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组合生物合成模块资源挖掘与开发的研究进展
1
作者 刘钦弘 王寅初 +1 位作者 王璐 焦绪栋 《黑龙江科学》 2023年第6期18-22,共5页
从数据信息和实验技术角度,综述了近年来组合生物合成模块资源的挖掘和开发利用进展,结合“点击化学(Click chemistry)”技术,对天然产物实际的组合生物合成过程中存在的若干问题进行了探讨和展望。Click化学作为组合化学(combinatorial... 从数据信息和实验技术角度,综述了近年来组合生物合成模块资源的挖掘和开发利用进展,结合“点击化学(Click chemistry)”技术,对天然产物实际的组合生物合成过程中存在的若干问题进行了探讨和展望。Click化学作为组合化学(combinatorial chemistry)领域中的新技术,可以在组合生物合成的基础上实现更多类型及更好活性的新化合物,促进组合生物合成在遗传操作和化学修饰两个维度上的拓展应用。 展开更多
关键词 组合生物合成 NRPSs pkss 模块 数据库
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南海红树林来源链霉菌Streptomyces sp.OUC6819遗传操作系统的建立 被引量：2
2
作者 刘增智 李通 +6 位作者 刘晶 姚婷婷 张慧 夏娟 李花月 车茜 李文利 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2016年第4期53-59,共7页
目的建立南海红树林来源链霉菌Streptomyces sp.OUC6819菌株的遗传转化系统,通过基因阻断方法来研究次级代谢产物的生物合成途径。方法分别以整合型载体pSET152和用于同源重组的、包含可能参与大环多烯类化合物生物合成的DNA片段的非复... 目的建立南海红树林来源链霉菌Streptomyces sp.OUC6819菌株的遗传转化系统,通过基因阻断方法来研究次级代谢产物的生物合成途径。方法分别以整合型载体pSET152和用于同源重组的、包含可能参与大环多烯类化合物生物合成的DNA片段的非复制型cosmid质粒,通过大肠杆菌—链霉菌属间接合转移导入Streptomyces sp.OUC6819之中。结果通过在接合转移过程中对菌丝体进行超声破碎,成功获得了正确的接合子。采用PCR方法验证了pSET152的导入和目标基因orf1的阻断,进一步对突变株的发酵产物进行了HPLC分析,结果显示突变株丧失了合成大环多烯类化合物的能力。结论成功建立了基于菌丝体超声破碎的海洋链霉菌遗传转化系统,为对其它基因进行遗传学操作奠定了基础,也为其它不便进行遗传操作的链霉菌提供了参考。 展开更多
关键词 STREPTOMYCES sp.OUC6819 pkss PCR-targeting 接合转移 基因敲除
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组合生物合成研究进展 被引量：2
3
作者 张能江 姚远 《国外医药（抗生素分册）》 CAS 2011年第1期10-15,31,共7页
组合生物合成是通过对微生物代谢途径中一些酶的编码基因进行操作,从而获得许多新的"非天然"天然产物。本文重点介绍聚酮合酶(PKSs)和非核糖体多肽合酶(NRPSs)的分类、作用机制及其杂合系统在组合生物合成应用研究中相关报道... 组合生物合成是通过对微生物代谢途径中一些酶的编码基因进行操作,从而获得许多新的"非天然"天然产物。本文重点介绍聚酮合酶(PKSs)和非核糖体多肽合酶(NRPSs)的分类、作用机制及其杂合系统在组合生物合成应用研究中相关报道。另外,对于PKSs和NRPSs在大肠埃希菌中的异源表达也作了简单介绍。 展开更多
关键词 组合生物合成 pkss NRPSs 异源表达
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聚酮合酶的催化机制及聚酮类化合物的组合生物合成 被引量：1
4
作者 张华茜 刘伟 杜春梅 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期400-412,共13页
