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Exome sequencing identifies compound heterozygous PKHD1 mutations as a cause of autosomal recessive polycystic kidney disease 被引量:8
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作者 ZHANG Da LU Lin YANG Hong-bo LI Mei SUN Hao ZENG Zheng-pei LI Xin-ping XIA Wei-bo XING Xiao-ping 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2012年第14期2482-2486,共5页
Background Autosomal recessive polycystic kidney disease (ARPKD) is a rare inherited disease, which is a disorder with multiple organ involvement, mainly the kidney and liver. It is caused by mutations in the PKHD1 ... Background Autosomal recessive polycystic kidney disease (ARPKD) is a rare inherited disease, which is a disorder with multiple organ involvement, mainly the kidney and liver. It is caused by mutations in the PKHD1 gene. Here, we reported the clinical characteristics of a case with ARPKD and analyze the genetic features of this patient as well as of his father using targeted exome sequencing and Sanger sequencing. Methods Genomic DNA was extracted from peripheral blood leukocytes obtained from a patient with ARPKD. The mutations were identified using exome sequencing and confirmed by Sanger sequencing. Results The patient was diagnosed as ARPKD based on ultrasonography and abdominal computed tomography which showed polycystic changes, multiple calcinosis of both kidneys, and multiple dilated bile ducts of the liver. Compound heterozygous PKHD1 gene mutations A979G and G5935A, which lead to substitution of an asparagine for an aspartate at amino acid 327 (N327D) and a glycine for an arginine at amino acid 1979 (G1979R) respectively, were identified using targeted exome sequencing and confirmed by Sanger sequencing for the patient. In addition, the father of the patient was identified to be a carrier of heterozygous A979G mutation of this gene. Conclusions We identified that the compound heterozygous PKHD1 gene mutations are the molecular basis of the patient with ARPKD. Targeted exome sequencing is suitable for genetic diagnosis of single-gene inherited diseases like ARPKD in which the pathogenic gene is a large. 展开更多
关键词 polycystic kidney autosomal recessive pkhd1 mutation exome sequencing
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PKHD1基因突变致常染色体隐性遗传性多囊肾病的研究进展
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作者 钱晨 林发全 《生命的化学》 CAS 2024年第4期688-693,共6页
常染色体隐性遗传性多囊肾病(autosomal recessive polycystic kidney disease,ARPKD)是一种表现为双侧肾脏肿大和肝纤维化的肝肾纤维囊性疾病。ARPKD主要是由致病基因PKHD1(polycystic kidney and hepatic disease 1)突变引起的,PKHD1... 常染色体隐性遗传性多囊肾病(autosomal recessive polycystic kidney disease,ARPKD)是一种表现为双侧肾脏肿大和肝纤维化的肝肾纤维囊性疾病。ARPKD主要是由致病基因PKHD1(polycystic kidney and hepatic disease 1)突变引起的,PKHD1编码纤维囊蛋白,纤维囊蛋白的确切功能及PKHD1基因突变导致ARPKD的具体发病机制目前尚不清楚。本文针对PKHD1基因的结构、功能、表达调控、常用检测方法及PKHD1基因突变与ARPKD关系的研究进行阐述。 展开更多
