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基于定量蛋白质组技术探索补阳还五汤治疗脑梗死气虚血瘀证的作用机制 被引量:28
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作者 马博 薛冰洁 +4 位作者 陈进成 任钧国 林成仁 潘映红 刘建勋 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2199-2206,共8页
中药"补阳还五汤"广泛应用于治疗脑梗死气虚血瘀证,但是其药理机制仍不明确。该研究应用非标记定量蛋白质组学技术探索"补阳还五汤"治疗脑梗死气虚血瘀证的生物学基础。以脑梗死气虚血瘀证大鼠模型为研究对象,比较假手术组、模型组... 中药"补阳还五汤"广泛应用于治疗脑梗死气虚血瘀证,但是其药理机制仍不明确。该研究应用非标记定量蛋白质组学技术探索"补阳还五汤"治疗脑梗死气虚血瘀证的生物学基础。以脑梗死气虚血瘀证大鼠模型为研究对象,比较假手术组、模型组、模型给药组大鼠脑组织的全蛋白表达水平。对3组样品进行定量分析,假手术组、模型组、模型给药组脑组织样品分别鉴定到3 959,3 996,4 055种蛋白。以模型组为对照,假手术组和给药组表达水平差异在2倍以上且趋势一致的蛋白共计391种。对差异表达蛋白进行生物信息学分析和功能聚类,发现补阳还五汤可能通过影响能量代谢、神经系统及一些信号通路蛋白的表达,从而对脑梗死气虚血瘀证发挥治疗作用。该研究从蛋白质水平探索了补阳还五汤发挥药效的生物学机制,为脑梗死气虚血瘀证的临床治疗和中医相关研究提供了分子依据。 展开更多
关键词 蛋白质组学 脑梗死气虚血瘀证 补阳还五汤
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适于双向电泳分析的苹果叶片蛋白质提取方法 被引量:14
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作者 曾广娟 李春敏 +2 位作者 张新忠 滕云龙 董文轩 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期484-488,共5页
为了探索适用于双向电泳(2-DE)分析的苹果叶片蛋白质提取方法,比较了三氯乙酸(TCA)/丙酮沉淀法、二硫苏糖醇(DTT)/丙酮法、Tris-HCl提取法和改良的Tris-HCl提取法等4种蛋白质提取方法。以7cm、pH3-10的线性固相pH梯度(immobilize... 为了探索适用于双向电泳(2-DE)分析的苹果叶片蛋白质提取方法,比较了三氯乙酸(TCA)/丙酮沉淀法、二硫苏糖醇(DTT)/丙酮法、Tris-HCl提取法和改良的Tris-HCl提取法等4种蛋白质提取方法。以7cm、pH3-10的线性固相pH梯度(immobilized pH gradient,IPG)胶条作为第一向电泳,以十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)(12.5%的分离胶)作为第二向电泳,对提取物进行2-DE分离,采用银染显色。结果表明,上述4种方法在2-DE图谱上分别得到140,215,181和616个蛋白质点。其中以改良的Tris-HCl提取法得到的蛋白质点数最多,且背景清晰、图谱上没有明显的横纵条纹。为了进一步验证改良的Tris-HCl提取法的有效性,用18cm、pH3-10的线性IPG胶条和12.5%的分离胶对提取的苹果叶片蛋白质进行2-DE分离,考马斯亮蓝R-250染色,共检测到455个蛋白质点,其相对分子质量主要分布在14000-66000范围内,图谱背景清晰,再次证明应用该方法制备的样品适用于双向电泳分析,可用于苹果叶片的蛋白质组学分析。 展开更多
关键词 双向电泳 蛋白质提取方法 苹果叶片 蛋白质组学分析
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日本血吸虫成虫呕吐和排泄分泌物的蛋白质组学分析 被引量:14
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作者 余传信 赵飞 +6 位作者 殷旭仁 肖迪 张建中 华万全 钱春艳 宋丽君 王玠 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期304-309,共6页
目的探讨日本血吸虫成虫呕吐物和排泄分泌物的蛋白质组成,寻找高丰度蛋白分子。方法将日本血吸虫成虫浸泡于无菌水中15~30min,收集成虫的呕吐和排泄分泌物。通过蛋白质二维电泳,考马斯亮蓝染色与飞行质谱分析,确定各蛋白点的基因种类... 目的探讨日本血吸虫成虫呕吐物和排泄分泌物的蛋白质组成,寻找高丰度蛋白分子。方法将日本血吸虫成虫浸泡于无菌水中15~30min,收集成虫的呕吐和排泄分泌物。通过蛋白质二维电泳,考马斯亮蓝染色与飞行质谱分析,确定各蛋白点的基因种类。结果日本血吸虫成虫的呕吐及排泄分泌物的二维电泳获得1012个蛋白斑点,456个斑点的蛋白质种类被质谱分析成功鉴定。这些蛋白可归为139种,其中76种为虫源性蛋白,主要是由一些与血吸虫生命代谢、生长发育、免疫调控相关的蛋白组成,其中烯醇化酶、70kDa热休克蛋白(HSP70)、果糖二磷酸醛缩酶、三磷酸甘油醛脱氢酶、磷酸甘油酸激酶、谷胱甘肽转移酶、抑免蛋白、硫氧还蛋白过氧化物酶、14-3-3蛋白等含量丰富,是高丰度的排泄分泌蛋白。结论本研究揭示了日本血吸虫成虫呕吐和排泄分泌物的蛋白组成,为进一步开发用于控制血吸虫病或其他寄生虫病的疫苗、新的治疗药物及诊断方法创造了条件。 展开更多
关键词 日本血吸虫 呕吐物 排泄分泌物 蛋白质组学分析 高丰度蛋白分子
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紫杉醇诱导MCF-7乳腺癌细胞凋亡的蛋白质组研究 被引量:8
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作者 吴峰 王清明 +2 位作者 范国才 陈吉中 陈惠鹏 《中华肿瘤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期418-421,共4页
