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Cloning and molecular characterization of a novel lectin gene from Pinellia ternata 被引量:18
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作者 ZHONGHAXCHEN FEICHEN +6 位作者 JUNSONG XIAOFENSUN KEXUANTANG JIANHONGYAO XIUYUNZHAO ZHIHUALIAO JUANLIN 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2003年第4期301-308,共8页
The full-length cDNA of Pinellia ternata agglutinin (PTA) was cloned from inflorescences using RACE-PCR. Through comparative analysis of PTA gene (pta) and its deduced amino acid sequence with those of other Araceae s... The full-length cDNA of Pinellia ternata agglutinin (PTA) was cloned from inflorescences using RACE-PCR. Through comparative analysis of PTA gene (pta) and its deduced amino acid sequence with those of other Araceae species, pta was found to encode a precursor lectin with signal peptide and to have extensive homology with those of other Araceae species. PTA was a heterotetrameric mannose-binding lectin with three mannose-binding boxes like lectins from other Araceae and Amaryllidaceae species. Southern blot analysis of the genomic DNA revealed that pta belonged to a low-copy gene family. Northern blot analysis demonstrated that pta constitutively expressed in various plant tissues including root, leaf, stem and inflorescence. The pta cDNA sequence encoding for mature PTA protein was cloned into pET-32a plasmid and the resulting plasmid, pET-32a-PTA containing Trx-PTA fusion protein, was investigated for the expression in E. coli BL21. SDS-PAGE gel analysis showed that the Trx-PTA fusion protein was successfully expressed in E. coli BL21 when induced by IPTG. Artificial diet assay revealed that PTA fusion protein had significant levels of resistance against peach potato aphids when incorporated into artificial diet at 0.1% (w/v). The cloning of the pta gene will enable us to further test its effect in depth on aphids by transferring the gene into crop plants. 展开更多
关键词 AraceAE cDNA cloning LECTIN Pinellia ternata race-pcr.