聚酮类化合物(polyketides,PKs)是一类来源广泛、数目庞大的天然产物。聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)负责催化PKs的生物合成,是具有模块化结构的多功能复合酶,由一系列对称或非对称的二聚体模块组成。模块按照其功能的不同,可分为... 聚酮类化合物(polyketides,PKs)是一类来源广泛、数目庞大的天然产物。聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)负责催化PKs的生物合成,是具有模块化结构的多功能复合酶,由一系列对称或非对称的二聚体模块组成。模块按照其功能的不同,可分为加载模块、延伸模块、卸载模块。各个模块中含有多个催化域,不同的催化域在聚酮链延伸过程中扮演着不同角色。模块以首尾相连的方式排列,通过非结构多肽接头或离散的对接结构域彼此连接,形成装配线来生产PKs。PKSs按照结构域和催化机制的不同,可以分为合成大环内酯类抗生素的I型PKSs(由迭代化PKSs和模块化PKSs组成)、合成芳香族聚酮类化合物的II型PKSs(也被叫做迭代类PKSs)和合成类黄酮化合物的III型PKSs。利用组合生物合成方法,如对不同聚酮物质或同一物质的不同结构域或模块进行交换,以及特异性地插入、替代、缺失关键基因,或者通过点突变等操作,可以形成重组PKSs,进而改变聚酮类化合物的结构。选择不同的起始和延伸单元,引入不同类型的PKSs后修饰酶以及对PKSs后修饰酶基因进行改造等方法,均可用于合成非天然PKs。本文概述了3大类型聚酮合酶的结构、催化机制和组合生物合成近期研究进展,为今后合理设计产量高、效价高、化学性质稳定的新型聚酮类化合物提供参考依据。 展开更多
关键词 聚酮类化合物 聚酮合酶 结构域 模块 催化机制 组合生物合成
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真菌芳香聚酮化合物的合成生物学研究进展
5
作者 饶海密 梁冬梅 +2 位作者 李伟国 乔建军 财音青格乐 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期52-61,共10页
真菌芳香聚酮化合物是由真菌非还原聚酮合酶(NR-PKSs)催化形成的具有广泛生物活性的一类天然产物。大部分内源真菌菌株存在难培养、致病性或产率低等问题,从根本上限制了真菌芳香聚酮化合物的开发和应用。随着合成生物学和代谢工程的发... 真菌芳香聚酮化合物是由真菌非还原聚酮合酶(NR-PKSs)催化形成的具有广泛生物活性的一类天然产物。大部分内源真菌菌株存在难培养、致病性或产率低等问题,从根本上限制了真菌芳香聚酮化合物的开发和应用。随着合成生物学和代谢工程的发展,很多具有生物活性的聚酮产物实现了在工业微生物(如酿酒酵母、构巢曲霉等)中的异源生产,相关研究逐渐成为热点。从合成途径解析与挖掘、底盘细胞的构建与改造等方面综述了近年来真菌芳香聚酮化合物的合成生物学研究进展,为未来真菌芳香聚酮化合物人工代谢途径的高效构建和实现工业化生产奠定基础。 展开更多
关键词 真菌芳香聚酮 NR-pkss 生物合成途径 合成生物学 异源表达
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毛醌素(Piloquinone)生物合成基因簇的初步鉴定
6
作者 张学文 殷华 +3 位作者 周威 庄以彬 张同存 刘涛 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期76-81,共6页
通过对毛链霉菌(Streptomyces pilosus)进行基因组测序及生物信息学分析,发现基因组中分布了26个次级代谢物合成基因簇;并通过构建敲除质粒分别破坏了2个Ⅱ型聚酮化合物基因簇7pil和8pil中Ⅱ型聚酮合酶核心酶KSα和KSβ基因,获得敲除株p... 通过对毛链霉菌(Streptomyces pilosus)进行基因组测序及生物信息学分析,发现基因组中分布了26个次级代谢物合成基因簇;并通过构建敲除质粒分别破坏了2个Ⅱ型聚酮化合物基因簇7pil和8pil中Ⅱ型聚酮合酶核心酶KSα和KSβ基因,获得敲除株pil1415和pil4243;通过HPLC检测发现敲除株pil1415代谢产物中仍能检测到毛醌素的产生,而敲除株pil4243的代谢产物中检测不到毛醌素的产生,表明8pil中Ⅱ型聚酮化合物基因簇中核心酶基因的敲除阻断了毛醌素的生物合成,确定Ⅱ型聚酮化合物基因簇8pil是毛醌素的生物合成基因簇。 展开更多
关键词 毛链霉菌(Streptomyces pilosus) 毛醌素 基因组挖掘 Ⅱ型聚酮合酶
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