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儿童急性B淋巴细胞白血病中相关融合基因检测结合BIOMED-2标准化Ig基因重排的应用研究 被引量：2
1
作者 艾晓非 张岩 +4 位作者 石欣荣 郑迎春 张丽 王晓静 李庆华 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期352-357,共6页
目的:探讨ALL相关基因检测与BIOMED-2标准化Ig基因重排技术在儿童B-ALL诊治中的应用以及两者的之间的相关性。方法:采用ALL相关基因检测试剂盒与BIOMED-2系统引物,分别进行RNA/DNA的多重PCR扩增,并应用RQ-PCR进行荧光检测及PCR片段分析... 目的:探讨ALL相关基因检测与BIOMED-2标准化Ig基因重排技术在儿童B-ALL诊治中的应用以及两者的之间的相关性。方法:采用ALL相关基因检测试剂盒与BIOMED-2系统引物,分别进行RNA/DNA的多重PCR扩增,并应用RQ-PCR进行荧光检测及PCR片段分析法进行Ig基因重排的克隆性分析。结果:251例B-ALL患儿中TEL-AML1^+77例,E2A-PBX1^+28例,MLL-AF4^+10例,BCR-ABL^+11例,总阳性率为50.2%;IgH V_H-J_H重排阳性率为82.5%,IgK重排阳性率为53.4%。融合基因与基因重排的联合检出率为99%。E2A-PBX1^+组及MLL-AF4^+组中Ig H及Ig K分别与阴性对照组相比,其中Ig K阳性率的差异具有统计学意义(P<0.001及P=0.005)。对105例融合基因阳性患者同时检测染色体荧光原位杂交,其阳性符合率均大于94%。结论:ALL相关融合基因筛查与BIOM ED-2标准化Ig基因重排技术相结合,不仅可以大大提高在儿童B-ALL的检出率,还可以对疾病预后进行较为精确地分组,同时相对于染色体FISH检测更加快速灵敏。 展开更多
关键词 儿童B-ALL ALL融合基因检测 BIOMED-2标准化Ig基因重排 多重pcr pcr片段分析
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参照多重PCR片段分析法进行实时荧光PCR法对ABCB1三等位基因测定结果读取方法的确定
2
作者 张燕 蒙卓成 +4 位作者 邢欢 崔小花 杨柳 郑璇 戴尊孝 《四川精神卫生》 2022年第2期137-143,共7页
目的为解决实时荧光PCR法对三等位基因测定结果无法正常读取的问题,通过参照多重PCR片段分析法,确定实时荧光PCR法读取方法,实现临床对ABCB1三等位基因准确、简便且价格低廉的检测。方法收集西安市精神卫生中心2020年3月-2021年3月DNA样... 目的为解决实时荧光PCR法对三等位基因测定结果无法正常读取的问题,通过参照多重PCR片段分析法,确定实时荧光PCR法读取方法,实现临床对ABCB1三等位基因准确、简便且价格低廉的检测。方法收集西安市精神卫生中心2020年3月-2021年3月DNA样本2794例,抽取5%作为实验样本,分别进行实时荧光PCR法和多重PCR片段分析法测定。根据PCR曲线Ct值的比较以及多重PCR片段分析法碱基峰位强度的比较,对比分析两种方法的判读结果,对其中报告结果不相同的样本进行数据核查并确定PCR读取方法。结果共抽取139例样本,其中存在120例等位基因及19例三等位基因,实时荧光PCR法和多重PCR片段分析法对等位基因的检测结果完全一致。根据多重PCR片段分析结果,对19例三等位基因制定了实时荧光PCR法的读取方法:扩增曲线图中,当∣∣Ct._(G)-Ct._(T)∣-∣Ct._(G)-Ct._(A)∣∣<3,分别读取两组碱基Ct值小的碱基,将其组合形成判读结果;当∣∣Ct._(G)-Ct._(T)∣-∣Ct._(G)-Ct._(A)∣∣≥3,读取两组碱基Ct值最小的碱基,其纯合型即为判读结果。根据读取方法,修正实时荧光PCR法的测定结果为:1例G/G,1例A/A,4例T/G,5例T/A,8例T/T,与多重PCR片段分析法结果一致。结论通过多重PCR片段分析法制定实时荧光PCR法对ABCB1三等位基因的读取方法,两者判读结果一致性良好。 展开更多
关键词 实时荧光pcr法 多重pcr片段分析 三等位基因 ABCB1
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成人流感样病例13种病原体检测情况及多重PCR毛细电泳片段分析法检测的临床应用 被引量：1