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织锦芋螺ο家族芋螺毒素的序列分析 被引量:10
2
作者 于芳 卢柏松 +1 位作者 赵东 黄培堂 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 1999年第6期853-856,共4页
为了从织锦芋螺(Conustextile)中尽可能多地分离出ο家族的毒素序列和研究其应用价值,在克隆了织锦芋螺α芋螺毒素的基础上进行了织锦芋螺ο家族芋螺毒素基因的分离工作.从织锦芋螺毒管中提取m RNA,通过RACE... 为了从织锦芋螺(Conustextile)中尽可能多地分离出ο家族的毒素序列和研究其应用价值,在克隆了织锦芋螺α芋螺毒素的基础上进行了织锦芋螺ο家族芋螺毒素基因的分离工作.从织锦芋螺毒管中提取m RNA,通过RACE(rapid am plification ofcDNA ends,cDNA 末端的快速扩增)-PCR方法扩增获得ο家族芋螺毒素cDNA 片段,并进行克隆和序列分析.从织锦芋螺毒液中获得了6种新的芋螺毒素序列,且毒素序列的成熟肽部分均符合C- C- CC- C- C的保守半胱氨酸框架.这些是新的ο家族芋螺毒素序列,新序列的阐明为进一步研究其生物活性和应用打下了基础. 展开更多
关键词 织锦芋螺 ο家族 芋螺 毒素 序列分析 基因分离
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植物凝集素及其在抗病虫害分子育种中的应用 被引量:10
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作者 侯学文 黄剑威 《植物生理学通讯》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1217-1223,共7页
提要文章简要介绍植物凝集素的抗虫特点,并与其他类型的抗虫基因进行了比较;对目前研究较多、应用前景较好的植物凝集素的性质、抗虫性、转基因植物的抗虫性等研究进展作了阐述;并对植物凝集素在抗虫转基因工程中的应用现状和前景进行... 提要文章简要介绍植物凝集素的抗虫特点,并与其他类型的抗虫基因进行了比较;对目前研究较多、应用前景较好的植物凝集素的性质、抗虫性、转基因植物的抗虫性等研究进展作了阐述;并对植物凝集素在抗虫转基因工程中的应用现状和前景进行了讨论。 展开更多
关键词 植物凝集素 甘露糖结合凝集素 基因克隆 race-pcr 抗虫基因工程
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盐藻八氢番茄红素脱氢酶cDNA的分离及序列分析 被引量:7
4
作者 朱跃辉 姜建国 林庆生 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期21-23,共3页
采用5’和3’RACE技术和梯度PCR方法从盐藻中克隆了八氢番茄红素脱氢酶(Pds)全长cDNA,序列分析表明,该cDNA长2198bp,包含1个1752bp的开放阅读框(ORF),编码一段583氨基酸残基的多肽链。氨基酸序列的同源性分析表明,它与高等植物和蓝藻的... 采用5’和3’RACE技术和梯度PCR方法从盐藻中克隆了八氢番茄红素脱氢酶(Pds)全长cDNA,序列分析表明,该cDNA长2198bp,包含1个1752bp的开放阅读框(ORF),编码一段583氨基酸残基的多肽链。氨基酸序列的同源性分析表明,它与高等植物和蓝藻的八氢番茄红素脱氢酶序列一致性高达67%,而与细菌和酵母的序列同源性较差;在N端具有一段转运序列和辅助因子结合结构域,C端则有一胡萝卜素结合域。这些序列特征预示,盐藻Pds与其他绿藻、高等植物和蓝藻中的同源基因一样催化八氢番茄红素发生前2步脱氢反应,并且需要与另一个脱氢酶联合作用合成番茄红素。 展开更多
关键词 盐藻 八氢番茄红素脱氢酶 racepcr β-胡萝卜素生物合成 全长CDNA 序列分析 分离 race技术 高等植物 pcr方法
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海芋凝集素cDNA的分子克隆及其性质预测(英文) 被引量:8
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作者 朱亚然 王捷 +1 位作者 黄炳球 侯学文 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期634-642,共9页
