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二花脸猪FSHR座位PCR-SSCP标记与产活仔数的关系 被引量:14
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作者 陈杰 刘红林 +1 位作者 姜志华 吴彦宁 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期53-56,共4页
采用PCR SSCP (PCR 单链构型多态性 )作为遗传标记 ,对二花脸猪促卵泡素受体 (FSHR)基因座位与产活仔数性状的关系进行了研究。结果表明 ,PCR SSCP分型共产生 2种等位基因 ,3种基因型。对不同标记基因型的二花脸猪群头胎产活仔数、头三... 采用PCR SSCP (PCR 单链构型多态性 )作为遗传标记 ,对二花脸猪促卵泡素受体 (FSHR)基因座位与产活仔数性状的关系进行了研究。结果表明 ,PCR SSCP分型共产生 2种等位基因 ,3种基因型。对不同标记基因型的二花脸猪群头胎产活仔数、头三胎产活仔数之和 ,及最高产活仔数进行单因子方差分析 ,发现该标记座位与最高产活仔数显著相关 ,其贡献率达 10 9%。基因效应分析表明 ,等位基因B的加性效应值为 0 37头 ,等位基因A的加性效应值为 - 0 6 0头。 展开更多
关键词 二花脸猪 促卵泡素受体(FSHR) pcr-单链构型多态性 产活仔数
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结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB突变特征初步分析 被引量:22
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作者 刘敬华 张丽水 +4 位作者 刘志广 黄明翔 赵秀芹 王琳 万康林 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期973-976,共4页
目的阐明结核分枝杆菌利福平耐药株rpoB基因突变特点。方法对110株结核分枝杆菌临床分离株包括rpoB基因利福平耐药决定区(RRDR)81个碱基在内的286 bp片段进行聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析,并对经检测显示有突变的结核分... 目的阐明结核分枝杆菌利福平耐药株rpoB基因突变特点。方法对110株结核分枝杆菌临床分离株包括rpoB基因利福平耐药决定区(RRDR)81个碱基在内的286 bp片段进行聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析,并对经检测显示有突变的结核分枝杆菌rpoB基因此扩增区域进行序列测定。其中利福平耐药株73株,非利福平耐药株11株,敏感株26株。结果PCR-SSCP检测显示利福平耐药株中有47株有突变存在,经直接测序分析其中76.6%的菌株存在rpoB基因的单位点突变,主要集中在531位(61.1%)和526位(25.0%);联合突变发生率为23.4%。此外,经PCR-SSCP检测,11株非利福平耐药株中2株有突变存在,26株敏感株中1株有突变存在。经直接测序分析突变涉及位点为511位、526位和535位。结论rpoB基因耐药决定区发生突变是结核分枝杆菌利福平耐药的主要原因,其中531位丝氨酸和526位组氨酸是最常见的突变位点。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 耐药 聚合酶链反应-单链构象多态性
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浙江省耐药结核分枝杆菌katG、rpoB、embB基因突变特点研究 被引量:14
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作者 朱敏 范玉美 +2 位作者 盛国平 李君 李锋 《医学研究杂志》 2008年第3期26-29,共4页
目的了解浙江省耐异烟肼、利福平、乙胺丁醇结核分枝杆菌katG、rpoB、embB基因突变特点。方法以结核分枝杆菌标准株H37RV为对照,应用聚合酶链反应——单链构象多态性(PCR-SSCP)技术、聚合酶链反应——直接测序(PCR-DS)技术检测100株耐... 目的了解浙江省耐异烟肼、利福平、乙胺丁醇结核分枝杆菌katG、rpoB、embB基因突变特点。方法以结核分枝杆菌标准株H37RV为对照,应用聚合酶链反应——单链构象多态性(PCR-SSCP)技术、聚合酶链反应——直接测序(PCR-DS)技术检测100株耐药结核分枝杆菌临床分离株katG、rpoB、embB基因。结果经PCR-DS检测katG基因突变率达54.8%,以Ser315Thr突变最常见(40.3%);在耐利福平菌株中,rpoB基因突变率达88.9%,以526、531位氨基酸改变最常见,总突变率达77.8%(63/81);在耐乙胺丁醇菌株中,embB基因突变率达60%,以Met306VaI改变最常见(28.9%)。结论PCR-SSCP技术操作简单、检测快速,可作为临床耐药检测的辅助手段;浙江省结核菌耐药基因突变位点同国内研究基本一致,各位点突变形式所占比例有自身特点。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 耐药 聚合酶链反应-单链构象多态性 序列分析
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E-选择素基因多态性与冠心病相关性研究 被引量:7
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作者 罗晓颖 戚文航 +2 位作者 陆国平 何汝敏 黄啸予 《上海第二医科大学学报》 CSCD 2003年第3期220-222,共3页