关键词 常染色体隐性遗传性多囊肾病 基因突变 pkhd1
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SVEP1 PKHD1 P53在原发性肝癌组织中的表达及其临床意义 被引量:4
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作者 王雅蕾 邱志强 +3 位作者 陈璐 程润芬 王靖怡 孙保存 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期105-110,共6页
目的:使用免疫组化法检测SVEP1、PKHD1与P53在原发性肝癌组织中的表达,结合临床病理因素分析其预测肝癌患者术后复发情况的临床意义。方法:回顾性分析2013年1月至2014年1月于天津医科大学肿瘤医院行手术切除且随访资料完整的103例原发... 目的:使用免疫组化法检测SVEP1、PKHD1与P53在原发性肝癌组织中的表达,结合临床病理因素分析其预测肝癌患者术后复发情况的临床意义。方法:回顾性分析2013年1月至2014年1月于天津医科大学肿瘤医院行手术切除且随访资料完整的103例原发性肝癌患者的临床资料。以ROC曲线为主要统计方法探究不同指标的免疫组化评分对于患者预后的预测效果。根据其临界值将患者分为高危组和低危组,以无瘤生存期主要研究指标比较两组间的差异。结果:患者中位年龄为55(21~88)岁,中位AFP水平70.6(1.03~718 840.0)μg/L,中位CA19-9水平22.89(0.6~1 000.0)kU/L,中位肿瘤大小4.5(1.0~27.0)cm。通过免疫组化法检测SVEP1、PKHD1、P53在原发性肝癌中的表达情况,表达水平使用免疫组化评分进行量化,三个指标免疫组化评分的ROC曲线中AUC面积分别为0.861、0.829、0.716,临界值分别为4、4、1分(P<0.001)。SVEP1高危组(≤4分)与低危组(>4分)3年无瘤生存率分别为4.1%和51.7%;PKHD1高危组(≤4分)与低危组(>4分)3年无瘤生存率分别为5.3%和51.9%;P53高危组(>1分)与低危组(≤1分)3年无瘤生存率分别为6.3%和27.3%,每个指标两组间差异均有统计学意义(P<0.001,<0.001,0.003)。PKHD1与SVEP1联合应用时,其ROC曲线的AUC面积为0.897(P<0.001),敏感性为76.5%,特异性为94.4%。结论:P53预测原发性肝癌复发的准确性不足,不推荐首选使用。SVEP1、PKHD1预测原发性肝癌复发准确性较高,SVEP1特异性较高,PKHD1敏感性较强,两者联用效果更佳。 展开更多
关键词 原发性肝癌 手术切除 无瘤生存期 SVEP1 pkhd1 P53
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先天性肝纤维化现状和研究进展
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作者 张一博 李新华 《临床内科杂志》 CAS 2024年第4期245-248,共4页
先天性肝纤维化(CHF)是一种罕见的疾病,其遗传学特征及发病机制尚不明确。CHF临床表现缺乏特异性且往往合并有其他器官系统的损害,在临床上诊断率低、误诊率高。该病临床目前缺乏有效的治疗药物,病理损伤过程难以逆转,治疗主要集中在并... 先天性肝纤维化(CHF)是一种罕见的疾病,其遗传学特征及发病机制尚不明确。CHF临床表现缺乏特异性且往往合并有其他器官系统的损害,在临床上诊断率低、误诊率高。该病临床目前缺乏有效的治疗药物,病理损伤过程难以逆转,治疗主要集中在并发症的管理方面,患者往往最终发展至终末期肝病,肝移植为该病唯一治愈方法。本文拟总结CHF的最新研究进展,以期全面综述并为临床提供参考。 展开更多
关键词 pkhd1 先天性肝纤维化 胆管发育异常 致病基因
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Polycystic kidney and hepatic disease 1 gene mutations in von Meyenburg complexes: Case report 被引量:4
5
作者 Su Lin Tian-Yu Shang +7 位作者 Ming-Fang Wang Jian Lin Xiao-Jian Ye Da-Wu Zeng Jiao-Feng Huang Nan-Wen Zhang Yi-Long Wu Yue-Yong Zhu 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2018年第9期296-300,共5页
Von Meyenburg complexes(VMCs) are a rare type of ductal plate malformation. We herein report two Chinese families with VMCs, and the suspicious gene mutation of this disease. Proband A was a 62-year-old woman with abn... Von Meyenburg complexes(VMCs) are a rare type of ductal plate malformation. We herein report two Chinese families with VMCs, and the suspicious gene mutation of this disease. Proband A was a 62-year-old woman with abnormal echographic presentation of the liver. She received magnetic resonance imaging(MRI) examination and liver biopsy, and the