目的研究紫杉醇诱导MCF-7乳腺癌细胞凋亡的分子机制。方法以100 nmol/L紫杉醇作用MCF-7细胞24 h后提取细胞总蛋白,利用蛋白质组技术,对紫杉醇诱导的MCF-7乳腺癌细胞凋亡前后的细胞蛋白进行二维电泳图谱分析,通过质谱鉴定差异蛋白质。结... 目的研究紫杉醇诱导MCF-7乳腺癌细胞凋亡的分子机制。方法以100 nmol/L紫杉醇作用MCF-7细胞24 h后提取细胞总蛋白,利用蛋白质组技术,对紫杉醇诱导的MCF-7乳腺癌细胞凋亡前后的细胞蛋白进行二维电泳图谱分析,通过质谱鉴定差异蛋白质。结果通过对凋亡前后的蛋白质组二维电泳图谱分析,找到了17个差异较大的蛋白质,其中6个蛋白质通过质谱得到了鉴定,它们是烯醇化酶、细胞核氯离子通道蛋白、角蛋白8、核糖体蛋白S12、galectin-1和Hint。结论通过蛋白质组技术,发现了在紫杉醇诱导MCF-7乳腺癌细胞凋亡前后发生变化的6种蛋白质;这些差异蛋白质在紫杉醇诱导细胞凋亡中发挥一定的作用。 展开更多
关键词 紫杉醇 MCF-7乳腺癌细胞 凋亡 蛋白质组
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整体柱制备技术的新进展及其在蛋白质组学中的应用 被引量:10
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作者 邹汉法 吴明火 +2 位作者 王方军 吴仁安 叶明亮 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期526-536,共11页
整体柱是通过在柱管内原位聚合或固化的方法制备得到的具有多孔结构的整体棒状固定相,与传统的填充柱相比,具有通透性好、传质速率快、容易制备等优点,因此在分离分析领域特别是生物分离分析中发挥的作用日益增大。整体柱的制备及应用... 整体柱是通过在柱管内原位聚合或固化的方法制备得到的具有多孔结构的整体棒状固定相,与传统的填充柱相比,具有通透性好、传质速率快、容易制备等优点,因此在分离分析领域特别是生物分离分析中发挥的作用日益增大。整体柱的制备及应用近年来也得到了快速发展,层出不穷的新型整体柱已被广泛用于色谱高效分离分析、固相萃取及酶反应器等方面,大大推动了分离分析科学的发展。本文主要总结了近五年来整体柱的制备技术及其在蛋白质组学应用中的一些最新研究进展。 展开更多
关键词 整体柱 制备 色谱分离 蛋白质组学 综述
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The prognostic value of serum C-reactive protein-bound serum amyloid A in early-stage lung cancer 被引量:10
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作者 Xue-Yan Zhang Ge Zhang +6 位作者 Ying Jiang Dan Liu Man-Zhi Li Qian Zhong Shan-Qi Zeng Wan-Li Liu Mu-Sheng Zeng 《Chinese Journal of Cancer》 SCIE CAS CSCD 2015年第8期335-349,共15页
Background:Elevated levels of serum C-reactive protein(CRP) have been reported to have prognostic significance in lung cancer patients.This study aimed to further identify CRP-bound components as prognostic markers fo... Background:Elevated levels of serum C-reactive protein(CRP) have been reported to have prognostic significance in lung cancer patients.This study aimed to further identify CRP-bound components as prognostic markers for lung cancer and validate their prognostic value.Methods:CRP-bound components obtained from the serum samples from lung cancer patients or healthy controls were analyzed by differential proteomics analysis.CRP-bound serum amyloid A(CRP-SAA) was evaluated by coimmunoprecipitation(IP).Serum samples from two independent cohorts with lung cancer(retrospective cohort,242patients;prospective cohort,222 patients) and healthy controls(159 subjects) were used to evaluate the prognostic value of CRP-SAA by enzyme-linked immunosorbent assay.Results:CRP-SAA was identified specifically in serum samples from lung cancer patients by proteomic analysis.CRP binding to SAA was confirmed by co-IP in serum samples from lung cancer patients and cell culture media.The level of CRP-SAA was significantly higher in patients than in healthy controls(0.37 ± 0.58 vs.0.03 ± 0.04,P < 0.001).Elevated CRP-SAA levels were significantly associated with severe clinical features of lung cancer.The elevation of CRPSAA was associated with lower survival rates for both the retrospective(hazard ration[HR]= 2.181,95%confidence