目的 探讨E-选择素基因多态性与中国人群冠心病发病的关系。 方法 93例年龄≤60岁的冠心病患者和97例年龄性别匹配的非冠心病对照者,运用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和直接测序技术对E-选择素基因全部外显子及其两翼的部... 目的 探讨E-选择素基因多态性与中国人群冠心病发病的关系。 方法 93例年龄≤60岁的冠心病患者和97例年龄性别匹配的非冠心病对照者,运用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和直接测序技术对E-选择素基因全部外显子及其两翼的部分内含子进行筛查。 结果 发现3个E-选择素基因多态性:2号外显子5’非翻译区存在G98→T所致的G98T多态性(G/T等位基因);4号外显子EGF结构域中存在A561→C所致的Ser128Arg多态性(A/C等位基因);11号外显子膜结构域中存在一个新的A1856→G所致的A1856G多态性(A/G等位基因)。在冠心病组中,T和C等位基因频率显著高于对照组(P=0.01,P=0.03)。 结论 T和C等位基因可能是中国人群中年龄≤60岁冠心病患者的遗传危险因素。 展开更多
关键词 E-选择素 基因多态性 冠心病 相关性 发病机制 pcr-SSCP 动脉粥样硬化 遗传病理学
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MUS81基因在喉癌中的突变和表达 被引量:5
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作者 李婵媛 王淑云 +5 位作者 袁海明 李巍 李子政 李晓渝 郭星 李福才 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期560-565,共6页
目的探讨MUS81基因突变和表达与喉癌发生发展的相关性。方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性分析技术结合DNA测序检测分析了42例喉癌患者MUS81基因第9、10外显子的突变;应用半定量逆转录-PCR和Western印迹方法分析MUS81基因在喉癌组... 目的探讨MUS81基因突变和表达与喉癌发生发展的相关性。方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性分析技术结合DNA测序检测分析了42例喉癌患者MUS81基因第9、10外显子的突变;应用半定量逆转录-PCR和Western印迹方法分析MUS81基因在喉癌组织中的表达情况。结果42例喉癌、癌旁组织标本中,癌旁正常组织均无突变,喉癌组织标本中19例发生突变,占45.2%(19/42),11例喉癌组织第9外显子发现有突变,占26.2%(11/42),8例喉癌组织第10外显子有突变,占19%(8/42),分析表明具有统计学意义(P〈0.01)。逆转录.PCR结果表明,42例喉癌中有17例MUS81基因mRNA低表达,占40.48%(17/42)。Western印迹方法分析结果表明,42例喉癌中有17例MUS81蛋白质低表达,占40.48%(17/42),经统计学分析肿瘤组与对照组差异有统计学意义(P〈0.01)。分析表明MUS81基因突变与mRNA和蛋白质低表达有显著相关性(P〈0.01)。统计结果显示喉癌MUS81基因突变与TNM分期、年龄和淋巴结转移无相关性(P〉0.05)。MUS81基因低表达与TNM分期、年龄和淋巴结转移无相关性(P〉0.05)。结论发现MUS81基因在喉癌组织中有突变发生及表达异常,提示MUS81基因突变和表达异常可能是喉癌发生及发展的重要因素之一。 展开更多
关键词 喉鳞状细胞癌 MUS81基因 聚合酶链反应-单链构象多态性
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Study of Mutation in Tyrosine Protein Kinase of Insulin Receptor Gene in Patients with Polycystic Ovarian Syndrome 被引量:1
6
作者 Min LI, Hong-yu QIU, Yong-yu SUN, Hong-fa LI, Yong-li CHU Department of Obstetrics and Gynecology, Xiehe Hospital, Tongji Medical College, Huazhong Science and Technology University, Wuhan 430022, China 《Journal of Reproduction and Contraception》 CAS 2003年第1期11-20,共10页
Objective To explore the molecular mechanism of insulin resistance in the patients with polycystic ovarian syndrome (PCOS)Methods Polymerase chain reaction, silver staining-single strand conformation poly-morphism(PCR... Objective To explore the molecular mechanism of insulin resistance in the patients with polycystic ovarian syndrome (PCOS)Methods Polymerase chain reaction, silver staining-single strand conformation poly-morphism(PCR-SSCP) and DNA direct sequencing were used to detect the mutation of insulin receptor (INSR) gene in