results showed she had VMCs. Histologically proved hepatocellular carcinoma was found 1 year after the diagnosis of VMCs. Proband B was a 57-year-old woman with intrahepatic diffuselesions displayed by abdominal ultrasonography. Her final diagnoses were VMCs, congenital hepatic fibrosis, and hepatitis B surface e antigen-negative chronic hepatitis B after a series of examinations. Then, all the family members of both proband A and proband B were screened for VMCs by MRI or ultrasonography. The results showed that four of the 11 family members from two families, including two males and two females, were diagnosed with VMCs. DNA samples were extracted from the peripheral blood of those 11 individuals of two VMCs pedigrees and subjected to polymerase chain reaction amplification of the polycystic kidney and hepatic disease 1(PKHD1) gene. Two different mutation loci were identified. Heterozygous mutations located in exon 32(c.4280 delG, p.Gly1427 ValfsX 6) in family A and exon 28(c.3118 C>T, p.Arg1040 Ter) in family B were detected. We speculate that PKHD1 gene mutations may be responsible for the development of VMCs. 展开更多
关键词 Von Meyenburg COMPLEXES DUCTAL PLATE MALFORMATIONS pkhd1 Gene MUTATION FIBROSIS
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PKHD1基因的分子特征和生物功能研究进展 被引量:4
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作者 付玉龙 吴冠青 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第6期684-688,共5页
PKHD1(polycystic kidney and hepatic disease1)基因定位于人染色体6p12.2.该基因在基因组内约占500kb,其中大约含86个外显子.目前所知,其最长ORF至少由67个外显子组成,编码一个由4074个氨基酸组成的单次跨膜受体样蛋白,被称为纤囊素(f... PKHD1(polycystic kidney and hepatic disease1)基因定位于人染色体6p12.2.该基因在基因组内约占500kb,其中大约含86个外显子.目前所知,其最长ORF至少由67个外显子组成,编码一个由4074个氨基酸组成的单次跨膜受体样蛋白,被称为纤囊素(fibrocystin/polycystin,FPC).PKHD1是人类常染色体隐性遗传多囊肾病(autosomal recessive polycystic kidneydisease,ARPKD)的致病基因.在小鼠中,FPC于胚胎期9.5天可在发育中的神经管、气管、原肠管等含管道的器官中被探测到.在人类,FPC在胎肾即开始表达于输尿管芽,并持续表达于输尿管芽分支演变为集合管的整个过程.在成体肾,FPC也主要表达于肾内集合管上皮细胞,其亚细胞定位于上皮细胞的管腔面的顶端,主要分布在细胞纤毛和基体附近.FPC的主要生物功能目前仍未完全明了,新近的研究表明,FPC可能作为一个膜受体样蛋白,将细胞外的信号通过结合与调节TRPP2(PKD2)钙离子介导的通道传递到细胞内,调控体内各管道上皮细胞分化、增殖、极化和移行,从而促成各种生理管道的形成. 展开更多
关键词 pkhd1 纤囊素 人类遗传性隐性多囊肾疾病 结直肠癌
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PKHD1基因缺陷与常染色体隐性遗传性多囊肾病的研究进展 被引量:2
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作者 孙丽萍 张欣洲 《生命科学》 CSCD 北大核心 2010年第10期1043-1046,共4页
PKHD1是目前所知人类常染色体隐性遗传多囊肾病(autosomal recessive polycystic kidney disease,ARPKD)的惟一致病基因。ARPKD临床病变以双肾多发性进行性充液囊泡为主要特征。目前对PKHDl基因在ARPKD发病中的作用了解并不多。该文对AR... PKHD1是目前所知人类常染色体隐性遗传多囊肾病(autosomal recessive polycystic kidney disease,ARPKD)的惟一致病基因。ARPKD临床病变以双肾多发性进行性充液囊泡为主要特征。目前对PKHDl基因在ARPKD发病中的作用了解并不多。该文对ARPKD的发病机制和PKHD1基因功能最新研究进展进行综述。 展开更多
关键词 人类遗传性隐性多囊肾疾病 pkhd1 基因缺陷
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全外显子测序检测6个囊性肾病胎儿及其核心家系的致病突变