用cDNA末端快速扩增-聚合酶链式反应(RACE-PCR)方法克隆了海芋(Alocasiamacrorrhiza)凝集素的全长cDNA(GenBank检索号DQ340864),并用多种生物信息学工具对其性质进行了预测。根据来源于天南星科其他植物的凝集素和类似蛋白的保守区的DN... 用cDNA末端快速扩增-聚合酶链式反应(RACE-PCR)方法克隆了海芋(Alocasiamacrorrhiza)凝集素的全长cDNA(GenBank检索号DQ340864),并用多种生物信息学工具对其性质进行了预测。根据来源于天南星科其他植物的凝集素和类似蛋白的保守区的DNA序列,设计了几个海芋凝集素基因aml特异引物(GSP)。用RNeasy试剂盒从海芋块茎中提取出总RNA,并以此为模板,用SMARTTMRACEcDNA扩增试剂盒提供的经特殊设计的通用引物以及不同的基因特异引物,分别获得海芋凝集素5'-和3'-RACE-PCR扩增片段。这些PCR产物经0.8%琼脂糖凝胶纯化后,分别与T克隆载体pMD18-T相连,筛选获得阳性克隆并提取质粒,经双酶切和特异引物的PCR验证无误后,进行序列分析。从5'-和3'-RACE-PCR测序结果拼接出全长海芋凝集素cDNA序列,并用新设计自5'-RACE-PCR5'末端的引物GSP7进行全长3'-RACE-PCR反应,获得全长海芋凝集素cDNA克隆并再次测序验证。这一新克隆的海芋凝集素cDNA的长度为1124核苷酸,分析表明它是一个编码270个氨基酸残基的蛋白质,其等电点为pH5.7,相对分子量为29.7kD。同源性分析结果表明,海芋凝集素与其他来源于天南星科的甘露糖凝集素以及相似蛋白具有高度同源性。在海芋凝集素序列中发现了2个B型凝集素功能区域和3个甘露糖的结合位点。综合上述信息,认为这一新克隆的海芋凝集素cDNA是一个编码甘露糖识别凝集素的基因序列。 展开更多
关键词 海芋 凝集 素cDNA末端快速扩增-聚合酶链式反应 分子克隆 性质预测
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瓜实蝇热激蛋白基因hsp70的克隆及序列分析 被引量:6
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作者 姜建军 王凤英 +3 位作者 黄立飞 陈红松 李磊 杨朗 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期800-805,共6页
【目的】克隆分析瓜实蝇热激蛋白hsp70基因序列特征,为进一步研究瓜实蝇的热适应性机制及制定综合防治策略奠定基础。【方法】根据NCBI数据库中已报道的昆虫hsp70基因保守序列,设计合成扩增瓜实蝇hsp70基因部分片段的简并引物,并利用RAC... 【目的】克隆分析瓜实蝇热激蛋白hsp70基因序列特征,为进一步研究瓜实蝇的热适应性机制及制定综合防治策略奠定基础。【方法】根据NCBI数据库中已报道的昆虫hsp70基因保守序列,设计合成扩增瓜实蝇hsp70基因部分片段的简并引物,并利用RACE-PCR扩增其全长序列。【结果】克隆获得瓜实蝇hsp70基因c DNA全长序列(获取号:KM112021)2271 bp,含1911 bp的开放阅读框,编码636个氨基酸,具有真核生物hsp70基因家族的3个明显基序标签,同时在C-末端具有EEVD基序,推测其属于胞质型热激蛋白。BLAST分析结果表明该序列与双翅目实蝇科昆虫hsp70基因高度相似,最高相似度达91%。氨基酸序列系统发育分析结果显示,瓜实蝇与双翅目实蝇科昆虫聚类为一个分支,证实hsp70基因的高度保守。【结论】瓜实蝇hsp70基因具有真核生物hsp70基因家族的特征,序列表现为高度的保守性,可作为今后研究瓜实蝇抗逆性机制的一个参数指标。 展开更多
关键词 瓜实蝇 热激蛋白70基因 race-pcr 序列分析
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甘蓝型油菜异胡豆苷合成酶(Strictosidine synthase)cDNA的克隆与分析 被引量:3
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作者 王敏培 周云涛 +1 位作者 王茂林 赵云 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期1277-1280,共4页
以无花瓣与正常甘蓝型油菜幼嫩花蕾(长度小于0.2mm)建立的差异表达文库中发现的异胡豆苷合成酶基因(STR)的一个cDNA片段为基础,利用RACE方法获得了甘蓝型油菜的STR基因cDNA全序列BnSTR.序列分析表明BnSTR全长1408bp,开放阅读框从第20个... 以无花瓣与正常甘蓝型油菜幼嫩花蕾(长度小于0.2mm)建立的差异表达文库中发现的异胡豆苷合成酶基因(STR)的一个cDNA片段为基础,利用RACE方法获得了甘蓝型油菜的STR基因cDNA全序列BnSTR.序列分析表明BnSTR全长1408bp,开放阅读框从第20个碱基到第1291个碱基,推导的蛋白序列与Arabidopsis thaliana,Lycopersicon esculentum,Oryzasativa,Rauvolfia manni,Catharanthus roseus和Ophiorrhiza pumila中STR的同源性分别是91,41.8,36.2,31.2,29.2和28.4%.表达结果显示,与野生型相比,油菜BnSTR在无花瓣突变型幼嫩花蕾中表达量明显下降,BnSTR可能与花瓣的发育有关. 展开更多