exon 17-21 with the abdominal wall adipose tissue from 31 patients with PCOS (PCOS Group) and 30 patients with pure hysteromyoma in reproductive lift (Control Group).Results Tiventy-two variant SSCP patterns in exon 17 of INSR gene were detected. Direct sequence analysis of exon 17 showed that homozygous nonsense mutation was two alleles single nucleotide polymorphism (SNP) at the codon 1058 (CAC→CAT). Exons 18-21were not detected with any significantly mutation. The INSR gene His1058C→ T substitution collecting rate and insulin resistance were significantly higher in the PCOS group than in the control group (P = 0. 0293, P<0. 05, P<0. 01). Conclusion It is suggested that the SNP in codon 1058 of the INSR gene might be related with the insulin resistance in PCOS patients, which has hereditary tendency. And the missense mutation,nonsense mutation and frameshift mutation at exons 18-21 in tyrosine protein kinase region of INSR gene for PCOS patients were not frequently observed. 展开更多
关键词 polycystic ovarian syndrome insulin resistance insulin receptor gene pcr-single strand conformation polymorphism single nucleotide polymorphism
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Poly(ADP-ribose) polymerase-1 gene polymorphism in various Chinese nationalities
7
作者 Hairong Liang Junli Shao +4 位作者 Yuting Gao Linhua Liu Juanxiu Dai Yun He Huanwen Tang 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2011年第9期699-705,共7页
Poly (ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) can exacerbate ischemic brain injury and lessen ischemic neuronal death, which may be associated with PARP-1 polymorphisms. The present study investigated human PARP-1 gene ... Poly (ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) can exacerbate ischemic brain injury and lessen ischemic neuronal death, which may be associated with PARP-1 polymorphisms. The present study investigated human PARP-1 gene polymorphisms in various Chinese nationalities, the results of which could potentially help in the treatment and prevention of neurologic diseases. Genetic polymorphisms of seven exons in the PARP-1 gene, in 898 Chinese Han, Buyi, Shui, Miao, and Zhuang subjects, were investigated by PCR-single-strand conformation polymorphism. A single-strand conformation polymorphism variant in exons 12, 13, 16, and 17 of the PARP-1 gene was identified in 148 people, with two stationary bands showing three degenerative single strands. Results showed that the PARP-1 gene polymorphisms exist in various nationalities, and may act as a biomarker for susceptibility to disease. 展开更多