interval[CI]= 1.641-2.897,P < 0.001) and the prospective cohorts(HR = 2.744,95%CI = 1.810-4.161,P < 0.001).Multivariate Cox analysis showed that CRP-SAA was an independent prognostic marker for lung cancer.Remarkably,in stages l-ll patients,only CRP-SAA,not total SAA or CRP,showed significant association with overall survival in two cohorts.Moreover,univariate and multivariate Cox analyses also showed that only CRP-SAA could be used as an independent prognostic marker for early-stage lung cancer patients.Conclusion:CRP-SAA could be a better prognostic marker for lung cancer than total SAA or CRP,especially in earlystage patients. 展开更多
关键词 C反应蛋白 血清样品 肺癌 预后 价值 早期 结合物 酶联免疫吸附试验
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Proteomic analysis of differentially expressed proteins between Xiangyou 15 variety and the mutant M15 被引量:5
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作者 Zhen-Qian ZHANG Gang XIAO +7 位作者 Rui-Yang LIU Tai-Long TAN Chun-Yun GUAN Guo-Huai WANG She-Yuan CHEN Xian-Meng WU Mei GUAN Qin LI 《Frontiers in Biology》 CAS CSCD 2014年第3期234-243,共10页
A high oleic acid rapeseed material MI5 (derived from Xiangyou 15 variety) has been received more attention for its significant effect for human health. And it has almost the same physiological characteristic with X... A high oleic acid rapeseed material MI5 (derived from Xiangyou 15 variety) has been received more attention for its significant effect for human health. And it has almost the same physiological characteristic with Xiangyou 15 variety. To find out the difference between high oleic acid rapeseed material and Xiangyou 15 seedling, a comparative proteomic approach based on 2-DE and mass spectrometry was adopted. A total of 277 protein spots showed a significant change in intensity by more than 2.0-fold from M15 compared with Xiangyou 15 variety. Among them, 48 spots that changed at least 3.0-fold were excised from gels and successfully identified by MALDI-TOF/TOF MS. The identified proteins involved in metabolism of carbohydrate and energy (75%), stress and defense (8.3%), photosynthesis (6.3%), protein metabolism (2.1%) and other functions (8.3%). Then real-time quantitative PCR (qPCR) analysis was used to verify the expression levels of differentially expressed proteins, but the results did well agree with the proteomic results. In this work, most of the proteins involved in metabolism of carbohydrate and energy have higher expression in M15, which may reveal M15 has higher metabolism ability. These results provided much information to understand the differences between high oleic acid rapeseed material and Xiangyou 15 variety, which will be useful to screen high oleic rapeseed materials in seedling period. 展开更多
关键词 proteomic analysis high oleic acid 2-D electrophoresis real-time quantitative PCR
