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RFX5调控原钙粘蛋白α基因簇的表达 被引量:7
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作者 王娜 甲芝莲 吴强 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期760-774,共15页
基因的表达调控与基因组在细胞核内的三维空间架构相辅相成,原钙粘蛋白(protocadherin,Pcdh)基因簇在大脑发育中起到关键作用,可以作为研究基因表达调控机制的模式基因。转录因子RFX5(regulatory factor x 5)是翼螺旋家族(winged HLH fa... 基因的表达调控与基因组在细胞核内的三维空间架构相辅相成,原钙粘蛋白(protocadherin,Pcdh)基因簇在大脑发育中起到关键作用,可以作为研究基因表达调控机制的模式基因。转录因子RFX5(regulatory factor x 5)是翼螺旋家族(winged HLH family)的成员,其蛋白由寡聚化结构域、DNA结合域、螺旋结构域和激活域组成,在调控免疫系统的主要组织相容性复合物Ⅱ类(major histocompatibility complex classⅡ,MHCⅡ)的表达中起着至关重要的作用。本研究发现RFX5与CTCF在全基因组上结合的位点有部分重叠,利用CRISPR/Cas9 DNA大片段编辑技术,构建了RFX5基因缺失的HEC-1-B细胞系。通过RNA-seq实验,发现RFX5敲除能够显著升高Pcdhα6、Pcdhα12、Pcdhαc2的表达水平。通过ChIP-nexus实验,发现敲除RFX5导致染色质架构蛋白CTCF和cohesin在原钙粘蛋白α基因簇处的结合增加。最后,染色质构象捕获QHR-4C实验发现Pcdhα6、Pcdhα12启动子与远端增强子HS5-1的染色质远距离相互作用增强。上述研究表明RFX5蛋白可能通过调控染色质高级结构影响原钙粘蛋白α基因簇的表达,为未来进一步探索RFX5的功能提供了参考。 展开更多
关键词 RFX5 pcdh CTCF COHESIN CRISPR/Cas9
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Has_circ_0065901通过竞争性吸附miR-197-3p促进 PCDH 10表达抑制宫颈癌进展的机制研究
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作者 热汗古丽·库尔班 夏提古丽·斯坎旦尔 潘静 《标记免疫分析与临床》 CAS 2022年第6期971-980,1046,共11页
目的本研究以has_circ_0065901为研究对象,探讨其在宫颈癌中的分子机制。方法本研究共纳入30对取自新疆医科大学第二附属医院2019年1月至2020年12月患者,对其未经化疗或放疗的宫颈癌组织和癌旁组织进行分析。根据基因表达综合(GEO)数据... 目的本研究以has_circ_0065901为研究对象,探讨其在宫颈癌中的分子机制。方法本研究共纳入30对取自新疆医科大学第二附属医院2019年1月至2020年12月患者,对其未经化疗或放疗的宫颈癌组织和癌旁组织进行分析。根据基因表达综合(GEO)数据库(GSE102686)分析发现了异常表达的环状RNA(circRNAs)。通过靶向预测数据库(Targetscan)发现has_circ_0065901的靶向微小RNA(miRNA)是miR-197-3p。通过TargetScan和癌症基因组图谱(TCGA)数据库发现原钙黏蛋白10(PCDH 10)是miR-197-3p的靶基因之一。此外,荧光素酶报告基因测定证实了靶标关系。采用荧光定量PCR(qRT-PCR)和免疫印迹法(WB)定量测定has_circ_0065901、miR-197-3p和PCDH 10的表达。利用细胞计数试剂盒(CCK-8)、流式细胞仪和细胞迁移检测细胞的增殖能力和迁移能力。最后通过体内裸鼠成瘤实验对其进行验证。结果发现在宫颈癌组织细胞中has_circ_0065901表达下调并能够抑制肿瘤细胞增殖和迁移,且差异具有统计学意义(P<0.05)。进一步检测发现has_circ_0065901的靶基因miR-197-3p在宫颈癌中高表达且能够促进肿瘤增殖和迁移(P<0.05)。此外,PCDH 10在宫颈癌组织及细胞中低表达,过表达PCDH 10能够显著抑制肿瘤细胞增殖和迁移且差异具有统计学意义(P<0.05)。双荧光素酶报告基因检测验证has_circ_0065901、miR-197-3p及PCDH 10三者之间的靶向关系且差异均存在统计学意义(P<0.05)。结论Has_circ_0065901能够竞争性吸附miR-197-3p,通过调节PCDH 10的表达来抑制细胞的增殖和迁移。 展开更多
关键词 宫颈癌 Has_circ_0065901 miR-197-3p pcdh 10
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PCDH 10基因启动子区高甲基化在结肠癌阶段性发生及进展中的作用
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作者 刘美玲 杨帆 +4 位作者 李冯锐 包乌仁吐亚 刘扬 吴海荣 杨占君 《包头医学院学报》 CAS 2015年第7期1-2,11,共3页
目的:本研究通过检测结肠癌组织中PCDH 10基因启动子区Cp G岛甲基化状态,探讨PCDH 10基因启动子区异常甲基化在结肠癌的阶段性发生及进展中的作用。方法:采用甲基化特异性聚合酶链式反应(methylation-specific polymerase chain reactio... 目的:本研究通过检测结肠癌组织中PCDH 10基因启动子区Cp G岛甲基化状态,探讨PCDH 10基因启动子区异常甲基化在结肠癌的阶段性发生及进展中的作用。方法:采用甲基化特异性聚合酶链式反应(methylation-specific polymerase chain reaction,MSPCR)检测56例结肠癌及癌旁结肠组织、15例正常结肠组织中PCDH 10基因启动子区Cp G岛甲基化的状态,同时分析其与结肠癌临床特征之间的联系。结果:结肠癌、癌旁结肠组织及正常结肠组织中PCDH 10基因启动子区Cp G岛异常甲基化率分别为57.1%(32/56)、10.7%(6/56)和0%,三组之间比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。PCDH 10基因启动子区Cp G岛甲基化状态与结肠癌的临床分期、结肠癌的分化程度以及淋巴结转移显著相关(P<0.05)。结论:PCDH 10基因启动子区异常甲基化是结肠癌组织区别于正常结肠组织的分子机制之一,可能在结肠癌的阶段性发生、发展中起着关键的作用。PCDH 10基因启动子区Cp G岛甲基化可能成为一种新的结肠癌肿瘤标志物。 展开更多
