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一个新的分子电性距离矢量(MEDV) 被引量：94
1
作者 刘树深 刘堰 +1 位作者 李志良 蔡绍皙 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第11期1353-1357,共5页
有机化合物通常由电性各异的碳、氢、氧、氮、硫等元素以共价键相互连接而成.我们提出一个称为分子电性距离矢量(简称MEDV)的新描述子来表征有机分子结构.以含有环、饱和与不饱和键及碳氧氮等元素的色氨酸分子为例,说明构建MEDV的基本方... 有机化合物通常由电性各异的碳、氢、氧、氮、硫等元素以共价键相互连接而成.我们提出一个称为分子电性距离矢量(简称MEDV)的新描述子来表征有机分子结构.以含有环、饱和与不饱和键及碳氧氮等元素的色氨酸分子为例,说明构建MEDV的基本方法.开发设计了计算有机分子MEDV的True BASIC语言程序.不借用其他任何描述子,仅用MEDV建立了烷、醇、多环芳烃等多种有机化合物包括沸点、密度、保留指数等多种性质的定量结构-性质相关(QSPR)模型,相关系数均达0.98以上. 展开更多
关键词 分子电性距离矢量 烷烃 醇 多环芳烃 qsar QSPR
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磺酰脲类除草剂研究进展 被引量：42
2
作者 魏东斌 张爱茜 +1 位作者 韩朔睽 王连生 《环境科学进展》 CSCD 1999年第5期34-42,共9页
本文较全面地概述了近几年国内外有关磺酰脲类除草剂的分析测试和降解方式等方面的研究现状。
关键词 磺酰脲 除草剂 降解 环境影响 风险评价
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分子价连接性指数中杂原子价点价计算新方法及应用 被引量：40
3
作者 余训民 余训爽 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第9期658-667,共10页
对分子价连接性指数中杂原子点价δvi 的计算方法进行了改进 ,提出了一种计算杂原子价点价δhi 的新方法 ,认为分子中某一杂原子i的价点价δhi 值不仅与它的价层电子数Zi、最高主量子数ni 以及结合的氢原子数目hi 有关 ,还与它所在的族... 对分子价连接性指数中杂原子点价δvi 的计算方法进行了改进 ,提出了一种计算杂原子价点价δhi 的新方法 ,认为分子中某一杂原子i的价点价δhi 值不仅与它的价层电子数Zi、最高主量子数ni 以及结合的氢原子数目hi 有关 ,还与它所在的族数Ni、隐氢图中连接的其他原子的数目mi 以及杂化方式Lp有关。杂原子i的δhi 值与该原子i的Pauling电负性具有相近的物理意义。用由δhi 构成的分子价连接性指数nχh(n =0 ,1,2 )研究了取代芳烃和烃衍生物的物理化学性质和生物活性 ,结果表明 ,1χh 比1χv有显著的改善 ,计算值与实验值接近的程度更高。 展开更多
关键词 分子价连接性指数 杂原子 价点价 QSPR qsar 计算方法 有机物 物理化学性质 生物活性
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QSAR模型内部和外部验证方法综述 被引量：46
4
作者 覃礼堂 刘树深 +1 位作者 肖乾芬 吴庆生 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1205-1211,共7页
验证定量-结构活性相关(QSAR)模型,是保证模型对未知样本的生物活性具有可靠预测能力的重要前提.然而,目前部分QSAR论文没有对模型进行有效验证.因此,本文详细综述QSAR模型的内部验证方法和外部验证方法.内部验证方法包括留一法(leave-o... 验证定量-结构活性相关(QSAR)模型,是保证模型对未知样本的生物活性具有可靠预测能力的重要前提.然而,目前部分QSAR论文没有对模型进行有效验证.因此,本文详细综述QSAR模型的内部验证方法和外部验证方法.内部验证方法包括留一法(leave-one-out,LOO)交叉验证,留多法(leave-many-out,LMO)或留N法(leave-N-out,LNO)交叉验证,y随机化验证和自举法.评价模型外部预测能力的统计量包括Q2F1、Q2F2、Q2F3、一致性相关系数(concordance correlation coefficient,CCC)、r珋2m和Golbraikh-Tropsha方法.此外,从文献中总结出可接受QSAR模型对应的统计量参考数值,从而为QSAR建模者提供指导与帮助. 展开更多
关键词 qsar 内部验证 外部验证
