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以梭鱼金属硫蛋白基因表达监测海洋重金属污染 被引量：13
1
作者 安立会 郑丙辉 +3 位作者 付青 赵兴茹 尚晶晶 张雷 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1383-1389,共7页
分离了梭鱼金属硫蛋白132个碱基对应44个氨基酸的部分基因序列,以此为基础建立了分析梭鱼金属硫蛋白基因表达的实时定量PCR方法,并用于分析渤海南戴河和大神堂近岸海域野生梭鱼金属硫蛋白基因的表达.结果表明,南戴河野生梭鱼金属硫蛋白... 分离了梭鱼金属硫蛋白132个碱基对应44个氨基酸的部分基因序列,以此为基础建立了分析梭鱼金属硫蛋白基因表达的实时定量PCR方法,并用于分析渤海南戴河和大神堂近岸海域野生梭鱼金属硫蛋白基因的表达.结果表明,南戴河野生梭鱼金属硫蛋白基因的表达水平(雄鱼:0.012±0.0064 copies/copyβ-actin;雌鱼:0.0099±0.0042 copies/copyβ-actin)明显高于大神堂野生梭鱼的表达水平(雄鱼:0.0017±0.0011 copies/copyβ-actin;雌鱼:0.0014±0.00095 copies/copyβ-actin).该结果与两地野生梭鱼体内重金属残留水平相一致,提示梭鱼金属硫蛋白基因可作为监测海洋重金属污染的敏感标志物之一. 展开更多
关键词 梭鱼 金属硫蛋白mRNA 实时定量PCR 重金属
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青海地区急性呼吸道感染症候群中人冠状病毒及鼻病毒分子流行病学研究 被引量：8
2
作者 刘高山 李红 +6 位作者 牛培华 石燕 姜双应 徐莉立 陆柔剑 赵生仓 谭文杰 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2016年第6期-,共5页
目的 了解青海地区急性呼吸道感染人群中人冠状病毒(human coronavirus,HCoV)及鼻病毒(human rhinovirus,HRV)的分布,探讨其分子流行病学特征.方法 采集2010年5月至2015年5月青海地区急性呼吸道症候群病例鼻咽拭子445例,采用荧光定量反... 目的 了解青海地区急性呼吸道感染人群中人冠状病毒(human coronavirus,HCoV)及鼻病毒(human rhinovirus,HRV)的分布,探讨其分子流行病学特征.方法 采集2010年5月至2015年5月青海地区急性呼吸道症候群病例鼻咽拭子445例,采用荧光定量反转录聚合酶链式反应(quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction,qRT-PCR)方法对HCoV 6种亚型(OC43,HKU1,229E,NL63,SARS和MERS)及HRV进行检测,并分析其分子流行病学特点.结果 445例样本中共检出HCoV 34例,检出率7.64％,其中HCoV-OC43 19例(4.26％)、HCoV-HKU1 15例(3.37％),其他亚型未检出.HRV检出16例,检出率3.59％.HCoV-OC43在20-60岁年龄组检出率最高,为9.48％,且不同年龄组差异有统计学意义(Fisher's确切概率P =0.0011).HRV在门急诊病例中的检出率比住院病例高,为6.72％,且差异有统计学意义(Fisher's确切概率P =0.0432).HCoV-OC43与HCoV-HKU1夏季检出率最高,分别为为7.20％ (9/125)、9.60％(12/125);不同季节HCoV检出率差异有统计学意义(x2=25.08,P＜0.0001).HRV春季检出率最高,为10.17％ (6/59),不同季节检出率差异有统计学意义(Fisher's确切概率P=0.0449).HCoV感染阳性样本Ct值中位数36.81(35.54-37.49),在住院病例中为36.93(35.54-37.53),在门急诊病例中为36.68(31.18-36.84),差异无统计学意义.HRV阳性样本Ct值中位数31.83 (27.16-33.65),在住院病例中为28.97(26.39-33.79),在门急诊病例中为32.34(30.85-33.65),差异无统计学意义.结论 HCoV及HRV流行高峰主要为夏季和春季,其中HCoV-OC43/HCoV-HKU1是HCoV感染的主要亚型.Ct值在一定程度上反映了HCoV和HRV在不同病例类型中病毒载量的差异. 展开更多
关键词 急性呼吸道症候群 人冠状病毒 人鼻病毒 荧光定量反转录聚合酶链式反应 流行病学
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小鼠肾脏缺血-再灌注损伤miRNAs差异表达谱研究
3
作者 吴奥 王水良 +1 位作者 祝玲 杨顺良 《器官移植》 CAS CSCD 2017年第2期138-143,共6页