8
作者 周静 马定远 +7 位作者 吴云 杨玲 朱爱红 李璃 罗春玉 张菁菁 胡平 许争峰 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2022年第1期6-10,共5页
目的全外显子测序技术检测6个囊性肾病胎儿及其核心家系,寻找致病变异,为遗传咨询、产前诊断或植入前诊断提供遗传学数据支持。方法应用Illumina Hiseq2500测序平台,对超声检查提示为囊性肾病、染色体微阵列检测(CMA)未见异常的胎儿标... 目的全外显子测序技术检测6个囊性肾病胎儿及其核心家系,寻找致病变异,为遗传咨询、产前诊断或植入前诊断提供遗传学数据支持。方法应用Illumina Hiseq2500测序平台,对超声检查提示为囊性肾病、染色体微阵列检测(CMA)未见异常的胎儿标本进行家系全外显子检测,参考数据库Human Genome 19(hg19/GRCh37),根据美国医学遗传学与基因组学学会指南(ACMG,2015)及指南应用建议评估变异致病性,对评级可疑致病位点应用Sanger测序验证。结果家系WES检出3个家系存在异常突变,其中1个家系的突变为遗传性,2个家系胎儿的突变为新发突变;余3个家系未检出明确致病突变。胎儿1 PKHD1基因c.5869G>A(父源)和c.9455delA复合杂合突变(母源),均为可能致病的变异。胎儿5 HNF1B基因c.826C>T杂合突变,为致病性新发突变。胎儿6 HNF1B基因c.1318G>T杂合突变,为可能致病性新发突变。Sanger测序验证结果与全外显子检测结果一致。结论对囊性肾病可运用家系核心成员全外显子检测,筛选出候选变异后进行Sanger测序验证,并对家系进行遗传分析,有助于遗传咨询、再次妊娠的产前诊断或辅助生殖的植入前诊断。本研究检出3个未见文献报道的可能致病突变位点,1个致病性突变位点已在个别文献报道但是未在国际公认数据库明确为致病突变位点,本研究拓宽了囊性肾病的致病基因位点谱。 展开更多
关键词 全外显子测序 胎儿囊性肾病 pkhd1 HNF1B
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新一代测序技术确诊1例遗传多囊肾病家系 被引量:1
9
作者 周娜 潘艳艳 +3 位作者 刘雪梅 张洪霞 刘毅 盖中涛 《中华生殖与避孕杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期658-663,共6页
目的明确1例肝肾发育异常患儿的遗传学病因。方法收集该患儿的家族史及临床资料,抽取患儿及其父母外周静脉血2 mL,对患儿基因组DNA进行新一代测序分析,并对疑似致病性突变位点进行Sanger测序验证及生物信息学预测。结果该患儿系第三胎... 目的明确1例肝肾发育异常患儿的遗传学病因。方法收集该患儿的家族史及临床资料,抽取患儿及其父母外周静脉血2 mL,对患儿基因组DNA进行新一代测序分析,并对疑似致病性突变位点进行Sanger测序验证及生物信息学预测。结果该患儿系第三胎第一产,前2胎均在围产期死亡,B超示多囊肾表现。该患儿为男性,4月大,腹部膨隆可触及质硬包块,腹部超声提示多囊肾并肝纤维化,新一代测序显示患儿PKHD1基因第30外显子c.3500T>C(p.L1167P)杂合突变,遗传自母亲;另外患儿PKHD1基因第58外显子c.9235_9236del GCins AA(p.A3079K)杂合突变,来自父亲;父母表型均正常,这2个突变均为新发现的突变。结论该患儿是由PKHD1基因的复合杂合突变导致的常染色体隐性遗传多囊肾病(ARPKD),结合家族史推断,该家系前2胎可能同样患有ARPKD。新一代测序可对该类疾病明确诊断,并有助于遗传咨询,以避免该类悲剧的再次发生。 展开更多
关键词 常染色体隐性遗传多囊肾病(ARPKD) pkhd1 新一代测序
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Pkhd1基因缺陷对雄性小鼠生育能力的影响
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作者 毛军 徐雨辰 +6 位作者 高晶晶 彭党委 窦贤明 黄振宇 程鹏 沈旭峰 张贤生 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2018年第10期1551-1555,共5页
目的观察Pkhd1基因缺陷对雄性小鼠生育能力的影响。方法取同龄成年野生型和Pkhd1基因缺陷(Pkhd1^(-/-))小鼠各10只,取附睾尾精子,观察记录两组精子各项参数:精子浓度、活力、活率及形态;另外,取同龄成年野生型和Pkhd1^(-/-)小鼠各5只,... 目的观察Pkhd1基因缺陷对雄性小鼠生育能力的影响。方法取同龄成年野生型和Pkhd1基因缺陷(Pkhd1^(-/-))小鼠各10只,取附睾尾精子,观察记录两组精子各项参数:精子浓度、活力、活率及形态;另外,取同龄成年野生型和Pkhd1^(-/-)小鼠各5只,将野生型雌鼠与之进行合笼试验,观察记录两组小鼠的各项生育指标:交配率(FM)、怀孕率(RP)及平均产仔率(ANP)。结果与野生型比较,Pkhd1基因缺陷小鼠精子浓度下降(P<0.01)、精子活力降低(P<0.01)且精子尾部形态异常;且与Pkhd1^(-/-)小鼠交配后的雌性小鼠RP显著下降(P<0.01)。结论 Pkhd1基因缺陷可降低雄性小鼠的生育力。此研究结果为男性常染色体隐性多囊肾患者在生育能力方面的潜在并发症提供了新的见解。 展开更多
关键词 男性不育 ARPKD pkhd1 精子 小鼠模型
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Possible PKHD1 Hot-spot Mutations Related to Early Kidney Function Failure or Hepatofibrosis in Chinese Children with ARPKD:A Retrospective Single Center Cohort Study and Literature Review 被引量:1