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一个新的拓扑指数用于有机化合物的QSPR/QSAR研究 被引量：38
5
作者 任碧野 许友 陈国斌 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第6期563-571,共9页
在分子图的邻接矩阵和距离矩阵的基础上提出了一个新的拓扑指数Xu,该拓扑指数易于计算,对C_2～C(16)饱和烷烃有较高的结构区分能力,通过适当的处理可方便地推广到含多重键杂原子体系.该指数与饱和烷烃的正常沸点等理化性质,不饱和链烃... 在分子图的邻接矩阵和距离矩阵的基础上提出了一个新的拓扑指数Xu,该拓扑指数易于计算,对C_2～C(16)饱和烷烃有较高的结构区分能力,通过适当的处理可方便地推广到含多重键杂原子体系.该指数与饱和烷烃的正常沸点等理化性质,不饱和链烃类化合物的热容以及某些脂肪醇的毒性和疏水性参数均具有较好的性质相关性.绝大多数理化性质与Xu指数均能建立简单线性模型,且相关系数均大于0.99,表明该指数有望在QSPR/QSAR研究中作为一个新的参数而获得推广应用. 展开更多
关键词 图论 拓扑指数 有机化合物 QSPR qsar
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黄酮类化合物抑制MMP-9的定量结构-活性关系和结构修饰的理论研究 被引量：42
6
作者 张骥 申鹏 +3 位作者 陆涛 余丹妮 李卉 杨国忠 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第4期383-392,共10页
运用密度泛函理论(DFT)和线性回归分析等方法研究了黄酮类化合物抑制MMP-9的定量结构-活性关系(QSAR)和结构修饰.研究发现,黄酮类化合物抑制MMP-9的实验生物活性数据-lg EC50值与计算获得的黄酮类化合物的最低空分子轨道能量及分子水合... 运用密度泛函理论(DFT)和线性回归分析等方法研究了黄酮类化合物抑制MMP-9的定量结构-活性关系(QSAR)和结构修饰.研究发现,黄酮类化合物抑制MMP-9的实验生物活性数据-lg EC50值与计算获得的黄酮类化合物的最低空分子轨道能量及分子水合能之间均存在着良好的线性关系;留一法交叉验证结果表明,所建立的两个相应的QSAR模型都具有良好的稳定性和预测能力.进一步研究发现,在黄酮类化合物分子的A环、B环和C环上的合适部位选用供电子能力较强、能降低分子水合能的取代基团对其进行结构修饰,有利于提高修饰后的分子抑制MMP-9的生物活性.根据对木犀草素(Luteolin)分子进行结构修饰的结果(共33种化合物),我们提出了黄酮类化合物抑制MMP-9可能的作用机理,并设计出8种经结构修饰后生物活性有显著提高的MMP-9抑制剂,希望将来得到实验的证实. 展开更多
关键词 黄酮类化合物 MMP-9 qsar 结构修饰 DFT 线性回归分析 生物活性
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比较分子场分析方法研究的最新进展 被引量：27
7
作者 侯廷军 徐筱杰 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 2001年第6期436-440,共5页
比较分子场分析方法 ( Co MFA)是目前在三维定量构效关系 ( 3D- QSAR)中应用最为广泛的方法之一。但传统的比较分子场分析方法在具体的实现过程中还存在着一些缺陷和不足 ,包括分子场势能函数的选择 ,活性构象的确定 ,分子的叠合以及分... 比较分子场分析方法 ( Co MFA)是目前在三维定量构效关系 ( 3D- QSAR)中应用最为广泛的方法之一。但传统的比较分子场分析方法在具体的实现过程中还存在着一些缺陷和不足 ,包括分子场势能函数的选择 ,活性构象的确定 ,分子的叠合以及分子场变量的选取等等。本文结合我们科研组的工作 ,就近几年Co MFA方法的最新进展做了较为详细的阐述 ,同时对 Co 展开更多
关键词 比较分子场分析 药物设计 三维定量构效关系 遗传算法 药物活性 结构
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邻苯二甲酸酯化合物生物降解性与其化学结构的相关性 被引量：28
8
作者 夏凤毅 郑平 +1 位作者 周琪 冯孝善 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期141-146,共6页
应用定量结构-活性关系(QSAR)研究方法,对邻苯二甲酸酯类化合物的好氧生物降解性能与其化学结构间的相关性进行了研究,建立了受试物的好氧生物降解速率常数与分子连接性指数和结构参数的定量关系.结果表明,对邻苯二甲酸酯类化合物而言,... 应用定量结构-活性关系(QSAR)研究方法,对邻苯二甲酸酯类化合物的好氧生物降解性能与其化学结构间的相关性进行了研究,建立了受试物的好氧生物降解速率常数与分子连接性指数和结构参数的定量关系.结果表明,对邻苯二甲酸酯类化合物而言,取代基的空间结构参数是影响受试物好氧生物降解性能的重要因素. 展开更多
