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花生PLT基因家族全基因组鉴定与表达分析
1
作者
王晓璇
王金枝
+1 位作者
邱鼎
殷冬梅
《山东农业科学》
北大核心
2024年第8期1-9,共9页
PLT家族是植物特有的一类转录因子,在植物胚胎、干细胞、分生组织及器官生长发育等过程都起着重要作用。本研究利用生物信息学技术在栽培种花生基因组中鉴定到12个PLT家族基因,分布在11条染色体上;AhPLT蛋白大多含有2个保守的AP2结构域...
PLT家族是植物特有的一类转录因子,在植物胚胎、干细胞、分生组织及器官生长发育等过程都起着重要作用。本研究利用生物信息学技术在栽培种花生基因组中鉴定到12个PLT家族基因,分布在11条染色体上;AhPLT蛋白大多含有2个保守的AP2结构域,编码439~713个氨基酸,预测定位在细胞核或叶绿体中;AhPLT基因结构复杂,具有多样的短外显子结构,外显子数在5~8个之间,不同家族成员中分布不同的保守基序;AhPLT家族成员启动子区存在生长素、赤霉素和茉莉酸等激素相关的顺式作用元件。qRT-PCR结果显示,AhPLT1-B和AhPLT5-B分别在根中和种子中的表达量最高;两基因对激素IAA、6-BA和GA_(3)有不同的响应,其中AhPLT1-B受6-BA调控上调表达最显著,AhPLT5-B受6-BA、IAA和GA_(3)调控呈先升高后降低的表达模式。本研究为花生PLT基因的生物学功能研究提供了参考。
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关键词
花生
plt
转录因子
基因家族
生物信息学分析
表达分析
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职称材料
水曲柳FmPLT基因家族的鉴定及表达分析
被引量:
1
2
作者
宋婷婷
梁楠松
+5 位作者
吕义品
崔靖弘
于磊
赵福江
徐亮
詹亚光
《北京林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期11-21,共11页
【目的】PLT转录因子家族能够参与植物的再生过程,并且在植物的生长发育及器官建成中发挥着重要作用,本研究旨在探究PLT转录因子在水曲柳生长发育及非生物胁迫中发挥的作用,以期为林木优良基因选育工作提供更多思路。【方法】通过同源...
【目的】PLT转录因子家族能够参与植物的再生过程,并且在植物的生长发育及器官建成中发挥着重要作用,本研究旨在探究PLT转录因子在水曲柳生长发育及非生物胁迫中发挥的作用,以期为林木优良基因选育工作提供更多思路。【方法】通过同源序列比对和基因克隆等方法对FmPLTs家族的成员进行鉴定及分析,之后对FmPLTs成员进行了详细的生物信息学分析,包括理化性质、系统进化关系和基因结构等;并进一步分析了FmPLTs成员在不同组织及种子萌发过程中的基因表达特征,以及其在非生物胁迫(氯化钠、聚乙二醇6000、碳酸氢钠和低温4℃)和植物激素处理脱落酸、赤霉素、生长素、水杨酸和茉莉酸甲酯下的诱导表达情况。【结果】水曲柳基因组中含有9个PLT基因家族成员,分别命名为FmPLT2、FmPLT3、FmPLT4、FmPLT4A、FmPLT5、FmPLT5A、FmPLT7、FmPLT8和FmPLT9。系统进化关系将其分为5组;其在根中表达量最高,在叶中表达量最低;在种子萌发第4天子叶变绿,下胚轴伸长,此时FmPLTs成员的表达量出现峰值;而在不同激素及非生物胁迫条件下,FmPLTs对低温、干旱、盐胁迫以及MeJA的处理响应明显。【结论】FmPLTs参与水曲柳种子萌发及器官发育,并能响应植物激素信号,同时积极参与植物非生物胁迫耐受性的调控,包括低温、高盐和干旱胁迫等;本研究初步揭示了水曲柳FmPLT家族成员响应植物激素和非生物胁迫的表达模式,同时为深入分析FmPLT基因家族基本功能及其调控机制奠定了基础。
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关键词
水曲柳
plt
转录因子
基因家族
表达分析
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职称材料
题名
花生PLT基因家族全基因组鉴定与表达分析
1
作者
王晓璇
王金枝
邱鼎
殷冬梅
机构
河南农业大学农学院
出处
《山东农业科学》
北大核心
2024年第8期1-9,共9页
基金
河南省重大科技专项(221100110300)
河南省重点研发专项(221111110500)
河南省产业技术体系专项(HARS-22-05-G1)。