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作者 Li-ru QIU Rong-rong XU +1 位作者 Jin-hui TANG Jian-hua ZHOU 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2020年第5期835-844,共10页
PKHD1 mutations are generally considered to cause autosomal recessive polycystic kidney disease(ARPKD).ARPKD is a rare disorder and one o f the most severe conditions leading to end-stage renal disease in childhood.Wi... PKHD1 mutations are generally considered to cause autosomal recessive polycystic kidney disease(ARPKD).ARPKD is a rare disorder and one o f the most severe conditions leading to end-stage renal disease in childhood.With the biallelic deletion mutation,patients have difficulty in surviving the perinatal period,resulting in perinatal or neonatal death.This study retrospectively analyzed patient characteristics,imaging characteristics,laboratory examinations and family surveys from 7 Chinese children with different PKHD1 gene mutations diagnosed by high-throughput sequencing from January 2014 to February 2018.O f the 7 children,there were 3 males and 4 females.Eight missense mutations,two frameshift mutations,two deletion mutations,and two intronic slicing mutations were identified.Six of the mutations have not previously been identified.In the literature search,we identified a total of 29 Chinese children with PKHD1 mutations.The missense mutation c.2507T>C in exon 24 was found in one patient in our study,and five patients with liver fibrosis but normal renal function were reported in the literature.The missense mutation c.5935G>A in exon 37 was found in two patients in our study and three cases in the literature.Four patients had renal failure at an age as young as 1 year of those five patients with the missense mutation c.5935G>A in exon 37.It was concluded that:(1)Kidney length more than 2-3 SDs above the mean and early-onset hypertension might be associated with PKHDI-associated ARPICD;(2)The more enlarged the kidney size is,the lower the renal function is likely to be;(3)c.5935G>A may be a hot spot that leads to early renal failure in Chinese children with PKHD1 mutations;(4)c.2507T>C may be a hot-spot mutation associated with hepatic lesions in Chinese children with PKHD1. 展开更多
关键词 pkhd1 mutations autosomal recessive polycystic kidney disease clinical phenotype genotypic characteristics Chinese children
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小鼠Pkhd1条件性基因打靶载体的构建
12
作者 杨季云 周钦 +2 位作者 张铮 郭红 张思仲 《四川医学》 CAS 2007年第1期1-3,共3页
目的构建小鼠Pkhd1条件性基因打靶载体,为建立Pkhd1条件性敲除小鼠模型奠定基础。方法以正常小鼠(129xl/SvJ)基因组DNA为模板,扩增小鼠包括第6号外显子的Pkhd1基因部分序列,通过引入LoxP和Neo基因等步骤,建立条件性敲除Pkhd1第6号外显... 目的构建小鼠Pkhd1条件性基因打靶载体,为建立Pkhd1条件性敲除小鼠模型奠定基础。方法以正常小鼠(129xl/SvJ)基因组DNA为模板,扩增小鼠包括第6号外显子的Pkhd1基因部分序列,通过引入LoxP和Neo基因等步骤,建立条件性敲除Pkhd1第6号外显子的条件性基因打靶载体。结果经多个限制性核酸内切酶酶切鉴定和测序证实,构建的小鼠Pkhd1基因条件性打靶载体符合设计要求。结论成功构建了小鼠Pkhd1条件性基因打靶载体,为建立Pkhd1基因条件性敲除小鼠打下了基础。 展开更多
