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大青杨PuICE1基因克隆及生物信息学分析
1
作者
王艳敏
李静
+4 位作者
殷志辉
李正华
郭成博
李海霞
白卉
《林业科技》
2024年第4期23-28,共6页
ICE1是b HLH类转录因子,能够特异性结合CBF3基因启动子序列中的元件,从而激活下游冷诱导基因的表达,在响应低温胁迫时具有重要作用。本文从低温条件下大青杨(Populus ussuriensis)c DNA中克隆得到一个受低温诱导的PuICE1基因,利用生物...
ICE1是b HLH类转录因子,能够特异性结合CBF3基因启动子序列中的元件,从而激活下游冷诱导基因的表达,在响应低温胁迫时具有重要作用。本文从低温条件下大青杨(Populus ussuriensis)c DNA中克隆得到一个受低温诱导的PuICE1基因,利用生物信息学工具分析PuICE1的序列和编码蛋白特征、利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析PuICE1基因在低温胁迫条件下的表达模式。结果表明:大青杨PuICE1基因的c DNA全长序列长1 635 bp,含有完整的开放阅读框,可编码545个氨基酸。Pu ICE1编码的蛋白序列含有1个典型的HLH结构域,属于b HLH类转录因子,进化树构建结果表明,大青杨Pu ICE1与毛果杨(P.trichocarpa)和甜杨(P. suaveolens)ICE1存在着较高的同源性。通过q RT-PCR分析表明,在4℃低温胁迫条件下,随着胁迫处理时间(0、1.5、3、6、12、24、48、72 h)的延长,大青杨根、茎、叶片中的PuICE1基因表达量都是在72 h时达到峰值,而在芽中PuICE1基因表达量呈现先下降后上升的趋势,在48 h表达量达到峰值。
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关键词
大青杨
puice
1
生物信息学分析
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职称材料
题名
大青杨PuICE1基因克隆及生物信息学分析
1
作者
王艳敏
李静
殷志辉
李正华
郭成博
李海霞
白卉
机构
黑龙江省林业科学院
黑龙江省林业科学研究所
黑龙江省速生林木培育重点实验室
出处
《林业科技》
2024年第4期23-28,共6页
基金
黑龙江省省属科研院所科研业务费项目“大青杨ICE1基因抗寒功能研究”。
文摘
ICE1是b HLH类转录因子,能够特异性结合CBF3基因启动子序列中的元件,从而激活下游冷诱导基因的表达,在响应低温胁迫时具有重要作用。本文从低温条件下大青杨(Populus ussuriensis)c DNA中克隆得到一个受低温诱导的PuICE1基因,利用生物信息学工具分析PuICE1的序列和编码蛋白特征、利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析PuICE1基因在低温胁迫条件下的表达模式。结果表明:大青杨PuICE1基因的c DNA全长序列长1 635 bp,含有完整的开放阅读框,可编码545个氨基酸。Pu ICE1编码的蛋白序列含有1个典型的HLH结构域,属于b HLH类转录因子,进化树构建结果表明,大青杨Pu ICE1与毛果杨(P.trichocarpa)和甜杨(P. suaveolens)ICE1存在着较高的同源性。通过q RT-PCR分析表明,在4℃低温胁迫条件下,随着胁迫处理时间(0、1.5、3、6、12、24、48、72 h)的延长,大青杨根、茎、叶片中的PuICE1基因表达量都是在72 h时达到峰值,而在芽中PuICE1基因表达量呈现先下降后上升的趋势,在48 h表达量达到峰值。
关键词
大青杨
puice
1
生物信息学分析
Keywords
Populus ussuriensis
puice
1
bioinformatics analysis
分类号
S792.113 [农业科学—林木遗传育种]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大青杨PuICE1基因克隆及生物信息学分析
王艳敏
李静
殷志辉
李正华
郭成博
李海霞
白卉
《林业科技》
2024
0
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