关键词 结肠癌 甲基化 pcdh 10基因
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原钙黏蛋白10(PCDH10)抑制BXPC-3胰腺癌细胞的增殖以及侵袭和迁移 被引量:10
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作者 邱禅 卜小娜 +1 位作者 胡丹 姜政 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期163-167,172,共6页
目的探讨原钙黏蛋白10(PCDH10)在胰腺癌细胞株中的表达情况以及生物学功能。方法利用反转录PCR检测PCDH10在CAPAN-1、PANC-1、ASPC-1、BXPC-3胰腺癌细胞以及HPDE6-C7人正常胰腺导管上皮细胞的表达情况。将质粒pc DNA3.1-PCDH10与质粒pc ... 目的探讨原钙黏蛋白10(PCDH10)在胰腺癌细胞株中的表达情况以及生物学功能。方法利用反转录PCR检测PCDH10在CAPAN-1、PANC-1、ASPC-1、BXPC-3胰腺癌细胞以及HPDE6-C7人正常胰腺导管上皮细胞的表达情况。将质粒pc DNA3.1-PCDH10与质粒pc DNA3.1-vector通过脂质体转染至BXPC-3人胰腺癌细胞,转染后通过反转录PCR检测BXPC-3细胞中PCDH10 mRNA的水平、Western blot法检测其蛋白水平;CCK-8法和克隆形成实验检测细胞增殖情况,膜联蛋白Ⅴ-碘化丙啶双标记结合流式细胞术检测细胞凋亡,Transwell^(TM)侵袭和迁移实验、划痕实验检测BXPC-3细胞的侵袭和迁移。结果与正常胰腺导管上皮细胞相比较,PCDH10在CAPAN-1、PANC-1、BXPC-3胰腺癌细胞中表达明显下调。反转录PCR及Western blot法检测结果表明,转染pc DNA3.1-PCDH10的BXPC-3实验组细胞PCDH10表达明显高于转染pc DNA3.1-vector的对照组细胞。与对照组相比,过表达PCDH10后,BXPC-3细胞的增殖速度明显降低、克隆形成数明显减少;细胞凋亡率明显增加,细胞的侵袭、迁移能力明显降低。结论 PCDH10在胰腺癌细胞中表达下调,过表达PCDH10能够明显抑制BXPC-3胰腺癌细胞的增殖、侵袭和迁移能力,并且诱导BXPC-3细胞凋亡。 展开更多
关键词 pcdh10 胰腺癌 转染 增殖 凋亡 侵袭 迁移
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儿童热性惊厥/热性惊厥附加症临床特点及其热点基因 被引量:6
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作者 原子凯 杜丽君 +4 位作者 付晓莹 牛菲 闫婷 李晓媛 贾利芳 《山西医科大学学报》 CAS 2023年第1期129-134,共6页
目的通过对热性惊厥(FS)/热性惊厥附加症(FS^(+))患儿临床特点及其热点基因筛查,探讨其基因谱并为预后评估及精准治疗奠定基础。方法选取109例首发年龄小、频繁FS/FS^(+)患儿进行热敏感相关癫痫基因检测,观察其预后与基因的相关性。结果... 目的通过对热性惊厥(FS)/热性惊厥附加症(FS^(+))患儿临床特点及其热点基因筛查,探讨其基因谱并为预后评估及精准治疗奠定基础。方法选取109例首发年龄小、频繁FS/FS^(+)患儿进行热敏感相关癫痫基因检测,观察其预后与基因的相关性。结果109例中筛查出20例涉及10种致病性基因突变,其中SCN1A突变8例,PCDH19突变3例,GABRB3突变2例,GABRG2、ASAH1、ADGRV1、CDKL5、GLB1、ST3GAL5、MEF2C基因突变各1例。9例转变为热敏感癫痫,其中Dravet综合征(Dravet syndrome,DS)3例,FS^(+)伴失神及FS^(+)伴肌阵挛各1例,PCDH19基因相关癫痫3例,Rolandic癫痫(运动性癫痫)1例。结论FS/FS^(+)与多个基因突变相关,SCN1A是其主要热点基因,其次是PCDH19和GABRB3基因。 展开更多
关键词 热性惊厥 热性惊厥附加症 基因突变 SCN1A pcdh19
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原钙黏蛋白19基因相关癫痫的遗传特点及临床表型谱研究 被引量:10
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作者 刘爱杰 许小菁 +8 位作者 孙丹 曾琦 杨小玲 杨志仙 吴晔 刘晓燕 姜玉武 吴希如 张月华 《癫痫杂志》 2017年第4期283-291,共9页
