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灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O片段的克隆与生物信息学分析
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作者 杨丽荣 闫海霞 +2 位作者 全鑫 薛保国 达楞巴雅尔 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期55-60,共6页
分析了灰斑古毒蛾核型多角体病毒（Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV）EcoR I-O片段分子生物学特征,为研究egt基因分子特性和杆状病毒遗传改良提供科学依据。克隆和分析了OrerNPVEcoR I-O片段所包含的2个基因,并应用生物软件... 分析了灰斑古毒蛾核型多角体病毒（Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV）EcoR I-O片段分子生物学特征,为研究egt基因分子特性和杆状病毒遗传改良提供科学依据。克隆和分析了OrerNPVEcoR I-O片段所包含的2个基因,并应用生物软件对OrerNPV蜕皮甾体尿苷二磷酸葡糖转移酶（egt）基因及其启动子进行了比对分析。结果表明OrerNPVEcoR I-O片段包含egt基因和Ol-129同源基因,在该区域中编码egt基因的开放阅读框（ORF）由1 539个核苷酸组成,可以编码512个氨基酸,预计蛋白质分子质量为57.9 kDa。OrerNPV和NPVs之间的同源性为46%-89%,与白斑天幕毛虫核型多角体病毒（Orgyia leucostigmaNPV,OlNPV）egt基因同源性最高,达89%,与棉褐带卷叶蛾核型多角体病毒（Adoxophyes oranaNPV,AoNPV）同源性最低为46%;而OrerNPV和GVs之间的同源性为44%-55%,小于与NPVs之间的同源性;与昆虫UGT间同源性最低,与家蚕UGT间同源性为41%。EcoR I-O片段＋M13端含有编码OlNPV ORF129（Ol-129）Ol-129同源基因ORF,由597 bp个核苷酸组成,在其起始密码子ATG上游-64,-24 nt处各有1个TATA box,其推测的氨基酸序列与Ol-129同源性最高达81%,与LdNPV ORF127同源性最低,为40%。明确了OrerNPVEcoR I-O片段的序列特征,以及OrerNPVegt基因特性。 展开更多
关键词 灰斑古毒蛾核型多角体病毒 EcoRI-O片段 EGT基因 ol-129同源基因
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