关键词 邻苯二甲酸酯 化合物 生物降解 化学结构 相关性 定量结构-活性关系 qsar
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多氯联苯的定量结构-性质(活性)关系 被引量：31
9
作者 邹建卫 蒋勇军 +3 位作者 胡桂香 曾敏 庄树林 俞庆森 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第3期267-272,共6页
多氯联苯(PCBs)是一类重要的持久性环境污染物.首先对所有209个PCB分子进行了HF/6-31G水平上的结构优化,在优化结构上获得了分子的表面静电势分布,并在此基础上对其统计导出的参数进行了计算.其后,运用多元线性回归方法对PCBs的水溶性... 多氯联苯(PCBs)是一类重要的持久性环境污染物.首先对所有209个PCB分子进行了HF/6-31G水平上的结构优化,在优化结构上获得了分子的表面静电势分布,并在此基础上对其统计导出的参数进行了计算.其后,运用多元线性回归方法对PCBs的水溶性、正辛醇/水分配系数、正辛醇/空气分配系数、土壤吸附性、水溶液活度系数、298K超冷流体蒸汽压、总分子表面积、色谱保留指数、升华焓、蒸发焓、熔融焓、PCB结合芳烃受体活性数据、生物降解度以及生物降解速率参数等理化性质和生物活性与分子的结构参数进行了关联.结果表明:分子静电势参数结合分子表面积和常规的量子化学参数可以很好地用于表达多氯联苯分子理化性质和生物活性与其分子结构间的定量关系. 展开更多
关键词 定量结构-性质关系 定量结构-活性关系 分子静电势 从头算 多氯联苯
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烷基酚类的生殖干扰毒性与结构相关研究 被引量：25
10
作者 刘征涛 张颖 +2 位作者 徐镜波 孔志明 沈萍萍 《环境科学研究》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第6期39-41,48,共4页
选用 4种烷基酚类化合物 ,对枝角类生物大型蚤进行 2 4h急性毒性试验和 2 1d生殖毒性试验 ,选取急性试验指标 (半数致死浓度 )和生殖毒性指标 (母蚤存活数、幼蚤生殖量、孵化成活率、幼蚤的雌、雄性个体数等 )进行定量构效相关 (QSAR)... 选用 4种烷基酚类化合物 ,对枝角类生物大型蚤进行 2 4h急性毒性试验和 2 1d生殖毒性试验 ,选取急性试验指标 (半数致死浓度 )和生殖毒性指标 (母蚤存活数、幼蚤生殖量、孵化成活率、幼蚤的雌、雄性个体数等 )进行定量构效相关 (QSAR)研究。结果表明 ,所测 4种烷基酚化合物均可对大型蚤的生殖特性产生活性影响。其中 ,4-辛基酚和对壬基酚不但能抑制大型蚤的生殖量 ,还可改变大型蚤孤雌生殖的幼蚤性别比率。实验化合物的一、二阶分子连接性指数与受试生物体的生殖活性有较好的相关性 。 展开更多
关键词 烷基酚 大型蚤 生殖毒性 构效相关 试验
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分析化学计量学 被引量：12
11
作者 吴海龙 梁逸曾 俞汝勤 《分析试验室》 CAS CSCD 1999年第6期94-102,共9页
本文是《分析试验室》第五篇“分析化学计量学”专题定期评述文章。评述了１９９７ 年１ 月至１９９８ 年１２ 月我国分析化学计量学的主要进展。内容涉及统计学与统计方法、试验设计与优化、分析信号处理、多元校正、化学模式识别、定... 本文是《分析试验室》第五篇“分析化学计量学”专题定期评述文章。评述了１９９７ 年１ 月至１９９８ 年１２ 月我国分析化学计量学的主要进展。内容涉及统计学与统计方法、试验设计与优化、分析信号处理、多元校正、化学模式识别、定量构效关系（ＱＳＡＲ）、数据库及专家系统、化学计量学教学等方面，共引用文献 １６８篇。 展开更多
关键词 分析化学 化学测量 化学计量学 试验设计
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苯砜基羧酸酯类急性毒性的QSAR研究 被引量：29
12
作者 李吉来 杭烨超 +3 位作者 耿彩云 黄旭日 李方实 孙家锺 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2007年第1期117-120,共4页