目的分析原钙黏蛋白19(X-linked protocadherin 19,PCDH19)基因相关癫痫的遗传学特点及临床表型谱。方法对2005年2月-2017年4月在北京大学第一医院儿科及武汉市儿童医院神经内科确诊的41例(女39例,男2例)PCDH19基因相关癫痫患儿及家系... 目的分析原钙黏蛋白19(X-linked protocadherin 19,PCDH19)基因相关癫痫的遗传学特点及临床表型谱。方法对2005年2月-2017年4月在北京大学第一医院儿科及武汉市儿童医院神经内科确诊的41例(女39例,男2例)PCDH19基因相关癫痫患儿及家系受累成员的临床特点进行总结。采用Sanger测序或靶向捕获二代测序(Next generation sequencing,NGS)和多重连接依赖的探针扩增技术(Multiple ligation-dependent probe amplification,MLPA)筛查PCDH19突变。结果41例先证者中,测序发现40例携带PCDH19基因突变,MLPA发现1例为整个PCDH19基因缺失。2例男性患儿经NGS检测为PCDH19突变嵌合体,突变等位基因占比分别为85%和33%;39例女性患儿中,19例为遗传性突变,20例为新生突变。女性携带突变者外显率为90%(53/59)。12例半合子父亲和1例嵌合体父亲均无抽搐病史。突变携带者表型包括癫痫伴智力低下、Dravet综合征、热性惊厥,少数女性携带者表型正常。即使在同一家系内,携带相同PCDH19突变的女性表型具有异质性。46例PCDH19突变阳性患者(41例先证者及5例家系受累成员)的临床特点:起病中位年龄为11个月(4~42个月),病程中全面强直阵挛发作(Generalized tonic clonic seizures,GTCSs)占87.0%(40/46),局灶性发作占69.6%(32/46),肌阵挛发作(6/46),不典型失神(3/46)和失张力发作(1/46)少见。丛集性发作见于所有患者(46/46),80.4%发作具有热敏感的特点(37/46),仅3例曾有发热诱发的癫痫持续状态,76%有不同程度的智力损害(35/46),少数有孤独症样表现(7/46,15.2%)。结论 PCDH19基因突变可为遗传性突变或新生突变,受累者以女性为主,少数男性嵌合体可发病或无症状。PCDH19基因相关癫痫具有外显率不全和表型异质性,丛集性发作和热敏感为其主要临床特点。 展开更多
关键词 癫痫 pcdh19基因 突变 嵌合体
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原钙黏蛋白15基因多态性与职业人群噪声性听力损失易感性的关系分析 被引量:12
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作者 徐相蓉 杨秋月 +10 位作者 焦洁 郑玉新 何丽华 余善法 谷桂珍 陈国顺 周文慧 吴辉 李艳红 张焕玲 张增瑞 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期20-26,共7页
目的探讨职业人群噪声性听力损失(NIHL)易感性与原钙黏蛋白15(PCDH15)基因单核苷酸多态性(SNPs)之间的关联。方法采用巢式病例.对照研究方法,从2006年1月1日起,以中国河南省某钢铁企业炼钢和轧钢车间的7445名接触噪声作业工人... 目的探讨职业人群噪声性听力损失(NIHL)易感性与原钙黏蛋白15(PCDH15)基因单核苷酸多态性(SNPs)之间的关联。方法采用巢式病例.对照研究方法,从2006年1月1日起,以中国河南省某钢铁企业炼钢和轧钢车间的7445名接触噪声作业工人为队列研究的源人群,随访至2015年12月31日,筛选其中双耳高频平均听阈≥40dB(A)定义为病例组,共394例;双耳高频平均听阈〈35dB(A)且双耳平均语频425dB(A)定义为对照组,共721名。对所有研究对象进行健康检查和问卷调查。采用SNPscan^TM多重SNP分型试剂盒对单核苷酸多态性位点进行分型,采用多元非条件logistic回归模型分析加性模型下病例、对照组不同单个位点与NIHL发病的相关性。采用多因素非条件logistic回归模型分析病例组、对照组人群中PCDH15基因不同位点SNP与NIHL发病之间的相关性。结果纳入调查对象的年龄为(40.5±8.3)岁,接噪工龄肘(P25,P75)为[21.1(9.1,27.3)1年,接触噪声的范围最小值.最大值为80.1—98.8dB(A),累计噪声暴露量(CNE)的最小值~最大值为86.6—111.2dB(A)·年。研究发现,PCDH15基因rs11004085位点的TT、CT和CC基因型分布在病例组和对照组的差异有统计学意义(P=0.049),病例组分别为370例(93.9%)、24例(6.1%)和0例(0),对照组分别为694例(96.3%)、26例(3.6%)和1例(0.1%)。在调整吸烟、饮酒、高血压、身高和CNE后,与1TT基因型相比,个体携带CC/CT基因型发生NIHL的0R(95%CI)为1.90(1.06—3.40)。分别按噪声暴露水平和CNE分层分析后发现,当噪声暴露水平〉85dB(A)时,与AA基因型相比,rs10825113位点的GA/GG基因型发生NIHL的0R(95%CI)为2.63(1.12~6.14)。以CNE分层后,发现在CNE≤98dB(A)·年时,与TT基因型相比,rs11004085位点的CC/ 展开更多
关键词 噪声 职业性 病例对照研究 噪声性听力损失 基因多态性 pcdh15
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miR-107靶向PCDH17表达调控EMT通路抑制胃癌细胞迁移、侵袭的分子机制 被引量:9
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作者 于志红 张娟 刘培民 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2020年第7期1508-1513,共6页
目的 探讨微小RNA(miR)-107靶向原钙黏蛋白(PCDH)-17调控EMT通路影响胃癌细胞迁移、侵袭的作用机制.方法 采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测miR-107、PCDH17 mRNA在胃癌组织中表达;双荧光素酶报告基因系统检测miR-107对PCDH17转录活性... 目的 探讨微小RNA(miR)-107靶向原钙黏蛋白(PCDH)-17调控EMT通路影响胃癌细胞迁移、侵袭的作用机制.方法 采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测miR-107、PCDH17 mRNA在胃癌组织中表达;双荧光素酶报告基因系统检测miR-107对PCDH17转录活性的影响;胃癌MKN-28细胞转染pcDNA-PCDH17或siRNA-PCDH,Transwell迁移及侵袭实验检测PCDH17的表达对MKN-28细胞迁移及侵袭能力的影响;Western印迹检测PCDH17的表达对EMT通路的蛋白表达水平的影响.miR-107过表达验证细胞迁移及侵袭.结果 miR-107在胃癌组织中高表达,PCDH17在胃癌组织中低表达;过表达PCDH17后,细胞迁移及侵袭能力明显降低,E-Cadherin表达水平明显升高,而N-Cadherin、Vimentin表达水平明显降低;抑制PCDH17表达后,细胞迁移及侵袭能力明显增强,E-Cadherin表达水平明显降低,而N-Cadherin、Vimentin表达水平明显升高;双荧光素酶报告基因系统检测结果 显示,miR-107可直接调控PCDH17的转录活性;miR-107可通过负向调控PCDH17而促进EMT转化进而增强胃癌细胞迁移及侵袭能力.结论 miR-107靶向PCDH17表达从而调控胃癌细胞迁移及侵袭能力,其可能通过激活EMT通路而发挥作用. 展开更多
