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灰斑古毒蛾核型多角体病毒EcoRⅠ-U片段的克隆与序列分析
1
作者
杨丽荣
薛保国
+2 位作者
刘红彦
王正军
王秀美
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2009年第1期155-160,共6页
【目的】分析灰斑古毒蛾核型多角体病毒(Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV)EcoRⅠ-U片段分子生物学特征,为研究其分子特性及其在OrerNPV感染周期中的功能提供科学依据。【方法】克隆、分析OrerNPV EcoRⅠ-U片段所包含的...
【目的】分析灰斑古毒蛾核型多角体病毒(Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV)EcoRⅠ-U片段分子生物学特征,为研究其分子特性及其在OrerNPV感染周期中的功能提供科学依据。【方法】克隆、分析OrerNPV EcoRⅠ-U片段所包含的若干基因,并应用生物软件对OrerNPV泛素基因(Ubi基因)进行了进化分析。【结果】OrerNPV EcoRⅠ-U片段包含Ubi基因、AcORF34同源基因和39K基因部分序列,在该区域中编码Ubi基因的开放阅读框(ORF)由246个核苷酸组成,可以编码81个氨基酸,预汁蛋白质分子质量为8.9ku。OrerNPV Ubi基因与苜蓿丫纹夜蛾核型多角体病毒(AcMNPV)、家蚕核型多角体病毒(BmNPV)、薄荷灰夜蛾核型多角体病毒(RaouM-NPV)的同源性最高,均达92%,与小菜蛾颗粒体病毒(Plutella xylostella granulovirus,PxGV)的同源性最低,为62%。OrerNPV与AcMNPV、BmNPV和RaouMNPV的亲源关系最近。EcoR Ⅰ-U片段+M13端含有编码39K基因(pp31)的部分序列,该多肽与10种NPV的39K序列有48%~52%的同源性。【结论】明确了OrerNPV EcoRⅠ-U片段的序列特征及OrerNPV Ubi在泛素蛋白家族中的进化关系。
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关键词
灰斑古毒蛾核型多角体病毒
EcoRⅠ-U片段
泛素基因
AcORF34同源基因
39K基因
分子进化
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职称材料
灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O片段的克隆与生物信息学分析
2
作者
杨丽荣
闫海霞
+2 位作者
全鑫
薛保国
达楞巴雅尔
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2010年第1期55-60,共6页
分析了灰斑古毒蛾核型多角体病毒(Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV)EcoR I-O片段分子生物学特征,为研究egt基因分子特性和杆状病毒遗传改良提供科学依据。克隆和分析了OrerNPVEcoR I-O片段所包含的2个基因,并应用生物软件...
分析了灰斑古毒蛾核型多角体病毒(Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV)EcoR I-O片段分子生物学特征,为研究egt基因分子特性和杆状病毒遗传改良提供科学依据。克隆和分析了OrerNPVEcoR I-O片段所包含的2个基因,并应用生物软件对OrerNPV蜕皮甾体尿苷二磷酸葡糖转移酶(egt)基因及其启动子进行了比对分析。结果表明OrerNPVEcoR I-O片段包含egt基因和Ol-129同源基因,在该区域中编码egt基因的开放阅读框(ORF)由1 539个核苷酸组成,可以编码512个氨基酸,预计蛋白质分子质量为57.9 kDa。OrerNPV和NPVs之间的同源性为46%-89%,与白斑天幕毛虫核型多角体病毒(Orgyia leucostigmaNPV,OlNPV)egt基因同源性最高,达89%,与棉褐带卷叶蛾核型多角体病毒(Adoxophyes oranaNPV,AoNPV)同源性最低为46%;而OrerNPV和GVs之间的同源性为44%-55%,小于与NPVs之间的同源性;与昆虫UGT间同源性最低,与家蚕UGT间同源性为41%。EcoR I-O片段+M13端含有编码OlNPV ORF129(Ol-129)Ol-129同源基因ORF,由597 bp个核苷酸组成,在其起始密码子ATG上游-64,-24 nt处各有1个TATA box,其推测的氨基酸序列与Ol-129同源性最高达81%,与LdNPV ORF127同源性最低,为40%。明确了OrerNPVEcoR I-O片段的序列特征,以及OrerNPVegt基因特性。
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关键词
灰斑古毒蛾核型多角体病毒
EcoRI-O片段
EGT基因
Ol-129同源基因
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职称材料
题名
灰斑古毒蛾核型多角体病毒EcoRⅠ-U片段的克隆与序列分析
1
作者
杨丽荣
薛保国
刘红彦
王正军
王秀美
机构
河南省农业科学院植物保护研究所
