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玉米细菌性枯萎病菌16S rDNA基因克隆及TaqMan探针实时荧光PCR 被引量:14
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作者 漆艳香 肖启明 朱水芳 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期183-187,共5页
为给农业和植物检疫部门提供一种特异性强、灵敏度高,可以快速、直接检测植物病原菌的方法,将玉米细菌性枯萎病菌16SrDNA基因克隆测序,根据该细菌与其他细菌菌株16SrDNA序列差异,设计出对玉米细菌性枯萎病菌具有稳定点突变的特异性探针... 为给农业和植物检疫部门提供一种特异性强、灵敏度高,可以快速、直接检测植物病原菌的方法,将玉米细菌性枯萎病菌16SrDNA基因克隆测序,根据该细菌与其他细菌菌株16SrDNA序列差异,设计出对玉米细菌性枯萎病菌具有稳定点突变的特异性探针,除泛菌属3个种和欧氏菌属3个种外,还对假单胞菌属1个种,黄单胞菌属1个种,棒形杆菌属1个种,短小杆菌属1个种以及5种植原体进行了实时荧光PCR检测.结果表明:只有玉米细菌性枯萎病菌产生荧光,其他细菌和植原体都没有荧光产生.检测的灵敏度为104CFU/mL的菌悬浮液,相当于4个细菌细胞的基因,灵敏度高,也就是说,反应体系中只要有2个活细菌,实时荧光PCR就能检测到.相对灵敏度为107CFU/mL,而且整个检测过程只需2h,由于实验采用独特全封闭反应管及光电传导系统,不用凝胶电泳,降低了污染. 展开更多
关键词 玉米细菌性枯萎病菌 16S RDNA TAQMAN探针
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利用巢式PCR检测玉米细菌性枯萎病菌 被引量:13
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作者 王茂华 胡白石 +3 位作者 卢玲 刘凤权 许志刚 陈建东 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期37-40,共4页
利用通用引物扩增了玉米细菌性枯萎病菌及其近似种的转录间隔区并进行了序列测定。通过序列比较,设计了一对玉米细菌性枯萎病菌的专化性引物,并对所有参试菌株进行扩增。结果显示:该对引物能从参试的玉米细菌性枯萎病菌中特异性地扩增出... 利用通用引物扩增了玉米细菌性枯萎病菌及其近似种的转录间隔区并进行了序列测定。通过序列比较,设计了一对玉米细菌性枯萎病菌的专化性引物,并对所有参试菌株进行扩增。结果显示:该对引物能从参试的玉米细菌性枯萎病菌中特异性地扩增出1条299bp的条带,而其他参试菌株没有扩增信号。与扩增细菌ITS区域的通用引物结合使用,建立了检测和鉴定玉米细菌性枯萎病菌的巢式PCR技术,其检测灵敏度可达到4个细菌细胞,可以准确、灵敏地检测和鉴定玉米细菌性枯萎病菌。 展开更多
关键词 玉米细菌性枯萎病菌 巢式PCR 检测
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玉米细菌性枯萎病菌LAMP检测方法的建立 被引量:6
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作者 袁钧 高文娜 +1 位作者 汪万春 廖晓兰 《植物检疫》 北大核心 2013年第5期61-65,共5页
利用玉米细菌性枯萎病菌基因组DNA特有的保守区域设计LAMP(loop-mediated isothermal amplification)引物,通过优化其反应条件,建立了玉米细菌性枯萎病菌的LAMP检测体系。以多种参比菌DNA为模板对LAMP检测体系的特异性进行了验证,利用... 利用玉米细菌性枯萎病菌基因组DNA特有的保守区域设计LAMP(loop-mediated isothermal amplification)引物,通过优化其反应条件,建立了玉米细菌性枯萎病菌的LAMP检测体系。以多种参比菌DNA为模板对LAMP检测体系的特异性进行了验证,利用玉米细菌性枯萎病菌DNA溶液和菌液梯度稀释液对LAMP检测体系的灵敏度进行了验证。在特异性测试中,LAMP检测体系仅对玉米细菌性枯萎病菌进行扩增,对非靶标菌不产生扩增。LAMP检测体系DNA和菌体检测灵敏度分别达到了0.858×10-4ng/uL和45 CFU/mL。为玉米细菌性枯萎病菌的检测提供了一种新的、简便的、快速的检测手段。 展开更多
关键词 玉米细菌性枯萎病菌 环介导等温扩增 检测