关键词 miR-107 原钙黏蛋白(pcdh)17 胃癌 上皮-间充质转化(EMT) 迁移 侵袭
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结直肠癌组织中PCDH10、RASSF1A基因启动子甲基化状态 被引量:9
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作者 李沫 颜登国 刘杰麟 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期456-459,共4页
目的 检测结直肠癌(CRC)组织中原钙黏素蛋白10 (PCDH10)基因和Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子区的甲基化状态,探讨其与CRC发生发展的关系.方法 选取2007至2010年在贵州医科大学附属医院行手术治疗的75例CRC患者的肿瘤组织... 目的 检测结直肠癌(CRC)组织中原钙黏素蛋白10 (PCDH10)基因和Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子区的甲基化状态,探讨其与CRC发生发展的关系.方法 选取2007至2010年在贵州医科大学附属医院行手术治疗的75例CRC患者的肿瘤组织,应用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测CRC组织及相应癌旁正常组织中PCDH10和RASSF1A基因启动子区的甲基化情况.采用x2检验分析PCDH10和RASSF1A甲基化的表达率及其与临床病理特征的关系.结果 PCDH10基因在CRC组织中的甲基化率为58.7% (44/75),明显高于癌旁组织的22.7%(17/75)(P<0.01);PCDH10甲基化与CRC患者的年龄、性别、病灶部位、Dukes分期、有无淋巴结转移等均无相关性(均P>0.05).RASSF1A基因在CRC组织中的甲基化率为64.6% (42/65),明显高于癌旁组织的15.4% (10/65) (P <0.01),RASSF1A甲基化与CRC患者的年龄、性别、病灶部位均无相关性(均P >0.05),CRC Dukes高分期和淋巴结转移患者RASSF1A甲基化率高[92.9% (26/28)比43.2%(16/37),92.9% (26/28)比43.2% (16/37),均P<0.05].结论 CRC组织中PCDH10、RASSF1A基因呈高甲基化状态,可能是CRC发生机制之一.高分期的CRC具有更高的RASSF1A基因甲基化率,提示RASSF1A基因甲基化还可能与CRC的发展有关. 展开更多
关键词 直肠肿瘤 DNA甲基化 基因 pcdh10 基因 RASSF1A
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PCDH19基因变异导致女性癫痫患儿的临床特点 被引量:9
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作者 陈奕 杨小玲 +8 位作者 刘爱杰 孙丹 杨莹 张静 陈娇阳 杨志仙 姜玉武 吴希如 张月华 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期857-862,共6页
目的分析PCDH19基因变异导致女性癫痫患儿的临床特点。方法回顾性总结分析2007年10月至2018年12月在北京大学第一医院儿科收集的PCDH19基因变异阳性的60例女性癫痫患儿临床资料,对其临床表现、辅助检查和治疗预后进行总结。结果60例PCD... 目的分析PCDH19基因变异导致女性癫痫患儿的临床特点。方法回顾性总结分析2007年10月至2018年12月在北京大学第一医院儿科收集的PCDH19基因变异阳性的60例女性癫痫患儿临床资料,对其临床表现、辅助检查和治疗预后进行总结。结果60例PCDH19基因变异的女性患儿起病年龄为11(4~42)月龄。病程中局灶性发作47例(78%),全面强直阵挛发作30例(50%),其他少见发作类型包括不典型失神发作、肌阵挛发作、阵挛发作、强直发作和失张力发作;24例(40%)有≥2种癫痫发作类型;7例(12%)有癫痫持续状态;47例(78%)患儿发作有热敏感性,所有患儿均有丛集性发作特点。发作间期脑电图监测到45例有癫痫样放电,其中局灶性放电22例(49%),多灶性放电12例(27%),广泛性放电2例(4%),既有局灶性又有广泛性放电9例(20%);30例脑电图监测到临床发作,其中局灶性发作22例,全面强直阵挛发作8例,强直发作3例,肌阵挛发作继发全面强直阵挛发作1例,4例监测到2种发作类型。末次随访年龄1岁3月龄~22岁1月龄,17例(28%)2年以上无发作。起病前57例发育正常,3例有语言发育落后;起病后38例(63%)有不同程度的智力障碍,36例(60%)有语言落后,10例(17%)步态不稳。17例(28%)患儿合并有孤独症样表现,33例(55%)合并有学习困难、性格行为或情绪异常。抗癫痫药物有效率分别为丙戊酸钠65%(33/51),左乙拉西坦63%(27/43),托吡酯59%(20/34)。结论PCDH19基因变异导致女性癫痫患儿以丛集性发作为特征,局灶性发作常见,多有热敏感性,脑电图以局灶性癫痫样放电为主,有不同程度智力或运动障碍,可合并孤独症谱系疾病,以丙戊酸钠和左乙拉西坦有效率较高。 展开更多
关键词 癫痫 预后 女性 局灶性发作 基因 pcdh19