关键词 常染色体隐性遗传多囊肾病 多囊肾肝病基因 条件性基因敲除 同源重组
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Congenital hepatic fibrosis in a young boy with congenital hypothyroidism:A case report
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作者 Fang-Fei Xiao Yi-Zhong Wang +2 位作者 Fang Dong Xiao-Lu Li Ting Zhang 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2021年第6期1475-1482,共8页
BACKGROUND Congenital hepatic fibrosis(CHF)is a rare autosomal recessive disorder characterized by variable degrees of periportal fibrosis and malformation of bile ducts.CHF is generally accompanied by a variety of co... BACKGROUND Congenital hepatic fibrosis(CHF)is a rare autosomal recessive disorder characterized by variable degrees of periportal fibrosis and malformation of bile ducts.CHF is generally accompanied by a variety of conditions or syndromes with other organ involvement.CASE SUMMARY We report a 5-year-4-month-old Chinese boy with congenital hypothyroidism(CH)diagnosed with CHF.The patient was diagnosed with CH by a newborn screening test and has since been taking levothyroxine.He has developed normally without neurocognitive deficits.Abnormal liver function was observed in the patient at the age of 4 years and 11 mo,and elevated levels of liver function indices were persistent for 5 mo.Radiological imaging indicated hepatosplenomegaly without narrowing of the portal vein but dilated splenic vein.A liver biopsy confirmed the pathological features of CHF.Genetic testing revealed two novel homozygous mutations,namely,c.2141-3T>C variant in PKHD1 related to CHF and c.2921G>A(p.R974H)in DUOX2 related to CH.The patient was treated with compound glycyrrhizin tablet,ursodeoxycholic acid,and levothyroxine after diagnosis.The patient achieved a favorable clinical outcome during a follow-up period of over 2 years.CONCLUSION Herein,we report the first case of a Chinese boy with comorbidity of CHF and CH,carrying both PKHD1 gene and DUOX2 gene novel mutations.Liver biopsy and genetic testing should be considered for the diagnosis of coexistent liver disease in CH patients with unexplained abnormal liver function. 展开更多
关键词 Congenital hepatic fibrosis Congenital hypothyroidism Liver biopsy pkhd1 DUOX2 Case report Genetic testing
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婴儿型多囊肾家系PKHD1基因的突变分析 被引量:6
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作者 郭小艳 王志红 +4 位作者 廖娟 周春燕 王鸿 耿丹明 兰风华 《分子诊断与治疗杂志》 2012年第4期227-232,共6页
目的对1个婴儿型多囊肾家系的致病基因PKHD1进行突变分析。方法先证者母亲怀孕两次,胎儿均在围产期死亡,且两次胎儿彩超结果相似,符合多囊肾改变。提取先证者父母及其他成员外周血基因组DNA,PCR扩增PKHD1基因编码区并进行序列测定;找到... 目的对1个婴儿型多囊肾家系的致病基因PKHD1进行突变分析。方法先证者母亲怀孕两次,胎儿均在围产期死亡,且两次胎儿彩超结果相似,符合多囊肾改变。提取先证者父母及其他成员外周血基因组DNA,PCR扩增PKHD1基因编码区并进行序列测定;找到突变后,对相应PCR产物进行酶切鉴定或变性高效液相色谱分析,以证实突变。结果先证者家系成员序列分析表明,其父和祖母PKHD1基因第59外显子存在杂合突变(c.9901G>T),其母和外祖母PKHD1基因第53外显子存在杂合的缺失突变(c.8317delG)。两个突变均导致mRNA提前出现终止密码子。结论发现两个新的PKHD1基因突变;若胎儿同时遗传了这两个突变,将导致婴儿型多囊肾的发生。 展开更多