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玉米细菌性枯萎病菌实时荧光PCR检测方法的建立
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作者 丁钿 牟桂萍 +4 位作者 魏霜 李献锋 林晓红 章柱 易建平 《植物检疫》 2024年第2期32-37,共6页
玉米细菌性枯萎病菌(Pantoea stewartii subsp. stewartii,Pss)是我国进境植物检疫性有害生物。根据Pss与其近似种序列差异,设计特异性引物PS3F/PS3R和探针PS-3P,建立Pss实时荧光PCR检测方法。测试结果显示,供试的6株Pss菌株均有阳性扩... 玉米细菌性枯萎病菌(Pantoea stewartii subsp. stewartii,Pss)是我国进境植物检疫性有害生物。根据Pss与其近似种序列差异,设计特异性引物PS3F/PS3R和探针PS-3P,建立Pss实时荧光PCR检测方法。测试结果显示,供试的6株Pss菌株均有阳性扩增,其他74株供试菌株和空白对照均为阴性扩增,菌体DNA的检测低限为13 fg;对模拟带菌玉米种子进行实时荧光PCR检测并建立标准曲线,R2=0.998 8,线性关系良好。本文建立的实时荧光PCR检测方法可为口岸检疫提供一种准确快速检测方法。 展开更多
关键词 玉米细菌性枯萎病菌 实时荧光PCR 检测
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玉米细菌性枯萎病菌的环介导恒温扩增(LAMP)检测方法 被引量:5
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作者 封立平 倪新 +3 位作者 吴兴海 伦才智 吴翠萍 栾晶 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期347-352,共6页
为了提高口岸和基层实验室检疫和监测玉米细菌性枯萎病菌的准确性和工作效率,利用环介导恒温扩增技术(LAMP),根据内切葡聚糖酶(EGase)基因前导序列,设计2个内引物和2个外引物,对玉米细菌性枯萎病菌进行快速检测。结果表明,使用玉米细菌... 为了提高口岸和基层实验室检疫和监测玉米细菌性枯萎病菌的准确性和工作效率,利用环介导恒温扩增技术(LAMP),根据内切葡聚糖酶(EGase)基因前导序列,设计2个内引物和2个外引物,对玉米细菌性枯萎病菌进行快速检测。结果表明,使用玉米细菌性枯萎病菌的近缘种或引致相似症状的病原菌菊欧文氏菌玉米致病变种Erwinia chrysanthemi pv.zeae、玉米内州萎蔫病菌Clavibacter michiganensis subsp.nebraskensis、燕麦假单胞菌Pseudomonas avenae、杓兰欧文氏菌Erwinia cypripedii检测其特异性,仅玉米细菌性枯萎病菌有扩增。LAMP检测灵敏度达到2 pg DNA,为普通PCR的100倍;与其它检测方法相比,LAMP方法检测时间短,效率高,不仅降低了设备投入,易于操作,而且具有较高的灵敏度和特异性,适合玉米细菌性枯萎病菌的现场检疫和大规模检测。 展开更多
关键词 玉米细菌性枯萎病菌 内切葡聚糖酶 环介导恒温扩增 检测
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基于锁式探针技术快速检测玉米细菌性枯萎病菌和玉米内州萎蔫病菌 被引量:1
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作者 李志锋 王忠文 +3 位作者 冯建军 程颖慧 李一农 章桂明 《生物技术通讯》 CAS 2016年第4期529-534,共6页
目的:建立一种检测玉米细菌性枯萎病菌和玉米内州萎蔫病菌的方法,为同时检测这2种检疫性细菌提供技术手段。方法:基于靶标序列设计2种检疫性细菌的锁式探针,与靶标菌进行连接消化反应,然后采用通用引物进行滚环扩增,其产物与偶联上对应... 目的:建立一种检测玉米细菌性枯萎病菌和玉米内州萎蔫病菌的方法,为同时检测这2种检疫性细菌提供技术手段。方法:基于靶标序列设计2种检疫性细菌的锁式探针,与靶标菌进行连接消化反应,然后采用通用引物进行滚环扩增,其产物与偶联上对应捕获探针的微球进行杂交,最后通过液相悬浮芯片二重检测。结果:该检测方法能够有效地检测2种检疫性细菌,其检测阈值为103CFU/m L,具有良好的可重复性。结论:建立了一种快速、灵敏的玉米细菌性枯萎病菌和玉米内州萎蔫病菌的二重检测方法。 展开更多
关键词 滚环扩增 玉米细菌性枯萎病菌 玉米内州萎蔫病菌 液相悬浮芯片