关键词 异胡豆苷合成酶 无花瓣突变体 racepcr 甘蓝型油菜
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三角帆蚌CAT基因cDNA全长克隆及表达分析 被引量:4
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作者 袁一鸣 李西雷 +2 位作者 白志毅 汪桂玲 李家乐 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期481-492,共12页
采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)首次克隆了三角帆蚌过氧化氢酶(CAT)基因的cDNA全长序列,为2 804 bp,包含112 bp的5'非翻译区(untranslated region,UTR),1 303 bp的3'UTR和1 388 bp... 采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)首次克隆了三角帆蚌过氧化氢酶(CAT)基因的cDNA全长序列,为2 804 bp,包含112 bp的5'非翻译区(untranslated region,UTR),1 303 bp的3'UTR和1 388 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)。ORF区共编码462个氨基酸,推算的分子量约为52.7 ku,理论等电点为6.35。多序列比对结果显示,有一段CAT氨基酸高度保守的催化位点序列FDRERIPERVVHAKGAG。三角帆蚌CAT基因有12个与还原型辅酶Ⅱ(NADPH)结合的氨基酸残基,分别是Asp107、His153、Phe157、Ser160、Arg162、Asn172、Try174、Lys196、Val261、Trp262、His264和Try317,其中第261位和第264位的氨基酸在不同物种间有所区别。比对结果得到的三角帆蚌CAT基因的氨基酸序列,与软体动物的CAT基因相似性高达99%,与虾类、鱼类、两栖类、哺乳类的CAT基因相似性也达到98%~99%,可推断属于CAT3。利用CAT基因推断得到的氨基酸序列构建NJ系统树,分析显示三角帆蚌首先与软体动物聚在一起,再与虾类聚在一起,然后依次与鱼类、两栖类和哺乳类聚在一起。荧光定量结果显示,CAT基因在三角帆蚌的7个组织均有表达,其中在肾中的表达量极低,在血液中表达呈上调趋势且明显区别于其他组织,在另外5个组织中总体上呈现不统一的先上调后下调的趋势。 展开更多
关键词 三角帆蚌 过氧化氢酶(CAT) 基因表达 race-pcr
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牙鲆纤维蛋白原相关蛋白(FREP1)基因的克隆和表达分析 被引量:2
9
作者 陈文君 鲍宝龙 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期488-495,共8页
利用RACE-PCR技术获得了牙鲆FREP1(fibrinogen-relatedprotein)基因1 131 bp cDNA全长序列,其中开放阅读框786 bp,所编码的蛋白C端含有纤维蛋白样结构域标签(WWYSRCGSAGLNG)。RNA整体原位杂交检测发现只在孵化后2 d和5 d(2 dph、5 dph)... 利用RACE-PCR技术获得了牙鲆FREP1(fibrinogen-relatedprotein)基因1 131 bp cDNA全长序列,其中开放阅读框786 bp,所编码的蛋白C端含有纤维蛋白样结构域标签(WWYSRCGSAGLNG)。RNA整体原位杂交检测发现只在孵化后2 d和5 d(2 dph、5 dph)仔鱼的肠道中有FREP1基因表达,而在9 dph和13 dph仔鱼胸鳍、肠道、鳃和皮肤中均有表达。荧光定量PCR检测显示该基因主要在成鱼的肠、鳃、皮肤和鳍条上表达,而脾脏、心脏、肾脏、肝脏和肌肉表达量很低或没有表达。鳍条和皮肤较其他组织均有极显著差异(P<0.01),鳃和肠相比其他组织具有显著差异(P<0.05)。由于该基因主要在鳍条、皮肤、肠和鳃中表达,提示FREP1基因可能和牙鲆先天性免疫相关。 展开更多
