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樱桃谷鸭PRKCA基因多态性与蛋壳品质的关联性分析
被引量:
3
1
作者
谭光辉
张依裕
+2 位作者
李杰章
覃媛钰
吴磊
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2020年第6期45-50,共6页
实验旨在探究蛋鸭蛋白激酶Cα(PRKCA)基因多态性与蛋壳品质的关联性,以期找到与蛋壳品质相关的分子标记。利用PCR与直接测序相结合的方法对蛋鸭PRKCA基因外显子区域的SNP突变位点进行检测,并与蛋壳品质性状进行关联性分析。结果显示:在...
实验旨在探究蛋鸭蛋白激酶Cα(PRKCA)基因多态性与蛋壳品质的关联性,以期找到与蛋壳品质相关的分子标记。利用PCR与直接测序相结合的方法对蛋鸭PRKCA基因外显子区域的SNP突变位点进行检测,并与蛋壳品质性状进行关联性分析。结果显示:在樱桃谷鸭第7外显子区域检测到2个SNP位点g.9583228G>A和g.9583222C>T,均为同义突变且均产生3种基因型。2个SNP位点之间强连锁不平衡,发现3种单倍型和6种双倍型,单倍型H1和双倍型H1H1频率最高;关联性分析结果表明:双倍型H1H3和H2H2个体蛋重显著高于H3H3个体;H2H3、H3H3双倍型个体蛋壳厚度显著高于H2H2个体;H3H3蛋壳强度显著高于H2H2个体。综上,双倍型H3H3是改善樱桃谷鸭蛋壳品质最有利的双倍型,揭示在PRKCA基因外显子7发现的2个SNP位点相互联合能显著影响蛋壳品质,可能作为鸭蛋壳品质选择的遗传标记。
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关键词
樱桃谷鸭
PRKCA基因
基因多态性
蛋壳品质
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职称材料
风湿性二尖瓣疾病合并心房颤动患者心房纤维化相关微小RNA-647及预测靶基因研究
被引量:
1
2
作者
韩丹
罗超迪
闫炀
《国际心血管病杂志》
2022年第4期228-234,共7页
目的:明确风湿性二尖瓣疾病合并心房颤动(房颤)患者心房组织的主要病理变化,生物信息学分析并筛选与风湿性二尖瓣疾病房颤患者心房纤维化相关的微小RNA(miRNA)及其靶基因。方法:收集在西安交通大学第一附属医院行心脏外科手术治疗的30...
目的:明确风湿性二尖瓣疾病合并心房颤动(房颤)患者心房组织的主要病理变化,生物信息学分析并筛选与风湿性二尖瓣疾病房颤患者心房纤维化相关的微小RNA(miRNA)及其靶基因。方法:收集在西安交通大学第一附属医院行心脏外科手术治疗的30例风湿性二尖瓣疾病患者(窦性心律组10例,房颤组20例)的临床资料及心房样本。苏木精-伊红染色、Masson染色、免疫组织化学染色后观察心房组织病理变化;实时定量聚合酶链反应及Western blot法检测纤维化相关蛋白和通路在心房组织中的表达;生物信息学分析并筛选出与风湿性二尖瓣疾病房颤发病机制相关的miR-647及其预测靶基因PRKCA;进一步应用双荧光素酶报告基因确定miR-647的靶基因为PRKCA。结果:相较于窦性心律组患者,房颤组患者左房组织具有典型的心房肌肥大、间质纤维化、心房肌细胞坏死等病理改变;房颤组患者左房纤维化蛋白及通路表达水平显著高于窦性心律组(P均<0.05);生物信息学筛选出风湿性二尖瓣疾病房颤相关miR-647及其纤维化相关的下游靶基因PRKCA;房颤组左房组织中miR-647明显下调,PRKCA表达则明显升高(P均<0.05);双荧光素酶报告基因实验验证miR-647对靶基因PRKCA具有明显的抑制作用(P<0.05)。结论:miR-647靶向作用于PRKCA基因,与风湿性二尖瓣疾病房颤患者的心房纤维化有关。
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关键词
心房颤动
心房纤维化
生物信息学
微小RNA-647
PRKCA基因
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职称材料
题名
樱桃谷鸭PRKCA基因多态性与蛋壳品质的关联性分析
被引量:
3
1
作者
谭光辉
张依裕
李杰章
覃媛钰
吴磊
机构
贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2020年第6期45-50,共6页
