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618例小儿重症社区获得性肺炎病原谱及临床特点分析 被引量:27
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作者 黄艳智 孙利伟 +8 位作者 刘宇奇 马英伟 田玉玲 赵艳玲 王利武 姜洪波 崔爱利 张燕 许文波 《中国小儿急救医学》 CAS 2021年第2期111-115,共5页
目的了解长春地区住院重症社区获得性肺炎病原谱及临床特点,为其病原学诊断和针对性治疗提供科学依据。方法2016年1月至2019年12月长春市儿童医院住院的618例临床诊断为重症社区获得性肺炎患儿,采集患儿咽拭子和肺泡灌洗液标本。应用病... 目的了解长春地区住院重症社区获得性肺炎病原谱及临床特点,为其病原学诊断和针对性治疗提供科学依据。方法2016年1月至2019年12月长春市儿童医院住院的618例临床诊断为重症社区获得性肺炎患儿,采集患儿咽拭子和肺泡灌洗液标本。应用病毒分离、细菌培养、飞行时间质谱和PCR/RT-PCR技术检测标本中的核酸和蛋白质谱。结果住院重症社区获得性肺炎患儿男性多于女性。发病高峰年龄段为7~12月龄小儿。发病多集中在冬春季。重症社区获得性肺炎病毒检出率最高,为56.15%(347/618);检出一种病毒病原阳性73.49%(255/347),其中前5位的是呼吸道合胞病毒(27.8%)、甲型流感病毒(23.9%)、乙型流感病毒(16.1%)、鼻病毒(12.2%)和偏肺病毒(10.2%);两种病毒阳性19.88%(69/347);3种病毒阳性4.32%(15/347);4种病毒阳性2.31%(8/347)。非典型微生物感染占29.77%(184/618),其中肺炎支原体感染占95.65%(176/184)。细菌感染17.31%(107/618),以肺炎链球菌(39.25%,42/107)和金黄色葡萄球菌(24.30%,26/107)为主。多种病原混合感染7.61%(47/618),其中肺炎支原体和肺炎链球菌、病毒混合感染分别为40.43%和34.04%。高热、呼吸增快和口周发绀是重症社区获得性肺炎的危险因素(OR值和95%CI分别为7.71和4.56~13.04、2.43和2.02~2.93、3.53和2.56~4.86);病毒混合感染36.96%(34/92)出现心力衰竭、中毒性脑病、心肌损害等并发症;肺炎支原体与其他病原混合感染35.29%出现胸腔积液。结论长春地区重症社区获得性肺炎的病原以病毒为主,呼吸道合胞病毒是优势病原,肺炎支原体次之,细菌病原以肺炎链球菌为主。高热、呼吸增快和口周发绀是重症肺炎的危险因素。多病原混合感染易出现严重并发症。 展开更多
关键词 重症社区获得性肺炎 病原谱 临床特点 儿童
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我国近十年手足口病病原谱及分子流行病学研究进展 被引量:26
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作者 张萌 陈祥鹏 谢正德 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2020年第6期660-664,共5页
手足口病(hand, foot, and mouth disease, HFMD)是世界范围内流行的一种由肠道病毒感染引起的急性传染性疾病。引起中国大陆HFMD的主要病原为肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EV-A71)、柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)... 手足口病(hand, foot, and mouth disease, HFMD)是世界范围内流行的一种由肠道病毒感染引起的急性传染性疾病。引起中国大陆HFMD的主要病原为肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EV-A71)、柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)和柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CV-A6),不同时期不同地区HFMD的病原谱存在差异。近年我国HFMD病原谱发生了较大的变化,这一方面与肠道病毒的流行规律有关,另一方面也可能受近年EV-A71疫苗应用的影响。本文对中国近十年来HFMD的流行状况、病原谱变化及分子流行病学进行综述。 展开更多
关键词 手足口病 病原谱 分子流行病学
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2008~2017年我国深部真菌病原谱及流行特征国内文献系统分析 被引量:25
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作者 何小羊 任秋霞 杨英 《中国真菌学杂志》 CSCD 2018年第4期229-234,共6页
目的了解2008~2017年间我国深部真菌感染病原谱及流行特征。方法通过检索收集中国知网、万方全文数据库中我国深部真菌(侵袭性真菌)感染的医院报道病例相关文献资料,建立病原谱数据库,进行回顾性分析,时间限定为2008年1月至2017年12月... 目的了解2008~2017年间我国深部真菌感染病原谱及流行特征。方法通过检索收集中国知网、万方全文数据库中我国深部真菌(侵袭性真菌)感染的医院报道病例相关文献资料,建立病原谱数据库,进行回顾性分析,时间限定为2008年1月至2017年12月。结果共纳入全国各级医院发表的相关文献464篇,报道感染病例94526例,涉及20多种临床标本,27个感染部位。10年间我国病原真菌谱大致稳定,主要的病原真菌种属有9种,包括念珠菌、曲霉、青霉、隐球菌、毛霉和孢子丝菌等,以念珠菌报道数量最多,占总病例数的91%,其中又以白念珠菌比例最大,占念珠菌属的65%,不过其感染比例10年间降低了10%;呼吸道及肺部是深部真菌感染最频繁的部位;各省行政区种群分布结构相似,气候温暖潮湿的长江中下游及岭南地区是深部真菌感染报道病例最多的地区。结论近10年来,我国深部真菌感染病原真菌主要是念珠菌,其中,以白念珠菌为主,其他菌属的感染比例有增长趋势;报道最多的感染部位是呼吸系统;全国主要病原菌菌种分布结构相似,气候温暖潮湿的长江中下游及岭南地区是主要的发病区。 展开更多
