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题名运用AFLP技术分析筇竹种群遗传多样性
被引量：11
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作者
茹广欣
袁金玲
张朵
郭广平
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机构
河南农业大学林学院林学系
中国林业科学研究院亚热带林业研究所
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出处
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2010年第6期850-855,共6页
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基金
中国林科院亚热带林业研究所基本科研业务费项目(6807)
"十一五"林业科技支撑计划专题(2006BAD19B0202)
国家林业局重点项目(2006-64)
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文摘
利用AFLP分子标记技术对筇竹2个种群的遗传多样性进行了分析,筛选出10对多态性和清晰度较高的引物组合,共获得680个AFLP位点,其中多态性位点662个,平均多态性检出率为97.20%,并用PopGen32软件对AFLP多态性数据进行分析,结果表明,供试2个筇竹种群均具有丰富的遗传多样性,多态位点百分率分别为89.86%和91.95%,等位基因数分别为1.898 6和1.919 5,有效等位基因数分别为1.585 0和1.568 3,种群内遗传多样性为0.332 1,种群水平平均Ne’is遗传多样性为0.394 9,Shannon信息指数为0.575 4,基因流为2.900 9,遗传一致度为0.821 9,遗传距离平均值为0.196 1。并根据遗传距离进行了UPGMA聚类分析。
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关键词
筇竹
遗传多样性
AFLP
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Keywords
qiongzhuea tumidnoda
genetic diversity
AFLP
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分类号
S795.9
[农业科学—林木遗传育种]
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题名珍稀保护竹种筇竹SSR反应体系的优化
被引量：6
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作者
张朵
袁金玲
顾小平
郭广平
茹广欣
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机构
河南农业大学林学院
中国林科院亚热带林业研究所
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出处
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期644-648,共5页
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基金
国家"十一五"林业科技支撑计划专题(2006BAD19B0202)
国家林业局重点项目(2006-64)
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文摘
为建立高效的筇竹SSR反应体系,以筇竹新鲜幼嫩叶片提取的基因组DNA为模板,研究了影响SSR反应效果的因素,包括Taq酶、Mg2+、dNTPs、引物、模板DNA浓度等,建立了适合筇竹SSR反应的PCR体系,即20μL反应体系中含有Taq酶0.8 U,Mg2+为1.5 mmol.L-1,dNTP 0.2 mmol.L-1,引物0.25μmol.L-1,模板DNA60 ng.扩增程序为:94℃3 min,然后94℃40 s,52℃30 s,72℃45 s,30个循环,72℃延伸5 min,4℃保存.
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关键词
筇竹
SSR
体系优化
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Keywords
qiongzhuea tumidnoda
SSR
Optimization of system
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分类号
S665.1
[农业科学—果树学]
Q944.42
[农业科学—园艺学]
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