基金
国家自然科学基金(31760663)
贵州省科技人才补助项目(黔科合平台人才[2017]5788)
贵州省千层次创新人才项目共同资助
文摘
实验旨在探究蛋鸭蛋白激酶Cα(PRKCA)基因多态性与蛋壳品质的关联性,以期找到与蛋壳品质相关的分子标记。利用PCR与直接测序相结合的方法对蛋鸭PRKCA基因外显子区域的SNP突变位点进行检测,并与蛋壳品质性状进行关联性分析。结果显示:在樱桃谷鸭第7外显子区域检测到2个SNP位点g.9583228G>A和g.9583222C>T,均为同义突变且均产生3种基因型。2个SNP位点之间强连锁不平衡,发现3种单倍型和6种双倍型,单倍型H1和双倍型H1H1频率最高;关联性分析结果表明:双倍型H1H3和H2H2个体蛋重显著高于H3H3个体;H2H3、H3H3双倍型个体蛋壳厚度显著高于H2H2个体;H3H3蛋壳强度显著高于H2H2个体。综上,双倍型H3H3是改善樱桃谷鸭蛋壳品质最有利的双倍型,揭示在PRKCA基因外显子7发现的2个SNP位点相互联合能显著影响蛋壳品质,可能作为鸭蛋壳品质选择的遗传标记。
关键词
樱桃谷鸭
PRKCA基因
基因多态性
蛋壳品质
Keywords
Cherry Valley ducks
PRKCA gene
Gene polymorphism
Eggshell quality
分类号
S834.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
风湿性二尖瓣疾病合并心房颤动患者心房纤维化相关微小RNA-647及预测靶基因研究
被引量:
1
2
作者
韩丹
罗超迪
闫炀
机构
西安交通大学第一附属医院心血管外科
西安交通大学第一附属医院心血管内科
出处
《国际心血管病杂志》
2022年第4期228-234,共7页
基金
陕西省自然科学基础研究计划(2021JQ-394)。
文摘
目的:明确风湿性二尖瓣疾病合并心房颤动(房颤)患者心房组织的主要病理变化,生物信息学分析并筛选与风湿性二尖瓣疾病房颤患者心房纤维化相关的微小RNA(miRNA)及其靶基因。方法:收集在西安交通大学第一附属医院行心脏外科手术治疗的30例风湿性二尖瓣疾病患者(窦性心律组10例,房颤组20例)的临床资料及心房样本。苏木精-伊红染色、Masson染色、免疫组织化学染色后观察心房组织病理变化;实时定量聚合酶链反应及Western blot法检测纤维化相关蛋白和通路在心房组织中的表达;生物信息学分析并筛选出与风湿性二尖瓣疾病房颤发病机制相关的miR-647及其预测靶基因PRKCA;进一步应用双荧光素酶报告基因确定miR-647的靶基因为PRKCA。结果:相较于窦性心律组患者,房颤组患者左房组织具有典型的心房肌肥大、间质纤维化、心房肌细胞坏死等病理改变;房颤组患者左房纤维化蛋白及通路表达水平显著高于窦性心律组(P均<0.05);生物信息学筛选出风湿性二尖瓣疾病房颤相关miR-647及其纤维化相关的下游靶基因PRKCA;房颤组左房组织中miR-647明显下调,PRKCA表达则明显升高(P均<0.05);双荧光素酶报告基因实验验证miR-647对靶基因PRKCA具有明显的抑制作用(P<0.05)。结论:miR-647靶向作用于PRKCA基因,与风湿性二尖瓣疾病房颤患者的心房纤维化有关。
关键词
心房颤动
心房纤维化
生物信息学
微小RNA-647
PRKCA基因
Keywords
Atrial fibrillation
Atrial fibrosis
Bioinformatics
MiR-647
PRKCA gene
分类号
R541.75 [医药卫生—心血管疾病]
R542.51 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
樱桃谷鸭PRKCA基因多态性与蛋壳品质的关联性分析
谭光辉
张依裕
李杰章
覃媛钰
吴磊
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2020
3
下载PDF
职称材料
2
风湿性二尖瓣疾病合并心房颤动患者心房纤维化相关微小RNA-647及预测靶基因研究
韩丹
罗超迪
闫炀
《国际心血管病杂志》
2022
1
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职称材料
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