关键词 婴儿型多囊肾 pkhd1基因 基因突变 突变分析
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PKHD1基因新型复合杂合突变致常染色体隐性遗传多囊肾病的基因型和临床表型分析
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作者 杨钧岚 彭思琪 +4 位作者 韦致远 王彬 王凤梅 王小兵 张晓良 《中华肾脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期451-457,共7页
目的分析PKHD1基因一个新型复合杂合突变致常染色体隐性遗传多囊肾病(autosomal recessive polycystic kidney disease,ARPKD)家系的突变致病性,扩充PKHD1基因突变数据库,并探讨PKHD1基因突变致ARPKD的基因型与表型关联。方法收集PKHD1... 目的分析PKHD1基因一个新型复合杂合突变致常染色体隐性遗传多囊肾病(autosomal recessive polycystic kidney disease,ARPKD)家系的突变致病性,扩充PKHD1基因突变数据库,并探讨PKHD1基因突变致ARPKD的基因型与表型关联。方法收集PKHD1基因1个新型复合杂合突变致ARPKD的患者及家系成员的临床资料及外周血,应用高通量测序发现先证者的致病性突变,应用PCR扩增和Sanger测序对致病性突变行家系验证。应用AlphaFold软件预测突变前后蛋白结构变化,分析突变致病性。结果患者为青年男性,7岁时因肝硬化、脾功能亢进行“脾切除术”,22岁时进入终末期肾病,开始维持性腹膜透析治疗,24岁时因重症肺炎、感染性休克去世。基因检测示其PKHD1基因存在3个来自父母的复合杂合突变:1条等位基因仅携带1个来自父亲的错义突变(c.5935G>A);另1条等位基因来自其母亲,同时携带1个错义突变(c.1187G>A)和1个剪切突变(c.6332+1_6332+2insG)。患者存在1条仅携带错义突变的等位基因,解释了其相对较长的生存期。c.6332+1_6332+2insG为既往未被报告过的新型剪切突变,可导致蛋白翻译提前终止,该发现扩充了PKHD1基因突变数据库。c.1187G>A(p.S396N)和c.5935G>A(p.G1979R)分别发生在蛋白的G8结构域和PA14结构域,与患者早期且严重的肝脏表型有关。结论PKHD1基因的突变类型及氨基酸定位与ARPKD患者临床表型的异质性有关,通过预测并比较突变前后蛋白质的结构变化,可从分子层面解析突变致病性,建立基因型与表型关联,为评估患者预后和早期识别高危ARPKD患者提供重要参考。 展开更多
关键词 多囊肾 常染色体隐性 突变 遗传关联研究 pkhd1基因
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一个婴儿型多囊肾家系的PKHD1基因致病突变分析 被引量:5
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作者 项延包 李焕铮 +4 位作者 徐晨阳 董雪琴 徐雪琴 陈冲 唐少华 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期662-665,共4页
目的对一常染色体隐性遗传性多囊肾家系进行PKHDl基因突变分析,为家系遗传咨询及产前诊断提供依据。方法收集胎儿脐带血及其父母外周血,提取基因组DNA,通过二代测序法对胎儿脐血行PKHDI基因全外显子序列分析,并应用Sanger测序法明... 目的对一常染色体隐性遗传性多囊肾家系进行PKHDl基因突变分析,为家系遗传咨询及产前诊断提供依据。方法收集胎儿脐带血及其父母外周血,提取基因组DNA,通过二代测序法对胎儿脐血行PKHDI基因全外显子序列分析,并应用Sanger测序法明确可疑致病位点,用Poly Phen-2及SIFT软件对新突变位点进行致病突变分析。结果Sanger测序结果显示胎儿PKHDl基因存在c.11314C〉T(p.Arg3772*)杂合突变和c.889T〉A(p.Cys297Ser)杂合错义突变,胎儿母亲PKHD1基因存在c.11314C〉T(P.Arg3772*)杂合突变,胎儿父亲PKHD1基因存在c.889T〉A(p.Cys297Ser)杂合突变。胎儿的突变位点分别遗传自父母。Polyphem2和SIFT软件分析结果显示c.889T〉A(p.Cys297Ser)可能为致病性位点,c.11314C〉T(P.Arg3772*)突变为已报道的致病性突变。结论检测出PKHDl基因的1个新错义突变,明确了该常染色体隐性遗传婴儿型多囊肾家系的基因致病位点,这将有助于家系的遗传咨询及产前诊断。 展开更多
关键词 常染色体隐性遗传性多囊肾 pkhd1基因 基因突变
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婴儿型多囊肾1例临床表型与基因型分析 被引量:4
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作者 赵延凤 黄宇戈 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期420-423,共4页