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脑性瘫痪儿童脑脊液内外泌体的蛋白质组学分析 被引量:2
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作者 张厚君 邓博文 +4 位作者 蒋昇源 赵毅 任敬佩 徐林 穆晓红 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2023年第6期903-908,共6页
背景:脑性瘫痪(简称脑瘫)是一种广泛的神经损伤性疾病,其病因在很大程度上仍不明确,用于该病分类或监测的分子指标也尚未见报道。目的:分离培养儿童脑瘫患者脑脊液来源的外泌体,使用无标记定量质谱蛋白质组学方法分析其外泌体的蛋白质... 背景:脑性瘫痪(简称脑瘫)是一种广泛的神经损伤性疾病,其病因在很大程度上仍不明确,用于该病分类或监测的分子指标也尚未见报道。目的:分离培养儿童脑瘫患者脑脊液来源的外泌体,使用无标记定量质谱蛋白质组学方法分析其外泌体的蛋白质组表达谱特征,为儿童脑瘫群体的分型、诊断和预后评估等提供分子生物学依据。方法:选择在北京中医药大学东直门医院进行选择性脊神经后根切断术的脑瘫患者,其中痉挛型脑瘫患者4例,混合型脑瘫患者3例,每位患者抽取3 mL脑脊液,通过超速离心法分离儿童脑瘫患者脑脊液中的外泌体,并使用纳米颗粒跟踪分析、透射电镜和蛋白质质谱分析对外泌体进行表征。结果与结论:①透射电镜观察显示,儿童脑瘫患者脑脊液内存在外泌体形态的囊泡。Western blot检测到外泌体标志蛋白Syntenin-1和Flotillin-1的表达;②纳米颗粒跟踪分析显示囊泡的大小和浓度符合外泌体的异质性特征。对痉挛性脑瘫、混合性脑瘫的脑脊液外泌体进行蛋白质谱分析,共鉴定出551个蛋白;③生物信息学分析显示,鉴定出的脑脊液外泌体蛋白与负责外泌体功能和神经发育过程的分子信号机制相关,这些蛋白主要富集于额叶皮质、运动皮质等脑部区域,与脑瘫病理密切相关。研究结果提示儿童脑瘫患者脑脊液内存在外泌体,外泌体蛋白可能与脑瘫分子病理机制相关。 展开更多
关键词 脑瘫 脑脊液 外泌体 蛋白质组学分析
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水稻类病变突变体lms1的表型鉴定与抗病分子机制分析
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作者 余瑶 王紫瑶 +5 位作者 周思睿 刘鹏程 叶亚峰 马伯军 刘斌美 陈析丰 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期857-870,共14页
类病变突变体是研究植物细胞死亡和抗病分子机制的重要遗传材料。通过辐射诱变粳稻品种武运粳7号,获得一个少见的抗病性下降的类病变突变体lms1(lesion mimic and disease susceptible mutant 1)。与野生型相比,该突变体叶片自发出现红... 类病变突变体是研究植物细胞死亡和抗病分子机制的重要遗传材料。通过辐射诱变粳稻品种武运粳7号,获得一个少见的抗病性下降的类病变突变体lms1(lesion mimic and disease susceptible mutant 1)。与野生型相比,该突变体叶片自发出现红褐色斑点,其株高、穗长、每穗粒数以及单株产量降低,但千粒重增加;对水稻白叶枯病的抗性显著下降,组织染色表明突变体的叶片中存在明显的细胞死亡以及活性氧的过量积累。遗传分析表明,lms1突变体的表型受单隐性核基因控制,利用图位克隆技术将lms1基因精细定位于水稻9号染色体Indel7和Indel8两个分子标记间,物理距离为62 kb。定位区间内候选基因的PCR扩增测序结果表明,其中一个编码泛素羧基末端水解酶的OsLMP1(Lesion Mimic Phenotype 1)基因第1个外显子中插入了一段长度为654 bp的序列,导致其蛋白翻译提前终止。利用蛋白组学技术分析了lms1突变体与野生型对照的蛋白积累水平,共鉴定到19个差异蛋白(7个上调、12个下调),主要参与氧化还原、叶绿素合成、光合作用等代谢途径。上述结果为进一步研究OsLMP1基因的功能及其调控细胞程序性死亡与抗病性的分子机制提供借鉴。 展开更多
关键词 水稻 类病变 lms1 基因定位 蛋白组学分析
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基于数据非依赖性采集定量蛋白质组学分析的原发性干燥综合征潜在唾液生物标志物研究
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作者 田艺超 郭春岚 +7 位作者 李珍 尤欣 刘晓燕 苏金梅 赵斯佳 穆月 孙伟 李倩 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 2024年第1期19-28,I0003,共11页
目的唾液腺是原发性干燥综合征(pSS)的主要靶器官,因此唾液被认为是腺体病理生理学和疾病状态的镜子。本研究旨在说明pSS患者的唾液蛋白质组学特征,并鉴定可能辅助诊断的潜在生物标志物。方法发现集包含49个样本[24个来自pSS,25个来自... 目的唾液腺是原发性干燥综合征(pSS)的主要靶器官,因此唾液被认为是腺体病理生理学和疾病状态的镜子。本研究旨在说明pSS患者的唾液蛋白质组学特征,并鉴定可能辅助诊断的潜在生物标志物。方法发现集包含49个样本[24个来自pSS,25个来自年龄和性别匹配的健康对照(HCs)],验证集包括25个样本(12个来自pSS,13个来自HCs)。36例pSS患者和38例健康对照者以2:1的比例集中随机分配至Discovery组或验证组。在2D LC-HRMS/MS平台上使用数据非依赖性采集(DIA)策略分析来自pSS患者和健康对照组的未刺激性全唾液样本,以揭示差异蛋白。根据基因本体(GO)分析和国际药学文摘(IPA)分析的蛋白质注释,使用DIA分析验证了关键蛋白质。随机森林用于建立SS的预测模型。结果共发现1,963个蛋白,其中136个蛋白在pSS患者中表现出差异性。生物信息学研究表明这些蛋白质主要与免疫功能、新陈代谢和炎症有关。一组19个蛋白质生物标志物通过基于P值和随机森林的排序顺序进行鉴定,并验证为具有特殊曲线下面积(AUC)值(发现集:0.817;验证集:0.882)的潜在生物标志物,可用于鉴别pSS患者和健康对照人群。结论新发现的候选蛋白组合可能有助于pSS的诊断。唾液蛋白质组学分析是一种很有前途的无创方法,可用于对pSS患者进行预后评估以及早期和精确治疗。DIA具备最佳的时间效率和数据可靠性,可望成为未来唾液蛋白质组研究的合适选择。 展开更多
