期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到7篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
系统发生分析软件PAUP和TreePuzzle使用方法介绍 被引量：4
1
作者 王勇 陈克平 姚勤 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第2期818-821,829,共5页
系统发生分析被广泛应用于研究不同生物DNA、蛋白质序列的进化关系。PAUP和TreePuzzle是目前使用较多的系统发生分析软件,但其使用方法较为复杂,不易被初学者掌握。从序列信息模块、序列参数模块、运算命令模块3个方面介绍了PAUP软件的... 系统发生分析被广泛应用于研究不同生物DNA、蛋白质序列的进化关系。PAUP和TreePuzzle是目前使用较多的系统发生分析软件,但其使用方法较为复杂,不易被初学者掌握。从序列信息模块、序列参数模块、运算命令模块3个方面介绍了PAUP软件的使用方法,同时也对TreePuzzle软件的使用和进化树的编辑与注释方法做了简单介绍。 展开更多
关键词 系统发生分析 paup TreePuzzle
下载PDF
基于全基因组序列的新型冠状病毒SARS-CoV-2多算法进化树分析 被引量：3
2
作者 傅奇 庄峙厦 +2 位作者 黄华斌 何少贵 肖玉娟 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1014-1019,共6页
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)作为一种RNA病毒,具有高突变率的特征,自新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发生以来,病毒基因组已出现了一定程度的突变,可以通过进化分析对其进行分类,以辅助分析病毒感染源。由于时间较短,总体突变率仍然较低,利用... 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)作为一种RNA病毒,具有高突变率的特征,自新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发生以来,病毒基因组已出现了一定程度的突变,可以通过进化分析对其进行分类,以辅助分析病毒感染源。由于时间较短,总体突变率仍然较低,利用单一算法构建的进化树结构可靠性不高。本文用Paup、MrBayes和MEGA软件,通过不同算法构建进化树,对目前GenBank中所有的SARS-CoV-2基因组进行了分析。不同算法所得到的多个进化树中,部分序列分支结构相同或相似,且相应的病毒宿主间可能存在交集,通过比较分析多个树之间的相似结构,可为病毒的来源提供参考信息。随着病毒的进化和基因组数据库的不断积累,预计利用多算法构建进化树去筛选相同分枝结构的方法的有效性将逐步提升,可作为感染源分析的参考方法之一。 展开更多
关键词 新型冠状病毒(SARS-CoV-2) COVID-19 进化树 paup MRBAYES MEGA
原文传递
联合使用PAUP和MacClade程序进行支序分析 被引量：2
3
作者 孟凯巴依尔 李枢强 傅金钟 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期59-62,共4页
针对一组数据 ,同时利用MacClade和PAUP两个软件进行系统发育分析 ,是支序系统学前沿学者广泛使用的研究方法。本文主要介绍了PAUP 4 0、MacClade 4 0以及两者联合使用的优势 ,同时介绍了具体的操作方法。
关键词 联合使用 paup MacClade程序 支序分析 系统发育学 分析软件
下载PDF
河南茶藨子属植物表型性状的数量分类 被引量：1
4
作者 王小国 《黑龙江农业科学》 2016年第7期92-96,共5页
为了明确茶藨子属植物种间的亲缘关系及主要分类性状,对河南省10种茶藨子属植物的表型性状进行了数量分类、PAUP系统发育树构建及主成分分析。结果表明:R.maximowiczianum与R.glaciale,R.longiracemosum和R.moupinense,R.burejense和R.a... 为了明确茶藨子属植物种间的亲缘关系及主要分类性状,对河南省10种茶藨子属植物的表型性状进行了数量分类、PAUP系统发育树构建及主成分分析。结果表明:R.maximowiczianum与R.glaciale,R.longiracemosum和R.moupinense,R.burejense和R.alpestre亲缘关系较近,各聚为一类,Bootstrap支持率>50%;主成分分析中前四种主成分占到了总信息量的91.723%,小枝及浆果是否具刺、两性花或单性花、萼片形状、花瓣大小、果实颜色可作为种间分类的主要依据。 展开更多