关键词 poly (ADP-ribose) polymerase-1 genetic polymorphism pcr-single-strand conformation polymorphism
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p73基因在鼻咽癌组织中的表达及突变分析 被引量:1
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作者 杨旭 雷科 龚静蓉 《中国耳鼻咽喉颅底外科杂志》 CAS 2011年第4期248-251,共4页
目的研究鼻咽癌组织中p73基因的表达和突变。方法运用实时定量逆转录聚合酶链反应技术(real time quantitative Reverse Transcription polymerase chain reaction,RQ-RT-PCR)检测鼻咽癌和鼻咽炎组织中p73基因的表达,应用单链构象多态... 目的研究鼻咽癌组织中p73基因的表达和突变。方法运用实时定量逆转录聚合酶链反应技术(real time quantitative Reverse Transcription polymerase chain reaction,RQ-RT-PCR)检测鼻咽癌和鼻咽炎组织中p73基因的表达,应用单链构象多态性分析技术(Single Strand Conforma-tion Polymorphism,SSCP)检测p 7 3基因的突变。结果 5 8例鼻咽癌组织中p 7 3基因表达水平经内参校正后为3.56±3.14,与鼻咽组(1.93±1.39)相比差异有统计学意义(P<0.01)。p 7 3基因的表达与鼻咽癌临床分期有关,Ⅲ、Ⅳ期高于Ⅰ、Ⅱ期,差异有统计学意义(P<0.0 5)。SSCP检测发现1例鼻咽癌组织出现p 7 3基因突变,突变率1.7 2%;鼻咽炎组织未发现突变。结论鼻咽癌组织中存在p73基因的过表达现象,P73基因的异常表达及突变与鼻咽癌的发生发展存在一定的关系。 展开更多
关键词 鼻咽癌 P73基因 基因突变 基因突变实时定量逆转录聚合酶链反应 单链构象多态性分析
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急性髓系白血病患者转录因子CCAAT/增强子结合蛋白α基因突变研究 被引量:1
9
作者 赵晋梅 王宏伟 +3 位作者 徐智芳 朱镭 白波 葛晓燕 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期299-302,共4页
目的探讨髓系转录因子CCAAT/增强子结合蛋白α(C/EBPα)基因突变与急性髓系白血病(AML)发生的关系。方法采用聚合酶链反应单链构象多态性(PCRSSCP)分析联合测序的方法检测48例AML患者骨髓标本,11名正常体检者的外周血标本C/EBPα基因突... 目的探讨髓系转录因子CCAAT/增强子结合蛋白α(C/EBPα)基因突变与急性髓系白血病(AML)发生的关系。方法采用聚合酶链反应单链构象多态性(PCRSSCP)分析联合测序的方法检测48例AML患者骨髓标本,11名正常体检者的外周血标本C/EBPα基因突变情况。结果经PCRSSCP检测,48例AML患者中有5例(10.4%)存在突变。经测序证实有4种重复,1种缺失,均为新的突变类型。结论C/EBPα基因在少数AML患者中存在不同类型的突变,其变异可能与某些AML的发生有关。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 转录因子 CCAAT/增强子结合蛋白α 基因突变
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4个鸡品种TPK1基因的PCR-SSCP分析
10
作者 孟春玲 徐琪 +2 位作者 王克华 包文斌 陈国宏 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期39-42,共4页
以鸡硫胺焦磷酸激酶(TPK1)基因为候选基因,隐性白羽鸡、泰和乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP方法对TPK1所有外显子及3′-调控区进行单核苷酸多态性(SNP)筛查,探讨不同基因型与不同鸡品种肌肉硫胺素含量的关系。结果表明:... 以鸡硫胺焦磷酸激酶(TPK1)基因为候选基因,隐性白羽鸡、泰和乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡为试验材料,采用PCR-SSCP方法对TPK1所有外显子及3′-调控区进行单核苷酸多态性(SNP)筛查,探讨不同基因型与不同鸡品种肌肉硫胺素含量的关系。结果表明:在3′-调控区发现了1个SNP位点,其纯合子AA型与BB型相比有一个C2132T的单碱基突变,CC型与BB型相比有一个C2132A的单碱基突变。等位基因A和B的频率极显著高于等位基因C的频率,且泰和乌骨鸡与白耳鸡差异显著,故推测所检测到的基因座与肌肉硫胺素含量相关。 展开更多
关键词 硫胺焦磷酸激酶 单核苷酸多态性 pcr—SSCP
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多药耐药相关蛋白1和2基因突变对地方性砷中毒患者表型的影响
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作者 张蕊 侯文胜 +9 位作者 高艳芳 苏林梁 梁江 高怡 田凤洁 韩光 穆进军 范淑兰 张爱民 裴秋玲 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期14-19,共6页
