挖掘出清热化湿抗毒方中202种化学成分、301个药物靶点,COVID-19相关疾病靶点360个,二者交集靶点64个,组方中主要化学成分9个,关键靶点涉及PTGS2、NOS2、PPARG、MAPK14、NOS3、RELA等,预测到3个核心模块,核心术语主要包括感染性疾病、免疫性疾病和通路、免疫和炎症通路。GO富集分析共得到条目196个,主要涉及细胞因子介导的信号通路、对氧化应激的反应、凋亡信号通路、蛋白质定位建立的调控、活性氧代谢过程等。KEGG通路富集筛选出147条信号通路,包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、弓形虫病、细胞凋亡、MAPK信号通路、阿米巴病、HIF-1信号通路和RIG-I样信号通路,分子对接发现木犀草素、槲皮素、黄芩素、山柰酚、刺槐素、汉黄芩素、柚皮素7种化学成分与ACE2具有较好的结合性,且槲皮素、黄芩素、山柰酚与ACE2结合得更为稳定。结论:清热化湿抗毒方具有多成分、多靶点、多通路作用COVID-19的作用。
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关键词
清热化湿抗毒方
网络药理学
分子对接
新型冠状病毒肺炎
免疫和炎症反应
HIF-1
信号
通路
rig
-
ⅰ
样
信号
通路
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探讨清热化湿抗毒方治疗COVID-19的物质基础和作用机制
被引量:
2
1
作者
李林
田鑫
王兴
韦祖猛
黄卫清
刘良徛
徐丽丽
机构
江西中医药大学附属医院
江西中医药大学
出处
《中药材》
CAS
北大核心
2021年第3期756-766,共11页
基金
江西省科技厅科技攻关项目(S2020ZPYFG0006)
“全国中医药创新骨干人才”培养项目(国中医药人教函[2019]128号)
文摘
目的:探寻国医大师伍炳彩所拟清热化湿抗毒方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在效应物质基础及可能的分子机制,为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的中医药治疗及科研提供参考。方法:借助TCMSP、Batman等数据库检索清热化湿抗毒方的中药化学成分和作用靶点。通过GeneCards、OMIM和GEO数据库筛选出COVID-19的疾病靶点。使用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络和潜在靶点的相互作用关系,通过Metascape富集分析预测核心模块和作用机制,并用主要成分与ACE2进行分子对接。结果:挖掘出清热化湿抗毒方中202种化学成分、301个药物靶点,COVID-19相关疾病靶点360个,二者交集靶点64个,组方中主要化学成分9个,关键靶点涉及PTGS2、NOS2、PPARG、MAPK14、NOS3、RELA等,预测到3个核心模块,核心术语主要包括感染性疾病、免疫性疾病和通路、免疫和炎症通路。GO富集分析共得到条目196个,主要涉及细胞因子介导的信号通路、对氧化应激的反应、凋亡信号通路、蛋白质定位建立的调控、活性氧代谢过程等。KEGG通路富集筛选出147条信号通路,包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、弓形虫病、细胞凋亡、MAPK信号通路、阿米巴病、HIF-1信号通路和RIG-I样信号通路,分子对接发现木犀草素、槲皮素、黄芩素、山柰酚、刺槐素、汉黄芩素、柚皮素7种化学成分与ACE2具有较好的结合性,且槲皮素、黄芩素、山柰酚与ACE2结合得更为稳定。结论:清热化湿抗毒方具有多成分、多靶点、多通路作用COVID-19的作用。
关键词
清热化湿抗毒方
网络药理学
分子对接
新型冠状病毒肺炎
免疫和炎症反应
HIF-1
信号
通路
rig
-
ⅰ
样
信号
通路
Keywords
Qingre huashi kangdu prescription
Network pharmacology
Molecular docking
COVID-19
Immune and inflammatory response
HIF-1 signaling pathway
rig
-I-like signaling pathway
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接探讨清热化湿抗毒方治疗COVID-19的物质基础和作用机制
李林
田鑫
王兴
韦祖猛
黄卫清
刘良徛
徐丽丽
《中药材》
CAS
北大核心
2021
2
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