期刊文献+
共找到3篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
Understanding the lifestyles and pathogenicity mechanisms of obligate biotrophic fungi in wheat:The emerging genomics era 被引量:6
1
作者 Chunlei Tang Qiang Xu +2 位作者 Mengxin Zhao Xiaojie Wang Zhensheng Kang 《The Crop Journal》 SCIE CAS CSCD 2018年第1期60-67,共8页
Obligate biotrophic fungi cause serious and widespread diseases of crop plants, but are challenging to investigate because they cannot be cultured in vitro. The two economically important groups of biotrophic fungi pa... Obligate biotrophic fungi cause serious and widespread diseases of crop plants, but are challenging to investigate because they cannot be cultured in vitro. The two economically important groups of biotrophic fungi parasitizing wheat are the rust and powdery mildew pathogens, but their obligate biotrophic lifestyles and pathogenicity mechanisms are not well understood at the molecular level. With the advent of next generation sequencing technology, increasing numbers of pathogen genomes are becoming available. Research in plant pathology has entered a new genomics era. This review summarizes recent progress in understanding the biology and pathogenesis of biotrophic fungal pathogens attacking wheat based on pathogen genomics. We particularly focus on the three wheat rust and the powdery mildew fungi in regard to genome sequencing, avirulence gene cloning, effector discovery, and pathogenomics. We predict that coordinated study of both wheat and its pathogens should reveal new insights in biotrophic adaptation, pathogenicity mechanisms,and population dynamics of these fungi that will assist in development of new strategies for breeding wheat varieties with durable resistance. 展开更多
关键词 Common WHEAT Biotrophic FUNGUS PATHOGENICITY pathogenomics Powdery MILDEW RUST
下载PDF
1株多杀性巴氏杆菌的全基因组序列及致病相关基因分析 被引量:4
2
作者 许文博 吴丽梅 +3 位作者 刘鑫 李升 黄复深 李润成 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1858-1869,共12页
通过对多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)CS株全基因组的毒力基因分析,以期从基因组角度了解P.multocida CS的致病性机理。常规方法分离细菌,并进行毒力鉴定。基于二代测序平台对P.multocida CS进行测序,应用比较基因组学方法将其... 通过对多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)CS株全基因组的毒力基因分析,以期从基因组角度了解P.multocida CS的致病性机理。常规方法分离细菌,并进行毒力鉴定。基于二代测序平台对P.multocida CS进行测序,应用比较基因组学方法将其与GenBank中具全基因组来源于不同地域和宿主的P.multocida基因组进行比较分析。结果显示:猪肺疫病料中分离细菌滴鼻感染小鼠,测得其LD_(50)为5×10^(2) CFU·mL^(-1),显示较强毒性。将测序后的P.multocida CS株全基因组信息提交至NCBI,获得登录号SUB11119617。通过对P.multocida CS全基因组序列的分析表明,P.multocida CS株全基因组大小为2599048 bp,G+C含量为39.932%,编码CDs为2580个,占整个基因组长度的69.6%,编码CDs的平均长度为952 bp。此外还有53个tRNA基因和3个rRNA基因。有87.95%的编码CDs可进行COGs功能分类,29个为功能未知基因。利用RaAXML的最大释然法(maximum likelihood,ML)进行系统进化分析发现,P.multocida CS株与1个猪源性、2个牛源血清A型毒株,和1个猪源性D型毒株有较近的亲缘关系。P.multocida CS株含254个毒力相关基因,分为4大类11小类。其中铁摄取系统、黏附系统、分泌系统和双组分调控系统相关的多个基因在不同的毒株(包括血清型)的分布存在多态性。通过对基因出现频率的分析发现,铁摄取系统相关的tbpA和铁复合物外膜受体蛋白基因(iron complex outer membrane receptor protein gene,irp)以及黏附的相关的ppdD和ompA基因在血清A型出现的频率较高,这是否与不同菌株的毒力差异相关有待进一步证实。P.multocida CS的分泌系统由Ⅰ型(hly基因)、Tat型、Sec-SRP型3种类型组成。其中,hlyD基因在不同的血清型的分布频率存在多态性。P.multocida CS株的双组分信号转导系统(TCSs)由16个调节相关基因,12个感应相关基因和2个有hybrid相关基因。这些基因在不同血清型分布的多态性与不同菌� 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌CS株 全基因组序列 致病基因组学 基因多态性
下载PDF
植物青枯菌遗传多样性及致病基因组学研究进展 被引量:40
3
作者 徐进 冯洁 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第14期2902-2909,共8页
植物细菌性青枯病是由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum Yabuuchi et al.)引起的一种世界性重大病害。作为复合种,青枯菌在与寄主长期协同进化过程中,表现出广泛的生态和寄主适应性。Fengan和Prior提出青枯菌演化型分类框架,用以描... 植物细菌性青枯病是由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum Yabuuchi et al.)引起的一种世界性重大病害。作为复合种,青枯菌在与寄主长期协同进化过程中,表现出广泛的生态和寄主适应性。Fengan和Prior提出青枯菌演化型分类框架,用以描述青枯菌种以下的遗传多样性。青枯菌种内表型特征差异的本质是其基因组较其它植物病原细菌更为复杂和更具可塑性。笔者对近期青枯菌遗传多样性和致病基因组学方面的研究进展进行了归纳和讨论。 展开更多
关键词 青枯菌 遗传多样性 演化型 致病基因组学
下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部