目的探讨多药耐药相关蛋白1和2(MRP1、MRP2)基因突变对地方性砷中毒患者表型的影响。方法在山西省饮水型地方性砷中毒高发区朔州市朔城区的3个自然村,对常住人口采用单纯随机抽样法抽样并进行问卷调查,从问卷中筛选出在当地居住20... 目的探讨多药耐药相关蛋白1和2(MRP1、MRP2)基因突变对地方性砷中毒患者表型的影响。方法在山西省饮水型地方性砷中毒高发区朔州市朔城区的3个自然村,对常住人口采用单纯随机抽样法抽样并进行问卷调查,从问卷中筛选出在当地居住20年以上的居民作为凋查对象并进行临床检查。依据《地方性砷中毒诊断标准〉〉(WS/T211-2001),将临床诊断为地方性砷中毒的75名患者作为砷中毒组,其余164人作为对照组。采集两组人群外周血,其中砷中毒组75份,对照组118份,提取DNA。对MRP1基因第2、17、23外显子和MRP2基因第10、18、31外显子进行扩增,采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR—SSCP)方法检测目的基因的突变情况,并应用多元Logistic回归模型比较基因突变率在砷中毒组和对照组间的差异。结果共收回有效问卷239份,其中砷中毒组75份,对照组164份。两组人群在年龄[(58.85±11.26)岁与(45.73±11.92)岁]、性别[男性57.3%(43/75)与27.4%(45/164)]、吸烟[46.7%(35/75)与21-3%(35/164)]、农药接触史[41.3%(31/75)与29.3%(48/164)]比较,差异有统计学意义[比值比(OR)分别为3.378、3.553、3.225、1.864,P〈0.叭或〈0.05];在饮酒[17.3%(13/75)与8.5%(14/164)]、果蔬摄入[5.3%(4/75)与9.1%(15/164)]、肉蛋奶摄入[34.7%(26/75)与30.5%(50/164)]比较,差异无统计学意义(OR值分别为1.836、0.560、1.210,P〉0.05)。MRP1的第23外显子和MRP2的第18外显子在砷中毒组和对照组中均未检测到突变:MRP1的第2外显子在砷中毒组和对照组中突变检出率分别为8.00%(6/75)和5.93%(7/118),第17外显子突变检出率分别为13.33%(10/75)和8.47%(10/118);MRP2第10外显子突变检出率分别为22.67%(17/75)� 展开更多
关键词 砷中毒 多药耐药相关蛋白 基因突变 聚合酶链反应-单链构象多态性
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甘肃高山细毛羊和小尾寒羊DQB1基因第2外显子多态性及其与乳房炎相关性 被引量:7
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作者 宋晓育 张小丽 +3 位作者 马小军 李发弟 张晨 张欣 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第5期1070-1077,共8页
为探讨绵羊MHC-DQB1第2外显子基因多态性与乳房炎的抗性,采用PCR-SSCP方法对200只甘肃高山细毛羊和212只小尾寒羊MHC-DQB1第2外显子基因多态性进行了分析。结果表明,甘肃高山细毛羊和小尾寒羊的MHC-DQB1基因第2外显子均存在丰富多态性,... 为探讨绵羊MHC-DQB1第2外显子基因多态性与乳房炎的抗性,采用PCR-SSCP方法对200只甘肃高山细毛羊和212只小尾寒羊MHC-DQB1第2外显子基因多态性进行了分析。结果表明,甘肃高山细毛羊和小尾寒羊的MHC-DQB1基因第2外显子均存在丰富多态性,2个绵羊品种共检测出14个等位基因,卡方适合性检验结果显示2个绵羊品种的SSCP带型均未达到哈德温伯格平衡。甘肃高山细毛羊中等位基因B(P<0.01,RR=0.158)与乳房炎抗性有较强相关性,等位基因F(P<0.01,RR=3.513)和L(P<0.01,RR=10.197)与乳房炎易感性具有较强相关性;小尾寒羊等位基因A(0.01<P<0.05,RR=0.878)与乳房炎抗性有相关性,等位基因E(P<0.01,RR=3.333)和M(P<0.01,RR=8.000)与乳房炎易感性具有较强相关性。表明2个绵羊品种的DQB1第2外显子存在丰富的多态性,甘肃高山细毛羊的等位基因B、F、L和小尾寒羊的等位基因A、E、M与乳房炎抗性和易感性相关。 展开更多
关键词 MHC-DQB1基因第2外显子 pcr-SSCP 乳房炎 甘肃高山细毛羊 小尾寒羊
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多囊卵巢综合征患者胰岛素受体基因酪氨酸蛋白激酶域突变的研究 被引量:5
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作者 李曼 邱红玉 +1 位作者 孙永玉 李红发 《生殖与避孕》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期270-274,321,共5页
目的:探讨多囊卵巢综合征(PCOS)胰岛素抵抗的分子发病机理。方法:应用聚合酶链反应-单链构象多态性银染技术结合DNA直接测序,检测PCOS患者及育龄期单纯子宫肌瘤患者腹壁脂肪组织中的胰岛素受体(INSR)基因17~21外显子的突变。结果:发现2... 目的:探讨多囊卵巢综合征(PCOS)胰岛素抵抗的分子发病机理。方法:应用聚合酶链反应-单链构象多态性银染技术结合DNA直接测序,检测PCOS患者及育龄期单纯子宫肌瘤患者腹壁脂肪组织中的胰岛素受体(INSR)基因17~21外显子的突变。结果:发现22例外显子17的异常电泳条带,经测序分析,证实为CAC^(1058)→CAT^(1058)的二等位单核苷酸多态性。外显子18~21未检测到任何有意义突变。PCOS组与对照组相比较,17外显子His^(1058)C→T替换检出率及胰岛素抵抗程度均明显增高。结论:PCOS患者INSR基因酪氨酸蛋白激酶域18~21外显子的错义、无义及移码突变并不常见,17外显子的C/T SNP可能与多囊卵巢综合征有遗传倾向的胰岛素抵抗状态有关。 展开更多
关键词 多囊卵巢综合征 胰岛素抵抗 胰岛素受体基因 聚合酶链反应-单链构象多态性(pcr—SSCP) 单核苷酸多态性