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非小细胞肺癌组织PCDH9和cyclin D1表达及其临床意义分析 被引量:7
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作者 刘换新 白义凤 +1 位作者 吴晓霞 郭琳琅 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2014年第19期1508-1512,共5页
目的探讨原钙黏附蛋白9(protocadherin 9,PCDH9)和细胞周期蛋白D1(cyclin D1)的表达与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)生物学行为的相关性及其临床意义。方法收集2007-08-01-2013-05-31武警广东总队医院手术切除的NSCL... 目的探讨原钙黏附蛋白9(protocadherin 9,PCDH9)和细胞周期蛋白D1(cyclin D1)的表达与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)生物学行为的相关性及其临床意义。方法收集2007-08-01-2013-05-31武警广东总队医院手术切除的NSCLC组织337例,QRT-PCR及免疫组织化学染色方法分别检测其中临床资料完整的142例肿瘤及癌旁组织中PCDH9及cyclin D1基因和蛋白表达,分析其相关性及临床意义。结果在142例肺癌组织中,PCDH9的表达为0.386±0.008,低于癌旁组织的0.994±0.012,差异有统计学意义,t=5.748,P<0.001;cyclin D1在癌组织中的表达为7.392±0.079,较癌旁组织的1.004±0.007明显增高,差异有统计学意义,t=13.219,P=0.003。同一患者组织标本中的PCDH9与cyclin D1的表达呈负相关,r=-0.478,P=0.009。PCDH9及cyclin D1蛋白的表达与患者性别、年龄和组织来源无关,P值均>0.05;而与肿瘤的分期、转移、对化疗药物的敏感性及总生存时间相关,差异有统计学意义,P值均<0.05;PCDH9高表达患者的中位生存时间较低表达者明显延长,差异有统计学意义,χ2=68.051,P<0.001,cyclin D1高表达患者的中位生存时间较低表达者缩短,差异有统计学意义,χ2=74.436,P<0.001。结论 PCDH9及cyclin D1表达可能与NSCLC发生发展及转移相关,并可作为评估NSCLC恶性生物学行为及预后的参考指标。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 NSCLC pcdh9 CYCLIN D1 免疫组织化学
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胃癌中PCDH8基因启动子甲基化状态及其临床意义 被引量:7
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作者 张丹杰 李少民 +1 位作者 姜建涛 张晋 《现代肿瘤医学》 CAS 2018年第15期2417-2421,共5页
目的:本研究旨在明确胃癌中PCDH8表达水平以及PCDH8基因启动子甲基化情况,分析PCDH8的甲基化差异表达与胃癌临床病理因素的关系。方法:我们通过RT-PCR、Western blot方法检测了65例胃癌组织标本和30例正常胃黏膜标本中PCDH8 mRNA及蛋白... 目的:本研究旨在明确胃癌中PCDH8表达水平以及PCDH8基因启动子甲基化情况,分析PCDH8的甲基化差异表达与胃癌临床病理因素的关系。方法:我们通过RT-PCR、Western blot方法检测了65例胃癌组织标本和30例正常胃黏膜标本中PCDH8 mRNA及蛋白的表达,然后分析了其在不同组织中的表达差异。并运用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测PCDH8基因启动子区在不同组织中的甲基化情况,并分析其基因启动子区甲基化情况与胃癌临床病理因素的关系。结果:PCDH8 mRNA、蛋白在正常胃组织中为阳性表达,而在胃癌组织中则表达缺失或下调,其差异有统计学意义(P<0.05)。PCDH8甲基化情况在胃癌组织(55.38%,36/65)与正常组织(0%,0/65)、癌旁组织(41.54%,27/65)与正常组织间存在显著差异(P<0.05)。65例胃癌患者中,其甲基化情况与胃癌患者性别、年龄、肿瘤大小、远处转移及TNM分期均无关(P>0.05)。多因素回归分析结果表明,淋巴结转移为PCDH8基因启动子区甲基化的独立因素(P=0.026,95%CI 1.12~86.84)。结论:PCDH8甲基化及表达情况与胃癌患者肿瘤分化程度及淋巴结转移有关。PCDH8在调节胃癌的发生和转移过程中具有重要作用,它有可能作为胃癌的抑癌基因而发挥作用,并作为标记物对胃癌的诊断、预后判定及治疗提供研究方向。 展开更多
关键词 胃癌 pcdh8基因 DNA甲基化
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PCDH10基因对子宫内膜腺样癌细胞抑制作用的研究 被引量:6
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作者 江曼 叶元 +1 位作者 杨一华 江艳 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2015年第4期526-528,共3页
目的:研究PCDH10基因诱导子宫内膜腺样癌细胞凋亡的作用及相关机制。方法:将pc DNA3.1(+)PCDH10及pc DNA3.1(+)空质粒分别瞬时转染入子宫内膜腺样癌细胞系,通过RT-PCR和实时荧光定量PCR检测PCDH10的表达;以MTT和细胞计数测定转染后细胞... 目的:研究PCDH10基因诱导子宫内膜腺样癌细胞凋亡的作用及相关机制。方法:将pc DNA3.1(+)PCDH10及pc DNA3.1(+)空质粒分别瞬时转染入子宫内膜腺样癌细胞系,通过RT-PCR和实时荧光定量PCR检测PCDH10的表达;以MTT和细胞计数测定转染后细胞的增殖能力和生长数量;应用流式细胞术检测细胞的凋亡率和细胞周期。结果:子宫内膜癌细胞转染PCDH10后,细胞的PCDH10表达升高;细胞计数和MTT试验显示转染PCDH10后的子宫内膜癌细胞的生长数量明显减少,细胞增殖受抑制(P<0.05);流式细胞凋亡率实验结果显示转染PCDH10后的子宫内膜癌细胞早期凋亡率增加;流式周期分析显示转染后的细胞G1期阻滞。结论:PCDH10基因在子宫内膜腺样癌的发生发展中起抑制作用;PCDH10基因促进对子宫内膜腺样癌细胞早期凋亡,使细胞在G1期受阻滞。 展开更多