关键词 深部真菌 回顾性分析 病原谱 流行特征
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2017-2018年青岛地区儿童急性上呼吸道感染病毒谱与流行特征 被引量:21
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作者 张凤 史晓燕 +5 位作者 赵丹 杨雯 孙睿 苏志磊 汪照国 高汝钦 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期694-699,共6页
目的了解2017年3月-2018年3月青岛地区儿童急性上呼吸道感染病毒谱与流行特征。方法随机抽选青岛地区符合国家流感监测方案诊断标准的流感监测病例中的儿童流感样病例(influenza-like illness,ILI)作为研究对象,共检测359例。采集患儿... 目的了解2017年3月-2018年3月青岛地区儿童急性上呼吸道感染病毒谱与流行特征。方法随机抽选青岛地区符合国家流感监测方案诊断标准的流感监测病例中的儿童流感样病例(influenza-like illness,ILI)作为研究对象,共检测359例。采集患儿咽拭子,采用多重实时荧光逆转录-聚合酶链反应进行核酸检测的方法,对9种呼吸道病毒进行筛查。结果 359例标本中200例至少有1种病毒检测结果为阳性,阳性率为55.71%(200/359)。其中,阳性最多的是流感病毒B型(Influenza Virus B, IVB)Yamagata亚型29.50%(59/200),其次是肠道病毒(Human Enterovirus, HEV) 15.00%(30/200),呼吸道腺病毒(Adenovirus, AdV) 13.50%(27/200),呼吸道合胞病毒A型(Respiratory Syncytial Virus A, RSVA) 12.50%(25/200),流感病毒A型(Influenza Virus A, IVA) H1N1亚型10.00%(20/200)等。2例3种病毒混合感染,1例4种病毒混合感染。结论 2017年3月-2018年3月9种呼吸道病毒在青岛地区均有流行,IVB Yamagata亚型、HEV、AdV、RSVA亚型、IVA H1N1亚型为主要流行病毒。其中流感病毒、HEV、RSV、偏肺病毒(Human metapneumovirus, HMPV)具有明显的季节性分布。9种病毒在各病毒流行月份存在混合感染。 展开更多
关键词 儿童 急性上呼吸道感染 呼吸道病毒 流行特征
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宝鸡地区小儿急性上呼吸道感染病原的多中心研究 被引量:19
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作者 魏升云 汤淑斌 +2 位作者 李虹 李文君 高改兰 《中国妇幼健康研究》 2012年第3期314-317,共4页
目的探讨小儿急性上呼吸道感染病原学的检测方法及宝鸡地区小儿急性上呼吸道感染的病原谱。方法对宝鸡市5家医院儿科2010年8月至2011年7月小儿急性呼吸道感染病原学多中心调查时收集到的小儿急性上呼吸道感染的病原学检测资料进行汇总... 目的探讨小儿急性上呼吸道感染病原学的检测方法及宝鸡地区小儿急性上呼吸道感染的病原谱。方法对宝鸡市5家医院儿科2010年8月至2011年7月小儿急性呼吸道感染病原学多中心调查时收集到的小儿急性上呼吸道感染的病原学检测资料进行汇总分析。结果5436例小儿急性上呼吸道感染咽拭子超高倍显微镜检结果分析显示阳性率为70.0%,其中细菌20.0%、肺炎支原体或衣原体35.0%、混合感染15.0%,镜检阴性率30.0%。小儿急性上呼吸道感染咽分泌物病原核酸检测结果显示肺炎支原体核酸、EB病毒核酸、呼吸道合胞病毒核酸、柯萨奇病毒A16核酸、肠道病毒7l核酸、肠道病毒普通型阳性率依次为12.1%、23.6%、7.8%、4.3%、0、10.1%,病毒核酸总阳性率为45.8%,阳性率最高的病毒是EB病毒,其次是肠道病毒普通型、呼吸道合胞病毒、柯萨奇病毒A16,各病毒在各年龄段感染率无明确规律,但呼吸道合胞病毒最多见于1岁以内的小儿。1745例小儿急性上呼吸道感染咽拭子肺炎支原体培养阳性率为16.0%。848例小儿急性上呼吸道感染咽拭子细菌培养结果阳性率24.9%,共培养出17种细菌,前6位致病菌为肺炎链球菌12.0%,溶血性链球菌3.5%,肺炎克雷伯杆菌2.9%,卡他莫拉菌2.5%,大肠埃希斯杆菌1.1%,金黄色葡萄球菌0.8%,肺炎链球菌占第1位且为绝对优势致病菌,在5岁以内感染率最高。结论各检测方法可检测病原的种类、敏感性、特异性、时效性不同,所以提倡多方法、多病原的联合检测。多中心联合检测结果显示宝鸡地区小儿急性上呼吸道感染的病原谱为病毒占45.8%为主,其次是细菌、肺炎支原体、混合感染、其他如衣原体等感染,临床医师诊治小儿急性上呼吸道感染应根据病原体检测结果结合临床表现合理选用抗� 展开更多
关键词 小儿 急性上呼吸道感染 病原谱 多中心
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2012-2019年浙江省杭州市哨点医院5岁以下儿童病毒性腹泻病原学和流行病学特征分析 被引量:17