关键词 牙鲆 纤维蛋白原相关蛋白基因 race-pcr 荧光定量
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日本囊对虾Ran基因的克隆表达与蛋白质GTP结合活性分析 被引量:2
10
作者 韩芳 王志勇 《集美大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第4期241-247,共7页
在日本囊对虾抑制性差减杂交(suppression subtractive hybrid ization,SSH)研究过程中,首次发现一段经同源比较为Ran基因的部分序列,在抗病日本囊对虾中上调表达.为了进一步探索日本囊对虾Ran基因的功能,通过RACE-PCR的方法克隆得到了... 在日本囊对虾抑制性差减杂交(suppression subtractive hybrid ization,SSH)研究过程中,首次发现一段经同源比较为Ran基因的部分序列,在抗病日本囊对虾中上调表达.为了进一步探索日本囊对虾Ran基因的功能,通过RACE-PCR的方法克隆得到了日本囊对虾Ran基因全长共1 441个碱基,其中开放阅读框为645个碱基,共编码215个氨基酸,这是首次在海洋无脊椎动物体内克隆到该基因.还将该基因克隆到原核表达载体PGEX-4T-2中并转化大肠杆菌BL21,37℃下诱导6 h,超声裂解表达菌株,结果表明GST-Ran融合蛋白在大肠杆菌中为可溶性表达,蛋白大小约为50 ku,经纯化得到了纯度大于90%的GST-Ran融合蛋白.随后的GTP结合试验验证了Ran蛋白具有GTP结合活性. 展开更多
关键词 日本囊对虾 Ran基因 racepcr 蛋白表达 GTP活性
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日本鳗鲡Ⅰ型Cathelicidin基因的克隆与原核表达 被引量:2
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作者 张东玲 喻达辉 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期124-131,共8页
Cathelicidin是目前发现的一个最大抗菌肽家族,具有多重生物学功能。旨在探索和利用鱼类Cathelicidin抗菌机制和潜在的生物学功能。应用RACE-PCR技术获得日本鳗鲡I型Cathelicidin(Aj Cath I)基因的c DNA全长序列。Aj Cath I的c DNA全长... Cathelicidin是目前发现的一个最大抗菌肽家族,具有多重生物学功能。旨在探索和利用鱼类Cathelicidin抗菌机制和潜在的生物学功能。应用RACE-PCR技术获得日本鳗鲡I型Cathelicidin(Aj Cath I)基因的c DNA全长序列。Aj Cath I的c DNA全长为842 bp,开放阅读框为570 bp,编码189个氨基酸。氨基酸序列分析表明,Aj Cath I靠近C端有4个保守的半胱氨酸序列,抗菌成熟肽与香鱼(Plecoglossus altivelis)抗菌成熟肽相似性最高,同源性为65.57%。进化分析表明,Aj Cath I与其它鱼类亲缘关系较近,处于同一个分支上。将Aj Cath I基因克隆至p ET-28a载体,转化Escherichia coli BL21(DE3)宿主菌进行表达。结果表明,Aj Cath I以包涵体形式表达,经鎳柱纯化、Western blot验证和透析复性,获得高纯度的重组蛋白。 展开更多
关键词 日本鳗鲡 CATHELICIDIN 抗菌肽 race-pcr
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树鼩PD-1基因的分离、鉴定及表达分析(英文)
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作者 张旭东 邵晓丽 +2 位作者 张远旭 张华堂 何有文 《中国科学技术大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期714-721,共8页
