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PIK3R1基因低甲基化在肺腺癌中的临床意义
被引量:
1
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作者
田甜
陈港军
+2 位作者
胡创
蔡兴东
赖文佳
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2023年第4期358-370,共13页
目的:为早期筛查、获取有效诊治手段来提高肺腺癌(LUAD)患者的总体生存率,探索PIK3R1基因低甲基化指标对肺腺癌诊疗及预后判断的影响。方法:使用大型公共数据库:TCGA、GEO、GEPIA2、UALCAN、KaplanMeier Plotter、LinkedOmics和TIMER进...
目的:为早期筛查、获取有效诊治手段来提高肺腺癌(LUAD)患者的总体生存率,探索PIK3R1基因低甲基化指标对肺腺癌诊疗及预后判断的影响。方法:使用大型公共数据库:TCGA、GEO、GEPIA2、UALCAN、KaplanMeier Plotter、LinkedOmics和TIMER进行在线分析。在LUAD人群不同的临床特征亚组中构建单变量和多变量COX比例风险模型。结果:低表达的PIK3R1会导致LUAD患者的总生存期(OS)、首次进展后生存期(FP)和疾病进展后生存期(PPS)较差。性别、肿瘤分期、吸烟史、T分型、N分型和PIK3R1低表达是LUAD发病的危险因素,低表达的PIK3R1是LUAD的潜在独立危险因素。DNA甲基化分析显示,探针ID(包括cg01239651、cg24797508、cg16664523和cg25008444)的PIK3R1启动子内CpGs的低甲基化通过DNA甲基转移酶(DNMT1)降低PIK3R1的表达。ROC曲线分析显示,PIK3R1的甲基化和表达在LUAD的准确诊断中具有高灵敏度和特异度。免疫分析研究表明,PIK3R1低甲基化和表达与免疫细胞(B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞)浸润有关。此外,共表达基因(PGR、C5orf41、SCN7A、RBMS3、FAT4、RASSF2、A2M、ITGA8、FLI1和RECK)通常与PIK3R1具有相似的功能。结论:PIK3R1的低甲基化及表达可视为肺腺癌的一种特异性诊断生物标志物和独立的预后因素,并可以预测免疫治疗的有效性。
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关键词
DNA甲基化
PIK3R1生物标志物
肺腺癌
预后因素
免疫治疗效果
PI3K通路
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题名
PIK3R1基因低甲基化在肺腺癌中的临床意义
被引量:
1
1
作者
田甜
陈港军
胡创
蔡兴东
赖文佳
机构
暨南大学附属第一医院呼吸科
暨南大学附属第一医院胸外科
暨南大学第一临床医学院口腔医学交叉学科临床研究平台
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2023年第4期358-370,共13页
基金
国家自然科学基金青年项目(81302030)。
文摘
目的:为早期筛查、获取有效诊治手段来提高肺腺癌(LUAD)患者的总体生存率,探索PIK3R1基因低甲基化指标对肺腺癌诊疗及预后判断的影响。方法:使用大型公共数据库:TCGA、GEO、GEPIA2、UALCAN、KaplanMeier Plotter、LinkedOmics和TIMER进行在线分析。在LUAD人群不同的临床特征亚组中构建单变量和多变量COX比例风险模型。结果:低表达的PIK3R1会导致LUAD患者的总生存期(OS)、首次进展后生存期(FP)和疾病进展后生存期(PPS)较差。性别、肿瘤分期、吸烟史、T分型、N分型和PIK3R1低表达是LUAD发病的危险因素,低表达的PIK3R1是LUAD的潜在独立危险因素。DNA甲基化分析显示,探针ID(包括cg01239651、cg24797508、cg16664523和cg25008444)的PIK3R1启动子内CpGs的低甲基化通过DNA甲基转移酶(DNMT1)降低PIK3R1的表达。ROC曲线分析显示,PIK3R1的甲基化和表达在LUAD的准确诊断中具有高灵敏度和特异度。免疫分析研究表明,PIK3R1低甲基化和表达与免疫细胞(B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞)浸润有关。此外,共表达基因(PGR、C5orf41、SCN7A、RBMS3、FAT4、RASSF2、A2M、ITGA8、FLI1和RECK)通常与PIK3R1具有相似的功能。结论:PIK3R1的低甲基化及表达可视为肺腺癌的一种特异性诊断生物标志物和独立的预后因素,并可以预测免疫治疗的有效性。
关键词
DNA甲基化
PIK3R1生物标志物
肺腺癌
预后因素
免疫治疗效果
PI3K通路
Keywords
DNA methylation
PIK3R1 biomarker
lung adenocarcinoma
prognostic factor
immunotherapy effectiveness
PI3K pathway
分类号
R563.9 [医药卫生—呼吸系统]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PIK3R1基因低甲基化在肺腺癌中的临床意义
田甜
陈港军
胡创
蔡兴东
赖文佳
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2023
1
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