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作者 商晓春 帅慧群 +1 位作者 赵雪琴 周晓红 《疾病监测》 CAS 2020年第9期809-814,共6页
目的分析2012—2019年浙江省杭州市及其周边县市5岁以下儿童病毒性腹泻的病原谱和流行病学特征,为病毒性腹泻防控提供参考依据。方法2012—2019年收集浙江大学医学院附属儿童医院门急诊和肠道门诊5岁以下腹泻患儿的粪便标本,采用实时荧... 目的分析2012—2019年浙江省杭州市及其周边县市5岁以下儿童病毒性腹泻的病原谱和流行病学特征,为病毒性腹泻防控提供参考依据。方法2012—2019年收集浙江大学医学院附属儿童医院门急诊和肠道门诊5岁以下腹泻患儿的粪便标本,采用实时荧光定量PCR方法检测诺如病毒(NV)、轮状病毒(RV)、札如病毒(SAV)、肠道腺病毒(EADV)和星状病毒(ASV)的核酸。采用SPSS 19.0软件分析病原检出结果。结果共收集1350份标本,阳性标本594份,总检出率为44.00%。阳性病例以单病毒感染为主(84.51%,502/594),双重和三重感染分别占14.31%和1.18%,双重感染以NV和RV为主(54.12%,46/85)。NV检出率最高,为23.41%,其次为RV(19.11%),SAV、EADV和ASV的检出率均<5%(分别为4.22%、2.96%、1.63%)。不同月龄组腹泻患儿间病毒核酸检出率差异有统计学意义(χ^2=256.140,P<0.001),12~月龄组患儿的检出率最高,为73.77%(239/324),0~月龄组最低,为17.18%(73/425)。各病毒在不同月龄组患儿间的检出率差异均有统计学意义。病毒总检出率的季节性差异有统计学意义(χ^2=188.495,P<0.001),冬季(12月至次年2月)检出率最高,为70.31%(225/320)。NV、RV和SAV在不同季节的检出率差异有统计学意义(χ^2=90.284,P<0.001;χ^2=188.068,P<0.001;χ^2=29.066,P<0.001),NV在秋季(9—11月)的检出率最高,RV和SAV均冬季检出率最高。2012—2019年各年度检出率在奇数年份高于前一偶数年份,总体呈上升趋势(趋势χ^2=13.532,P<0.001)。NV和ASV的检出率年度变化呈上升趋势(趋势χ^2=23.636,P<0.001;趋势χ^2=18.073,P=0.003)。RV、SAV、EADV的检出率年度变化趋势不规则(趋势χ^2=3.173,P=0.075;趋势χ^2=1.803,P=0.179;趋势χ^2=0.007,P=0.932)。结论5岁以下儿童病毒性腹泻主要病原为NV和RV,秋冬季为高发期,12~35月龄为高发年龄段,需在秋冬季加强病毒性腹泻的防控。 展开更多
关键词 病毒性腹泻 病原谱 流行病学
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2011—2018年上海市金山区手足口病病原学监测结果及柯萨奇病毒A6型分离株VP1基因特征分析 被引量:14
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作者 孙箐爽 董兆鹏 +3 位作者 臧昊 杜荐如 宋灿磊 李淑华 《实用预防医学》 CAS 2020年第1期33-37,共5页
目的了解2011-2018年上海市金山区手足口病病原学特征,分析柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CoxA6)VP1基因特征,为手足口病防控提供理论依据。方法对2011-2018年金山区手足口病监测病原学检测情况进行统计分析。CoxA6病毒分离株进行VP... 目的了解2011-2018年上海市金山区手足口病病原学特征,分析柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CoxA6)VP1基因特征,为手足口病防控提供理论依据。方法对2011-2018年金山区手足口病监测病原学检测情况进行统计分析。CoxA6病毒分离株进行VP1基因核苷酸序列测序,分析其同源性并构建系统进化树。结果2011-2018年金山区共采集手足口病例标本1207例,病原学检测阳性703例,阳性率为58.24%(703/1207);病原学构成为CoxA6254例(36.13%)、CoxA16217例(30.87%)、EV71162例(23.04%)、CoxA1018例(2.56%)和其他肠道病毒52例(7.40%)。2011-2013年,EV71、CoxA16、其他肠道病毒为优势病原;2014年起,CoxA6逐渐成为优势病原,2018年占病原学构成达85.43%。EV71发病呈单峰分布,高峰出现在5月;CoxA16呈双峰分布,主高峰出现在6月,次高峰出现在11月;CoxA6呈双峰分布,主高峰出现在11月,次高峰出现在7月。监测点监测2013年出现CoxA6型,疫情监测2014年出现CoxA6型。监测点监测,EV71,CoxA16和CoxA6病原年龄分布主要集中在1~5岁,其中CoxA6还主要集中在7~12岁。疫情监测,EV71、CoxA16、CoxA6病原分布主要集中在小班和中班,其中CoxA6病原分布还集中在小学。基因分析表明,2017-2018年金山区流行的CoxA6型病原基因特征为E2亚型。结论2011-2018年金山区手足口病的优势病原已由EV71、CoxA16转变为CoxA6 E2亚型为主。应进一步加强病原监测,尤其加强对7~12岁组病原的监测,及时发现新病原,为落实综合性防控手足口病预防措施提供依据。 展开更多
关键词 手足口病 病原谱 柯萨奇病毒A组6型 分子流行病学
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上海市黄浦区腹泻病病例病原及流行性病学特征 被引量:13
