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基于TCGA数据库Wnt相关长链非编码RNA构建肾乳头状细胞癌预后模型 被引量：2
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作者 唐国军 洪余德 +1 位作者 赵崇玉 李辽源 《中华腔镜泌尿外科杂志（电子版）》 2023年第3期270-275,共6页
目的构建一种Wnt通路相关的长链非编码RNA(LncRNAs)的肾乳头状细胞癌(pRCC)预后模型。方法经癌症基因组图谱(TCGA)获取pRCC患者的转录组数据和对应的临床信息。采用共表达网络分析、COX回归和Lasso分析方法筛选出Wnt相关的LncRNA用于构... 目的构建一种Wnt通路相关的长链非编码RNA(LncRNAs)的肾乳头状细胞癌(pRCC)预后模型。方法经癌症基因组图谱(TCGA)获取pRCC患者的转录组数据和对应的临床信息。采用共表达网络分析、COX回归和Lasso分析方法筛选出Wnt相关的LncRNA用于构建风险预后模型。此外,通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线验证模型的预测性能。结果构建了由5个Wnt相关的LncRNAs(CT66,PRECSIT,AL352984.1,AC124798.1,AC011503.2)组成的肾乳头状细胞癌预后模型。生存分析结果表明,该模型在TCGA训练组(P=0.002)、测试组(P=0.013)和完整组(P<0.001)中均具有较好的有效性。将风险评分作为独立预后指标时,完整组患者5年总生存率的ROC曲线下面积(AUC)为0.708。结论由5个Wnt相关lncRNA构建的新的预后模型有助于评估pRCC患者的预后。 展开更多
关键词 WNT 肾乳头状细胞癌 肾肿瘤 癌症基因组图谱 大数据 生物信息学分析 计算生物学 长链非编码RNA 预后模型
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