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The effect of decreasing alkalinity on microbial community dynamics in a sulfate-reducing bioreactor as analyzed by PCR-SSCP 被引量:4
14
作者 REN Nanqi1, ZHAO Yangguo1, WANG Aijie1, GAO Chongyang2, SHANG Huaixiang1, LIU Yiwei1 & WAN Chunli1 1. School of Environmental and Municipal Engineering, Harbin Institute of Technology, Harbin 150090, China 2. Key Laboratory of Forest Plant Ecology, Ministry of Education, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2006年第4期370-378,共9页
PCR-single-strand conformation polymorphism (SSCP) and Southern blotting tech-niques were adopted to investigate microbial community dynamics in a sulfate-reducing bioreactor caused by decreasing influent alkalinity. ... PCR-single-strand conformation polymorphism (SSCP) and Southern blotting tech-niques were adopted to investigate microbial community dynamics in a sulfate-reducing bioreactor caused by decreasing influent alkalinity. Experimental results indicated that the sulfate-removal rate approached 87% in 25 d under the conditions of influent alkalinity of 4000 mg/L (as CaCO3) and sul-fate-loading rate of 4.8 g/(L·d), which indicated that the bioreactor started up successfully. The analy-sis of microbial community structure in this stage showed that Lactococcus sp., Anaerofilum sp. and Kluyvera sp. were dominant populations. It was found that when influent alkalinity reduced to 1000 mg/L, sulfate-removal rate decreased rapidly to 35% in 3 d. Then influent alkalinity was increased to 3000 mg/L, the sulfate-removal rate rose to 55%. Under these conditions, the populations of Dysgo-nomonas sp., Sporobacte sp., Obesumbacterium sp. and Clostridium sp. got to rich, which predomi-nated in the community together with Lactococcus sp., Anaerofilum sp. and Kluyvera sp. However, when the alkalinity was decreased to 1500 mg/L, the sulfate-removal rate rose to and kept stable at 70% and populations of Dysgonomonas sp., Sporobacter sp. and Obesumbacterium sp. died out, while some strains of Desulfovibrio sp. and Clostridium sp. increased in concentration. In order to determine the minimum alkalinity value that the system could tolerate, the influent alkalinity was de-creased from 1500 to 400 mg/L secondly. This resulted in the sulfate-removal rate, pH value and ef-fluent alkalinity dropping quickly. The amount of Petrotoga sp., Prevotella sp., Kluyvera sp. and Neisseria sp. reduced obviously. The result data from Southern blotting indicated that the amount of sulfate-reducing bacteria (SRBs) decreased with influent alkalinity dropping. Analysis of the microbial community structure and diversity showed that the SRBs populations were very abundant in the in-oculated activated sludge and the alkalinity decrease caused the reduction of the p 展开更多