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作者 张焕珠 王曙 +2 位作者 俪佳莹 舒敏 沈福杰 《职业与健康》 CAS 2015年第18期2504-2507,共4页
目的掌握上海市黄浦区腹泻病的病原谱构成以及流行病学特征,为制定腹泻病防控策略提供科学依据。方法对2012—2014年3家监测点医院的腹泻监测病例开展流行病学调查;采用系统抽样法采集病例的粪便标本进行病原学鉴定,包括霍乱、志贺菌、... 目的掌握上海市黄浦区腹泻病的病原谱构成以及流行病学特征,为制定腹泻病防控策略提供科学依据。方法对2012—2014年3家监测点医院的腹泻监测病例开展流行病学调查;采用系统抽样法采集病例的粪便标本进行病原学鉴定,包括霍乱、志贺菌、沙门菌等细菌和轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒等。对病原谱构成及流行病学特征进行分析。结果共调查腹泻病例1 093例,采集257份粪便标本,阳性病例数为137份(53.17%),单重感染占78.83%(107/137),混合感染占21.17%(29/137)。病毒感染中以诺如病毒检出最高,为48.91%(67/137);其次为星状病毒,占12.41%(17/137)。细菌感染中以副溶血性弧菌检出最高,为18.25%(25/137);其次为肠产毒性大肠杆菌(ETEC),占13.14%(18/137)。结论上海市中心城区成人腹泻病例病毒感染尤其是诺如病毒已经是优势病原,应加大对病毒性腹泻的防治。 展开更多
关键词 腹泻 综合监测 病原谱 流行病学特征
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河南地区真菌性角膜病致病菌种调查 被引量:10
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作者 王丽娅 孙声桃 +4 位作者 张月琴 王印其 祝磊 李家臣 徐筠 《中国实用眼科杂志》 CSCD 北大核心 2003年第3期224-225,共2页
目的 :调查 6年间河南地区真菌性角膜病致病菌种。方法 :对 1996年 10月~ 2 0 0 2年 2月间就诊河南省眼科研究所的真菌性角膜炎患者 42 6人角膜取材行真菌培养 ,培养阳性的 3 15例标本进一步行致病真菌菌种鉴定。结果 :角膜主要致病菌... 目的 :调查 6年间河南地区真菌性角膜病致病菌种。方法 :对 1996年 10月~ 2 0 0 2年 2月间就诊河南省眼科研究所的真菌性角膜炎患者 42 6人角膜取材行真菌培养 ,培养阳性的 3 15例标本进一步行致病真菌菌种鉴定。结果 :角膜主要致病菌属依次为镰孢菌属 ( 67 9% )和曲菌属 ( 13 0 % )。主要致病菌种依次为茄病镰孢菌、梨孢镰孢菌、黄曲霉菌、串珠镰孢菌、互隔交链孢霉和烟曲霉菌。结论 :河南地区的角膜首位致病菌属为镰孢菌属。 展开更多
关键词 河南地区 真菌性角膜病 致病菌种 调查 镰孢菌属 曲菌属
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小儿病毒性腹泻病原谱及临床特征分析 被引量:12
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作者 姜洪波 孟婷玉 +4 位作者 王承训 黎伟明 李响 杨显达 孙利伟 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2019年第7期583-586,共4页
目的探讨小儿病毒性腹泻病原谱及临床特点。方法采集400例2016年1至12月吉林省儿童医学中心(长春市儿童医院)住院疑似病毒性腹泻患儿粪便标本,约5 mL,应用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测轮状病毒抗原和聚合酶链反应(PCR)方法检测轮状病毒(... 目的探讨小儿病毒性腹泻病原谱及临床特点。方法采集400例2016年1至12月吉林省儿童医学中心(长春市儿童医院)住院疑似病毒性腹泻患儿粪便标本,约5 mL,应用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测轮状病毒抗原和聚合酶链反应(PCR)方法检测轮状病毒(HRV)、杯状病毒(HUCV)、肠道腺病毒(HADV)和人星状病毒(HAstaV)核酸及基因型,同时收集患儿临床资料。结果粪便标本HRV、HuCV、EAdV和HAstV总阳性检出率为59%(236例);4种病毒的阳性检出情况分别为178例(75.42%)、68例(28.81%)、12例(5.08%)和5例(2.12%),其中双重混合感染占27例(11.42%);未知病原占164例(41%)。轮状病毒G6(93.63%,147例)、P3(91.08%)和G6[P3](90.45%)组合为2016年流行优势型,未能分型11.79%。杯状病毒中92.65%为诺如病毒,其中98.41%为GⅡ型。住院病毒性腹泻193例年龄≤24月龄;发病高峰年龄段不同病原不同。发病高峰季为1~3月份和12月份。主要临床表现有腹泻、呕吐和发热等。结论对于小儿病毒性腹泻,确定未知病原种类,完善病原谱非常必要。病毒性腹泻常伴发肠道外临床表现。 展开更多
关键词 小儿 病毒性 腹泻 病原谱 临床特征
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社区获得性肺炎病原菌构成及耐药分析 被引量:12
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作者 汪健 李华 +3 位作者 胡晓彦 刘晓庆 陈娇 李蓉 《实验与检验医学》 CAS 2011年第3期227-229,共3页