PD-1(Programmed cell death 1)是一种抑制性的受体,是免疫球蛋白超家族的成员.大量研究证明PD-1能被诱导而在活化的T淋巴细胞、B淋巴细胞、NKT细胞和单核细胞上表达,从而在慢性感染的病因学中起着重要作用.树鼩(Tupaiabelangeri)做为... PD-1(Programmed cell death 1)是一种抑制性的受体,是免疫球蛋白超家族的成员.大量研究证明PD-1能被诱导而在活化的T淋巴细胞、B淋巴细胞、NKT细胞和单核细胞上表达,从而在慢性感染的病因学中起着重要作用.树鼩(Tupaiabelangeri)做为一个理想的模型可被应用于许多人类感染性疾病如乙型病毒性肝炎.为了充分利用树鼩对于感染性疾病的宿主免疫应答模型,我们分离出树鼩PD-1基因.利用迅速扩增cDNA末端PCR(RACE-PCR)技术,从树鼩脾组织中克隆了PD-1基因的全长cDNA序列.序列分析显示树鼩PD-1 cDNA的开放阅读框编码一个由242个氨基酸组成的跨膜蛋白,并且和人类、灵长类和啮齿类中的同源基因有高度相似性.组织分布分析表明在所检测的几种组织中PD-1基因只在脾中表达.此外,淋巴细胞刺激实验显示,利用PMA和ionomycin刺激新鲜分离的树鼩外周血单核细胞(PBMCs)能够诱导PD-1 mRNA水平上的表达.我们的结果为将来进一步探讨树鼩的免疫功能提供了良好的基础. 展开更多
关键词 树鼩 PD-1 迅速扩增cDNA末端pcr 表达 外周血单核细胞
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应用改进的SSP-抑制PCR技术扩增cDNA片段旁侧序列 被引量:4
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作者 陈渝萍 薛社普 《基础医学与临床》 CSCD 1999年第4期87-91,共5页
结合抑制PCR和单链特异引物PCR技术,降低RACE过程中由公用引物引发的非特异扩增、增加目的cDNA在原始模板中的相对比例,从而提高RACE特异性,有效地扩增靶序列。
关键词 race 抑制pcr CDNA片段 旁侧序列
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甜菜夜蛾泛素延伸蛋白基因cDNA的3′RACE-PCR扩增及其克隆和表达 被引量:6
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作者 牛国栋 张海元 张忠信 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期166-170,共5页
根据已知的草地夜蛾Spodopterafrugiperda的泛素延伸基因 5′端核苷酸序列设计引物 ,应用 3′RACE PCR技术 ,从甜菜夜蛾S .exigua脂肪体组织总RNA中反转录扩增泛素基因的cDNA片段。扩增得到的片段全长 5 13bp ,3′末端有 12 3bp的非翻译... 根据已知的草地夜蛾Spodopterafrugiperda的泛素延伸基因 5′端核苷酸序列设计引物 ,应用 3′RACE PCR技术 ,从甜菜夜蛾S .exigua脂肪体组织总RNA中反转录扩增泛素基因的cDNA片段。扩增得到的片段全长 5 13bp ,3′末端有 12 3bp的非翻译区 ,翻译区编码一个长为 12 9个氨基酸残基的蛋白质 ,预测分子量为 14 8kD。同源分析表明 ,此cDNA序列为ubiquitin 5 3aaextensionprotein(ubi 5 3)基因 ,在泛素蛋白后融合了一个核糖体L4 0蛋白 (ribosomalL4 0protein)。用MagAlign和Genedoc软件对cDNA编码的氨基酸序列进行了同源性分析 ,结果表明 :甜菜夜蛾的ubi 5 3基因与真核生物家蚕Bombyxmori、草地夜蛾、果蝇Drosophilamelanogaster和人Homosapienes泛素的同源性分别为 96 9%、98 5 %、95 3%和 93 0 % ,与甜菜夜蛾核型多角体病毒(SeNPV)泛素的同源性为 78 8% ,说明真核生物的泛素基因与核型多角体病毒的泛素基因可能存在不同的分子进化途径。将甜菜夜蛾的ubi 5 3基因克隆到原核表达载体pET 2 8a上 ,转化至BL2 1(DE3)中 ,用IPTG进行诱导表达 ,用异源泛素单克隆抗体进行Westernblot检测 。 展开更多
关键词 甜菜夜蛾 3′racepcr 泛素延伸基因 分子进化 原核表达
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木榄ERF转录因子基因的克隆及功能分析初探 被引量:3
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作者 赵杨敏 庞俊峰 +3 位作者 张占路 姬澎 尉亚辉 吴燕民 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期66-72,共7页