关键词 原发性干燥综合征 唾液 蛋白质组学分析 质谱 诊断
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螨虫诱导变应性鼻炎患者血浆细胞外囊泡的蛋白质组学研究
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作者 杨育儒 卓明英 +2 位作者 杨峰 江采晔 张志荣 《国际耳鼻咽喉头颈外科杂志》 2024年第2期63-70,共8页
目的探究螨虫诱导的变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)患者血浆细胞外囊泡(extracellular vesicle,EV)蛋白质组学的差异,寻找并鉴定AR潜在的生物标志物。方法分别收集螨虫诱导的AR患者(AR组)和健康志愿者(HC组)的血液样本,每组各20例。... 目的探究螨虫诱导的变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)患者血浆细胞外囊泡(extracellular vesicle,EV)蛋白质组学的差异,寻找并鉴定AR潜在的生物标志物。方法分别收集螨虫诱导的AR患者(AR组)和健康志愿者(HC组)的血液样本,每组各20例。使用超速离心法对AR组与HC组的血浆EV进行分离,并使用透射电子显微镜和纳米流式细胞术对EV进行鉴定和表征。使用液相色谱-串联质谱技术对分离出的EV进行蛋白质组学分析,寻找并鉴定差异表达蛋白质(differentially expression proteins,DEPs)。随后,对DEPs进行基因本体(gene ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析和蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析。结果AR组和HC组的血浆EV大小在30~150 nm之间,两组之间无显著性差异。在两组之间共筛选出664种蛋白质,并鉴定出89种表达水平具有显著性差异的蛋白质(P<0.05)。与HC组相比,AR组中有44种蛋白质表达显著上调,45种蛋白质表达显著下调。通过进行GO分析,发现这89种DEPs可能与免疫调节有关。此外,KEGG富集分析和PPI分析显示,这89种DEPs还与补体和凝血级联反应、雌激素和脂肪细胞因子信号通路等多种途径密切相关。结论本研究通过蛋白质组学技术成功筛选出与螨虫诱导AR相关的89种差异表达蛋白质。这些DEPs主要参与调节个体的免疫反应,其中脂联素、补体C1q亚基A和溶质载体家族2等蛋白质可能成为诊断AR的潜在生物标志物。 展开更多
关键词 鼻炎 变应性 常年性 血浆 螨虫 细胞外囊泡 蛋白质组学分析
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Proteomic analysis of differentially expressed proteins involving in liver metastasis of human colorectal carcinoma 被引量:4
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作者 Li, Shi-Yong An, Ping +5 位作者 Cai, Hui-Yun Bai, Xue Zhang, Ying-Nan Yu, Bo Zuo, Fu-Yi Chen, Gang 《Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International》 SCIE CAS 2010年第2期149-153,共5页
BACKGROUND: Early diagnosis of liver metastasis of colorectal carcinoma is very important for the appropriate treatment of such patients. However, there has been no effective approach available for clinical applicatio... BACKGROUND: Early diagnosis of liver metastasis of colorectal carcinoma is very important for the appropriate treatment of such patients. However, there has been no effective approach available for clinical application. The present study aimed to investigate the differential expression of proteins in patients with liver metastasis of colorectal carcinomas using proteomic analysis and evaluate its potentiality in clinical diagnosis. METHODS: Fluorescence two-dimensional differential in-gel electrophoresis (2-D DIGE) was used to analyze and compare the protein expression between normal mucosa, the primary focus, and liver metastases. Proteomic analysis was made to identify the differentially expressed proteins. Immunohistological staining was used to confirm the expression of differentially expressed proteins in colorectal carcinomas and areas of liver metastasis. RESULTS: A 1.5-fold difference was found with 46 differentially expressed