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基于高通量测序揭示重楼根际土及不同部位真菌群落差异
被引量:
7
1
作者
程虎印
王艳
+5 位作者
赵乐
万一
程江雪
高静
成世强
王汉屏
《药物分析杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期455-461,共7页
目的:分析长药隔重楼内生菌门类及不同部位真菌群落差异,为寻找促进有效组分合成的功能菌群的研究奠定基础。方法:利用高通量测序技术对陕产长药隔重楼植物内生真菌及根际土菌群基因组遂行扩增子序列测定,并对菌群多样性及不同部位内生...
目的:分析长药隔重楼内生菌门类及不同部位真菌群落差异,为寻找促进有效组分合成的功能菌群的研究奠定基础。方法:利用高通量测序技术对陕产长药隔重楼植物内生真菌及根际土菌群基因组遂行扩增子序列测定,并对菌群多样性及不同部位内生真菌群落差异分析。结果:长药隔重楼内生真菌群落多样性Chao1指数、ACE指数、Shannon指数及Simpson指数均表现为根>叶>根茎。根际土壤优势真菌为担子菌门,根部优势门为球囊菌门真菌,根茎及叶的优势菌群为子囊菌门。结论:长药隔重楼根际土壤与根、根茎及叶部优势菌群多样性及群落均表现出显著性差异,该实验为挖掘重楼属内生菌对重楼代谢产物的合成调控产生影响及影响机制提供研究基础。
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关键词
长药隔重楼
高通量测序
内生真菌
根际土壤
多样性
原文传递
题名
基于高通量测序揭示重楼根际土及不同部位真菌群落差异
被引量:
7
1
作者
程虎印
王艳
赵乐
万一
程江雪
高静
成世强
王汉屏
机构
陕西中医药大学药学院
陕西省微生物研究所
陕西理工大学
镇巴县科技局
西安外事学院医学院
出处
《药物分析杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期455-461,共7页
基金
国家重点研发计划资助(2018YFD1001000)
陕西省重点研发计划项目(2019SF-291)
陕西省科学院科技计划项目(2018nk-01)。
文摘
目的:分析长药隔重楼内生菌门类及不同部位真菌群落差异,为寻找促进有效组分合成的功能菌群的研究奠定基础。方法:利用高通量测序技术对陕产长药隔重楼植物内生真菌及根际土菌群基因组遂行扩增子序列测定,并对菌群多样性及不同部位内生真菌群落差异分析。结果:长药隔重楼内生真菌群落多样性Chao1指数、ACE指数、Shannon指数及Simpson指数均表现为根>叶>根茎。根际土壤优势真菌为担子菌门,根部优势门为球囊菌门真菌,根茎及叶的优势菌群为子囊菌门。结论:长药隔重楼根际土壤与根、根茎及叶部优势菌群多样性及群落均表现出显著性差异,该实验为挖掘重楼属内生菌对重楼代谢产物的合成调控产生影响及影响机制提供研究基础。
关键词
长药隔重楼
高通量测序
内生真菌
根际土壤
多样性
Keywords
paris
polyphylla
sm
.
va
r
.
thibetica
(
franch
.)
hara
high-th
r
oughput
sequencing
endophytic
fungi
r
hizosphe
r
e
soil
dive
r
sity
分类号
R917 [医药卫生—药物分析学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于高通量测序揭示重楼根际土及不同部位真菌群落差异
程虎印
王艳
赵乐
万一
程江雪
高静
成世强
王汉屏
《药物分析杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
7
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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