利用RACE-PCR技术,以深圳红树自然保护区的木榄为材料,克隆出一个ERF类转录因子基因的cDNA全长序列,命名为BgERF(GenBank序列号:GU593720)。生物信息学分析表明:该基因全长1 870 bp,完整开放阅读框1 425 bp,具有一个保守的AP2/EREBP结构... 利用RACE-PCR技术,以深圳红树自然保护区的木榄为材料,克隆出一个ERF类转录因子基因的cDNA全长序列,命名为BgERF(GenBank序列号:GU593720)。生物信息学分析表明:该基因全长1 870 bp,完整开放阅读框1 425 bp,具有一个保守的AP2/EREBP结构域,且编码的由475个氨基酸组成的蛋白具有典型的1个α螺旋,3个β转角的三维结构,在AP2/EREBP结构域的第14位为丙氨酸(A),第19位为天冬氨酸(D),属于AP2/EREBPF蛋白家族中的ERF类转录因子;NCBI-BLAST比对结果表明:该基因与胡萝卜、拟南芥、水稻、辣椒、番茄、大豆、马铃薯、陆地棉等植物ERF类转录因子具有较高的同源性;并构建了高效植物表达载体PBI121-35s-BgERF,获得的转基因烟草与野生型相比,表现出明显的耐盐性,为该基因功能的深入分析和耐盐机理的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 木榄 race-pcr技术 AP2/EREBPF蛋白 ERF转录因子 生物信息学
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一个与油菜黄化相关的未知功能基因克隆及表达 被引量:1
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作者 张珍勇 刘阳 +2 位作者 周云涛 王茂林 赵云 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期455-458,共4页
以构建的油菜幼叶黄化突变体Cr3529消减文库中一个未知功能的差异表达基因片段为基础,应用RACE-PCR技术,扩增并克隆到两个cDNA全序列,分别命名为BnCr4和Bn-Cr4-1.测序结果显示,BnCr4编码区序列大小为1395 bp,编码465个氨基酸,而BnCr4-1... 以构建的油菜幼叶黄化突变体Cr3529消减文库中一个未知功能的差异表达基因片段为基础,应用RACE-PCR技术,扩增并克隆到两个cDNA全序列,分别命名为BnCr4和Bn-Cr4-1.测序结果显示,BnCr4编码区序列大小为1395 bp,编码465个氨基酸,而BnCr4-1编码区序列长1311 bp,编码437个氨基酸.BLAST结果表明它们与拟南芥中的一个未知功能基因的cDNA同源性分别为87%和80%.功能预测显示它们含有与蛋白质的修饰作用有关的多个活性位点,如磷酸化、糖基化、酰胺化以及磷酸泛酰巯基乙胺结合位点,可能是一种新的与cAMP介导的蛋白质磷酸化与去磷酸化作用有关的蛋白.Northen杂交结果显示该基因在Cr3529子叶期和幼叶期的表达高于野生型油菜,显示该基因的表达与突变性状紧密相关.最后,原核表达了BnCr4,得到了与预计分子量相同的融合蛋白. 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 黄化突变体race-pcr 原核表达
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旋毛虫组织蛋白酶基因CathepsinX的克隆表达及免疫学特性初步分析
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作者 周阳芳 贾飞飞 +2 位作者 占建华 胡旭初 周兴旺 《热带医学杂志》 CAS 2012年第6期669-674,共6页
目的克隆表达一个新的旋毛虫组织蛋白酶基因CathepsinX,初步探讨其免疫学特性,为研究新的防治方法奠定科学基础。方法从GenBank旋毛虫核酸数据库中筛选出功能未知的CathepsinX基因部分EST序列,使用RACE-PCR方法得到其全长编码基因序列... 目的克隆表达一个新的旋毛虫组织蛋白酶基因CathepsinX,初步探讨其免疫学特性,为研究新的防治方法奠定科学基础。方法从GenBank旋毛虫核酸数据库中筛选出功能未知的CathepsinX基因部分EST序列,使用RACE-PCR方法得到其全长编码基因序列。半定量RT-PCR分析该基因的转录。构建该基因的原核表达载体pET30a-TsCPX,大肠杆菌中IPTG诱导表达,His-tag亲和层析纯化获重组蛋白TsCPX;将纯化的重组蛋白40μg/只免疫BALB/c小鼠,免疫前1周及每次免疫后2周收集免疫血清,间接ELISA检测血清总IgG、亚类IgG1、IgG2a抗体浓度。结果 RACE-PCR克隆出TsCPX全长基因序列,共1227bp;RT-PCR揭示TsCPX在旋毛虫三个发育时期均有380bp扩增条带,条带光密度分析显示最高转录水平出现在新生幼虫期。E.coli原核表达体系中成功克隆表达出重组蛋白TsCPX;重组蛋白免疫小鼠二次后,免疫血清总IgG迅速上升,三次免疫后达到峰值(P<0.001);IgG亚类IgG1抗体浓度随着免疫次数的增加迅速上升,亚类IgG2a无明显上升,两者间差异有统计学意义(P<0.001)。结论成功克隆的TsCPX基因在旋毛虫的三个生长发育时期均有转录表达,TsCPX重组蛋白具有较强免疫原性,能引起宿主(小鼠)Th2型为主的免疫应答,具有作为旋毛虫病免疫预防研究靶分子的潜在价值。 展开更多