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作者 涂鹏 史大伟 +5 位作者 宛瑞杰 田秀君 窦海伟 袁青 陈小华 辛德莉 《国际检验医学杂志》 CAS 2022年第9期1133-1137,共5页
目的探究成人流感样病例中13种病原体分布情况及多重聚合酶链反应(PCR)毛细电泳片段分析法在病原体检测中的应用价值。方法收集2019年12月至2020年2月北方地区189份流感样病例咽拭子标本,采用多重RT-PCR与毛细电泳片段分析法联用技术得... 目的探究成人流感样病例中13种病原体分布情况及多重聚合酶链反应(PCR)毛细电泳片段分析法在病原体检测中的应用价值。方法收集2019年12月至2020年2月北方地区189份流感样病例咽拭子标本,采用多重RT-PCR与毛细电泳片段分析法联用技术得到病原体的检测结果。检测病原体包括甲型流感病毒(InfA)、人腺病毒(HADV)、博卡病毒(Boca)、人鼻病毒(HRV)、甲型流感病毒H1N1(2009)(InfA-H1N1)、季节性流感病毒(InfA-H3N2)、副流感病毒(HPIV)、人偏肺病毒(HMPV)、乙型流感病毒(InfB)、肺炎支原体(MP)、肺炎衣原体(CP)、冠状病毒(HCOV)、人呼吸道合胞病毒(RSV)13种病原体。结果189份流感样病例咽拭子标本中有180份(95.24%)检测出病原体,9份(4.76%)未检测出病原体。180份病原体阳性标本单一病原体150份(83.33%),多种病原体30份(16.67%);145份(80.56%)检测出流感病原体,35份(19.44%)检测出非流感病原体。3种最常见的单一病原体是InfA-H3N2(94份,49.74%),MP(26份,13.76%),InfA(16份,8.47%);3种最常见的多种病原体是InfA-H3N2合并MP感染(15份,7.93%),InfA合并MP感染(7份,3.70%),MP合并HRV感染(3份,1.59%)。结论2019年12月至2020年2月冬季我国北方地区的成人流感病毒主要以InfA-H3N2为主;非流感病毒也可引起流感样病例,以MP感染较多见;部分流感样病例可见混合感染。多重PCR毛细电泳片段分析法有助于全面了解成人流感样病例中病原体分布情况。 展开更多
关键词 成人 流感样病例 呼吸道感染 呼吸道病原体 多重pcr毛细电泳片段分析法
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PCR-毛细电泳片段分析法检测毛细支气管炎病原的临床价值探讨
4
作者 季妙玉 吕佳美 +5 位作者 李海燕 陈小芳 温顺航 张海邻 钱燕巧 董琳 《浙江医学》 CAS 2021年第23期2538-2542,共5页
目的探讨PCR-毛细电泳片段分析法(PCR-CEFA)检测毛细支气管炎病原的临床应用价值。方法选取2018年1至12月温州医科大学附属第二医院、育英儿童医院儿科收治的因毛细支气管炎住院的≤24个月且喘息次数≤2次的患儿932例,采集患儿鼻咽分泌... 目的探讨PCR-毛细电泳片段分析法(PCR-CEFA)检测毛细支气管炎病原的临床应用价值。方法选取2018年1至12月温州医科大学附属第二医院、育英儿童医院儿科收治的因毛细支气管炎住院的≤24个月且喘息次数≤2次的患儿932例,采集患儿鼻咽分泌物,采用PCR-CEFA检测呼吸道合胞病毒(RSV)、鼻病毒(RV)、流感病毒(Flu)、副流感病毒(HPIV)、腺病毒(ADV)等8种病毒核酸;直接免疫荧光法(DFA)检测RSV、HPIV、Flu、ADV抗原;并收集患儿性别、年龄、既往喘息史、湿疹史、哮喘家族史、家族过敏性疾病史、总IgE、血嗜酸性粒细胞计数(B-Eos)等资料。比较两种方法、不同年龄组患儿病毒检出率及RSV组与RV组患儿流行病学资料及实验室检查结果。结果PCR-CEFA病毒检出率为88.2%,高于DFA的33.6%,差异有统计学意义(P<0.01)。PCR-CEFA对RSV、HPIV、Flu、ADV的检出率均高于DFA,差异均有统计学意义(均P<0.01)。以DFA为参照,PCR-CEFA检测RSV、HPIV、Flu、ADV的特异度均达80%以上。≤12月龄患儿RSV检出率高于>12~24月龄患儿,RV、ADV、HBoV检出率均低于>12~24月龄患儿,差异均有统计学意义(均P<0.05)。RV组患儿年龄、B-Eos升高比例均明显高于RSV组,差异均有统计学意义(均P<0.01)。结论与DFA比较,PCR-CEFA病毒检出率更高,病毒检测种类更多,具有良好的特异度,有利于早期明确毛细支气管炎病原。 展开更多
