文摘脊髓灰质炎病毒受体(poliovirus receptor,PVR)基因与肿瘤的发生发展密切相关,然而PVR在肿瘤免疫中的调控作用及机制尚未阐明。研究从泛癌角度分析PVR在不同类型癌症组织中的表达及与患者预后和免疫水平的关联。通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和TIMER数据库完成了PVR在癌症和正常组织中表达差异的分析,利用生存分析工具评估了PVR与癌症患者预后的关联。通过TIMER数据库和R软件包评估了PVR在泛癌中与免疫细胞浸润、免疫检查点(immune checkpoint,ICP)基因的共表达关系及癌症基质/免疫评分。为进一步了解PVR基因在不同癌症中的潜在生物学作用机制,对PVR进行了单细胞水平测序分析和基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA);通过qRT-PCR对PVR在多种癌症细胞系中的表达进行验证。结果显示,PVR在肿瘤组织与正常组织中表达具有显著差异,如膀胱尿路上皮癌、胆管癌、结肠癌、食管癌和头颈部癌等。PVR的异常表达与多种癌症的不良预后有关,如肾上腺皮质癌、膀胱尿路上皮癌、乳腺癌和宫颈癌等。PVR的表达水平与泛癌中免疫细胞浸润、基质/免疫评分和ICP基因的表达调控显著相关(均P<0.05,具体见正文)。单细胞测序结果显示,PVR与肿瘤细胞的分化、基因沉默和DNA修复等多种细胞生物学功能和表型有关。GSEA结果发现,PVR与多种肿瘤细胞的免疫相关功能和信号通路有关。qRT-PCR结果显示,相较于健康细胞,PVR在胃癌、结肠癌和肝癌细胞系中表达较高。较全面的泛癌分析表明,PVR是一种癌症组织中高表达并导致较差预后的癌基因,PVR可能是新的免疫依赖的预后预测标志物,能为癌症的靶向治疗提供新方向。