目的研究社区获得性肺炎(CAP)的常见病原菌分布及其耐药性。方法对220例CAP患者同时通过痰培养和血清学检测进行病原菌检测,并用琼脂稀释法检测其最低抑菌浓度(MIC)。结果肺炎链球菌(12.3%)是最常见的病原菌,其后依次为嗜肺军团菌(9.1%... 目的研究社区获得性肺炎(CAP)的常见病原菌分布及其耐药性。方法对220例CAP患者同时通过痰培养和血清学检测进行病原菌检测,并用琼脂稀释法检测其最低抑菌浓度(MIC)。结果肺炎链球菌(12.3%)是最常见的病原菌,其后依次为嗜肺军团菌(9.1%)、流感嗜血杆菌(8.6%)、肺炎克雷伯菌(6.8%)和金黄色葡萄球菌(4.1%)。其中肺炎链球菌呈高度多重耐药,对克林霉素、阿奇霉素、四环素等药物的耐药率高达75%以上;流感嗜血杆菌对复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢呋辛等耐药率较高;肺炎克雷伯菌对左氧氟沙星、莫西沙星、环丙沙星、阿莫西林/克拉维酸、亚胺培南及哌拉西林/他唑巴坦等的敏感性较高。结论肺炎链球菌仍为CAP的重要病原体,多重耐药肺炎链球菌耐药形势严峻。喹诺酮类药物在肺炎链球菌所致CAP治疗中占有重要位置。 展开更多
关键词 社区获得性肺炎 病原菌 药敏 最低抑菌浓度 多重耐药
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827例血流感染患者的临床分布及病原谱分析 被引量:11
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作者 欧阳靖霖 欧阳征仁 +1 位作者 张小团 刘卓然 《中南医学科学杂志》 CAS 2019年第5期537-541,共5页
血流感染(Bloodstream infection,BSI)是一种严重感染性疾病,研究BSI的临床分布及病原菌流行特征,可为经验性治疗提供用药参考。分析某院2016至2018年发生BSI患者的临床资料及病原菌的耐药数据。827例BSI患者共检出病原菌863株,其中革... 血流感染(Bloodstream infection,BSI)是一种严重感染性疾病,研究BSI的临床分布及病原菌流行特征,可为经验性治疗提供用药参考。分析某院2016至2018年发生BSI患者的临床资料及病原菌的耐药数据。827例BSI患者共检出病原菌863株,其中革兰阴性菌600株,占69.5%,以大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌为主;革兰阳性菌218株,占25.3%,以金黄色葡萄球菌为主;深部真菌45株,占5.2%。科室分布主要以消化内科、ICU、泌尿外科和儿科为主。儿童中0-1岁患儿BSI的发生率最高,成人中>60岁患者BSI的发生率达到了51.4%。大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌对头孢曲松的耐药性较高,分别为53.6%和38.3%,对β-内酰胺/酶抑制剂和碳青霉烯类的耐药性较低。未检出耐万古霉素金黄色葡萄球菌,但MRSA检出率12.5%。因此,本院BSI患者病原菌分布以革兰阴性菌为主,常见细菌耐药性较为严重,年龄和科室分布存在较大差异,临床应进行分层诊疗,合理选用抗生素。 展开更多
关键词 血流感染 病原谱 细菌耐药性
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2017~2018年河北省重症手足口病的主要致病病原体为柯萨奇病毒A组6型 被引量:10
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作者 肖金波 于秋丽 +10 位作者 张勇 宋洋 张曼 路环环 韩振志 刘莹莹 冀天娇 严冬梅 祝双利 许文波 李琦 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期192-200,共9页
肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手... 肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手足口病的病原谱提供了帮助。为了明确河北省2017~2018年重症手足口病的病原谱,本研究采集2017~2018年河北省重症HFMD病例的50份标本(2017年29份,2018年21份)进行病毒分离,从23份标本中分离到病毒,采用一代测序方法获得其全长VP1区序列,而其余27份标本未能直接分离到病毒,其中17份采用高通量测序的方法获得了部分或者全长基因组序列。序列分析结果显示,近年来河北省重症HFMD的肠道病毒病原谱发生了较大变化,2017年重症HFMD标本中,10份检出肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71),1份检出柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16),10份检出柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)(其中高通量测序检出5份),还有3份检出其他肠道病毒;2018年重症HFMD标本中,1份检出CV-A16,7份CV-A6通过高通量测序检出,5份检出柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)(其中高通量测序检出3份),还有3份检出其他肠道病毒。通过高通量测序,可检出病原体的重症标本由原来的23份上升到40份,可检出CV-A6的标本由5份上升到17份,CV-A10由2份上升到5份;重症病例病原谱中CV-A6所占的比例由21.7%(5/23)上升到42.5%(17/40),CV-A10由8.7%(2/23)上升到12.5%(5/40),而EV-A71由于病毒分离比较敏感,含有EV-A71的标本病毒分离全部是阳性,高通量测序并没有多检出,在病原谱中的比例由43.5%(10/23)下降到25.0%(10/40)。RAxML构建的CV-A6和CV-A10的VP1区的系统发育树显示,CV-A6属于中国流行的优势基因亚型D3a,CV-A10属于中国流行的优势基因型C。河北重症HFMD标本检测到的两株CV-A6与其余中国CV-A6序列的3D区的核苷酸相似度为76.4%~98.9%,氨� 展开更多