目的探讨婴儿型多囊肾临床表型与基因型特点。方法回顾分析1例婴儿型多囊肾患儿的临床资料,分析临床表型与基因型的相关性。结果患儿于胎儿期即发现多囊肾,出生后出现气促、口吐泡沫。腹部磁共振提示双肾髓质海绵肾可能伴双肾轻度积液... 目的探讨婴儿型多囊肾临床表型与基因型特点。方法回顾分析1例婴儿型多囊肾患儿的临床资料,分析临床表型与基因型的相关性。结果患儿于胎儿期即发现多囊肾,出生后出现气促、口吐泡沫。腹部磁共振提示双肾髓质海绵肾可能伴双肾轻度积液、右肾囊肿。基因检测患儿PKHD1基因Exon15存在错义突变c.1123 C>T(Arg375Trp);PKHD1基因Exon 31存在错义突变c.3617 G>T(Gly 1206 Val),且为新型错义突变体;PKD1基因Exon 18存在错义突变c.7211 G>A(Arg 2404 Gln),为复合杂合突变纯合子;突变性质均为错义突变。患儿经治疗后好转出院,随访至4个月,肾功能无异常。结论基因检测可早期诊断婴儿型多囊肾,存在两个错义突变的新生儿可以生存,新发现Exon 31突变c.3617 G>T(Gly 1206 Val)。 展开更多
关键词 常染色体隐性遗传性多囊肾 pkhd1基因 PKD1基因 错义突变
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一个常染色体隐性多囊肾家系的PKHD1基因变异分析
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作者 李茜 童鸣 +2 位作者 马玲 孙安萍 胡苏玮 《中国优生与遗传杂志》 2024年第2期352-354,共3页
目的 对一个常染色体隐性多囊肾(ARPKD)家系进行基因变异分析,推断出可能的遗传学病因。方法 收集胎儿及父母的临床资料及样本DNA,应用高通量测序技术对胎儿进行测序分析,筛选候选基因变异位点,以Sanger测序验证变异位点并对父母进行溯... 目的 对一个常染色体隐性多囊肾(ARPKD)家系进行基因变异分析,推断出可能的遗传学病因。方法 收集胎儿及父母的临床资料及样本DNA,应用高通量测序技术对胎儿进行测序分析,筛选候选基因变异位点,以Sanger测序验证变异位点并对父母进行溯源检测。结果 测序结果显示胎儿PKHD1基因存在第4外显子c.279_281+13delinsA(p.Arg94fs)和第58外显子c.9769C>T(p.Gln3257^(*))的复合杂合变异,分别来自父亲和母亲。结论 该ARPKD家系的遗传学病因可能为PKHD1基因的复合杂合变异,新变异的检出扩展了PKHD1基因的变异分布谱系,并为家系的遗传咨询和再生育指导提供了分子依据。 展开更多
关键词 多囊肾 常染色体隐性遗传 pkhd1基因 全外显子组测序
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先天性肝纤维化20例的临床及病理特征
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作者 王傲 卢子剑 +2 位作者 谷夏斐 刘键平 鲁昌立 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1187-1191,共5页
目的探讨先天性肝纤维化(CHF)的临床病理特征。方法收集2017-2023年四川大学华西医院CHF病例20例,进行临床及病理特征分析。结果20例患者中,男性8例,女性12例,中位发病年龄21.5岁。主要临床表现为肝硬化、门静脉高压及上消化道出血。病... 目的探讨先天性肝纤维化(CHF)的临床病理特征。方法收集2017-2023年四川大学华西医院CHF病例20例,进行临床及病理特征分析。结果20例患者中,男性8例,女性12例,中位发病年龄21.5岁。主要临床表现为肝硬化、门静脉高压及上消化道出血。病理学特征为汇管区弥漫性纤维化,形成宽窄不一的纤维间隔,分割肝实质,细胆管增生。1例(5%)并Caroli病,1例(5%)并HNF1α肝细胞腺瘤。免疫组织化学谷氨酰胺合成酶检测示75%CHF为腺泡3区的阳性表达。结论CHF主要临床表现为门静脉高压及其并发症,组织学检查是诊断金标准。对儿童或青少年发现门静脉高压症,但无肝炎病史,合并肾病者,应首先考虑CHF的可能性。谷氨酰胺合成酶免疫组织化学检查腺泡3区的阳性模式有助于CHF的诊断,对预后有一定的提示作用。 展开更多
关键词 先天性肝纤维化 门静脉高压 肝硬化 pkhd1基因突变
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婴儿型多囊肾家系产前PKHD1基因诊断及遗传咨询 被引量:3
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作者 曹琴英 张为霞 +5 位作者 葛军 孙东兰 冯青奇 李彩霞 孟玉翠 朱俊真 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2019年第8期765-768,共4页
目的对两个婴儿型多囊肾家系进行PKHD1致病基因突变位点分析,进一步为家系提供遗传咨询和产前诊断。方法采集先证者及其父母的临床资料及血样,以及胎儿的羊水细胞,提取基因组DNA,PCR扩增PKHD1基因第32,第61外显子,扩增产物纯化后测序,... 目的对两个婴儿型多囊肾家系进行PKHD1致病基因突变位点分析,进一步为家系提供遗传咨询和产前诊断。方法采集先证者及其父母的临床资料及血样,以及胎儿的羊水细胞,提取基因组DNA,PCR扩增PKHD1基因第32,第61外显子,扩增产物纯化后测序,突变位点再进行Sanger测序验证。结果家系1先证者PKHD1基因存在第32外显子c.4274T>G(p.Leu1425Arg)与第61外显子c.10445G>C(p.Arg3482Pro)的复合杂合突变,分别来自其父亲及母亲;本次妊娠胎儿羊水细胞染色体核型未发现异常,胎儿携带PKHD1基因第32外显子c.4274T>G(p.Leu1425Arg)杂合突变,出生后表型正常。家系2为有2次胎儿型多囊肾不良妊娠史夫妇,妻子携带PKHD1基因c.5979_5981delTGG杂合突变,丈夫携带PKHD1基因c.9455delA杂合突变,本次妊娠胎儿脐血染色体核型未发现异常,基因检测因DNA含量低导致失败。根据突变类型及生物信息学软件预测可能均为致病性突变。结论PKHD1基因的c.4274T>G(p.Leu1425Arg)、c.10445G>C(p.Arg3482Pro)、c.5979_5981delTGG及c.9455delA可能为研究家系的致病性基因突变,本研究结果有助于两个家系行遗传咨询和产前诊断。 展开更多
关键词 婴儿型多囊肾 pkhd1基因 基因突变 产前基因诊断 遗传咨询
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