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基于玉米综合QTL图谱的比较分析及株高QTL的统合分析 被引量：22
1
作者 王毅 姚骥 +1 位作者 张征锋 郑用琏 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第15期1776-1786,共11页
以高密度遗传图IBM2Neighbors整合公开发表的、控制68个性状的1201个玉米QTL,构建了用于分子标记发掘、QTL定位、基因克隆及分子标记辅助选择的综合图谱,并将结果融入本地化数据库CMap软件.利用CMap比较玉米QTL综合图和水稻QTL图谱发现... 以高密度遗传图IBM2Neighbors整合公开发表的、控制68个性状的1201个玉米QTL,构建了用于分子标记发掘、QTL定位、基因克隆及分子标记辅助选择的综合图谱,并将结果融入本地化数据库CMap软件.利用CMap比较玉米QTL综合图和水稻QTL图谱发现,玉米和水稻QTL成簇分布具有普遍性;22个玉米株高QTL与64个水稻株高QTL位于标记水平上的共线性区域,43个玉米产量QTL与7个水稻QTL位于标记水平上的共线性区域.以控制玉米株高的QTL为例,利用overview的分析方法对127个QTL进行优化,定位了40个“真实”QTL,提高了QTL定位的准确性和有效性,发现了玉米和水稻株高相关QTG(quantitativetraitgene)的候选基因.本研究为大量玉米QTL信息的有效利用搭建了重要的生物信息学平台. 展开更多
关键词 qtl整合 比较定位 统合分析 qtl克隆
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水稻直链淀粉含量QTL图谱整合研究 被引量：8
2
作者 李修平 马文东 +3 位作者 王仲 郭勇 刘方明 吴恒梅 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期8-14,共7页
水稻直链淀粉含量是水稻品质育种重要指标之一。研究收集整理来自34个作图群体共141个与水稻直链淀粉含量相关的QTL信息。利用Biomercator 2.1软件和共有标记映射,将收集到的QTLs整合到参考图谱Cornell 2001上,通过元分析方法获得"... 水稻直链淀粉含量是水稻品质育种重要指标之一。研究收集整理来自34个作图群体共141个与水稻直链淀粉含量相关的QTL信息。利用Biomercator 2.1软件和共有标记映射,将收集到的QTLs整合到参考图谱Cornell 2001上,通过元分析方法获得"真实QTLs",建立水稻直链淀粉含量QTLs的一致性图谱,在第1、2、3、6、7、8、9和10染色体上共分析得到30个"真实QTLs"及其连锁标记。为水稻直链淀粉含量基因的精细定位、图位克隆及水稻品质的分子辅助育种提供理论基础。 展开更多
关键词 水稻 直链淀粉含量 qtl整合 元分析
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大豆单株荚数QTL定位及整合 被引量：2
3
作者 杨玉花 白志元 +2 位作者 张瑞军 卫一超 卫保国 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期90-95,共6页
大豆单株荚数是构成大豆产量的重要因素之一,同时在大豆种质资源中也是一个变异范围较广的性状,为了有助于大豆单株荚数分子选择育种,以大豆多荚材料C025和少荚材料JD18为亲本,以通过杂交构建的F2群体为材料,对亲本及遗传群体进行2a(太... 大豆单株荚数是构成大豆产量的重要因素之一,同时在大豆种质资源中也是一个变异范围较广的性状,为了有助于大豆单株荚数分子选择育种,以大豆多荚材料C025和少荚材料JD18为亲本,以通过杂交构建的F2群体为材料,对亲本及遗传群体进行2a(太原2017、太原2018)表型性状和基因型数据分析,同时结合利用已知的大豆SSR遗传图谱,结果显示,共定位大豆单株荚数QTLs33个,解释的表型变异为0.2%~56.4%;通过元分析整合最终共定位大豆单株荚数23个QTLs,其中有5个QTLs(qPN.C2-3、qPN.I、qPN.C2-4、qPN.C1和qPN.L)与前人的研究重叠,分别位于C2、N、C1这3条染色体上;其余18个QTLs是研究发现的控制大豆单株荚数新的QTLs(qPN.D1a、qPN.N、qPN.C2-1、qPN.C2-2、qPN.M、qPN.A2-1、qPN.A2-2、qPN.K、qPN.O-1、qPN.O-2、qPN.B1、qPN.F、qPN.B2、qPN.E、qPN.J、qPN.D2-1、qPN.D2-2、qPN.G)。qPN.A2-1、qPN.C2-4和qPN.C1(贡献率分别为56.4%,29.5%,35.4%)这3个QTLs可被多环境重复检测且贡献率较高,因此,其可以作为主效QTL进行后续大豆单株荚数分子研究。由于大豆单株荚数是一个易受环境影响且由多位点控制的复杂数量性状,研究检测到一些新的QTLs,并且也验证了一些前人检测的大豆单株荚数QTLs,同时整合目前比较完善的大豆单株荚数QTLs。 展开更多
