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云南花生丛枝植原体secY基因序列分析及结构预测
被引量：
8
1
作者
万琼莲
蔡红
+2 位作者
杨子祥
王连春
陈海如
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期163-168,共6页
对采自云南元谋的花生丛枝植株总DNA进行secY基因的巢式PCR扩增,得到约1 700 bp的特异扩增片段,将该扩增产物克隆后进行序列测定,表明该片段长1 709 bp,该序列包括部分rpl15基因、全部secY基因序列以及部分的map基因,为植原体部分spc核...
对采自云南元谋的花生丛枝植株总DNA进行secY基因的巢式PCR扩增,得到约1 700 bp的特异扩增片段,将该扩增产物克隆后进行序列测定,表明该片段长1 709 bp,该序列包括部分rpl15基因、全部secY基因序列以及部分的map基因,为植原体部分spc核糖体蛋白操纵子,其中secY基因编码的蛋白包括420个氨基酸,为含有10个明显跨膜区的整合性跨膜蛋白。通过同源性比对及构建的系统进化树,表明该株系与来源于台湾、海南的花生丛枝植原体亲缘关系最近,确定了该株系属于16SrII-A亚组成员。该分类结果与基于16SrDNA及rp基因的分析结果一致。
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关键词
花生丛枝植原体
云南
secY基因
序列分析
下载PDF
职称材料
花生丛枝植原体免疫膜蛋白基因克隆及细菌双杂交诱饵质粒构建
2
作者
杨文君
张雨良
+3 位作者
王健华
余乃通
林湛松
刘志昕
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期429-435,共7页
初步分析植原体免疫膜蛋白的结构,以Imp构建诱饵质粒,为研究植原体与寄主互作的分子机理,探讨植原体传播、侵染及在寄主内的运输方式奠定基础。根据本实验室获得的花生丛枝植原体免疫膜蛋白基因序列设计特异性引物Imp-F/Imp-R,通过PCR...
初步分析植原体免疫膜蛋白的结构,以Imp构建诱饵质粒,为研究植原体与寄主互作的分子机理,探讨植原体传播、侵染及在寄主内的运输方式奠定基础。根据本实验室获得的花生丛枝植原体免疫膜蛋白基因序列设计特异性引物Imp-F/Imp-R,通过PCR扩增获得花生丛枝植原体免疫膜蛋白基因,大小519 bp,编码蛋白含有172个氨基酸残基,与SPWB膜蛋白的核苷酸差异一个碱基,氨基酸序列相同。另外与WBDL膜蛋白的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为79.8%和70.2%。对其进行系统发育树分析;初步分析imp基因编码蛋白的跨膜区和疏水区。分析结果表明:花生丛枝植原体免疫膜蛋白C端有一跨膜锚定区,N端主要为膜内亲水区,没有前导信号序列。预测花生丛枝植原体免疫膜蛋白是一类C端跨膜的植原体免疫膜蛋白。将imp基因克隆到带有λcI基因的pBT质粒上,构建诱饵载体pBT-Imp,并通过IPTG诱导表达,western blot检测和自激活检验对其进行检测。结果显示:所构建的诱饵载体pBT-Imp可用于细菌双杂交的进一步实验。
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关键词
花生丛枝植原体
免疫膜蛋白
细菌双杂交
诱饵载体
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职称材料
题名
云南花生丛枝植原体secY基因序列分析及结构预测
被引量：
8
1
作者
万琼莲
蔡红
杨子祥
王连春
陈海如
机构
云南农业大学植物病理重点实验室
云南省农业科学院热区生态农业研究所
玉溪师范学院资源环境学院
出处
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期163-168,共6页
基金
国家自然科学基金(31060239)
云南省科技创新人才计划项目(2011HB026)
文摘
对采自云南元谋的花生丛枝植株总DNA进行secY基因的巢式PCR扩增,得到约1 700 bp的特异扩增片段,将该扩增产物克隆后进行序列测定,表明该片段长1 709 bp,该序列包括部分rpl15基因、全部secY基因序列以及部分的map基因,为植原体部分spc核糖体蛋白操纵子,其中secY基因编码的蛋白包括420个氨基酸,为含有10个明显跨膜区的整合性跨膜蛋白。通过同源性比对及构建的系统进化树,表明该株系与来源于台湾、海南的花生丛枝植原体亲缘关系最近,确定了该株系属于16SrII-A亚组成员。该分类结果与基于16SrDNA及rp基因的分析结果一致。
关键词
花生丛枝植原体
云南
secY基因
序列分析
Keywords
peanut
witches
′-
broom
phytoplasma
Yunnan
Province
secY
gene
sequence
analysis
分类号
S435.652 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
下载PDF
职称材料
题名
花生丛枝植原体免疫膜蛋白基因克隆及细菌双杂交诱饵质粒构建
2
作者
杨文君
张雨良
王健华
余乃通
林湛松
刘志昕
机构
海南大学农学院
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
海南大学环境与植物保护学院
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期429-435,共7页
基金
国家科技支撑计划项目(2007BAD48B01)
中央级公益性科研院所基本科研业务专项(ITBBZD1051)
文摘
初步分析植原体免疫膜蛋白的结构,以Imp构建诱饵质粒,为研究植原体与寄主互作的分子机理,探讨植原体传播、侵染及在寄主内的运输方式奠定基础。根据本实验室获得的花生丛枝植原体免疫膜蛋白基因序列设计特异性引物Imp-F/Imp-R,通过PCR扩增获得花生丛枝植原体免疫膜蛋白基因,大小519 bp,编码蛋白含有172个氨基酸残基,与SPWB膜蛋白的核苷酸差异一个碱基,氨基酸序列相同。另外与WBDL膜蛋白的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为79.8%和70.2%。对其进行系统发育树分析;初步分析imp基因编码蛋白的跨膜区和疏水区。分析结果表明:花生丛枝植原体免疫膜蛋白C端有一跨膜锚定区,N端主要为膜内亲水区,没有前导信号序列。预测花生丛枝植原体免疫膜蛋白是一类C端跨膜的植原体免疫膜蛋白。将imp基因克隆到带有λcI基因的pBT质粒上,构建诱饵载体pBT-Imp,并通过IPTG诱导表达,western blot检测和自激活检验对其进行检测。结果显示:所构建的诱饵载体pBT-Imp可用于细菌双杂交的进一步实验。
关键词
花生丛枝植原体
免疫膜蛋白
细菌双杂交
诱饵载体
Keywords
peanut
witches
＇
broom
phytoplasma
immunodominant
membrane
protein
Bacterio
Match
Ⅱ
two-hybrid
system
bait
plasmid
construction
分类号
Q349.53 [生物学—遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南花生丛枝植原体secY基因序列分析及结构预测
万琼莲
蔡红
杨子祥
王连春
陈海如
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
8
下载PDF
职称材料
2
花生丛枝植原体免疫膜蛋白基因克隆及细菌双杂交诱饵质粒构建
杨文君
张雨良
王健华
余乃通
林湛松
刘志昕
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2011
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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