目的筛选小鼠肾脏缺血-再灌注损伤(IRI)差异性表达的微小核糖核酸(miRNAs),为进一步深入阐明肾脏IRI发生、发展的分子机制奠定基础。方法应用微型动脉夹夹闭小鼠双侧肾动脉制备急性肾缺血损伤模型,将15只小鼠分为IRI组和假手术组(E组),... 目的筛选小鼠肾脏缺血-再灌注损伤(IRI)差异性表达的微小核糖核酸(miRNAs),为进一步深入阐明肾脏IRI发生、发展的分子机制奠定基础。方法应用微型动脉夹夹闭小鼠双侧肾动脉制备急性肾缺血损伤模型,将15只小鼠分为IRI组和假手术组(E组),IRI组再分为A组(缺血时间45 min,再灌注时间24 h)、B组(缺血时间25 min,再灌注时间24 h)、C组(缺血时间45 min,再灌注时间4 h)、D组(缺血时间25 min,再灌注时间4 h),每组3只。采用肾脏组织形态学改变和肾功能评估结果来鉴定各组小鼠的IRI程度;采用miRNAs芯片聚类分析对小鼠IRI特定缺血时间(25、45 min)和再灌注时间(4、24 h)下肾脏差异性表达差异表达的miRNAs进行筛选鉴定;采用实时定量逆转录聚合酶链反应(q RT-PCR)对小鼠IRI后差异表达miRNAs芯片miR-695与miR-145进行验证。结果肾脏组织形态学改变和肾功能评估结果显示成功建立IRI模型。与假手术组相比,肾脏IRI组共检出71种差异性表达显著的miRNAs,其中30种下调表达,41种上调表达。q RT-PCR法检测结果表明,以E组特定miRNAs的表达量标准化为1,miR-695及miR-145在肾脏IRI组的相对表达量分别为11.82和0.31(均为P<0.05),与芯片结果基本一致。结论肾脏IRI后,miRNAs表达谱发生差异性改变,这些差异性表达的miRNAs将可作为肾脏IRI的分子标志物而具有潜在的临床及科研应用价值。 展开更多
关键词 肾组织 肾动脉夹闭 缺血-再灌注损伤 微小核糖核酸(miRNAs) 芯片 miR-695 MIR-145 基因差异表达谱 实时定量逆转录-聚合酶链反应
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快速抗原检测在新型冠状病毒感染中的应用评价
4
作者 李晶晶 曾玫 +8 位作者 徐锦 葛艳玲 田鹤 王中林 柳龚堡 翟晓文 张晓波 朱启镕 常海岭 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1153-1157,共5页
目的评价快速免疫层析法抗原检测在新型冠状病毒症状性感染患者中的诊断价值。方法前瞻性研究,研究对象为2022年5月20日至6月5日复旦大学附属儿科医院(上海市新型冠状病毒感染患儿定点医院)新型冠状病毒肺炎隔离病房确诊住院的76例新型... 目的评价快速免疫层析法抗原检测在新型冠状病毒症状性感染患者中的诊断价值。方法前瞻性研究,研究对象为2022年5月20日至6月5日复旦大学附属儿科医院(上海市新型冠状病毒感染患儿定点医院)新型冠状病毒肺炎隔离病房确诊住院的76例新型冠状病毒症状性感染的患儿和其确认感染的55例陪护家属。连续采集其鼻咽拭子标本,采用实时荧光定量反转录PCR方法检测新型冠状病毒核酸,同时用免疫层析法检测新型冠状病毒抗原。评价抗原检测结果与核酸循环阈(Ct)值变化的相关性及新型冠状病毒抗原检测在患者发病后不同时期的灵敏度与特异度,采用Kappa检验分析2种检测方法的一致性。结果新型冠状病毒症状性感染患者中,患儿76例(男41例、女35例),患病年龄5(2,9)岁;陪护家属55例(男8例,女47例),患病年龄38(32,41)岁。对采集的所有478份鼻咽拭子样本同时进行了新型冠状病毒抗原与核酸扩增检测。自发病至新型冠状病毒核酸检测转阴性的任何时期,快速抗原检测的总体灵敏度和特异度分别为48.2%(119/247)和98.3%(227/231),抗原检测与核酸检测显示中等度的一致性(κ=0.46,P<0.05)。Ct值≤25,抗原检测灵敏度均为100.0%(82/82);Ct值为26,灵敏度为8/10;Ct值为30,灵敏度为4/15;Ct值为35,灵敏度为8.3%(3/36);Ct值>35,抗原检测均为阴性。发病1~2、3~5、6~7、8~10、>10 d抗原检测的灵敏度分别为5/8、90.2%(37/41)、88.9%(24/27)、45.0%(36/80)、18.7%(17/91),特异度分别为5/5、5/5、2/2、94.1%(32/34)、98.9%(183/185)。病程2~7 d,患者鼻咽拭子的Ct值均<26;病程第8天时,Ct值为28.7±5.0,病程第13天时,Ct值为34.5±2.9,病程第14天后,Ct值均>35。结论快速免疫层析法抗原检测新型冠状病毒在发病后7 d内具有较高的灵敏度和特异度,其灵敏度与患者的病毒载量呈正相关和发病时间呈负相关。 展开更多
关键词 冠状病毒感染 胶体金 实时荧光定量聚合酶链式反应 灵敏度与特异度
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