关键词 大豆 单株荚数 qtl qtl整合
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基于元分析的水稻抽穗期QTL图谱整合研究 被引量：1
4
作者 李修平 马文东 +3 位作者 张献国 苗百更 李佳美 张斯琦 《作物杂志》 CAS 北大核心 2017年第3期29-34,共6页
抽穗期决定水稻品种适宜的种植地区和种植季节,影响水稻的稳产和高产,是重要的水稻育种目标之一。对来自43个作图群体共计207个水稻抽穗期QTL信息进行了收集和整理。通过Bio Mercator 2.1软件的映射功能,将已发表的作图群体上与抽穗期相... 抽穗期决定水稻品种适宜的种植地区和种植季节,影响水稻的稳产和高产,是重要的水稻育种目标之一。对来自43个作图群体共计207个水稻抽穗期QTL信息进行了收集和整理。通过Bio Mercator 2.1软件的映射功能,将已发表的作图群体上与抽穗期相关QTL的共有标记整合到参考图谱Cornell 2001上,利用基于元分析的计算方法获得与水稻抽穗期相关的"真实"QTL,并且建立了一致性图谱,共获得14个与水稻抽穗期相关的"真实"QTL,分布在水稻第1、2、4、5、6、7、8和10染色体上。为水稻抽穗期的主效QTL精细定位、相关基因的图位克隆及其分子辅助育种提供了技术支持和理论基础。 展开更多
关键词 水稻 抽穗期 qtl整合 元分析
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水稻蛋白质含量与脂肪含量QTL图谱整合 被引量：5
5
作者 李修平 苗百更 +3 位作者 马文东 张献国 李佳美 张斯琦 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期2662-2670,共9页
水稻蛋白质含量和脂肪含量是衡量稻米营养品质的重要指标。将来自35个作图群体共238个与水稻蛋白质、脂肪相关的QTL信息进行收集整理。利用软件Biomercator 2.1,把收集到的与水稻蛋白质含量和脂肪含量相关的QTLs,通过共有标记映射的方... 水稻蛋白质含量和脂肪含量是衡量稻米营养品质的重要指标。将来自35个作图群体共238个与水稻蛋白质、脂肪相关的QTL信息进行收集整理。利用软件Biomercator 2.1,把收集到的与水稻蛋白质含量和脂肪含量相关的QTLs,通过共有标记映射的方法整合到参考图谱Cornell 2001上,利用基于元分析的方法获得"真实"QTLs,并且建立与水稻蛋白质和脂肪含量相关的QTLs的一致性图谱,共分析获得29个与蛋白质含量相关的"真实"QTLs及其连锁标记,分布在在第1、第2、第3、第4、第6、第7、第8、第9和第10染色体上;共分析得到12个与脂肪含量相关的"真实"QTLs及其连锁标记,分布在第3、第5、第6、第7和第8染色体上。为水稻蛋白质含量和脂肪含量相关基因的精细定位、图位克隆及其分子辅助育种提供技术支持和理论依据。 展开更多
关键词 水稻 蛋白质含量 脂肪含量 qtl图谱整合 元分析
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水稻株高QTL图谱整合 被引量：1
6
作者 李佳美 齐玉强 +5 位作者 王景佳 苗百更 李修平 马文东 张丽敏 吴恒梅 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第19期6341-6348,共8页
水稻作为人类的重要主食之一,其品质越来越得到重视。株高作为衡量水稻品质育种的重要指标之一,其优化和选择往往能提高水稻的产量和品质。本研究对53个作图群体,共229个水稻株高QTL信息进行了收集整理,基于元分析的计算方法进行图谱整... 水稻作为人类的重要主食之一,其品质越来越得到重视。株高作为衡量水稻品质育种的重要指标之一,其优化和选择往往能提高水稻的产量和品质。本研究对53个作图群体,共229个水稻株高QTL信息进行了收集整理,基于元分析的计算方法进行图谱整合,构建一张有关水稻株高的高密度图谱。结果显示,获得与水稻株高相关的QTL位点和紧密连锁标记33个,分布在染色体1、2、3、4、5、6、7、8、9以及10上。为水稻株高基因的准确定位以及水稻株型分子辅助育种提供理论依据。 展开更多
关键词 水稻 株高 qtl图谱整合 元分析
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