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玉米细菌性枯萎病菌检测引物/探针的特异性评估 被引量:1
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作者 魏霜 丁钿 +5 位作者 于璇 黄法余 陈永青 李献锋 单长林 胡学难 《植物检疫》 2021年第4期15-22,共8页
利用6株玉米细菌性枯萎病菌(Pantoea stewartii subsp.stewartii,PSS)和29株相关菌株对报道的18对检测引物/探针的特异性进行测试。试验结果显示,其中16对引物/探针会出现假阳性或弱假阳性扩增,仅引物cpsAB2313F/cpsR和DC283galE/DC283g... 利用6株玉米细菌性枯萎病菌(Pantoea stewartii subsp.stewartii,PSS)和29株相关菌株对报道的18对检测引物/探针的特异性进行测试。试验结果显示,其中16对引物/探针会出现假阳性或弱假阳性扩增,仅引物cpsAB2313F/cpsR和DC283galE/DC283galEc可以特异检测目的菌,两对引物的检测灵敏度分别为0.1 pg和1 pg。根据测试结果,推荐这2对引物用于检测玉米细菌性枯萎病菌,优先推荐引物cpsAB2313F/cpsR。 展开更多
关键词 玉米细菌性枯萎病菌 检测 引物
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玉米细菌性枯萎病菌EGase内切葡聚糖酶蛋白纯化研究初探
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作者 厉艳 邵秀玲 +3 位作者 张京宣 王英超 封立平 王简 《食品安全质量检测学报》 CAS 2016年第4期1392-1396,共5页
目的研究玉米细菌性枯萎病菌EGase内切葡聚糖酶蛋白纯化的方法。方法以玉米细菌性枯萎病菌(Pantoea stewartii subsp.stewartii)菌株为材料,分离纯化其内切葡聚糖酶Egase。制备EGase浓缩液,浓缩液经Sephradex^(TM)G-75凝胶过滤层析和DEA... 目的研究玉米细菌性枯萎病菌EGase内切葡聚糖酶蛋白纯化的方法。方法以玉米细菌性枯萎病菌(Pantoea stewartii subsp.stewartii)菌株为材料,分离纯化其内切葡聚糖酶Egase。制备EGase浓缩液,浓缩液经Sephradex^(TM)G-75凝胶过滤层析和DEAE-Sephorose Fast Flow阴离子交换柱层析等提纯步骤,获得了凝胶电泳均一的内切葡聚糖酶。结果经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测为一条电泳带,纯化后的EGase是单体蛋白,分子量约为72.3 k Da。Egase酶反应的最适温度是60℃,最适pH为5.0。结论本研究从玉米细菌性枯萎病菌中分离得到了一种新的内切葡聚合糖酶,对其部分性质进行了表述,为后续EGase基因的克隆及表达研究提供了研究基础。 展开更多
关键词 玉米细菌性枯萎病菌 内切葡聚糖酶 蛋白纯化
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玉米细菌性枯萎病及其病原菌的检测技术 被引量:6
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作者 吴琼 陈枝楠 +1 位作者 范怀忠 金显忠 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 2004年第12期22-25,31,共5页
玉米细菌性枯萎病是影响玉米生产的重要病害 ,该病害通过带菌的种子进行远距离传播 ,对该病菌的检测成为防止和控制该病害的重要手段。介绍现有的检测该病菌的各种方法 ,即黑色素选择培养法、double sandwichELISA以及RAPD PCR ,LCR PCR... 玉米细菌性枯萎病是影响玉米生产的重要病害 ,该病害通过带菌的种子进行远距离传播 ,对该病菌的检测成为防止和控制该病害的重要手段。介绍现有的检测该病菌的各种方法 ,即黑色素选择培养法、double sandwichELISA以及RAPD PCR ,LCR PCR ,Nested PCR ,multiplePCR和荧光实时PCR等分子生物学检测方法 ,并对这些方法的特性进行比较和探讨。 展开更多
关键词 分子生物学检测 实时PCR 培养法 带菌 病原菌 ELISA 病菌 细菌性枯萎病 病害 玉米
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