proteins. In 20 differentially expressed proteins, 3 were down-regulated and 17 up-regulated in liver metastases. Proteomic analysis showed that the S-adenosylmethionine transgelin variant was down-regulated in liver metastasis tissues. Zinc finger protein 64 homolog (Zfp64), guanine nucleotide exchange factor 4 (GEF4), human arginase, glutathione S-transferases (GSTs) A3, and tumor necrosis factor a (TNF-alpha)-induced protein 9 were up-regulated in liver metastasis tissues. Immunohistochemical staining confirmed that human arginase expression was higher in liver metastases than in the primary focus. CONCLUSIONS: There was a significant difference in protein expression between the primary focus of colorectal carcinoma and liver metastases. The differentially regulated proteins were closely related to liver metastasis of colorectal carcinoma. Elevated human arginase may be an important molecular marker for liver metastasis from colorectal carcinoma. (Hepatobiliary Pancreat Dis Jut 2010; 9: 149-153) 展开更多
关键词 colorectal carcinoma liver metastasis proteomic analysis human arginase
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小麦磷饥饿前后根系蛋白质组差异表达谱建立及差异表达蛋白的鉴定 被引量:5
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作者 冯万军 李振兴 +4 位作者 郭宝健 彭惠茹 姚颖垠 倪中福 孙其信 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期780-790,共11页
以耐低磷的小麦基因型洛夫林10号为材料,采用蛋白质双向电泳技术,结合质谱鉴定,分析了正常磷供应和无磷处理7d后根系中的蛋白质组表达谱差异,以期为深入探讨小麦响应磷胁迫的分子机理提供蛋白水平上的数据和资料。研究发现,在可重复检... 以耐低磷的小麦基因型洛夫林10号为材料,采用蛋白质双向电泳技术,结合质谱鉴定,分析了正常磷供应和无磷处理7d后根系中的蛋白质组表达谱差异,以期为深入探讨小麦响应磷胁迫的分子机理提供蛋白水平上的数据和资料。研究发现,在可重复检测到的1144个蛋白点中,有87个在磷胁迫处理前后发生了明显的表达改变,占总数的7.6%,包括磷胁迫前特异表达、磷胁迫后特异表达、磷胁迫后上调和磷胁迫后下调表达等4种差异表达模式。在87个差异表达蛋白点中,有39个通过质谱技术被成功鉴定,涉及到代谢、细胞生长和分裂、转录和翻译、抗病、信号转导、转座元件及未知功能蛋白等功能类别,说明小麦可能通过细胞的代谢状态和基因表达改变来适应磷胁迫,进而维持体内磷含量的平衡状态。最后,还对差异表达点与磷胁迫的关系进行了分析和讨论。 展开更多
关键词 磷营养 蛋白质组表达谱 根系 小麦
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颅内动脉瘤壁的定量蛋白质组学研究 被引量:5
14
作者 王道奎 王成东 +6 位作者 曲秉坤 王喆 鞠吉雨 王玉亭 王增武 闫红梅 曹培成 《中华神经外科杂志》 CSCD 北大核心 2013年第12期1281-1285,共5页
目的筛选动脉瘤壁差异表达蛋白质,为动脉瘤形成和破裂的分子机制研究提供思路。方法收集破裂的14例动脉瘤壁标本,以匹配的14例颅脑外伤手术患者颞浅动脉做正常对照,等量混合同组内标本,采用同位素标记的绝对和相对定量技术(iTRAQ)... 目的筛选动脉瘤壁差异表达蛋白质,为动脉瘤形成和破裂的分子机制研究提供思路。方法收集破裂的14例动脉瘤壁标本,以匹配的14例颅脑外伤手术患者颞浅动脉做正常对照,等量混合同组内标本,采用同位素标记的绝对和相对定量技术(iTRAQ)和2D-LC-MS/MS法进行差异蛋白质分析。结果共鉴定出蛋白质915个,其中差异2倍以上的蛋白质有255个,包括102个上调蛋白和153个下调蛋白。上调的蛋白质主要与细胞免疫炎性反应、细胞自噬与凋亡以及细胞黏附迁移等生物过程相关;下调的蛋白质主要与细胞骨架连接、细胞组分形态形成、信号传导和蛋白质转运有关。其中,细胞自噬诱导分子(TM9SFl)和杀青素1(AZUl)上调最高为8.0倍;血管张力纤维形成相关蛋白质(SORBS2)下调最显著为12.1倍。结论破裂动脉瘤壁有多种蛋白质表达异常,其中TM9SFl、AZUl及SORBS2的变化可能参与了动脉瘤破裂的分子机制。 展开更多
关键词 颅内动脉瘤 蛋白质组学 同位素标记的绝对和相对定量技术 液质联用
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2,2',4,4'-四溴联苯醚的好氧微生物降解 被引量:4
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作者 张姝 Giulio Franco +3 位作者 李晓豹 卢晓霞 侯珍 杨君君 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第5期1945-1950,共6页