关键词 alkalinity community dynamics pcr-single-strand conformation polymorphism (SSCP) Southern blotting sulfate-reducing BACTERIUM (SRB) fermentative acidogenic BACTERIUM (FAB).
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绵羊LHR基因PCR-SSCP多态性与繁殖性状的关联分析 被引量:4
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作者 王利红 高勤学 +3 位作者 张伟 靳春方 李玉春 王锋 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期362-369,共8页
通过聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析方法检测绵羊品种(湖羊、晋中绵羊和陵川半细毛羊)促黄体素受体(luteinizing hormone receptor,LHR)基因外显子11核酸序列的单核苷酸多态性,并研究该基因多态性对湖羊性早熟和产羔数的... 通过聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析方法检测绵羊品种(湖羊、晋中绵羊和陵川半细毛羊)促黄体素受体(luteinizing hormone receptor,LHR)基因外显子11核酸序列的单核苷酸多态性,并研究该基因多态性对湖羊性早熟和产羔数的影响。结果表明:在6对引物扩增产物中,只有引物P2和P6的扩增片段具有多态性,引物P2扩增区存在2种基因型,分别为LL和LM型,在3个绵羊品种中均未检测到MM型;引物P6扩增区存在6种不同的SSCP带型,经序列比对分析存在T2053A、A2044T和G2003A的错义突变。湖羊和晋中绵羊P2扩增区基因型分布差异不显著(P>0.05),而与陵川半细毛羊均存在极显著差异(P<0.01);P6扩增区的2 053、2 044、2 003位点各基因型分布在湖羊和晋中绵羊间差异不显著(P>0.05),而与陵川半细毛羊间存在显著差异。P2扩增位点仅陵川半细毛羊的基因分布不符合哈迪-温伯格定律;P6扩增区湖羊和晋中绵羊在各突变位点的等位基因频率处于群体平衡状态,陵川半细毛羊除2 003突变位点基因分布处于群体不平衡状态外,其余突变位点的等位基因频率分布符合哈迪-温伯格定律;LHR外显子11区不同基因型湖羊各胎次产羔数差异不显著(P>0.05),表明LHR外显子11对湖羊的性早熟和高繁殖力性状没有显著影响。 展开更多
关键词 促黄体素受体基因 聚合酶链式反应-单链构象多态性 繁殖力 湖羊 晋中绵羊 陵川半细毛羊
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P73基因在鼻咽癌组织中表达的意义 被引量:1
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作者 李俊 江孝清 +3 位作者 周绪红 田慎之 李晖 彭涛 《武汉大学学报(医学版)》 CAS 2005年第6期707-709,733,F0002,共5页
目的:研究鼻咽癌组织中P73基因的表达及其临床意义.方法:运用逆转录聚合酶链反应技术(RT-PCR)及单链构象多态性分析技术(SSCP)检测P73mRNA的表达及P73基因的突变情况.运用免疫组化SABC技术检测P73蛋白的表达情况.结果:47例鼻咽癌组织中2... 目的:研究鼻咽癌组织中P73基因的表达及其临床意义.方法:运用逆转录聚合酶链反应技术(RT-PCR)及单链构象多态性分析技术(SSCP)检测P73mRNA的表达及P73基因的突变情况.运用免疫组化SABC技术检测P73蛋白的表达情况.结果:47例鼻咽癌组织中29例P73mRNA表达阳性,15例鼻咽粘膜慢性炎症组织中3例P73mRNA表达阳性.鼻咽癌组织中P73mRNA的表达与鼻咽粘膜慢性炎症组织相比,其差异具有显著性(P<0.05).鼻咽癌组织中P73mRNA的表达与TNM分期存在密切关系,Ⅲ~Ⅳ期患者P73mRNA的阳性表达率较Ⅰ~Ⅱ期高(P<0.05).P73基因在所检测的标本中未发现有突变.免疫组化技术检测证实鼻咽癌中存在P73蛋白的过表达(P<0.05).结论:鼻咽癌组织中存在P73基因的过表达现象,P73基因的异常表达与鼻咽癌的发生发展存在一定的关系. 展开更多
关键词 鼻咽癌 P73基因 逆转录聚合酶链反应(RT-pcr) 单链构象多态性分析(SSCP)
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用聚合酶链反应单链构象多态性分析技术检测结核分枝杆菌L型的rpoB基因突变
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作者 陆军 李卫鹏 叶松 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第3期420-421,453,共3页