关键词 子宫内膜腺样癌 pcdh10 细胞凋亡 细胞周期
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一对常染色体隐性遗传性聋夫妻的遗传学及产前诊断分析
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作者 刘向科 陆祖耀 +4 位作者 刘丽娜 郝胜菊 惠玲 张钏 李富萍 《听力学及言语疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期297-301,共5页
目的对一对常染色体隐性非综合征型聋备孕夫妻患者进行基因分析,以明确其可能的遗传学病因,并为其提供产前诊断。方法应用遗传性听力损失Panel对先证者进行基因分析,应用Sanger测序法对可疑致病位点进行验证,孕妇18周采集羊水后进行产... 目的对一对常染色体隐性非综合征型聋备孕夫妻患者进行基因分析,以明确其可能的遗传学病因,并为其提供产前诊断。方法应用遗传性听力损失Panel对先证者进行基因分析,应用Sanger测序法对可疑致病位点进行验证,孕妇18周采集羊水后进行产前基因诊断。结果妻子检测到常染色体隐性遗传性聋3型相关基因MYO15A c.10419_10423delCAGCT/c.10294_10308delCCTTGCATCCTTGCC复合杂合变异,分别遗传自其父母。丈夫检测到常染色体隐性遗传性聋77型相关基因LOXHD1 c.6388C>T/exon 33-38 del复合杂合变异,分别遗传自其父母。胎儿羊水检测到母源MYO15A c.10294_10308del CCTTGCATCCTTGCC杂合变异与父源LOXHD1 exon 33-38 del杂合变异,同时还检测到父源CDH23 c.6693delT杂合变异与母源PCDH15 c.5048_5051dupAGAA杂合变异,这两个杂合变异导致胎儿可能患ID/F型Usher综合征。结论该耳聋夫妻为两个不同的耳聋基因变异所致,胎儿患与该夫妻双方相同耳聋的概率很低,但胎儿患二基因突变引起的耳聋的可能性大。对于双方均为耳聋患者的家庭进行产前诊断时应关注二基因突变导致的耳聋。 展开更多
关键词 MYO15A LOXHD1 CDH23 pcdh15 二基因突变
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PCDH8基因表达对鼻咽癌细胞生物学效应的影响 被引量:6
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作者 石宇良 曾泉 +3 位作者 龙表利 向庭秀 洪苏玲 胡国华 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第14期1455-1458,共4页
目的探讨PCDH8基因表达对鼻咽癌细胞株CNE-1生物学行为的影响。方法采用脂质体介导质粒pcDNA3.1-PCDH8(实验组)与质粒pcDNA3.1(对照组)转染至鼻咽癌细胞株CNE-1,RT-PCR、Western blot检测转染后CNE-1细胞的PCDH8 mRNA及蛋白表达;通过CC... 目的探讨PCDH8基因表达对鼻咽癌细胞株CNE-1生物学行为的影响。方法采用脂质体介导质粒pcDNA3.1-PCDH8(实验组)与质粒pcDNA3.1(对照组)转染至鼻咽癌细胞株CNE-1,RT-PCR、Western blot检测转染后CNE-1细胞的PCDH8 mRNA及蛋白表达;通过CCK-8细胞生长曲线、流式细胞技术、Transwell侵袭实验及CCK-8细胞药物敏感实验,进一步对转染PCDH8基因质粒的细胞株CNE-1的增殖能力、生长周期、细胞侵袭能力及对化疗药物的敏感性进行了分析,并与转染对照质粒的细胞株进行比较。结果 RT-PCR、Western blot检测结果表明转染质粒pcDNA3.1-PCDH8的实验组细胞株中PCDH8 mRNA及蛋白成功表达并明显高于转染质粒pcDNA3.1的对照组细胞株。CCK-8细胞生长曲线结果表明实验组细胞株的生长速度明显低于对照组。流式细胞仪检测结果表明实验组细胞株G0/G1期较对照组增加,S期细胞较对照组减少;Transwell侵袭实验结果表明实验组细胞株侵袭能力明显低于对照组;CCK-8细胞药物敏感性实验结果表明PCDH8基因的高表达能显著提高鼻咽癌细胞株CNE-1对顺铂化疗药物的敏感性。结论 PCDH8基因的表达能降低鼻咽癌细胞的增殖、侵袭能力,延缓细胞分裂周期,提高对顺铂化疗药物的敏感性。 展开更多
关键词 pcdh8 鼻咽癌 CCK-8 Transwell侵袭实验 流式细胞周期实验 顺铂
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TurboID Proximity Labeling of a Protocadherin Protein to Characterize Interacting Protein Complex 被引量:1
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作者 Chenyu Wang Laidong Yu 《American Journal of Molecular Biology》 2023年第4期213-226,共14页
