-
题名硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析
被引量：1
- 1
-
-
作者
姚运法
练冬梅
林碧珍
赖正锋
洪建基
-
机构
福建省农业科学院亚热带农业研究所
-
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第12期2737-2747,共11页
-
基金
福建省公益类项目(2019R1030-2)
漳州市自然科学基金(ZZ2019J21)。
-
文摘
【目的】探索外源硒对冰菜转录组相应机制影响及相关功能基因挖掘。【方法】利用高通量测序技术,构建冰菜硒响应转录组数据库。【结果】硒处理对冰菜植物激素信号转导途径影响:除油菜素类固醇外,其它7个激素代谢途径均产生重要影响。硒处理浓度的增加,能够促进生长素信号转导,激活下游基因表达;细胞分裂素信号转导途径中,AHP对硒处理敏感,A-ARR受硒处理呈显著上调作用,但均对硒浓度变化不敏感;硒处理浓度增加,使得赤霉素信号转导下游TF得到激活;脱落酸信号转导途径中,低硒处理(10 mmol/L)导致SnRK2表达量显著降低,抑制气孔关闭,导致冰菜易脱水;硒处理(100 mmol/L)SnRK2蛋白表达量显著恢复;乙烯信号转导途径中ETR和ERF1/2表达量随着硒处理浓度的提高而降低;硒处理(10 mmol/L)促进茉莉酸信号途径中JAZ和MYC2表达量上调,调节硒对冰菜的逆境胁迫,硒处理(10 mmol/L)对JAZ和MYC2表达量影响不显著;水杨酸信号转导途径中TGA和PR-1在硒处理(10 mmol/L)表达量无上下调表达,硒处理(100 mmol/L)TGA表达量下调,PR-1表达量上调,激活冰菜硒响应能力。经实时定量PCR分析,7个DEGs相对表达量与转录组表达谱分析趋势完全一致。【结论】本研究为冰菜硒关键基因挖掘和遗传育种奠定了一定基础。
-
关键词
冰菜
转录组
差异表达基因
植物激素信号转导途径
-
Keywords
Ice plant
Transcriptome
Function annotation
DEGs
plant hormone signal transduction pathway
-
分类号
S641.9
[农业科学—蔬菜学]
-