采用密度泛函理论方法,在B3LYP/6-31G(d)理论水平下,计算了56种苯砜基羧酸酯类化合物的量子化学参数.计算结果表明,酯基连接的烷烃链亲水性越小,毒性越大;苯环连接的取代基亲水性越大,毒性越大;分子的体积越大,毒性越小;分子产生氢键的... 采用密度泛函理论方法,在B3LYP/6-31G(d)理论水平下,计算了56种苯砜基羧酸酯类化合物的量子化学参数.计算结果表明,酯基连接的烷烃链亲水性越小,毒性越大;苯环连接的取代基亲水性越大,毒性越大;分子的体积越大,毒性越小;分子产生氢键的能力越大,毒性越小;分子最高占据轨道能量越高,毒性越大. 展开更多
关键词 苯砜基羧酸酯 急性毒性 密度泛函 qsar
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氯代苯类化合物对江水细菌的毒性及QSAR研究 被引量：21
13
作者 李玉梅 陆光华 《环境科学研究》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期116-119,共4页
采用细菌生长抑制实验,测定了18种氯苯类化合物对长江水中混合细菌的毒性,得到24 hIC50值,-1gIC50为3.65～4.32,其中,毒性最弱的是氯苯,毒性最强的是1,2,4-三氯苯.选用分子连接性指数法对毒性数据进行定量结构活性关系(QSAR)研究.结果表... 采用细菌生长抑制实验,测定了18种氯苯类化合物对长江水中混合细菌的毒性,得到24 hIC50值,-1gIC50为3.65～4.32,其中,毒性最弱的是氯苯,毒性最强的是1,2,4-三氯苯.选用分子连接性指数法对毒性数据进行定量结构活性关系(QSAR)研究.结果表明,氯苯类化合物对江水细菌的毒性与苯环上取代基的种类、数目和位置有关,价分子连接性指数0XV和7XCHV能够很好地描述氯苯类化合物对江水细菌的毒性.方程-1gIC50=0.8390XV-25.3727XCHV+0.802的稳健性很好,该模型的预测值与毒性实测值之间的相关系数达0.948. 展开更多
关键词 氯苯类化合物 江水细菌 价分子连接性指数 24 H IC50值 qsar
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取代芳烃对五种生物急性毒性的QSAR研究 被引量：31
14
作者 冯长君 李鸣建 +1 位作者 陈艳 唐自强 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第6期853-861,共9页
提出成键原子的生物活性点价(Ai),并建构蕴含有机物的生物活性的自相关拓扑指数(mQ).使用1Q,距离指数(L)分别与16～30种取代芳烃(含F,Cl,Br,I,NO2,OH,NH2,甲氧基,甲醛基,甲酰胺基,乙酮基,烷基等)对绿藻,斜生栅列藻,日本长腿蛙蝌蚪,发光... 提出成键原子的生物活性点价(Ai),并建构蕴含有机物的生物活性的自相关拓扑指数(mQ).使用1Q,距离指数(L)分别与16～30种取代芳烃(含F,Cl,Br,I,NO2,OH,NH2,甲氧基,甲醛基,甲酰胺基,乙酮基,烷基等)对绿藻,斜生栅列藻,日本长腿蛙蝌蚪,发光菌,呆鲦鱼等的毒性数据关联,相应二元相关系数依次为0.9361,0.9559,0.9733,0.9354,0.9599.以上QSAR模型的估算结果均优于相应的文献成果. 展开更多
关键词 生物活性点价 自由关拓扑指数 取代芳烃 绿藻 斜生栅列藻 日本长腿蛙蝌蚪 发光菌 急性毒性 qsar 毒理
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苯酚、苯胺及其衍生物对斜生栅列藻的急性毒性及QSAR研究 被引量：20
15
作者 陆光华 袁星 赵元慧 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期225-229,共5页
本文应用OECD标准方法测定了18种酚类、胺类化合物对斜生栅列藻的48h-EC_(50)值.选择参数E_(LUMO)和lgK_(OW)进行了QSAR分析,得到下列回归方程:-lgEC_(50)=2.541-0.649E_(LUMO)+0.299lgK_(OW),n=18,r=0.903,SE=0.314应用所得方程计算了... 本文应用OECD标准方法测定了18种酚类、胺类化合物对斜生栅列藻的48h-EC_(50)值.选择参数E_(LUMO)和lgK_(OW)进行了QSAR分析,得到下列回归方程:-lgEC_(50)=2.541-0.649E_(LUMO)+0.299lgK_(OW),n=18,r=0.903,SE=0.314应用所得方程计算了化合物的毒性,探讨了毒性机理. 展开更多
关键词 苯酚 苯胺 斜生栅列藻 毒性 qsar
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农药微生物降解性与农药疏水性参数间的相关性 被引量：18
16
作者 虞云龙 陈鹤鑫 樊德方 《环境科学学报》 CAS CSSCI CSCD 北大核心 1998年第2期208-211,共4页