从北京高碑店污水处理厂活性污泥中筛选出1株能好氧降解2,2',4,4'-四溴联苯醚(BDE-47)的细菌,并对其降解特性及有关蛋白质进行分析,目的是了解好氧条件下BDE-47的微生物降解机制.BDE-47降解菌通过平板划线法获得,其16S rDNA与... 从北京高碑店污水处理厂活性污泥中筛选出1株能好氧降解2,2',4,4'-四溴联苯醚(BDE-47)的细菌,并对其降解特性及有关蛋白质进行分析,目的是了解好氧条件下BDE-47的微生物降解机制.BDE-47降解菌通过平板划线法获得,其16S rDNA与不动杆菌(Acintobacter sp.)的相似度最大,为90%.采用250 mL锥形瓶研究了所得菌对BDE-47的降解情况,在BDE-47初试浓度为146μg.L-1的条件下,经过63 d的培养,所得菌降解了45.44%的BDE-47,降解产物主要为4-OH-联苯醚,菌量增加了7倍左右.分别以BDE-47和酵母提取物为碳源培养所得菌2周,然后各自提取蛋白质,通过蛋白质双向电泳及质谱检测,发现了与BDE-47降解有关的一些特异蛋白质.本研究表明,在好氧条件下,细菌可以BDE-47为碳源生长,其过程涉及多种蛋白质的作用. 展开更多
关键词 2 2' 4 4'-四溴联苯醚 活性污泥 好氧条件 微生物降解 蛋白质组分析
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Blood Stasis Syndrome in Japan and Its Molecular Biological Analysis 被引量:3
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作者 Hirozo Goto 《Chinese Journal of Integrative Medicine》 SCIE CAS 2014年第7期490-495,共6页
Blood stasis syndrome is one of the pathological concepts of Oriental traditional medicine. In Oriental traditional medicine, blood is thought of as not only blood but also as a living component of the body. In fact, ... Blood stasis syndrome is one of the pathological concepts of Oriental traditional medicine. In Oriental traditional medicine, blood is thought of as not only blood but also as a living component of the body. In fact, blood stasis syndrome is related to not just circulation disorders but dermatological and gynecological and other diseases. In Japan, the concept of blood stasis syndrome is based on the past literature, for instance, Synopsis of Golden Chamber (Jin Kui Yao Lue), etc. There are many signs of this syndrome, such as a dry mouth, fullness of the abdomen and rough skin. However, the levels of importance of these signs had been unclear. Therefore, in order to determine the levels of seriousness, a scoring system of blood stasis syndrome was made based on multivariate analysis by Dr. Terasawa (Terasawa's Blood Stasis Score). Using the scoring system, we have studied blood stasis syndrome mainly related to blood circulation using modem techniques of analysis. From the results, we found that patients with blood stasis syndrome showed hemorheological abnormalities, and an improvement in these abnormalities was shown after administration of removing-blood stasis formulae. Furthermore, we have studied blood stasis syndrome from the point of view of molecular biology. We searched for the specific protein expression in blood stasis syndrome by proteomic analysis, and found no specific protein expression. However, there may be a possibility of developing a diagnostic algorithm for blood stasis by construction of a decision tree. During the past few years, as one of the molecular biological factors affecting blood stasis syndrome, we have been studying hypoxia inducible factor, which is located in the upstream of many genes. Above all, blood stasis syndrome is more than just circulatory deficit but encompasses the pathological concept of constant multilateral change in the living body. 展开更多