关键词 毛细支气管炎 呼吸道病毒 直接免疫荧光法 pcr-毛细电泳片段分析法
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内蒙古草原典型植物对土壤微生物群落的影响 被引量：16
5
作者 王纳纳 陈颖 +2 位作者 应娇妍 高勇生 白永飞 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期201-208,共8页
为了分析内蒙古草原不同植物物种对土壤微生物群落的影响,采用实时荧光定量PCR(real-time PCR)以及末端限制性片段长度多态性分析(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)等分子生物学技术,测定了退化-恢复样地上... 为了分析内蒙古草原不同植物物种对土壤微生物群落的影响,采用实时荧光定量PCR(real-time PCR)以及末端限制性片段长度多态性分析(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)等分子生物学技术,测定了退化-恢复样地上几种典型植物的根际土壤和非根际土壤中细菌和真菌的数量及群落结构。结果表明,不同植物物种对根际和非根际细菌及根际真菌数量均有显著影响。根际土壤中的细菌和真菌数量普遍高于非根际土壤,尤其以真菌更为明显。对T-RFLP数据进行多响应置换过程(multi-response permutation procedures,MRPP)分析和主成分分析(principal component analysis,PCA),结果表明,大多数物种的根际细菌及真菌的群落结构与非根际有明显差异,并且所有物种的真菌群落可以按根际和非根际明显分为两大类群。此外,细菌和真菌群落结构在一定程度上存在按物种聚类的现象,以细菌较为明显。这些结果揭示了不同植物对土壤微生物群落的影响特征,对理解内蒙古草原地区退化及恢复过程中植被演替引起的土壤性质和功能的变化有一定的帮助。 展开更多
关键词 植物-微生物互作 实时聚合酶链反应 根际微生物 末端限制性片段长度多态性分析
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PRA法检测hsp65和groES在非结核分枝杆菌肺病诊断中的价值 被引量：1
6
作者 章洁 郭秋萍 《国际检验医学杂志》 CAS 2019年第17期2112-2115,2119,共5页
目的 探讨PCR-限制性片段长度多态性分析(PRA)法检测hsp65和groES在非结核分枝杆菌肺病诊断中的价值。方法 选取非结核分枝杆菌肺病患者30例为肺病组,结核病患者30例为结核组,非结核分枝杆菌病感染患者30例为感染组,同时选取体检健康者3... 目的 探讨PCR-限制性片段长度多态性分析(PRA)法检测hsp65和groES在非结核分枝杆菌肺病诊断中的价值。方法 选取非结核分枝杆菌肺病患者30例为肺病组,结核病患者30例为结核组,非结核分枝杆菌病感染患者30例为感染组,同时选取体检健康者30例为健康对照组。使用PRA法检测4组受试者痰液中hsp65和groES的相对分子质量。采用受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积分析hsp65和groES联合检测在非结核分枝杆菌肺病中的诊断意义。结果 肺病组患者痰液中hsp65相对分子质量和groES相对分子质量明显高于结核组、感染组及健康对照组(P<0.05)。肺病组与结核组的hsp65和groES灵敏度分别为93%和77%,特异度分别为80%和90%;肺病组与感染组的hsp65和groES的灵敏度分别为77%和63%,特异度分别为63%和96%;肺病组与健康对照组的hsp65和groES的灵敏度分别为93%和76%,特异度分别为83%和87%。hsp65和groES的临界值分别为2.27和1.96。结论 PRA法检测hsp65和groES在非结核分枝杆菌肺病诊断中具有较好的效果。 展开更多
关键词 pcr-限制性片段长度多态性分析 HSP65 GROES 非结核分枝杆菌病
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