The study of the neuron has always been a fundamental aspect when it came to studying mental illnesses such as autism and depression. The protein protocadherin-9 (PCDH9) is an important transmembrane protein in the de... The study of the neuron has always been a fundamental aspect when it came to studying mental illnesses such as autism and depression. The protein protocadherin-9 (PCDH9) is an important transmembrane protein in the development of the neuron synapse. Hence, research on its protein interactome is key to understanding its functionality and specific properties. A newly discovered biotin ligase, TurboID, is a proximity labeler that is designed to be able to label and observe transmembrane proteins, something that previous methods struggled with. The TurboID method is verified in HEK293T cells and primary cultured mouse cortical neurons. Results have proven the validity of the TurboID method in observing PCDH9-interacting proteins. 展开更多
关键词 TurboID pcdh9 Proximity Labeling Protein Interactome Synapse Development
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白山毛桃根提取物对非小细胞肺癌细胞的抑制效果及机制研究 被引量:4
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作者 赵泽义 陈军堂 王明明 《广西医科大学学报》 CAS 2020年第12期2166-2172,共7页
目的:探讨白山毛桃根提取物对非小细胞肺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响,并探究其潜在分子调控机制。方法:设置白山毛桃根提取物各浓度(0 mg/mL、10 mg/mL、20 mg/mL、40 mg/mL、60 mg/mL)实验组进行MTT实验,观察白山毛桃根提取物对肺癌H... 目的:探讨白山毛桃根提取物对非小细胞肺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响,并探究其潜在分子调控机制。方法:设置白山毛桃根提取物各浓度(0 mg/mL、10 mg/mL、20 mg/mL、40 mg/mL、60 mg/mL)实验组进行MTT实验,观察白山毛桃根提取物对肺癌H1299细胞增殖的影响。根据MTT实验结果,再设置分组为对照组(无白山毛桃根提取物)、白山毛桃根提取物组(浓度40 mg/mL)、白山毛桃根提取物+miR-NC组、白山毛桃根提取物+miR-182-5p组进行实验。采用脂质体法,分别将miRNC、miR-182-5pmimics、anti-miR-NC、anti-miR-182-5p转染至H1299细胞。Transwell检测各组细胞的侵袭和迁移;实时荧光定量PCR(qPCR)检测H1299细胞中miR-182-5pmRNA和PCDH10 mRNA表达水平;蛋白免疫印迹(Western blotting)检测PCDH10蛋白表达;双荧光素酶报告基因检测实验检测荧光活性。结果:各浓度白山毛桃根提取物组细胞抑制率均高于0 mg/mL组,并呈剂量依赖性(P<0.05)。荧光素酶报告基因实验结果显示,miR-182-5p组WT-PCDH10非小细胞肺癌细胞的荧光素酶活性低于miR-NC组(P<0.05);而miR-182-5p组与miR-NC组的MUT-PCDH10荧光素酶活性比较,差异无统计学意义(P>0.05),白山毛桃根提取物组细胞迁移和侵袭数量低于对照组(P<0.05);白山毛桃根提取物组H1299细胞中miR-182-5p mRNA表达低于对照组;PCDH10 mRNA及蛋白表达高于对照组(P<0.05),白山毛桃根提取物组H1299细胞中miR-182-5p表达水平、细胞迁移和侵袭数量低于对照组;白山毛桃根提取物+miR-24-3p组H1299细胞中miR-182-5p表达水平、细胞迁移和侵袭数量高于白山毛桃根提取物+miR-NC组(P<0.05);白山毛桃根提取物组H1299细胞中PCDH10蛋白表达水平、细胞抑制率高于对照组;白山毛桃根提取物+miR-182-5p组H1299细胞中PCDH10蛋白表达水平、细胞抑制率低于白山毛桃根提取物+miR-NC组(P<0.05)。结论:白山毛桃根提取物可抑制非小细胞肺癌H1299细胞增殖、迁移� 展开更多
关键词 白山毛桃根提取物 miR-182-5p pcdh10 非小细胞肺癌 增殖 迁移 侵袭
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circ_LARP4调控miR-135a-5p/PCDH9抑制膀胱癌细胞T24生物学行为
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作者 张萌 张盼 +3 位作者 李令勋 罗成君 晏萧 韦堂墙 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第13期3197-3202,共6页