西安交通大学生命科学学院
通辽市林业局种苗站
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2009年第1期155-160,共6页
基金
河南省基础与前沿项目(072300430080)
河南省农业科学院博士启动项目
文摘
【目的】分析灰斑古毒蛾核型多角体病毒(Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV)EcoRⅠ-U片段分子生物学特征,为研究其分子特性及其在OrerNPV感染周期中的功能提供科学依据。【方法】克隆、分析OrerNPV EcoRⅠ-U片段所包含的若干基因,并应用生物软件对OrerNPV泛素基因(Ubi基因)进行了进化分析。【结果】OrerNPV EcoRⅠ-U片段包含Ubi基因、AcORF34同源基因和39K基因部分序列,在该区域中编码Ubi基因的开放阅读框(ORF)由246个核苷酸组成,可以编码81个氨基酸,预汁蛋白质分子质量为8.9ku。OrerNPV Ubi基因与苜蓿丫纹夜蛾核型多角体病毒(AcMNPV)、家蚕核型多角体病毒(BmNPV)、薄荷灰夜蛾核型多角体病毒(RaouM-NPV)的同源性最高,均达92%,与小菜蛾颗粒体病毒(Plutella xylostella granulovirus,PxGV)的同源性最低,为62%。OrerNPV与AcMNPV、BmNPV和RaouMNPV的亲源关系最近。EcoR Ⅰ-U片段+M13端含有编码39K基因(pp31)的部分序列,该多肽与10种NPV的39K序列有48%~52%的同源性。【结论】明确了OrerNPV EcoRⅠ-U片段的序列特征及OrerNPV Ubi在泛素蛋白家族中的进化关系。
关键词
灰斑古毒蛾核型多角体病毒
EcoRⅠ-U片段
泛素基因
AcORF34同源基因
39K基因
分子进化
Keywords
orgyia
ericae
nucleopolyhedrovirus
EcoR
Ⅰ-U
Fragment
Ubi
gene
homologues
of
AcORF34
39K
gene
molecular
evolution
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O片段的克隆与生物信息学分析
2
作者
杨丽荣
闫海霞
全鑫
薛保国
达楞巴雅尔
机构
河南省农业科学院植物保护研究所
内蒙古自治区乌审旗林业局
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2010年第1期55-60,共6页
基金
国家自然基金项目(30872033)
河南省科技攻关项目(082102140011)
文摘
分析了灰斑古毒蛾核型多角体病毒(Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV)EcoR I-O片段分子生物学特征,为研究egt基因分子特性和杆状病毒遗传改良提供科学依据。克隆和分析了OrerNPVEcoR I-O片段所包含的2个基因,并应用生物软件对OrerNPV蜕皮甾体尿苷二磷酸葡糖转移酶(egt)基因及其启动子进行了比对分析。结果表明OrerNPVEcoR I-O片段包含egt基因和Ol-129同源基因,在该区域中编码egt基因的开放阅读框(ORF)由1 539个核苷酸组成,可以编码512个氨基酸,预计蛋白质分子质量为57.9 kDa。OrerNPV和NPVs之间的同源性为46%-89%,与白斑天幕毛虫核型多角体病毒(Orgyia leucostigmaNPV,OlNPV)egt基因同源性最高,达89%,与棉褐带卷叶蛾核型多角体病毒(Adoxophyes oranaNPV,AoNPV)同源性最低为46%;而OrerNPV和GVs之间的同源性为44%-55%,小于与NPVs之间的同源性;与昆虫UGT间同源性最低,与家蚕UGT间同源性为41%。EcoR I-O片段+M13端含有编码OlNPV ORF129(Ol-129)Ol-129同源基因ORF,由597 bp个核苷酸组成,在其起始密码子ATG上游-64,-24 nt处各有1个TATA box,其推测的氨基酸序列与Ol-129同源性最高达81%,与LdNPV ORF127同源性最低,为40%。明确了OrerNPVEcoR I-O片段的序列特征,以及OrerNPVegt基因特性。
关键词
灰斑古毒蛾核型多角体病毒
EcoRI-O片段
EGT基因
Ol-129同源基因
Keywords
orgyia
ericae
nucleopolyhedrovirus
EcoR
I-O
fragment
egt
gene
Homologues
of
Ol-129
gene
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
灰斑古毒蛾核型多角体病毒EcoRⅠ-U片段的克隆与序列分析
杨丽荣
薛保国
刘红彦
王正军
王秀美
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2009
0
下载PDF
职称材料
2
灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O片段的克隆与生物信息学分析
杨丽荣
闫海霞
全鑫
薛保国
达楞巴雅尔
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2010
0
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