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河南省2020年输入性恶性疟原虫Pfhrp2基因多态性分析
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作者 李素华 纪鹏慧 +2 位作者 王丹 王昊 周瑞敏 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CSCD 北大核心 2024年第5期664-667,共4页
分析河南省2020年确诊的输入性恶性疟病例血样的恶性疟原虫富组氨酸蛋白2 (Pfhrp2)基因的缺失情况和外显子2区多态性。收集2020年河南省疟疾诊断参比实验室确诊的输入性恶性疟病例信息和血样,血样DNA进行巢式PCR扩增Pfhrp2基因外显子2区... 分析河南省2020年确诊的输入性恶性疟病例血样的恶性疟原虫富组氨酸蛋白2 (Pfhrp2)基因的缺失情况和外显子2区多态性。收集2020年河南省疟疾诊断参比实验室确诊的输入性恶性疟病例信息和血样,血样DNA进行巢式PCR扩增Pfhrp2基因外显子2区,阳性扩增产物进行测序。共收集确诊的输入性恶性疟病例血样37份,Pfhrp2基因外显子2区巢式PCR扩增阳性35份,阳性率94.59%(35/37)。35份扩增阳性产物中有28份测序成功,序列平均长度为822 bp。Pfhrp2基因外显子2区序列编码的氨基酸链共包含12种重复类型,均以1型(AHHAHHVAD)作为起始、12型(AHHAA)作为结束。28条氨基酸链均含有1型、2型、4型、11型和12型重复。其他重复类型占比从高到低依次为13型(96.43%,27/28),3型(92.86%,26/28),7型(82.14%,23/28),8型(64.29%,18/28),6型(60.71%,17/28),5型(46.43%,13/28)和9型(32.14%,9/28)。本研究结果显示,2020年河南省输入性恶性疟原虫虫株的Pfhrp2基因外显子2区片段存在高度多样性,可能会造成快速诊断检测结果的差异。 展开更多
关键词 输入性恶性疟原虫 pfhrp2基因 多态性 河南省
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云南恶性疟病例疟原虫Pfhrp2基因序列多态性分析 被引量：1
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作者 董莹 孙艾明 +4 位作者 陈梦妮 徐艳春 毛祥华 邓艳 杨恒林 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期411-417,共7页
目的：分析云南省恶性疟病例疟原虫虫株的富组氨酸蛋白Ⅱ（Histidine？rich protein？2，HRPⅡ）基因（Pfhrp2）序列的多态性，为研究疟原虫抗原基因缺失奠定基础。方法搜集2012年8月-2015年9月云南省恶性疟现症病例的滤纸血样和相关信... 目的：分析云南省恶性疟病例疟原虫虫株的富组氨酸蛋白Ⅱ（Histidine？rich protein？2，HRPⅡ）基因（Pfhrp2）序列的多态性，为研究疟原虫抗原基因缺失奠定基础。方法搜集2012年8月-2015年9月云南省恶性疟现症病例的滤纸血样和相关信息，用PCR技术扩增血样中恶性疟原虫Pfhrp2基因exon2区并测序，测序成功序列与AY816237、AY816240、AY816301参比序列比对；用Mega 5.04分析Pfhrp2基因exon2区序列多态性，计算序列间保守位点、遗传距离等；根据氨基酸序列间遗传距离绘制聚类树状图。结果共收集云南省15个州（市）的恶性疟现症病例血样218份，病例感染来源地包括云南本地、非洲、缅甸等流行区。其中155份Pfhrp2基因exon2区扩增阳性和测序成功，编码氨基酸数在115～298之间，平均为239.7 aa，非洲（239.9 aa）、缅甸（239.5 aa）、云南（241.6 aa）感染虫株的氨基酸残基均数差异无统计学意义（F=0.025，P＆gt;0.05）。所有氨基酸残基序列均以12型重复作为结尾，以1型、2型重复为起始，比例各占98.1%（152/155）和1.9%（3/155），2型重复次数最多，为12.9次。155条Pfhrp2基因exon2区DNA序列的同源位点为894 bp，保守位点占20.8%（186/894），变异位点占78.2%（699/894），非洲虫株序列间遗传距离为0.000～0.741，缅甸为0.000～0.948，云南为0.000～0.750。所有155条序列按氨基酸序列大小聚类成3个大类，同一个层级的序列具有近似的序列长度和氨基酸重复类型。结论云南省恶性疟现症病例所感染疟原虫的Pfhrp2基因exon2区存在高度多态性，恶性疟原虫株主要按Pfhrp2基因exon2区的氨基酸序列长度进行聚类。 展开更多
关键词 恶性疟 恶性疟原虫 富组氨酸蛋白Ⅱ pfhrp2基因 多态 云南省 Histidine-rich protein Ⅱ(HRP II)
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