关键词 旋毛虫 组织蛋白酶X racepcr克隆 重组蛋白 免疫原性
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半夏凝集素基因的克隆(英文) 被引量:5
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作者 姚剑虹 孙小芬 唐克轩 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期461-464,共4页
利用RACE -PCR技术从半夏花序中克隆出半夏凝集素的全长cDNA .通过比较半夏同其他天南星科植物的凝集素基因序列和推测的氨基酸序列 ,发现半夏凝集素基因编码一具有信号肽的前体蛋白 .半夏凝集素同其他天南星科植物凝集素一样 ,为具有
关键词 天南星科 CDNA 凝集素 半夏 race-pcr 基因克隆 氨基酸序列 基因编码
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雌核发育银鲫四种孵化酶基因全长cDNA的克隆及其特征分析 被引量:10
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作者 刘军 石耀华 +1 位作者 尹隽 桂建芳 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2003年第7期38-45,共8页
用抑制性差减杂交结合SMARTcDNA合成和RACE PCR技术 ,克隆得到雌核发育银鲫 (Carassiusauratusgibelio) 4种孵化酶基因的全长cDNA。 4种孵化酶基因分别被命名为GHE1、GHE2、GHE3、GHE4。序列分析表明 ,4种孵化酶基因cDNA的开放阅读框均... 用抑制性差减杂交结合SMARTcDNA合成和RACE PCR技术 ,克隆得到雌核发育银鲫 (Carassiusauratusgibelio) 4种孵化酶基因的全长cDNA。 4种孵化酶基因分别被命名为GHE1、GHE2、GHE3、GHE4。序列分析表明 ,4种孵化酶基因cDNA的开放阅读框均为 795bp ,都编码 2 6 5个氨基酸。它们推断的编码氨基酸序列同源性在 79 6~95 1 %之间。种系分析表明 ,GHE1、GHE2、GHE3、GHE4的进化地位位于日本鳗鲡(Anguillajaponica)孵化酶和青 (Oryziaslatipes)孵化酶之间。不同发育时期胚胎的RT PCR分析表明 ,银鲫GHE1、GHE2、GHE3、GHE4 4种孵化酶基因从尾芽期到幼苗期都检测到表达 ,且GHE3和GHE4在神经胚期也检测到表达。各种组织的RT PCR表明 。 展开更多
关键词 银鲫 雌核 孵化酶基因 抑制性差减杂交 SMARTcDNA race-pcr 克隆 开放阅读框 氨基酸序列同源性
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石蒜凝集素基因的克隆(英文) 被引量:4
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作者 姚剑虹 孙小芬 唐克轩 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期102-105,共4页
用石蒜科植物凝集素基因的保守序列为引物 ,利用RACE PCR技术从石蒜幼嫩叶片中克隆出石蒜凝集素的全长cDNA .通过比较石蒜同其他石蒜科植物凝集素基因序列和推测的氨基酸序列 ,发现石蒜凝集素基因编码一具有信号肽的前体蛋白 .石蒜凝集... 用石蒜科植物凝集素基因的保守序列为引物 ,利用RACE PCR技术从石蒜幼嫩叶片中克隆出石蒜凝集素的全长cDNA .通过比较石蒜同其他石蒜科植物凝集素基因序列和推测的氨基酸序列 ,发现石蒜凝集素基因编码一具有信号肽的前体蛋白 .石蒜凝集素同其他石蒜科植物凝集素一样为具有 展开更多
关键词 石蒜科 CDNA 凝集素 石蒜 race-pcr
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