关键词 重症手足口病(HFMD) 高通量测序(HTS) 病原谱 柯萨奇病毒A组6型(CV-A6) 柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)
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2019—2021年广东省住院严重急性呼吸道感染病毒病原谱分析 被引量:6
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作者 谢家敏 张云强 +4 位作者 杨康 黄鑫鑫 邓慧诗 武婕 邹丽容 《公共卫生与预防医学》 2023年第3期38-42,共5页
目的了解2019—2021年广东省住院严重急性呼吸道感染(sever acute respiratory infection,SARI)患者常见病毒病原体的感染状况和流行病学特征,为SARI的临床诊断和防控提供参考依据。方法对2019—2021年收集的SARI患者呼吸道标本,采用Lum... 目的了解2019—2021年广东省住院严重急性呼吸道感染(sever acute respiratory infection,SARI)患者常见病毒病原体的感染状况和流行病学特征,为SARI的临床诊断和防控提供参考依据。方法对2019—2021年收集的SARI患者呼吸道标本,采用Luminex呼吸道多病原检测技术对呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、人鼻病毒/肠道病毒(HRV/EV)和人偏肺病毒(HMPV)等常见呼吸道病毒进行检测分析。结果共收集流感阴性病例1948例,病毒感染总阳性检出率为24.28%,其中HRV/EV检出率最高(10.32%)、其次为RSV(4.31%)。不同年龄组病毒检出率差异有统计学意义(Χ^(2)=176.186,P<0.05),以0~4岁年龄组检出率最高,为41.50%。男性病毒检出率和女性病毒检出率差异无统计学意义(Χ^(2)=0.042,P>0.05)。RSV的检出高峰主要集中在夏秋两季,HMPV以冬季为主要流行季节,HRV/EV和ADV无明显季节性。39份样本存在混合感染,混合感染率为2.00%,混合感染病例中以HPIV和HRV/EV合并感染最为常见。结论2019—2021年广东省SARI流感阴性住院病例主要检出病毒病原体为HRV/EV、RSV、HMPV和ADV,建议重点加强5岁以下儿童的SARI病例监测。 展开更多
关键词 严重急性呼吸道感染 呼吸道病毒 病原谱 住院病例
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2015-2019年上海某三级医院感染性腹泻的病原学监测结果分析 被引量:9
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作者 兰莹莹 邱卫华 +3 位作者 周龙珠 曹新梅 黄俐敏 朱渭萍 《海南医学》 CAS 2021年第7期940-943,共4页
目的分析2015-2019年5年间上海市某三级医院感染性腹泻疾病的病原谱及流行病学特征,为腹泻病的临床诊治、监测预警和制定防治对策提供科学依据。方法收集上海市浦东新区人民医院2015-2019年1012例就诊腹泻患者的疫情报告资料和病理学检... 目的分析2015-2019年5年间上海市某三级医院感染性腹泻疾病的病原谱及流行病学特征,为腹泻病的临床诊治、监测预警和制定防治对策提供科学依据。方法收集上海市浦东新区人民医院2015-2019年1012例就诊腹泻患者的疫情报告资料和病理学检测报告资料,并对其进行统计分析。结果1012例腹泻患者中病原阳性率为52.7%(533/1012),男女比例1.03∶1;单细菌、病毒和混合感染的阳性率分别为15.5%、30.9%和6.2%;单一细菌阳性病例中,致泻性大肠埃希菌阳性率最高(8.1%),其次为沙门菌(3.3%);单一阳性病毒病例中,诺如病毒阳性率最高(12.7%),其次为轮状病毒(7.0%);混合感染病例中,病毒-细菌阳性率最高(1.1%);致泻性大肠埃希菌(11.6%)和诺如病毒(14.2%)阳性率在20~64岁年龄组最高,而沙门菌(5.0%)和轮状病毒(18.3%)在0~6岁年龄组最高;病原构成呈现季节性分布,春季和冬季主要流行的病原体以诺如病毒和轮状病毒为主,而夏季主要流行的病原体以致泻性大肠埃希菌和沙门菌为主。结论大肠埃希菌、沙门菌、轮状病毒和诺如病毒是本区域腹泻病患者优势病原体,病原在不同的年龄段分布存在差异,病原阳性呈明显的季节性流行分布特征。 展开更多
关键词 浦东新区 腹泻病 监测 病原谱 流行特征
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2018-2020年呼吸科患者下呼吸道感染病原谱和耐药性分析 被引量:8
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作者 毛成晔 范庭涛 +1 位作者 蔡兴旺 周洋洋 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2022年第11期1319-1323,共5页