目的探讨circ_核糖核蛋白(LARP)4对膀胱癌细胞T24增殖、迁移和凋亡的影响及分子机制。方法选取膀胱癌患者的癌组织及癌旁组织,实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测circ_LARP4和miR-135a-5p的表达水平;Western印迹法检测原钙黏蛋白(PC... 目的探讨circ_核糖核蛋白(LARP)4对膀胱癌细胞T24增殖、迁移和凋亡的影响及分子机制。方法选取膀胱癌患者的癌组织及癌旁组织,实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测circ_LARP4和miR-135a-5p的表达水平;Western印迹法检测原钙黏蛋白(PCDH)9蛋白表达;将T24细胞随机分为pcDNA-circ_LARP4组、pcDNA组、anti-miR-135a-5p组、anti-miR-NC组、pcDNA-circ_LARP4+miR-135a-5p组;用四甲基偶氮唑蓝(MTT)法检测细胞增殖抑制率;克隆形成实验检测集落形成数;细胞移动范围采用划痕实验进行检测;采用流式细胞术检测细胞凋亡;双荧光素酶报告实验检测circ_LARP4、miR-135a-5p、PCDH9之间的靶向关系。结果与癌旁组织相比,膀胱癌组织中circ_LARP4和PCDH9蛋白的表达水平显著降低,miR-135a-5p表达水平显著升高(P<0.05)。过表达circ_LARP4或抑制miR-135a-5p表达,PCDH9蛋白表达水平升高,miR-135a-5p表达水平降低,T24增殖抑制率升高,集落形成数减少,迁移距离缩短,细胞凋亡率升高,差异有统计学意义(P<0.05)。过表达miR-135a-5p可逆转circ_LARP4对T24细胞增殖、迁移的抑制和凋亡的诱导作用。circ_LARP4靶向miR-135a-5p,miR-135a-5p靶向PCDH9。结论circ_LARP4通过调控miR-135a-5p/PCDH9轴抑制膀胱癌细胞T24的增殖、迁移,诱导细胞凋亡。 展开更多
关键词 circ_LARP4 miR-135a-5p pcdh9 膀胱癌 增殖 迁移
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PCDH10基因促进多发性骨髓瘤细胞凋亡及机制研究 被引量:4
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作者 李珍 陈建斌 +3 位作者 彭曦 谭栩 杨泽松 黄宗干 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期437-441,共5页
目的探讨PCDH10(protocadherin 10)基因诱导多发性骨髓瘤KM3细胞凋亡的作用及相关机制。方法采用脂质体法将重组质粒pcDNA3.1(+)PCDH10以及pcDNA3.1(+)空质粒稳定转染入人骨髓瘤KM3细胞,以未转染组和转染pcDNA3.1(+)空质粒组作为对照,通... 目的探讨PCDH10(protocadherin 10)基因诱导多发性骨髓瘤KM3细胞凋亡的作用及相关机制。方法采用脂质体法将重组质粒pcDNA3.1(+)PCDH10以及pcDNA3.1(+)空质粒稳定转染入人骨髓瘤KM3细胞,以未转染组和转染pcDNA3.1(+)空质粒组作为对照,通过RT-PCR和Western blot检测PCDH10基因和蛋白的表达,应用MTT法检测PCDH10转染后细胞增殖能力;应用流式细胞仪检测细胞凋亡率;应用透射电镜观察细胞凋亡超微结构;应用Western blot检测凋亡相关蛋白表达水平。结果 PCDH10转染KM3细胞后,PCDH10基因和蛋白表达水平均明显升高。MTT结果显示PCDH10转染后细胞增殖明显受到抑制(P<0.05);流式细胞仪结果显示转染PCDH10基因的KM3细胞凋亡率明显增高(P<0.05);透射电镜下观察,PCDH10转染组细胞可以看到胞质空泡样变,核固缩以及明显的凋亡小体,对照组未见明显异常;Western blot结果显示PCDH10能降低Bcl-2的表达,促进P53、Fas的表达(P<0.05)。结论 PCDH10基因有促进多发性骨髓瘤细胞KM3凋亡作用。 展开更多
关键词 pcdh10 多发性骨髓瘤 细胞凋亡
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PCDH19基因突变相关癫痫的临床和遗传学特点研究 被引量:4
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作者 张晓莉 韩瑞 +5 位作者 牛国辉 李小丽 李肖 董燕 杜开先 贾天明 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2020年第16期1256-1259,共4页
目的回顾性分析11个家系PCDH19基因突变相关癫痫的临床和遗传学特点。方法对2013年3月至2019年7月郑州大学第三附属医院小儿神经内科确诊的11个家系共13例PCDH19基因突变相关癫痫患者的临床表现和基因突变特点进行分析。结果1.PCDH19基... 目的回顾性分析11个家系PCDH19基因突变相关癫痫的临床和遗传学特点。方法对2013年3月至2019年7月郑州大学第三附属医院小儿神经内科确诊的11个家系共13例PCDH19基因突变相关癫痫患者的临床表现和基因突变特点进行分析。结果1.PCDH19基因突变结果:11例先证者中,10例携带PCDH19基因点突变,1例为5号外显子缺失。1例男性患儿为PCDH19基因突变嵌合体,为c.840C>A,变异比例为34.27%。家系分析,11例先证者中5例为遗传性突变,6例为新发突变。5例遗传性突变中3例为父源遗传,父亲为无临床症状的半合子;2例为母源遗传,其中1例为患者,1例为表型正常的携带者。2.临床特点:13例中,女12例,男1例。起病年龄均<2岁,临床表型包括:癫痫伴智力低下9例(其中Dravet综合征3例),癫痫不伴智力低下4例。在同一家系内携带相同PCDH19基因突变的女性表型具有明显异质性,少数女性(2例)可不发病。13例癫痫发作均具有丛集性特点,12例有热敏性特点,仅3例有癫痫持续状态。13例中,仅2例达到2年以上无发作,表现为Dravet综合征的3例先后予6~8种抗癫痫药物治疗,仍有频繁发作。结论PCDH19基因突变相关癫痫受累者以女性为主,少数男性嵌合体可发病,具有明显的表现异质性,丛集性发作和热敏感为其主要临床特点,多伴智力损伤。PCDH19基因突变可为遗传性突变或新生突变,多数为点突变。 展开更多
关键词 癫痫 pcdh19基因 智力低下 突变 嵌合体
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