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铁蓄积性骨量下降小鼠微小RNA筛选及靶基因预测
1
作者
朱和平
周建刚
+3 位作者
蒋建农
张雷炎
王强
徐又佳
《中华实验外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期1308-1311,共4页
目的探讨铁蓄积小鼠骨量下降与微小RNA(miRNA,miR)差异性表达的关系。方法12周龄雄性ICR小鼠(n=12)随机分为两组:铁蓄积组(FAC组)及对照组(Con组),分别腹腔注射枸橼酸铁胺(FAC)及等量生理盐水,干预8周后检测血清铁蛋白,...
目的探讨铁蓄积小鼠骨量下降与微小RNA(miRNA,miR)差异性表达的关系。方法12周龄雄性ICR小鼠(n=12)随机分为两组:铁蓄积组(FAC组)及对照组(Con组),分别腹腔注射枸橼酸铁胺(FAC)及等量生理盐水,干预8周后检测血清铁蛋白,微计算机断层扫描技术(Micro-CT)检测小鼠股骨骨量,并分析相关骨结构参数。小鼠全血分离自细胞提取RNA,进行Taqman miRNA芯片检测表达谱差异,实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测验证差异miRNA。利用Targetscan及miRDB数据库预测差异miRNA的下游靶基因,并对预测的下游靶基因进行生物信息学分析,包括细胞成分、生物过程、分子功能和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果FAC组干预8周后,血清铁蛋白[(218.2±29.5)μg/L]相较于对照组[(30.6±9.9)μg/L]明显升高(P=0.000)。股骨三维重建示铁蓄积小鼠骨质结构破坏,骨量、骨小梁厚度(Tb.Th)及骨体积分数(BV/TV)显著下降(P=0.001、0.005、0.021),而骨小梁间隙(Th.Sp)升高(P=0.000)。miRNA芯片结果:初步筛选出20个miRNA表达上调:mmu-miR-29b-3p、mmu-miR-324-3p、mmu-miR-133a-5p、mmu-miR-214-5p、mmu-miR-22-3p、mmu-miR-34a-5p、mmu-miR-31-5p,mmu-miR-143-5p,mmu-miR-423-3p、mmu-miR--223、mmu-miR-155、mmu-miR-106a、mmu-miR-2861、mmu-miR-148a、mmu-miR-96、mmu-miR-449a-5p,mmu-miR-423-5p、mmu-miR-204-5p、mmu-miR-211、mmu-miR-23b及7个miRNA表达下调:mmu-miR-18a.3p、mmu-miR-223-3p、mmu-miR-199a-5p、mmu-miR-196a-5p、mmu-miR-30c-5p、mmu-miR-15b、mmu-miR-130b。其中mmu-miR-423-5p表达差异最为显著,q-PCR验证结果显示miR-423-5p的表达趋势与测序结果一致。Targetsean和miRDB预测并筛选miR-423-5p下游靶基因共91个。生物信息学分析表明miR-423-5p的靶基因在磷脂酰肌醇3激酶(P13K)-蛋白激酶B(Akt)、Rap1、Ras及丝裂原活化蛋白激
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关键词
铁蓄积
骨质疏松
微小RNA
原文传递
题名
铁蓄积性骨量下降小鼠微小RNA筛选及靶基因预测
1
作者
朱和平
周建刚
蒋建农
张雷炎
王强
徐又佳
机构
苏州大学附属第二医院骨科
江苏大学附属宜兴医院骨科
出处
《中华实验外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期1308-1311,共4页
基金
国家自然科学基金(81572179)
江苏省临床专项(BL2014044)
+3 种基金
苏州市临床医学中心(SZZXJ201504)
苏州市民生科技项目(SS201634)
苏州大学附属第二医院优势学科群项目(XKQ2015001)
无锡市卫生计生科研青年项目(Q201732)
文摘
目的探讨铁蓄积小鼠骨量下降与微小RNA(miRNA,miR)差异性表达的关系。方法12周龄雄性ICR小鼠(n=12)随机分为两组:铁蓄积组(FAC组)及对照组(Con组),分别腹腔注射枸橼酸铁胺(FAC)及等量生理盐水,干预8周后检测血清铁蛋白,微计算机断层扫描技术(Micro-CT)检测小鼠股骨骨量,并分析相关骨结构参数。小鼠全血分离自细胞提取RNA,进行Taqman miRNA芯片检测表达谱差异,实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测验证差异miRNA。利用Targetscan及miRDB数据库预测差异miRNA的下游靶基因,并对预测的下游靶基因进行生物信息学分析,包括细胞成分、生物过程、分子功能和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果FAC组干预8周后,血清铁蛋白[(218.2±29.5)μg/L]相较于对照组[(30.6±9.9)μg/L]明显升高(P=0.000)。股骨三维重建示铁蓄积小鼠骨质结构破坏,骨量、骨小梁厚度(Tb.Th)及骨体积分数(BV/TV)显著下降(P=0.001、0.005、0.021),而骨小梁间隙(Th.Sp)升高(P=0.000)。miRNA芯片结果:初步筛选出20个miRNA表达上调:mmu-miR-29b-3p、mmu-miR-324-3p、mmu-miR-133a-5p、mmu-miR-214-5p、mmu-miR-22-3p、mmu-miR-34a-5p、mmu-miR-31-5p,mmu-miR-143-5p,mmu-miR-423-3p、mmu-miR--223、mmu-miR-155、mmu-miR-106a、mmu-miR-2861、mmu-miR-148a、mmu-miR-96、mmu-miR-449a-5p,mmu-miR-423-5p、mmu-miR-204-5p、mmu-miR-211、mmu-miR-23b及7个miRNA表达下调:mmu-miR-18a.3p、mmu-miR-223-3p、mmu-miR-199a-5p、mmu-miR-196a-5p、mmu-miR-30c-5p、mmu-miR-15b、mmu-miR-130b。其中mmu-miR-423-5p表达差异最为显著,q-PCR验证结果显示miR-423-5p的表达趋势与测序结果一致。Targetsean和miRDB预测并筛选miR-423-5p下游靶基因共91个。生物信息学分析表明miR-423-5p的靶基因在磷脂酰肌醇3激酶(P13K)-蛋白激酶B(Akt)、Rap1、Ras及丝裂原活化蛋白激
关键词
铁蓄积
骨质疏松
微小RNA
Keywords
Iron accumulation
osteonorosis
MicroRNA
分类号
R580 [医药卫生—内分泌]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
铁蓄积性骨量下降小鼠微小RNA筛选及靶基因预测
朱和平
周建刚
蒋建农
张雷炎
王强
徐又佳
《中华实验外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
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