关键词 茶藨子属 数量分类 paup 主成分分析
下载PDF
石蒜属植物分支系统学分析 被引量：20
5
作者 邓传良 周坚 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期393-399,共7页
基于37个形态学、解剖学、孢粉学和细胞学性状及解剖学性状之外的28个形态学、孢粉学和细胞学性状,分别对石蒜属进行分支系统学分析,试图建立石蒜属种间的系统发育关系。利用PAUP*软件分别构建了最大简约树(MP),所得树的拓扑结构是一致... 基于37个形态学、解剖学、孢粉学和细胞学性状及解剖学性状之外的28个形态学、孢粉学和细胞学性状,分别对石蒜属进行分支系统学分析,试图建立石蒜属种间的系统发育关系。利用PAUP*软件分别构建了最大简约树(MP),所得树的拓扑结构是一致的。同时,基于解剖学9个性状,对石蒜、换锦花、忽地笑、江苏石蒜、长筒石蒜、乳白石蒜、夏水仙、红兰石蒜、安徽石蒜、短蕊石蒜、中国石蒜11个种进行系统发育树构建,其结果也是支持上述系统发育树的。系统发育树结构结果表明,石蒜属16种明显聚为两大类:石蒜、玫瑰石蒜、稻草石蒜和江苏石蒜;广西石蒜、红兰石蒜、换锦花、香石蒜、夏水仙、长筒石蒜、安徽石蒜、中国石蒜、忽地笑、乳白石蒜、短蕊石蒜和陕西石蒜。除换锦花、红兰石蒜及江苏石蒜系统发育位置不同之外,大类群的划分与RAPD指纹图谱基本一致。类群一均属于石蒜亚属(Lycoris亚属)。类群二又可以聚为两小类:广西石蒜、红兰石蒜、换锦花、香石蒜、夏水仙归为一类;长筒石蒜、安徽石蒜、中国石蒜、忽地笑、乳白石蒜、短蕊石蒜和陕西石蒜归为一类。前一子类群除广西石蒜外,都属于整齐花亚属(Symmanthus亚属)。后一子类群除长筒石蒜与安徽石蒜外,均属于石蒜亚属(Lycoris亚属)。因此,花冠整齐与否是一个重要的分类特征,但作为石蒜属植物亚属的划分依据,没有得到本研究支持。而在本文中,雄蕊与花被片的位置关系可以作为大分类群划分依据,能否依此来对石蒜属植物亚属进行划分,仍需探讨。另外研究表明叶微形态特征在研究种间亲缘关系时,具有一定的作用。而在种间亲缘关系鉴定时,出叶期不应成为重要的依据。同时研究还表明中国石蒜与忽地笑具有非常近的亲缘关系,与形态学研究一致。 展开更多
关键词 石蒜属 植物分支系统学 植物形状 分子系统发育树 气孔密度
下载PDF
中国叩甲科昆虫12亚科的支序分类研究 被引量：5
6
作者 江世宏 卓晨雷 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期329-332,共4页
选取中国叩甲科昆虫 12亚科间的 13个特征 ,经量化处理并判定特征的极化方向后得到数据矩阵 ,再利用计算机支序分类软件PAUP 4.0进行数据处理 ,得出中国叩甲科昆虫 12亚科的谱系图。研究结果表明 :叩甲科可明显地划分为 3个自然类群 ,... 选取中国叩甲科昆虫 12亚科间的 13个特征 ,经量化处理并判定特征的极化方向后得到数据矩阵 ,再利用计算机支序分类软件PAUP 4.0进行数据处理 ,得出中国叩甲科昆虫 12亚科的谱系图。研究结果表明 :叩甲科可明显地划分为 3个自然类群 ,它们的亲缘关系可表示为 (7,8) ,(((2 ,4) 3) 9) ,(((11,12 ) 10 ) 5 (1,6 ) ) ,其中齿胸叩甲亚科 (7)与露唇叩甲亚科 (8) ,槽缝叩甲亚科 (2 )与萤叩甲亚科 (4) ,小叩甲亚科 (11)与心盾叩甲亚科(12 ) ,尖鞘叩甲亚科 (1)与异角叩甲亚科 (6 )是 4对姊妹群 ,每对姊妹群中的 2个亚科间亲缘关系最近 ;单叶叩甲亚科 (3)和叩甲亚科 (9)与第 2对姊妹群 (2 ,4) ,梳爪叩甲亚科 (10 )与第 3对姊妹群 (11,12 ) ,胖叩甲亚科 (5 )与第 4对姊妹群 (1,6 )亲缘关系较近 ;齿胸叩甲亚科 (7)与露唇叩甲亚科 (8)是最原始的 1对姊妹群 ,小叩甲亚科 (11)与心盾叩甲亚科 (12 )是最进化的 展开更多
关键词 鞘翅目 支序分类 系统发育 中国 叩甲科 亚科 数据矩阵 paup4.0软件 谱系图
下载PDF
支序分类CLADISTICS在浮游多毛类眼蚕科ALCIOPIDAE系统演化研究中的应用 被引量：2
7
作者 吴宝铃 陆华 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 1993年第1期23-29,共7页
本论文运用支序分类学,借助于计算机技术,详细探讨了浮游多毛类眼蚕科(Alciopidae)九属的系统演化关系,并同前人的进化分类学和数值分类学研究结果进行了比较,对眼蚕科各属的演化途径提出了新的见解。
关键词 浮游多毛类 眼蚕科 支序分类学
下载PDF
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部