关键词 blood stasis syndrome Terasawa's Blood Stasis Score hemorheological abnormalities proteomic analysis decision tree hypoxia inducible factor
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基于蛋白组学技术探讨脓毒症巨噬细胞功能异常机制
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作者 周靓 肖雯 +2 位作者 姜伟斌 刘艳娟 顾潇宵 《实用休克杂志(中英文)》 2023年第5期282-284,共3页
目的基于蛋白质组学技术分析脓毒症时巨噬细胞蛋白表达改变。方法采用蛋白质组学技术检测1ug/mLLPS刺激的巨噬细胞蛋白谱变化,并将差异蛋白进行GO富集分析与KEGG通路分析。结果蛋白质组学技术工鉴定差异表达蛋白487个。GO富集分析得到... 目的基于蛋白质组学技术分析脓毒症时巨噬细胞蛋白表达改变。方法采用蛋白质组学技术检测1ug/mLLPS刺激的巨噬细胞蛋白谱变化,并将差异蛋白进行GO富集分析与KEGG通路分析。结果蛋白质组学技术工鉴定差异表达蛋白487个。GO富集分析得到条目数30条,其中生物过程10条,细胞组成10条,分子功能10条。KEGG通路分析发现差异基金主要富集在细胞周期、内吞等信号通路,表明LPS刺激所致细胞损伤与上述通路有关。结论LPS可能通过影响细胞周期、内吞等信号通路造成巨噬细胞损伤。 展开更多
关键词 脓毒症 巨噬细胞 蛋白质组学 GO富集分析 KEGG通路分析
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外生菌根真菌对宿主植物耐胁迫能力的影响研究进展
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作者 谭灿灿 聂稳 +6 位作者 刘逸夫 王亚 袁艳超 刘建锋 常二梅 肖文发 贾子瑞 《世界林业研究》 CSCD 北大核心 2023年第6期26-31,共6页
菌根真菌是多种真菌类群的异质群,与90%以上的植物根有关。外生菌根(ECM)在森林生态系统中种类繁多、分布广泛、适应性强,是天然林的重要组成。菌根化可以促进宿主植物对水分和营养元素的吸收,对宿主植物的定植、生长和抗逆性等具有重... 菌根真菌是多种真菌类群的异质群,与90%以上的植物根有关。外生菌根(ECM)在森林生态系统中种类繁多、分布广泛、适应性强,是天然林的重要组成。菌根化可以促进宿主植物对水分和营养元素的吸收,对宿主植物的定植、生长和抗逆性等具有重要影响。因此,研究其在胁迫下的响应机制对于更好地利用外生菌根真菌—植物联合修复污染土壤有着重要意义。目前对外生菌根真菌提高植物耐胁迫能力的机制还不甚了解。文中综述菌根化植物的生长特征、抗胁迫能力以及转录组和蛋白质组表达水平等的研究进展,分析菌根真菌增强宿主植物耐胁迫能力,并提出有待深入研究的方向,以期为揭示ECM植物抵抗胁迫机制、探索外生菌根真菌—树木联合修复技术的相关研究提供参考和借鉴。 展开更多
关键词 外生菌根真菌 宿主植物 抗胁迫 转录组分析 蛋白质组分析
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玉米杂交种先玉335及其亲本种子萌发过程中胚芽蛋白质组学分析 被引量:4
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作者 进茜宁 付志远 +3 位作者 丁冬 刘宗华 李卫华 汤继华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1689-1694,共6页
以培养84h种子的胚芽(包括胚芽鞘)为试验材料,对优良玉米杂交种先玉335与其亲本自交系的蛋白质组学差异进行了分析。结果表明,在杂交种先玉335中共检测到560个蛋白点,在亲本PH6WC和PH4CV分别检测到507个和508个蛋白点,而且先玉335胚芽... 以培养84h种子的胚芽(包括胚芽鞘)为试验材料,对优良玉米杂交种先玉335与其亲本自交系的蛋白质组学差异进行了分析。结果表明,在杂交种先玉335中共检测到560个蛋白点,在亲本PH6WC和PH4CV分别检测到507个和508个蛋白点,而且先玉335胚芽及胚芽鞘中81%的蛋白点表现非加性累积模式,其中288个蛋白点表现为超高亲的上调表达,仅15个蛋白点表现超低亲的下调表达,因此推测非加性蛋白的累积可能是杂交种先玉335胚芽萌发过程中胚芽及胚芽鞘杂种优势产生的主要原因。用于质谱分析的13个差异极显著蛋白主要涉及代谢途径、蛋白折叠、胁迫响应、细胞骨架和细胞解毒5种类型。 展开更多
关键词 玉米 胚芽(胚芽鞘) 杂种优势 蛋白质组学分析
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基于MALDI-TOF-MS的羊绒羊毛蛋白定量法及其应用 被引量:4
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作者 费静 谢璐蔓 +1 位作者 吴娟 陈晓 《现代纺织技术》 北大核心 2021年第4期76-80,共5页
山羊绒与绵羊毛理化性质相近,外观形态相似,传统的检测方法主要是借助显微镜或者电镜,依据两者的外观形态进行判别,受限于检测人员的经验,结果较为主观。研究从ISO 20418—2提供的MALDI-TOF-MS多肽分析法入手,建立羊绒羊毛定量模型,实... 山羊绒与绵羊毛理化性质相近,外观形态相似,传统的检测方法主要是借助显微镜或者电镜,依据两者的外观形态进行判别,受限于检测人员的经验,结果较为主观。研究从ISO 20418—2提供的MALDI-TOF-MS多肽分析法入手,建立羊绒羊毛定量模型,实现仪器客观检测。使用不同产地、不同品种的羊绒以及一些特殊处理的样品,对该方法的适用性进行验证;使用不同种类的羊绒产品对方法的准确性进行验证。结果表明:该方法对不同产地、不同品种的羊绒有普适性,可用于羊绒制品的定量检测;但经剥色处理的羊绒不适用该定量方法。 展开更多
关键词 羊绒 羊毛 蛋白组学分析 MALDI-TOF-MS
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