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题名四川地区一株PCV2的分离鉴定及基因组序列分析
被引量：1
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作者
陈劲松
郭紫晶
黄雄挺
张志东
李彦敏
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机构
西南民族大学动物医学四川省高等学校重点实验室
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出处
《四川畜牧兽医》
2024年第2期23-27,共5页
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基金
西南民族大学中央高校基本科研业务费专项基金项目(ZYN2023042)
西南民族大学引进高层次人才科研资助金项目(RQD202100)
四川省自然科学基金项目(2022NSFSC0073)。
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文摘
为了解猪圆环病毒2型(PCV2)当前流行分离株的基因型和进化特征,本研究对PCV2阳性临床样品进行分离鉴定,并对分离毒株进行全基因组序列扩增、测序及遗传进化分析,利用MegAlign7.0和DNAstar软件对分离株ORF2基因编码的Cap蛋白进行氨基酸变异分析和抗原指数预测分析。测序结果显示,PCV2分离株(SMU-2022)的全基因组序列长度为1 767 nt。全基因组和Cap蛋白的遗传进化树结果均显示分离株属于PCV2d基因型,与国内外46株参考毒株的相似性在91.8%~99.1%之间,其中与QZ1410毒株的相似性最高,亲缘关系最接近。关键氨基酸位点变异分析表明,在Cap蛋白上有2个氨基酸特异性突变位点,分别是V30L和T232K。抗原指数分析发现,分离株的Cap蛋白抗原指数与4株疫苗株相比差异较大,主要集中在第20-30、40-75、90-100、130-140、195-205、210-220位氨基酸这6个区域。
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关键词
猪圆环病毒2型(PCV2)
orf2基因型
CAP蛋白
抗原指数
遗传进化分析
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分类号
S852.659.2
[农业科学—基础兽医学]
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