目的分析呼吸科患者下呼吸道感染病原谱以及病原菌对常用抗生素的耐药性,从而为呼吸科患者下呼吸道感染精准治疗提供参考依据。方法收集2018-2020年自福建医科大学附属三明第一医院呼吸内科接受诊治的患者痰液、支气管肺泡灌洗液、胸水... 目的分析呼吸科患者下呼吸道感染病原谱以及病原菌对常用抗生素的耐药性,从而为呼吸科患者下呼吸道感染精准治疗提供参考依据。方法收集2018-2020年自福建医科大学附属三明第一医院呼吸内科接受诊治的患者痰液、支气管肺泡灌洗液、胸水、支气管冲洗液、气管吸出物样本中分离的1002株下呼吸道病原菌进行菌种鉴定,并测定这些病原菌对哌拉西林、头孢吡肟、头孢他啶、美罗培南、亚胺培南、环丙沙星、左旋氧氟沙星、阿米卡星、庆大霉素、妥布霉素、奈替米星、复方新诺明、粘菌素、替加环素等常用抗生素的耐药性。结果自患者下呼吸道分离的1002株病原菌中,85.13%为革兰阴性菌、14.87%为革兰阳性菌(χ^(2)=467.21,P<0.001),鲍曼不动杆菌(25.05%)、铜绿假单胞菌(21.86%)和肺炎克雷伯菌(17.07%)占分离菌株的前三位。鲍曼不动杆菌对粘菌素敏感性最高(86.86%),对哌拉西林耐药性最高(96.41%);铜绿假单胞菌对粘菌素敏感性最高(92.27%),对替加环素耐药性最高(85.73%)。肠杆菌中,大肠埃希菌对粘菌素敏感性最高(98.09%),对头孢呋辛耐药性最高(66.70%);肺炎克雷伯菌对粘菌素敏感性最高(81.17%),对头孢噻肟耐药性最高(80.64%);沙雷菌对阿米卡星敏感性最高(97.07%),对头孢噻肟耐药性最高(52.33%);变形杆菌对美罗培南敏感性最高(94.93%),对复方新诺明耐药性最高(70.28%);柠檬酸杆菌对阿米卡星敏感性最高(100.00%),对头孢噻肟耐药性最高(49.81%)。革兰阳性菌中,金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性葡萄球菌对万古霉素100.00%敏感、粪肠球菌对利奈唑烷100.00%敏感,屎肠球菌对左旋氧氟沙星100.00%耐药。流感嗜血杆菌对氯霉素敏感性最高(96.87%),对青霉素耐药性最高(52.94%);卡他莫拉菌对左氧氟沙星敏感性最高(98.33%),对阿米卡星耐药性最高(70.90%)。结论革兰阴性菌是引发呼吸内科患者下呼吸道感染� 展开更多
关键词 病原谱 抗生素耐药性 下呼吸道感染 呼吸内科
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贵州省4个县2013-2014年发热出疹性疾病病原谱的研究 被引量:9
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作者 吴升伟 唐小敏 +2 位作者 戴丽芳 杜雯 叶绪芳 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2017年第5期517-520,525,共5页
目的分析贵州省2013年8月-2014年7月发热出疹性疾病(Rash and fever illness,RFI)病原谱的构成特征。方法收集贵州省4个项目县363例RFI病例病原标本,采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)、聚合酶链反应(PCR)及细菌/病毒分离鉴定等方... 目的分析贵州省2013年8月-2014年7月发热出疹性疾病(Rash and fever illness,RFI)病原谱的构成特征。方法收集贵州省4个项目县363例RFI病例病原标本,采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)、聚合酶链反应(PCR)及细菌/病毒分离鉴定等方法检测麻疹病毒(MV)、风疹病毒(RV)、肠道病毒(EV)、EB病毒、水痘-带状疱疹病毒(VZV)、人类小DNA病毒B19、人疱疹病毒6型(HHV-6)、伤寒/副伤寒杆菌。结果 RFI监测病例的病原标本阳性率为20.94%(76/363)。阳性株主要为EV(80.26%)、VZV(11.84%)、MV(5.26%)。在61株EV中,EV71型(EV71)、柯萨奇病毒A16型(CA16)、其他EV分别占21.31%、21.31%和55.74%。VZV基因型为J型。MV基因型为H1a亚型。结论 EV、VZV和MV是RFI的主要病原,开展相应的疫苗接种是控制RFI的主要措施。本研究建立了贵州省RFI实验室监测技术平台。 展开更多
关键词 发热出疹性疾病 病原谱 肠道病毒 水痘-带状疱疹病毒 麻疹病毒
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2015-2016年度龙山县感染性腹泻病原学监测结果分析 被引量:9
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作者 晏芳 张建斌 +4 位作者 张孝洪 罗垲炜 赵善露 吴周建 李俊华 《实用预防医学》 CAS 2018年第12期1462-1465,共4页
目的了解2015-2016年度龙山县感染性腹泻病例的病原学特征,为制定相应的防控措施提供科学依据。方法2015年5月-2017年4月,收集在龙山县哨点医院就诊的符合纳入标准的腹泻病例相关信息,采集粪便标本进行肠道致病菌及病毒检测,并进行数据... 目的了解2015-2016年度龙山县感染性腹泻病例的病原学特征,为制定相应的防控措施提供科学依据。方法2015年5月-2017年4月,收集在龙山县哨点医院就诊的符合纳入标准的腹泻病例相关信息,采集粪便标本进行肠道致病菌及病毒检测,并进行数据分析。结果共调查并检测264例感染性腹泻病例,检出阳性病例98例,总感染率为37. 1%。2015、2016年度感染率分别为45. 0%、30. 6%,差异有统计学意义(χ~2=5. 851,P=0. 016)。细菌、病毒的感染率分别为13. 3%、25. 4%,差异有统计学意义(χ~2=12. 443,P<0. 001)。共分离出致病菌35株,阳性率为13. 3%,以沙门菌为主(74. 3%);共分离出病毒78株,阳性率为29. 5%,以诺如病毒为主(61. 5%),细菌、病毒病原谱构成差异均有统计学意义(χ~2=36. 260,P<0. 001;χ~2=11. 957,P=0. 008)。不同性别病原检出阳性率及病原谱构成差异无统计学意义(P> 0. 05);青少年组、壮年组和老年组病毒检出阳性率分别为45. 2%、19. 2%、10. 8%,差异有统计学意义(χ~2=24. 175,P<0. 001)。各年龄组细菌检出阳性率及细菌、病毒病原谱构成差异均无统计学意义(P>0. 05)。7-9月份细菌检出阳性率高,检出沙门菌22份,占总数的84. 6%; 11月-次年3月病毒检出阳性率高,诺如病毒春秋季感染较多,共检出36份,占总数的75%,轮状病毒感染呈现秋冬季高峰特点,共检出9份,占总数的60%。结论 2015-2016年度龙山县腹泻病例的主要病原是沙门菌、诺如病毒和A组轮状病毒,且具有明显的季节流行特征。 展开更多