在纯培养条件下，产碱菌属（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓｓｐ．）广谱性降解菌ＹＦ１１对对硫磷、甲基对硫磷、杀螟松、氰戊菊酯、溴氰菊酯、甲氰菊酯、氯氰菊酯、三氟氯氰菊酯、氯菊酯的降解速率的差异主要是由各杀虫剂的疏水性参数的不同... 在纯培养条件下，产碱菌属（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓｓｐ．）广谱性降解菌ＹＦ１１对对硫磷、甲基对硫磷、杀螟松、氰戊菊酯、溴氰菊酯、甲氰菊酯、氯氰菊酯、三氟氯氰菊酯、氯菊酯的降解速率的差异主要是由各杀虫剂的疏水性参数的不同引起的，两者之间存在较好的相关性：ｌｏｇＫ＝２．２１－０．２６ｌｏｇＫｏｗ，ｒ＝０．９７３９． 展开更多
关键词 农药 微生物降解 疏水性参数 构效关系
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环境化学中有机化合物毒性的QSAR研究方法 被引量：13
17
作者 于瑞莲 胡恭任 《环境科学与技术》 CAS CSCD 2003年第1期57-59,共3页
定量结构—活性相关 (QSAR)研究具有重要的理论和实际意义。在前人大量相关研究的基础上分析了目前国内外普遍实用的七种QSAR研究方法 ,并讨论了各方法的优缺点及适用范围 ,以利于各方法的进一步推广。同时简要介绍了QSAR的发展趋势。
关键词 qsar 研究方法 发展趋势
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苯酚类化合物对日本长腿蛙蝌蚪的急性毒性与构效关系研究 被引量：14
18
作者 王晓栋 董玉瑛 +1 位作者 曹加胜 王连生 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期230-234,共5页
利用半静态法测定了21种取代苯酚类化合物对日本长腿蛙蝌蚪的24h急性致死毒性(24h-LC_(50)),并进行了定量结构活性相关研究.研究表明:大部分酚类化合物的毒性表现为极性麻醉作用.影响毒性的因素有化合物的疏水性。
关键词 苯酚类化合物 急性毒性 日本长腿蛙蝌蚪 qsar
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QSAR及其在农药设计中的应用和进展 被引量：19
19
作者 钟国华 胡美英 《农药学学报》 CAS CSCD 2001年第2期1-11,共11页
在介绍定量结构 -活性关系 (QSAR)的基本原理后 ,重点评述了 QSAR各种方法的主要原理、优缺点及其在农药设计中的研究应用进展 ,包括取代基多参数法 (Hansch法 )、Free- Wilson法、分子轨道法 (MO)、距离比较法 (DISCO)、比较分子力场... 在介绍定量结构 -活性关系 (QSAR)的基本原理后 ,重点评述了 QSAR各种方法的主要原理、优缺点及其在农药设计中的研究应用进展 ,包括取代基多参数法 (Hansch法 )、Free- Wilson法、分子轨道法 (MO)、距离比较法 (DISCO)、比较分子力场分析法 (Co MFA)、分子模拟法 (MS)、分子对接法 (MD)、人工神经网络法 (ANN)以及 展开更多
关键词 定量结构-活性关系 qsar 农药 设计 取代基多参数法 分子轨道法
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面向化学品风险评价的计算(预测)毒理学 被引量：29
20
作者 王中钰 陈景文 +3 位作者 乔显亮 李雪花 谢宏彬 蔡喜运 《中国科学：化学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期222-240,共19页
进入21世纪以来,为快速高效地评价和预测化学品的环境与生态健康风险,毒性测试方法发生着巨大的变革.计算毒理学无疑处于这场变革的前沿—它融合毒理学、计算化学、化学/生物信息学、系统生物学等学科资源,构建数学或计算机模型以实现... 进入21世纪以来,为快速高效地评价和预测化学品的环境与生态健康风险,毒性测试方法发生着巨大的变革.计算毒理学无疑处于这场变革的前沿—它融合毒理学、计算化学、化学/生物信息学、系统生物学等学科资源,构建数学或计算机模型以实现化学品的环境暴露、危害性与风险性的高效预测和评价,并提升对毒性机制的认识.计算毒理学可显著减少毒性测试所需的动物数量、成本和时间,支持化学品风险的预先防范.本综述介绍了计算毒理学在辅助化学品风险评价以及剖析毒性机制时常用的策略与模型,并就其在化学品风险管理领域的外延进行了讨论. 展开更多
关键词 计算毒理学 模型 化学品 风险评价 定量构效关系
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