目的:探索结核分枝杆菌L型的耐药基因rpoB突变与利福平耐药性的关系,以及聚合酶链反应单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术的临床应用价值。方法:收集结核分枝杆菌L型菌株52株,采用PCR-SSCP方法检测rpoB基因,与采用常规药敏试验法检测利... 目的:探索结核分枝杆菌L型的耐药基因rpoB突变与利福平耐药性的关系,以及聚合酶链反应单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术的临床应用价值。方法:收集结核分枝杆菌L型菌株52株,采用PCR-SSCP方法检测rpoB基因,与采用常规药敏试验法检测利福平耐药的结果进行对比分析。结果:采用常规法检测,52株临床分离株中有38株利福平耐药,耐药率为73.08%(38/52);PCR-SSCP方法对52株临床耐药株rpoB基因突变的检出率为65.38%(32/52),两种方法检测耐利福平的符合率为84.21%。结论:PCR-SSCP对利福平耐药的结核分枝杆菌L型菌株检出率较高,将其与常规药敏试验联合应用,是一种指导临床用药的好方法。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌L型 RPOB基因 聚合酶链反应单链构象多态性分析
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性别判定基因突变与男性不育症相关性的研究 被引量:1
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作者 朱章菱 刘敬忠 +1 位作者 方鸣武 闫梅 《中国计划生育学杂志》 1997年第6期339-341,共3页
采用两对引物的多重聚合酶链反应(mPCR)技术,对28例镜下无精子、先天性睾丸发育不良男性不育症患者性别决定基因(SRY基因)扩增。一对引物特异于SRY基因序列称为引物对A,扩增片段长为280bp,另一对引物B,可从X染色体及Y染色体分别扩增出两... 采用两对引物的多重聚合酶链反应(mPCR)技术,对28例镜下无精子、先天性睾丸发育不良男性不育症患者性别决定基因(SRY基因)扩增。一对引物特异于SRY基因序列称为引物对A,扩增片段长为280bp,另一对引物B,可从X染色体及Y染色体分别扩增出两个DNA片段,分别为590bp、355bp。在确定SRY基因无大缺失情况下,用引物对A行单链构象多态性分析(PCR/SSCP),检测有无基因突变。结果发现有7例患者SSCP与正常男性不同,可能有突变。进而用Sanger氏的双脱氧末端终止法测该7例患者280bp片段DNA序列,有3例在128密码子发现A→T突变;使原赖氨酸的密码子突变为终止密码(AAG→TAG)。结果提示部分镜下无精子、先天睾丸发育不良男性不育症患者可能与性别决定基因突变有一定的相关。 展开更多
关键词 不育症 男性 性别决定基因 基因突变
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PCR-SSCP在恶性血液病N-ras癌基因点突变检测中的应用
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作者 欧英贤 达万明 +1 位作者 刘源 吕桂玲 《西北国防医学杂志》 CAS 1998年第3期15-17,共3页
目的:检测血液系统肿瘤中N-ras癌基因点突变的活性。方法:采用PCRSSCP技术分析了28例恶性血液病Nras基因的突变活性,包括:ANLL6例,ALL12例,HD2例,NHL3例,MDS5例。结果:28例中P... 目的:检测血液系统肿瘤中N-ras癌基因点突变的活性。方法:采用PCRSSCP技术分析了28例恶性血液病Nras基因的突变活性,包括:ANLL6例,ALL12例,HD2例,NHL3例,MDS5例。结果:28例中PCRSSCP检测与正常对照,发生阳性者4例(14.6%),其中ALL1例(8.3%)、ANLL1例(16.6%)、MDS2例(40%)。4例中有2例临床缓解后持续阳性,1例为ALL患者,于骨髓移植后104d复发死亡。1例MDS患者转化为急性白血病,另2例临床缓解后3个月检测转阴,其中1例为ANLL,1例为MDS。结论:PCRSSCP方法可作为一种癌基因点突变检测手段常规应用于临床,但值得注意的是,PCRSSCP方法只能提供分析区域是否存在突变点。 展开更多
关键词 聚合酶链式反应-单股链构象多态性(pcr-SSCP) Nras原癌基因 白血病.急性 恶性淋巴瘤 骨髓增生异常综合征(MDS)
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KLF6基因在原发性肝癌中遗传不稳定性的研究
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作者 王文香 田菊霞 +2 位作者 关媛媛 于宁 徐锦屏 《浙江医学》 CAS 2013年第12期1132-1135,共4页
目的研究KLF6基因M1、M2、M4、D10S1716位点的微卫星不稳定性(MSI)和杂合性缺失(LOH)与原发性肝癌进展的关系,为揭示抑癌基因作用机制和肿瘤发生、发展机制提供实验依据。方法从肝癌组织标本中抽提DNA,应用PCR一单链构象多态性(... 目的研究KLF6基因M1、M2、M4、D10S1716位点的微卫星不稳定性(MSI)和杂合性缺失(LOH)与原发性肝癌进展的关系,为揭示抑癌基因作用机制和肿瘤发生、发展机制提供实验依据。方法从肝癌组织标本中抽提DNA,应用PCR一单链构象多态性(PCR—SSCP)法进行KLF6基因遗传不稳定性的研究。结果肝癌KLF6基因微卫星位点LOH的检出率为35.71%(1O/28),与肝癌分化程度、有无包膜无相关性(均P〉0.05),但与临床TNM分期密切相关(P〈0.01),LOH在肝癌Ⅲ~IV期检出率为(75.00%,6/8)明显高于I~II期(20.00%,4120)。MSI检出率为17.86%(5/28),MSI与肝癌分化程度、淋巴转移、临床TNM分期和有无包膜均无相关性(均P〉O.05)。结论KLF6基因的遗传不稳定性可能是原发性肝癌发生、发展的一个重要机制,KLF6基因LOH的发生率与临床TNM分期正相关。LOH在KLF6杂合性缺失的过程中起了重要作用,可作为肝癌恶化及进展的一个指标,MSI则可能影响肿瘤的预后。 展开更多
关键词 肝细胞癌 KLF6基因 pcr-单链构象多态性(pcr—SSCP)法
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