关键词 感染性腹泻 病原谱 监测
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济南市2012~2017年手足口病肠道病毒谱变化及流行特征 被引量:9
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作者 关恒云 王春荣 +4 位作者 刘岚铮 杨国樑 赵怀龙 孙洁 成洪旗 《山东大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2019年第11期90-97,共8页
目的阐明济南市手足口病肠道病毒病原谱的构成及变化,探索不同肠道病毒类型的流行特征。方法收集2012年1月~2017年12月济南市手足口病标本4 929例,采用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测EV-A71、柯萨奇病毒A组16型(CV-A... 目的阐明济南市手足口病肠道病毒病原谱的构成及变化,探索不同肠道病毒类型的流行特征。方法收集2012年1月~2017年12月济南市手足口病标本4 929例,采用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测EV-A71、柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)、柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)和柯萨奇病毒A组10型(CV-A10);对肠道病毒通用(PE)阳性而未明确分型标本采用巢式RT-PCR方法,扩增肠道病毒5′-非翻译区(5′-UTR),经核苷酸序列测定明确肠道病毒类型。结果 4 929例标本中共检出27种肠道病毒类型,除EV-A71、CV-A16、CV-A6和CV-A10外,柯萨奇病毒A组(CV-A2、4、5、9、12、13、21、22、24)、柯萨奇病毒B组(CV-B1~5)、埃可病毒(E3、6、7、9、11、18、24、25、30)均有检出。轻型病例肠道病毒感染率居前4位的是CV-A16(29.03%)、EV-A71(25.67%)、CV-A6(17.58%)和CV-A10(3.10%),重症病例为EV-A71(77.64%)、CV-A16(5.59%)、CV-A6(1.86%)和CV-A10(1.24%)。CV-A6和CV-A10感染者的发病年龄较EV-A71和CV-A16感染者略小,分别为(3.02±2.43)岁、(2.87±1.67)岁、(3.29±2.34)岁和(3.36±2.18)岁,差异有统计学意义(F=3.659,P=0.003)。流行季节研究显示,EV-A71和CV-A16发病高峰为第2或4季度,CV-A6好发于6~12月份,CV-A10病例6~8月份发病较多。平阴县和章丘区肠道病毒阳性检出率较高,分别为93.49%和91.99%。结论济南市手足口病肠道病毒谱以EV-A71、CV-A16、CV-A6和CV-A10为优势型别,27种肠道病毒共存。常年监测非EV-A71非CV-A16肠道病毒的流行特征,及时掌握肠道病毒谱变化,有助于及时完善手足口病疫情的防控措施。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 病原谱 流行特征
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浙北地区197例真菌性角膜炎感染特征分析 被引量:8
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作者 胡卫萍 林琳 +2 位作者 周宏伟 朱彬彬 晋秀明 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1327-1329,1333,共4页
目的分析我国浙北地区真菌性角膜炎(FK)的流行病学特征、致病菌菌谱及药物敏感性情况,为临床诊治提供参考依据。方法收集2011年7月-2016年6月在浙江大学附属第二医院眼科中心就诊并确诊为真菌性角膜炎的197例(197眼)患者资料,对患者的... 目的分析我国浙北地区真菌性角膜炎(FK)的流行病学特征、致病菌菌谱及药物敏感性情况,为临床诊治提供参考依据。方法收集2011年7月-2016年6月在浙江大学附属第二医院眼科中心就诊并确诊为真菌性角膜炎的197例(197眼)患者资料,对患者的流行病学特征、致病真菌菌种分布及药物敏感性结果进行分析。结果 197例中男性患者132例,女性患者65例,男女比例为2.03∶1,发病年龄:23~85岁,51~70岁年龄段患者124例(62.94%),发病高峰月份在10~12月,实验室检查共分离菌株197株,前三位致病真菌分别为曲霉菌属94株(47.71%)、镰刀菌属60株(30.46%)、链格孢霉属28株(14.21%);体外药敏结果显示,3种主要致病真菌对制霉菌素和两性霉素B的敏感率均大于80%,而对氟康唑的敏感率均低于20%。结论我国浙北地区FK患者以中老年男性为主,每年发病集中在秋冬季,致病菌中曲霉菌占首位,其次为镰刀菌。 展开更多
关键词 真菌性角膜炎 流行病学 致病菌谱 药物敏感性
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