目的:基于网络药理学方法探讨加味二陈汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的有效成分及其作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and ana...目的:基于网络药理学方法探讨加味二陈汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的有效成分及其作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取半夏、陈皮、茯苓、白术、天南星、枳实、泽兰、菟丝子的主要活性成分及其蛋白质靶点,并用蛋白质数据库(universal protein,UniProt)将其蛋白质靶点规范为基因靶点,再通过Cytoscape 3.7.1软件构建中药-活性成分-基因靶点网络;采用基因名片数据库(GeneCards)、诊疗靶点数据库(therapeutic target database,TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、药物数据库(Drugbank)、疾病相关基因与突变位点数据库(Disgenet)获取PCOS的主要作用基因靶点,并与加味二陈汤基因靶点绘制韦恩图,通过Excel明确共同靶点后,利用网络可视化软件STRING平台对共同靶点进行蛋白互作网络(protein protein interaction,PPI)分析,并用Cytoscape 3.7.1软件进行拓扑参数分析,寻找关键核心靶点;通过DAVID平台进行基因本体(gene ontology,GO)生物功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopodia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,预测其生物过程及作用通路。结果:加味二陈汤共筛选出72个活性成分,对应基因靶点数目为257个,PCOS疾病靶点为2 354个,二者共有靶点143个;GO及KEGG富集结果显示,其主要涉及转录正调控、负调控、药物反应、凋亡过程及其调控、细胞增殖负调控、雌二醇反应等生物过程以及PI3K/Akt、MAPK、TNF等多条信号通路,其中PI3K/Akt信号通路为主要的作用通路。结论:加味二陈汤主要通过PI3K/Akt信号转导通路发挥治疗PCOS的作用,同时还能通过降低睾丸激素、雌二醇、促黄体生成素的激素水平、抑制胰岛素抵抗及调控自噬水平等,促进卵巢功能恢复。展开更多
目的基于网络药理学方法预测降酸除痹方治疗痛风性关节炎作用靶点与通路。方法采用Therapeutic Targets数据库,Genetic Association数据库,Traditional Chinese M edicine Systems Pharmacology数据库获得痛风性关节炎靶点以及降酸除痹...目的基于网络药理学方法预测降酸除痹方治疗痛风性关节炎作用靶点与通路。方法采用Therapeutic Targets数据库,Genetic Association数据库,Traditional Chinese M edicine Systems Pharmacology数据库获得痛风性关节炎靶点以及降酸除痹方药物靶点,采用Uniprot数据库转换信息,采用Cytoscape3.2.1软件包括Bisogene插件,Merge插件,Cyto NCA插件构建网络,最后通过DAVID数据库和Omicshare数据库做通路分析和结果可视化。结果降酸除痹方作用于痛风性关节炎有核心靶点蛋白295个,而这些蛋白主要富集在EB病毒感染,癌症,病毒致癌,PI3K-Akt通路,MAPK通路等多条通路,与痛风的治疗均有密切的联系。结论降酸除痹方治疗痛风性关节炎从多靶点、多通路发挥作用。展开更多
文摘目的:基于网络药理学方法探讨加味二陈汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的有效成分及其作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取半夏、陈皮、茯苓、白术、天南星、枳实、泽兰、菟丝子的主要活性成分及其蛋白质靶点,并用蛋白质数据库(universal protein,UniProt)将其蛋白质靶点规范为基因靶点,再通过Cytoscape 3.7.1软件构建中药-活性成分-基因靶点网络;采用基因名片数据库(GeneCards)、诊疗靶点数据库(therapeutic target database,TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、药物数据库(Drugbank)、疾病相关基因与突变位点数据库(Disgenet)获取PCOS的主要作用基因靶点,并与加味二陈汤基因靶点绘制韦恩图,通过Excel明确共同靶点后,利用网络可视化软件STRING平台对共同靶点进行蛋白互作网络(protein protein interaction,PPI)分析,并用Cytoscape 3.7.1软件进行拓扑参数分析,寻找关键核心靶点;通过DAVID平台进行基因本体(gene ontology,GO)生物功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopodia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,预测其生物过程及作用通路。结果:加味二陈汤共筛选出72个活性成分,对应基因靶点数目为257个,PCOS疾病靶点为2 354个,二者共有靶点143个;GO及KEGG富集结果显示,其主要涉及转录正调控、负调控、药物反应、凋亡过程及其调控、细胞增殖负调控、雌二醇反应等生物过程以及PI3K/Akt、MAPK、TNF等多条信号通路,其中PI3K/Akt信号通路为主要的作用通路。结论:加味二陈汤主要通过PI3K/Akt信号转导通路发挥治疗PCOS的作用,同时还能通过降低睾丸激素、雌二醇、促黄体生成素的激素水平、抑制胰岛素抵抗及调控自噬水平等,促进卵巢功能恢复。
文摘目的基于网络药理学方法预测降酸除痹方治疗痛风性关节炎作用靶点与通路。方法采用Therapeutic Targets数据库,Genetic Association数据库,Traditional Chinese M edicine Systems Pharmacology数据库获得痛风性关节炎靶点以及降酸除痹方药物靶点,采用Uniprot数据库转换信息,采用Cytoscape3.2.1软件包括Bisogene插件,Merge插件,Cyto NCA插件构建网络,最后通过DAVID数据库和Omicshare数据库做通路分析和结果可视化。结果降酸除痹方作用于痛风性关节炎有核心靶点蛋白295个,而这些蛋白主要富集在EB病毒感染,癌症,病毒致癌,PI3K-Akt通路,MAPK通路等多条通路,与痛风的治疗均有密切的联系。结论降酸除痹方治疗痛风性关节炎从多靶点、多通路发挥作用。