文摘
PLT家族是植物特有的一类转录因子,在植物胚胎、干细胞、分生组织及器官生长发育等过程都起着重要作用。本研究利用生物信息学技术在栽培种花生基因组中鉴定到12个PLT家族基因,分布在11条染色体上;AhPLT蛋白大多含有2个保守的AP2结构域,编码439~713个氨基酸,预测定位在细胞核或叶绿体中;AhPLT基因结构复杂,具有多样的短外显子结构,外显子数在5~8个之间,不同家族成员中分布不同的保守基序;AhPLT家族成员启动子区存在生长素、赤霉素和茉莉酸等激素相关的顺式作用元件。qRT-PCR结果显示,AhPLT1-B和AhPLT5-B分别在根中和种子中的表达量最高;两基因对激素IAA、6-BA和GA_(3)有不同的响应,其中AhPLT1-B受6-BA调控上调表达最显著,AhPLT5-B受6-BA、IAA和GA_(3)调控呈先升高后降低的表达模式。本研究为花生PLT基因的生物学功能研究提供了参考。
关键词
花生
plt
转录因子
基因家族
生物信息学分析
表达分析
Keywords
Arachis
hypogaea
L.
plt
transcription
factor
Gene
family
Bioinformatics
analysis
Expression
analysis
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
水曲柳FmPLT基因家族的鉴定及表达分析
被引量:
1
2
作者
宋婷婷
梁楠松
吕义品
崔靖弘
于磊
赵福江
徐亮
詹亚光
机构
东北林业大学生命科学学院
东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室
吉林省临江林业局
出处
《北京林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期11-21,共11页
基金
黑龙江省应用技术研究与开发计划项目(GA19B201)。
文摘
【目的】PLT转录因子家族能够参与植物的再生过程,并且在植物的生长发育及器官建成中发挥着重要作用,本研究旨在探究PLT转录因子在水曲柳生长发育及非生物胁迫中发挥的作用,以期为林木优良基因选育工作提供更多思路。【方法】通过同源序列比对和基因克隆等方法对FmPLTs家族的成员进行鉴定及分析,之后对FmPLTs成员进行了详细的生物信息学分析,包括理化性质、系统进化关系和基因结构等;并进一步分析了FmPLTs成员在不同组织及种子萌发过程中的基因表达特征,以及其在非生物胁迫(氯化钠、聚乙二醇6000、碳酸氢钠和低温4℃)和植物激素处理脱落酸、赤霉素、生长素、水杨酸和茉莉酸甲酯下的诱导表达情况。【结果】水曲柳基因组中含有9个PLT基因家族成员,分别命名为FmPLT2、FmPLT3、FmPLT4、FmPLT4A、FmPLT5、FmPLT5A、FmPLT7、FmPLT8和FmPLT9。系统进化关系将其分为5组;其在根中表达量最高,在叶中表达量最低;在种子萌发第4天子叶变绿,下胚轴伸长,此时FmPLTs成员的表达量出现峰值;而在不同激素及非生物胁迫条件下,FmPLTs对低温、干旱、盐胁迫以及MeJA的处理响应明显。【结论】FmPLTs参与水曲柳种子萌发及器官发育,并能响应植物激素信号,同时积极参与植物非生物胁迫耐受性的调控,包括低温、高盐和干旱胁迫等;本研究初步揭示了水曲柳FmPLT家族成员响应植物激素和非生物胁迫的表达模式,同时为深入分析FmPLT基因家族基本功能及其调控机制奠定了基础。
关键词
水曲柳
plt
转录因子
基因家族
表达分析
Keywords
Fraxinus
mandschurica
plt
transcription
factor
gene
family
expression
analysis
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
S792.153
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
花生PLT基因家族全基因组鉴定与表达分析
王晓璇
王金枝
邱鼎
殷冬梅
《山东农业科学》
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
水曲柳FmPLT基因家族的鉴定及表达分析
宋婷婷
梁楠松
吕义品
崔靖弘
于磊
赵福江
徐亮
詹亚光
《北京林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
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